基于网络药理学和分子对接探究三拗片治疗急性支气管炎分子作用机制

目的:通过网络药理学和分子对接方法探究三拗片治疗急性支气管炎的潜在活性成分及作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选三拗片活性成分和靶点,与GeneCards、OMIM、DrugBank数据库中急性支气管炎基因集相互映射获取共同靶点;利用STRING数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,筛选核心靶点;依托DAVID平台对共同靶点进行基因本体(GO)生物学过程及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,以了解共同靶点集的生物学作用;通过分子对接结果验证PPI网络核心靶点。结果:获得三拗片活性成分124个;三拗片治疗急性支气管炎靶点103个,其中核心靶点5个;GO生物学过程575条,涉及凋亡过程、炎症反应、细胞增殖、信号转导等生物过程;KEGG通路117条,三拗片可能通过干预磷脂酰肌醇3-激酶/蛋白激酶B (PI3K/Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、流感、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、Toll样受体信号通路、缺氧诱导因子1 (HIF-1)信号通路发挥治疗急性支气管炎作用;分子对接结果显示,三拗片中槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-谷甾醇、柚皮素、芒柄花黄素、甘草查耳酮A均能较好地与急性支气管炎靶蛋白结合,可能通过作用于细胞肿瘤抗原p53 (TP53)、Akt1、白细胞介素-6 (IL-6)、TNF、血管内皮生长因子A (VEGFA)靶点发挥作用。结论:三拗片活性化合物可能从结构上作用于支气管,共同参与抗炎、平衡细胞因子、免疫调节、抗病毒抑菌而发挥治疗作用。     

基于网络药理学探讨重楼与非小细胞肺癌相关分子机制

目的:基于网络药理学方法筛选重楼[Paris polyphylla var.yunnanensis(Franch.)Hand.-Mazz.]的主要活性成分,预测其治疗非小细胞肺癌（NSCLC）的作用靶点及信号通路,进一步探讨其治疗NSCLC的可能作用机制。方法:通过中药与化学成分数据库、瑞士生物信息研究所平台（SIB）及文献挖掘,检索并收集重楼的活性成分及其对应的靶标基因。利用GeneCards、在线人类孟德尔遗传数据库（OMIM）获得NSCLC的潜在靶标基因。将二者靶标基因相映射筛选核心靶标基因,依托DAVID数据库对重楼的作用靶标基因进行基因本体（GO）富集分析生物学过程和京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路富集注释分析,并通过分子对接验证预测结果。结果:共筛选得到重楼的7个活性成分,包括β-蜕皮素、γ-氨基丁酸、重楼皂苷A、重楼皂苷G、重楼皂苷F、重楼皂苷D、重楼皂苷B等;筛选出核心靶点7个,包括MAPK1、MAPK3、VEGFA、PIK3CA、BCL2L1、FGF1、STAT3。结论:7个核心靶点主要通过癌症通路、非小细胞肺癌通路、PI3K-AKT信号通路、FoxO信号通路、MAPK信号通路起到抗癌、免疫调节、维持端粒稳定的作用。本研究基于网络药理学的方法预测了重楼治疗NSCLC可能的作用机制,为后续的深入研究提供了参考。     

基于网络药理学及分子对接探讨半夏-藿香抗新型冠状病毒肺炎作用机制

目的:基于网络药理学筛选半夏-藿香药对治疗新型冠状病毒肺炎（COVID-19）的潜在活性成分、核心靶点、信号通路。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台（TCMSP）筛选半夏-藿香药对活性成分和靶点,与GeneCards、NCBI数据库中COVID-19基因集相互映射获取关键靶点,同时通过STRING数据库和Cytoscape 3.6.1软件构建关键靶点相互作用网络。利用DAVID数据库进行基因本体（GO）-生物过程(BP)及KEGG通路富集分析,获得分子对接证据支持。结果:半夏-藿香药对有效活性成分24个,关键靶点45个,共富集出生物过程、细胞组分和分子功能条目443条,通路103条。分子对接结果显示在半夏-藿香药对中,与3CLpro结合最好的是β-谷甾醇;与血管紧张素转换酶2结合最好的为槲皮素。结论:半夏-藿香药对关键化合物可能从结构上作用于严重急性呼吸系统综合征冠状病毒2(SARS-CoV-2)入侵及从多成分多靶点多通路抑制细胞因子风暴,广谱抗病毒、抑菌及免疫调节,干预网状激活系统起到治疗作用。