柯萨奇病毒B组3型四川分离株的基因特征分析

目的了解从四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例和手足口(hand-foot-and-mouth disease,HFMD)病例中分离到的柯萨奇病毒B组3型(Coxsackievirus B3,CVB3)的基因特征,探索其变异规律及在四川省的传播动态。方法对2008—2020年AFP病例和2013—2019年非肠道病毒71型(Enterovirus 71,EV 71)和柯萨奇A16型(Coxsackie virus A16,CVA 16)感染的HFMD病例标本进行细胞分离培养,血清学鉴定,全VP1基因序列的测定及核苷酸同源性和遗传进化的分析,用MEGA6.0软件以邻位连接法构建遗传进化树,bootstrap检验1 000次;以Kimura 2参数方法计算基因型间遗传距离。结果从2008—2020年4 378份四川省AFP病例标本中分离鉴定到13株CVB3,从2013—2019年四川省454份非EV 71和CVA16感染的HFMD病例标本中分离鉴定到1株CVB3。14株CVB3四川分离株之间核苷酸同源性为84.4~98.8%,氨基酸同源性为84.1~100.0%。14株CVB3均属于G基因型,其中11株在G1基因亚型,3株在G2基因亚型。结论四川省存在CVB3病毒的多条传播链,流行趋势呈现周期性变化;G1、G2两种基因亚型在四川省同时流行,G1基因亚型为四川省CVB3的优势基因亚型。     

2019年四川省凉山州Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎病毒循环相关儿童脊髓灰质炎病毒中和抗体水平调查北大核心CSCD

目的评价2019年6月四川省凉山州Ⅱ型疫苗衍生脊髓灰质炎(脊灰)病毒循环(Circulating vaccine-derived poliovirus type II,cVDPV2)相关儿童脊灰病毒(Poliovirus,PV)中和抗体水平。方法在发生cVDPV2的雷波县田坝村选取所有1-5岁儿童,在雷波县其他地区和凉山州其他6个县采用便利抽样法抽取1-5岁儿童,采集血清标本,应用微量中和试验检测PVⅠ、PVⅡ、PVⅢ和/或cVDPV2中和抗体,分析抗体阳性率和几何平均滴度(Geometric mean titer,GMT)。结果在凉山州7个县(不包括田坝村)697名儿童中,PVⅠ、PVⅡ、PVⅢ中和抗体阳性率分别为90.8%、78.5%、85.5%,GMT分别为1∶85.1、1∶25.2、1∶37.1;各型PV抗体水平均随年龄增长而先下降再上升,且在7个县之间具有显著性差异。在雷波县田坝村52名儿童中,PVⅠ、PVⅡ、PVⅢ、cVDPV2中和抗体阳性率分别为44.2%、34.6%、38.5%、84.6%,GMT分别为1∶9.5、1∶5.1、1∶8.2、1∶89.9;在雷波县其他地区100名儿童中,相应中和抗体阳性率为分别为88.0%、75.0%、80.0%、79.0%,GMT分别为1∶69.4、1∶12.3、1∶32.5、1∶18.0。结论本起cVDPV2发生地区的儿童存在脊灰免疫空白,cVDPV2循环时间较久且传播广泛,凉山州1-5岁儿童脊灰免疫水平较低,需加强儿童脊灰预防接种工作。     

成都地区腹泻病例人杯状病毒感染状况研究

目的 了解成都地区2010年7～12月之间人杯状病毒感染性腹泻的情况.方法 采集成都市2家哨点医院2010年7～12月之间腹泻病人的大便标本501份,采用RT-PCR方法,对501份大便标本同时进行诺如病毒、札如病毒核酸检测.结果 501份标本中检出阳性122份,核酸阳性率为24.35％ (122/501),其中诺如病毒GⅠ型1份,占阳性标本的0.82％ (1/122);诺如病毒GⅡ型100份,占阳性标本的81.97％ (100/122);札如病毒18份,占阳性标本的14.75％(18/122);诺如病毒GⅡ型和札如病毒共同感染3份,占阳性标本的2.46％ (3/122).5岁以下儿童患者标本病毒核酸阳性检出率为24.3％ (109/449),其中诺如病毒GⅡ型的检出率最高;5～18岁患者标本病毒核酸阳性检出率为14.29％(1/7),标本检验结果为诺如病毒GⅡ型;18岁以上患者标本阳性检出率为26.67％ (12/45),其中诺如病毒GⅡ型检出率最高.9、10、11 3个月病毒核酸检出率较高,其中9月份病毒核酸检出率最高为36.51％ (23/63).结论 成都地区人杯状病毒感染性腹泻的病原体以诺如病毒GⅡ型为主,主要在秋冬季节高发,且婴幼儿和成人同样容易感染.     

不同代次MDCK细胞对流感病毒的敏感性比较

目的 比较不同代次的狗肾传代(MDCK)细胞对流感病毒的敏感性差异.方法 选择生长状态及形态良好的、不同代次的MDCK细胞,在相同培养条件下同时接种流感样病例咽拭子标本,观察细胞病变,细胞收获后采用血凝试验测定病毒血凝效价和分离率;以参考流感病毒株测定TCID50值,比较不同代次MDCK细胞对流感病毒的敏感性.结果 3个不同代次的MDCK细胞对流感样病例标本的分离阳性率、血凝效价相比差异无统计学意义,且3者TCID50值相比,相差不超出1个Lg.结论 在相同实验条件以及细胞生长状态和形态良好的情况下,不同代次的MDCK细胞对流感病毒的敏感性无差异.     

2011-2012年四川省急性弛缓性麻痹病例流行病学分析及监测系统运转情况评价

目的了解四川省2011-2012年急性弛缓性麻痹(AFP)病例发病与报告情况,评价该省AFP病例监测系统运转效果。方法利用四川省AFP病例监测系统资料,采用描述流行病学方法进行分析。结果四川省2011-2012年AFP病例监测系统共报告832例,其中AFP病例786例,非AFP病例46例。786例AFP病例中,782例排除脊髓灰质炎(脊灰),1例为临床符合脊灰病例,3例为脊灰疫苗衍生病毒(VDPV)病例。<15岁儿童非脊灰AFP病例年平均报告发病率为2.77/10万,报告病例的县(市、区,下同)155个,占全省总县数85.64%。监测系统48 h内调查率≥99%、合格粪便标本采集率≥94%、粪便标本7 d内送达率≥92%、随访表75 d内送达率≥93%、分离结果 28 d内反馈率≥93%。结论 2011-2012年四川省AFP病例监测系统运转良好、敏感有效,全省各项监测指标均达到世界卫生组织和卫生部的要求。     

四川省2007-2014年急性弛缓性麻痹病例中埃可病毒6型的基因特征分析

目的 描述四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中埃可病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征.方法 对四川省2007-2014年AFP病例中分离到的11株E6进行全VP1区逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)扩增和核酸序列测定,进行序列比对和构建进化树.结果 从2889份AFP病例的粪便标本中分离出11株E6病毒.经测序鉴定为C2基因亚型10株,C4基因亚型1株.来源病例的临床诊断分别为:肠道病毒感染6例,周围神经炎l例,格林巴利综合征2例,肌炎2例.C4亚型与10株C2亚型VP1区核酸序列同源性为83.9％-85.2％,氨基酸同源性为96.5％-97.2％;10株C2亚型VP1区核酸序列同源性为94.0％-100.0％,氨基酸同源性为98.9％-100％.结论 2007-2014年四川地区AFP病例中分离到的E6为C2和C4基因亚型,其中以C2基因亚型为主.     

2006-2020年四川省急性弛缓性麻痹病例中柯萨奇B组病毒的基因特征分析

目的 了解2006-2020年四川省急性弛缓性麻痹(acute flaccid paralysis,AFP)病例中各血清型柯萨奇B组病毒(Coxsackie virus B,CVB)的时空分布情况及基因特征,探索CVB在四川省的传播动态.方法 对AFP病例标本进行细胞分离培养,血清学鉴定,全VP1基因序列的测定及同源性...     

四川省木里县1株C/D基因型重组乙型肝炎病毒基因组序列分析

目的 分析四川省木里县1株乙型肝炎病毒基因组特征.方法 从HBsAg阳性的血清标本11B18中提取病毒DNA,经多聚酶链反应和核苷酸片段测序后,用Mega4软件和Simplot软件做进化树分析和重组分析.结果 S基因和C基因核苷酸序列进化树分析显示11B18分别属于D基因型和C基因型,全基因组核苷酸序列进化树分析显示此株与C1基因亚型参考株在同一进化分枝上;重组分析证实此株为C/D基因型重组株,与D基因型的重组位点大约在nt140～nt740.结论 与我国西部地区的CD1和CD22种C/D基因型重组株比较,11B18属于C1基因亚型,其与D基因型的重组位点也有差异.     

四川省甲型H1N1流感病毒血凝素基因特性和抗原性分析

目的 了解四川省甲型H1N1流感病毒的抗原性和血凝素(HA)基因的变异情况.方法 对四川省2009-2011年分离的流感病毒采用单项血凝抑制试验鉴定毒株型别,在此基础上选取分离自中国内地首发甲型H1N1流感病例、首起甲型H1N1流感疫情、甲型H1N1流感死亡病例以及哨点医院流感样病例标本的甲型H1N1流感病毒株共计11株,进行HA基因核苷酸序列测定并推导出其氨基酸序列,然后进行基因特征分析.结果 与中国代表株A/四川/SWL1/2009(H1N1)相比,2009-2011年四川省甲型H1N1流感毒株单项血凝抑制效价均无4倍以上差异,与疫苗株A/California/7/2009(H1N1)相比,HA氨基酸具有高度同源性(96.6％ ～99.4％).结论 四川省甲型H1N1流感病毒的HA基因特性和抗原性没有发生明显变异.