濮阳市首例发热伴血小板减少综合征病例流行病学调查及基因组特征分析

目的报告濮阳市首例发热伴血小板减少综合征病例, 通过流行病学调查和基因测序了解其流行病学特点并分析濮阳市首例新型布尼亚病毒(severe fever with thrombocytopenia syndrome virus, SFTSV)分离株S、M、L片段分子特征。方法采用流行病学调查方法, 分析流行病学特点, 用Vero细胞分离病毒, 提取SFTSV核酸, 实时荧光定量PCR进行检测;构建多重PCR法对病毒核苷酸序列进行特异性扩增, 利用二代测序仪进行全基因组测序, DNAStar、MEGA11等生物信息软件进行同源性分析, 构建系统进化树。结果流行病学调查结果显示, 患者及其密切接触者14 d内均无旅居史, 有野外作业史, 无蜱虫叮咬史;血液样本检测SFTSV核酸阳性;SFTSV基因型为E型, 其S、M、L片段基因均为E型, 与GenBank中已知的SFTSV核苷酸序列进行比对, 核苷酸序列同源性分别为94.8%～99.9%、94.0%～99.8%、95.7%～99.7%。结论该患者确诊为濮阳市首例SFTSV感染引起的发热伴血小板减少综合征, 与河南近年来分离株基因分型差异较大,...     

2022年河南省两起发热伴血小板减少综合征聚集性疫情流行病学及病原学调查

调查河南省信阳市2022年连续两起发热伴血小板减少综合征聚集性疫情, 分析其发生原因、传播方式、影响因素及病毒遗传变异特征。根据病例定义展开病例搜索, 采集病例、家属、邻居血液样本和生物媒介样本, 进行逆转录-聚合酶链反应检测发热伴血小板减少综合征病毒(SFTSV)核酸。通过全基因组测序, 构建系统进化树, 分析核苷酸同源性和氨基酸变异位点。两起聚集性疫情涉及首发病例2例, 续发病例10例, 均涉及家庭聚集性病例, 其中9例续发病例曾直接接触首发病例血液, 判定直接接触血液是两起聚集性疫情的主要危险因素。经基因组测序分析发现, 本次聚集性疫情SFTSV基因型为A型, 与该地区既往流行株亲缘关系近, 病例的SFTSV核苷酸序列高度同源, 共9个编码区氨基酸突变位点, 不排除其变异位点对疫情暴发可能产生影响。     

2011-2020年河南省流行性乙型脑炎流行病学特征

目的 分析河南省2011-2020年流行性乙型脑炎（乙脑）的流行病学特征，为河南省制定乙脑防控策略提供科学依据。方法 收集《中国疾病预防控制信息系统》中2011-2020年河南省乙脑发病数据，进行描述性流行病学分析；应用Joinpoint 4.9.0.0软件计算乙脑发病率的年度变化百分比(annual percentage change,APC)及其95%置信区间（95%CI）以分析发病率的变化趋势。结果 2011-2020年河南省共报告乙脑819例，年均发病率为0.09/10万，其中男性441例，年均发病率为0.09/10万，女性378例，年均发病率为0.08/10万，发病率男性高于女性(P<0.05);0～14岁人群455例，占55.56%；农民、散居儿童及学生为主要发病人群，分别占发病总数的32.84%、27.84%、23.57%。报告死亡34例，总病死率4.15%。发病高峰在8-9月，占总发病数的83.39%。十年间在乙脑高发的8月APC为-21.09%(95%CI:-33.38%～-6.53%,P<0.05)，呈逐年下降趋势。报告病例主要分布在信阳市、洛阳市、南阳...     

河南省一起发热伴血小板减少综合征聚集性疫情的流行病学和病原学特征

目的 了解2022年河南省一起发热伴血小板减少综合征（SFTS）聚集性疫情的流行病学和病原学特征，为制定防控策略提供科学依据。方法 制定病例定义，开展病例搜索，对病例和密切接触者进行流行病学调查，应用回顾性队列研究分析危险因素。采集病例和密切接触者血液，应用荧光定量RT-PCR检测发热伴血小板减少综合征病毒（SFTSV）核酸，对分离到的病毒株扩增S片段基因，进行同源性分析，构建系统进化树。结果 该起疫情共涉及病例6例，2例死亡，病死率为33.33%。首发病例3月12日发病，3月20日死亡，3月28日至4月4日参与丧事的4名亲属和1名邻居陆续发病，潜伏期为8～14 d。首发病例死亡后，5例续发病例均直接接触过首发病例血液。暴露于血液组和非暴露于血液组的罹患率分别为83.33%(5/6)和0.00%(0/11)，差异有统计学意义（P<0.05）。6例病例从发病至诊断的时间间隔为2～8 d，中位数为4.5 d。所有病例SFTSV核酸检测均为阳性，分离到的3株病毒株核苷酸同源性为99.9%～100.0%，遗传进化分析显示，均属于A基因型。结论 该起SFTS聚集性疫情是由SFTSV A基因...     

CVA6高通量测序方法的建立及应用

目的 建立柯萨奇病毒A组6型（Coxsackievirus A6,CVA6）基于多重PCR扩增的高通量测序方法，并应用于CVA6的基因进化研究。方法 利用PRIMER5.0设计7对CVA6型特异性引物，在同一体系构建并优化多重PCR高通量测序方法，并应用该方法对河南省39份CVA6标本开展基因测序，分析核苷酸氨基酸同源性和构建系统进化树。结果本研究成功建立基于多重PCR的CVA6高通量测序方法，基因特征分析表明此次河南省检出的CVA6流行亚型为D3a亚型，与山东、湖南、浙江、云南、辽宁、江西等地区的毒株亲缘关系较近。结论 本研究建立CVA6的高通量测序方法特异性强，扩增效率高，为CVA6型基因型遗传特征和变异规律提供了技术支持，可应用于CVA6的同源性分析及基因进化研究分析。