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目的 应用核糖核酸测序(RNA-seq)技术探讨马尔尼菲篮状菌(TM)致小鼠脑皮层损伤的可能机制。方法 (1)将10只C57/BL6小鼠随机分为TM感染组和健康对照组(5只/组)后,分别经尾静脉注射TM分生孢子悬液、生理盐水。将BV2细胞和N2a细胞均随机分为TM感染组和空白对照组,TM感染组加入TM分生孢子悬液,空白对照组加入等量培养液。(2)建模成功后,取小鼠脑皮层组织进行RNA-seq后分析差异表达基因(DEGs);采用R 4.1.2软件对DEGs进行京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析和基因本体论(GO)功能富集分析等。取两组小鼠脑皮层组织及两组BV2细胞、N2a细胞,采用实时荧光定量PCR对富集通路相关DEGs、促炎因子进行体内体外验证。结果 (1)共获得871个DEGs,其中上调基因373个、下调基因498个。KEGG通路富集分析结果显示,显著性最大的通路为氧化磷酸化通路(Q=9.60×10-3),基因数目比例最大的通路为神经退行性病变-多种疾病通路;GO功能富集分析结果显示,DEGs主要涉及细胞因子产生的正向调节、突触组织等生物学过程和组... 相似文献
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目的 基于国家健康和营养检查调查(NHANES)数据库探讨多种病毒感染与睡眠障碍之间的关联性。方法 选取NHANES数据库2009—2010年的横断面调查数据,根据睡眠障碍发生情况将研究对象分为睡眠障碍组与非睡眠障碍组。采用逆概率处理加权法(IPTW)平衡两组研究对象的基线特征。采用χ2检验及标准均数差(SMD)评估IPTW分析前后两组基线特征的均衡性;应用非条件Logistic回归(IPTW分析前)和加权Logistic回归(IPTW分析后)分析7种病毒感染与睡眠障碍之间的关联性。针对HAV感染与睡眠障碍之间的关联性进行亚组分析。结果 共纳入2 385名研究对象,其中146名纳入睡眠障碍组,2 239名纳入非睡眠障碍组。IPTW分析前,两组的年龄、人群、家庭收入贫困比率(PIR)、吸烟的SMD>0.1,基本特征不均衡;IPTW分析后,两组的基线特征差异无统计学意义(SMD<0.1,P>0.05),基本特征均衡。非条件Logistic回归结果显示,HAV感染、单纯疱疹病毒2型(HSV‐2)感染与睡眠障碍存在相关性(P<0.05);加权Log... 相似文献
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