胃癌相关核心基因的生物信息学分析

目的：筛选胃癌相关的核心基因及其与胃癌诊断、预后的关系,为胃癌分子诊断、靶向治疗、预后评判提供研究方向。方法：从基因表达数据库（GEO）下载胃癌相关的mRNA表达谱芯片数据,利用R软件的Limma包分别筛选出胃癌组织中较癌旁组织相比具有显著差异表达的基因（DEGs）,在基因功能注释数据库（DAVID）中对DEGs进行基因本体（GO）功能注释及京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析,交互基因检索工具（STRING）及Cytoscape软件的网络分析插件CytoHubba用于构建蛋白互作网络（PPI）并进行可视化分析,筛选出核心基因;利用生存分析工具（KM数据库）分析核心基因与胃癌患者预后的关系,并量化具有预后意义的核心基因的诊断价值,利用GraphPad软件将其可视化。最后用皮尔逊（Pearson）法检验核心基因之间的相关性。结果：在GEO数据库得到的3个基因芯片表达谱中,胃癌组织与正常组织差异表达显著的基因有1 839个,上调基因851个,下调基因988个,三者取交集后,在3个表达谱芯片中均有显著差异表达的基因有66个,上调基因24个,下调基因42个;GO富集分析显示,差异表达基因的功能主要集中在细胞外空间、细胞外外泌体、消化、细胞外基质组织、胶原纤维组织;KEGG富集分析提示,差异表达基因的通路主要涉及蛋白质消化和吸收、胃酸分泌、氮代谢、ECM-受体相互作用、矿物质吸收等;PPI网络中,Cytoscape可视化分析发现10个核心基因的差异表达与胃癌的发生密切相关,KM数据库检索发现,FN1、COL1A1低表达组患者预后更佳,高表达组更差。FN1、COL1A1的AUC分别为0.93、0.90,提示两者均具有较高的诊断价值,两者的相关性分析得出相关系数r=0.59（P < 0.05）,提示COL1A1与FN1两者在胃癌中的表达呈正相关。结论：生物信息分析筛选的核心基因FN1、COL1A1可能成为提示胃癌患者预后、早期诊断、研发胃癌靶向药物的候选标志物或靶点。     

星形胶质细胞在放射性脑损伤中作用研究进展

放射性脑损伤(RBI)是头颈部恶性肿瘤放疗后的并发症之一,严重影响了患者的生活质量。RBI的病理生理机制目前尚不完全清楚,研究认为中枢神经系统(CNS)多种细胞参与其中,而星型胶质细胞作为CNS数量最多的胶质细胞,在维持CNS稳态及应对CNS损伤反应中发挥重要作用,本文就星形胶质细胞在RBI中的作用作一综述。     

转移性结直肠癌抗EGFR治疗的耐药机制研究进展

以表皮生长因子受体（EGFR）作为特异靶点的单克隆抗体西妥昔单抗和帕尼单抗联合化疗是有效的治疗携带鼠类肉瘤病毒癌基因野生型转移性结直肠癌的方法，两者的运用显著改善了转移性结直肠癌患者的预后，是结直肠癌治疗发展过程中的里程碑。然而，大多患者会对抗EGFR治疗产生耐药而致病情进展。因此，对耐药机制的充分认识及探索尤为重要，将有助于为耐药后治疗策略的制定提供方向。随着对EGFR耐药机制的深入研究，我们发现多种生物标志物和途径均与抗EGFR治疗的耐药有关。本文将对转移性结直肠癌抗EGFR耐药机制作出概述。