医学统计学信息化教学的探索与实践

医学统计学为高等医科院校各专业学员的必修课。为提高本科生医学统计学课程的教学效果,第二军医大学积极采用现代信息化手段和技术推行信息化教学改革,通过软硬件平台建设和师资培训等手段不断提高教师的信息化教学能力。信息化教学有利于培养学员的自主学习能力和解决实际问题的能力。     

基于偏最小二乘的原发性肝癌细胞遗传学异常区域识别方法

目的 应用偏最小二乘法,并结合Fisher精确检验实现原发性肝癌细胞遗传学异常区域的识别.方法 利用Chen等发布在SMD上的原发性肝癌基因表达数据库,运用偏最小二乘法中的变量投影重要性(Variable mportance in the Project,VIP)指标筛选肝癌异常表达基因,根据基因在染色体上的定位,计算每条染色体上的上调、下调基因以及正常表达基因,运用Fisher精确检验识别有统计学意义的细胞遗传学异常区域.结果 得到基因表达增强区域7个(1q,5q,6p,8q,12q,17q,20q),表达下调区域为8个(4q,8p,9p,12p,13q,16q,17p,21q),15个异常区域已全部由实验方法证实.结论 与传统的实验方法和一些预测算法相比,偏最小二乘法结合Fisher精确检验能够有效、快速地识别染色体基因异常表达区域,灵敏度有了较大提高.     

2014学年浦东新区中小学因病缺课监测情况分析

目的及时动态掌握中小学生因病缺课原因,对重点疾病、伤害进行预警预测。方法利用《上海市学校因病缺课缺勤网络直报系统》,分析浦东新区2014学年中小学因病缺课基本情况、病因分布及传染病和意外伤害发生情况。结果冬季是中小学生因病缺课的高峰时段,"发热及发热合并其他症状"与"呼吸道症状和疾病"是主要病种,两者分别占了39.51%和38.93%。传染病方面占前五位的分别是水痘990例(36.69%)、流行性感冒692例(25.65%)、手足口病506例(18.75%)、猩红热323例(11.97%)、流行性腮腺炎133例(4.93%)。伤害原因中"跌倒/坠落"占84.43%,远高于其他原因。结论学校应该有针对性地开展一些健康教育活动,预防冬季传染病的发生,普及安全意识,减少意外伤害。     

两种基于偏最小二乘法的分类模型对肿瘤基因表达数据行多分类的比较研究

目的 比较两种基于偏最小二乘法的分类模型对肿瘤基因表达数据行多分类分析的效果,比较不同差异基因选取方法对分类结果的影响.方法 利用NCI60等4个肿瘤基因表达数据库,通过4种不同方法选取差异表达基因,在此基础上,用两种基于偏最小二乘的方法行多分类分析.一是偏最小二乘线性判别,首先运用偏最小二乘法行降维,再利用降维得到的成分作为输入变量作线性判别分析;二是偏最小二乘判别分析,利用偏最小二乘回归直接进行分类.分类效果采用留一法和10倍交叉验证法进行评价.结果 偏最小二乘判别分析的分类效果略优于偏最小二乘降维后的线性判别.以变量重要性指标选取差异表达基因时分类效果较好,其次是SAM法.结论 在对肿瘤基因表达数据行多分类分析时,偏最小二乘法既是一种高效的降维方法,也是一种实用的分类方法.     

信息化条件下《医学统计学》分层次多目标教学探索与实践

二十一世纪是信息时代,数据是信息的重要表现形式.<医学统计学>是以医学理论为指导,借助概率论和数理统计的原理和方法,研究医学科研中数据的搜集、整理、分析和推断的一门应用性学科,最终目的是服务于医学实践.医学统计学在本科生与研究生的知识体系中占有重要地位,它的教学效果对医学生今后的科研素质将产生很大的影响.目前统计学理论方法、统计软件应用与计算机技术发展很快,如何在信息化条件下作好医学统计学教学工作,是我们教研室多年来一直探讨的问题.     

基于时间序列表达数据基因调控网络模型的研究进展

基因间的调控是随时间、环境变化的动态事件,基因调控网络是一个连续而复杂的动态系统,基于时间序列的基因组DNA微阵列为研究者提供了构建动态调控网络的工具.本文介绍几种基于时间序列基因表达数据调控网络模型(时序布尔网络、微分方程、动态贝叶斯等),分析几种模型的优缺点,并展望未来的研究趋势.