新疆4种绢蒿属植物及近缘种银蒿的ITS/ITS2条形码鉴定研究

目的：评价ITS/ITS2热点条形码序列对新疆4种绢蒿属植物及其近缘种银蒿的鉴别能力,为绢蒿属植物分类鉴定提供分子参考依据。方法：对15份绢蒿属及银蒿植物样本进行DNA提取、PCR扩增、双向测序,采用CodonCode Aligner软件对序列峰图进行校对拼接,MEGA6.0分析序列碱基组成及变异,计算K2P遗传距离并构建聚类邻接树,预测ITS2序列二级结构,评估鉴别能力。结果：西北绢蒿、针裂叶绢蒿种内变异位点及信息位点数均小于银蒿。ITS序列种间、种内遗传变异均大于ITS2序列。ITS/ITS2 序列邻接（NJ）树均聚为3支,绢蒿属、银蒿1、银蒿2。绢蒿属ITS2序列二级结构与银蒿有差异。结论：通过ITS/ITS2序列的种间K2P遗传距离、邻接树、ITS2序列二级结构分析,ITS、ITS2序列具很好的属鉴定效果,不同产地的针裂叶绢蒿被区分开。     

基于ITS2的和田玫瑰分子进化分析

目的 分析和田玫瑰分子系统发育进化式样并评价其道地性。方法 采用聚合酶链式反应获得和田玫瑰内转录间隔区2（ITS2）序列,在美国国家生物技术信息中心数据库（NCBI）比对,从GenBank获取邻近属ITS2序列共52条,利用MEGA X软件进行多重比对分析,构建邻接（NJ）系统发育树,推断进化时间,预测ITS2序列二级结构。结果 基于ITS2引物扩增获得长度为409 bp的序列,包括小亚基核糖体核糖核酸基因和内部转录间隔区的部分序列（1~39 bp）、5.8S核糖体核糖核酸基因全序列（40~64 bp）、ITS2标准全序列（65~268 bp）、大亚基核糖体核糖核酸基因的部分序列（269~409 bp）。分析发现和田玫瑰与英国、意大利等欧洲产玫瑰Rosa sherardii距离最近,共同亲本是大马士革玫瑰,和田玫瑰于20 000多年前开始出现。结论 和田玫瑰ITS2标准序列为204 bp,起源于欧洲大马士革玫瑰,分歧进化时间约为29 000年,与《中华人民共和国药典》2020年版收录玫瑰花的ITS2序列二级结构的区别主要在Ⅲ螺旋区部位。