云南省HIV-1 CRF01AE毒株分子网络分析

目的了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的分子网络特征及相关影响因素。方法收集2018—2021年云南省耐药监测数据库中HIV/AIDS患者的人口学资料, 采集患者血浆, 逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定, 选择最适基因距离, 基于基因型为CRF01_AE的序列构建分子网络。结果通过序列测定共获得967余CRF01_AE亚型毒株序列, 在1.75%最适基因距离阈值下, 共有320条序列进入网络, 入网率为33.1%, 共鉴别出84个簇。在地区分布网络中形成1个多地区连接的簇, 1个以昭通为主的簇, 1个以红河为主的簇以及5个以文山为主的簇。网络中75.8%异性传播的男性与其他异性传播的男性连接, 其次与异性传播的女性连接(54.1%)。66.7%的男男同性性行为人群(MSM)之间存在潜在传播关联。入网影响因素分析结果显示, 与昆明市比较, 楚雄州、大理州、德宏州、红河州、临沧市、普洱市、文山州、玉溪市以及昭通市的HIV/AIDS患者更容易进入网络。年龄≥50岁人群较<25岁...     

云南省HIV-1 CRF01_AE毒株基因型耐药研究

目的 了解云南省HIV-1 CRF01_AE毒株的流行分布及基因型耐药情况。 方法 收集2018—2021年云南省抗病毒治疗失败的HIV/AIDS患者的人口学资料,采集患者血浆,逆转录聚合酶链反应扩增HIV-1 pol基因蛋白酶和逆转录酶区并进行序列测定,对基因型为CRF01_AE的序列进行耐药情况分析。结果 通过基因型耐药检测共获得967例亚型为CRF01_AE序列,其中男性682例（占70.5%）,耐药509例,耐药率为52.6%,异性性传播813例（占84.1%）,同性性传播95例（占9.8%）。同性性传播的耐药率最高,为65.3%;治疗时长<12个月的耐药率最低,为35.9%,36~<48个月耐药率最高,为58.1%。核苷类反转录酶抑制剂（NRTIs）耐药率为33.9%,非核苷类反转录酶抑制剂（NNRTIs）的耐药率为48.5%,蛋白酶抑制剂（PIs）的耐药率较低为1.3%。NRTIs类药物中阿巴卡韦（ABC）、恩曲他滨（FTC）和拉米夫定（3TC）耐药率较高,分别为为32.9%、32.4%和32.4%;NNRTIs类药物中奈韦拉平（NVP）和依非韦仑（EFV）耐药率较高,分别为47.6%和47.5%,均以高度耐药为主。一线治疗方案耐药率56.2%高于二线治疗方案耐药率29.5%,差异有统计学意义（P<0.001）。NRTIs耐药突变位点中,以M184V/I突变位点为主,突变率为30.0%;NNRTIs耐药突变位点中,以K103N/Q/S突变位点为主,突变率为28.1%;PIs耐药位点突变率相对较低,主要的耐药突变位点是L33F,突变率为3.7%。结论 云南省抗病毒治疗失败亚型CRF01_AE的患者耐药率有所降低,但部分地区及人群的耐药率仍较高,应加强对重点地区和人群的管理,加强耐药监测,对治疗失败的患者及时掌握耐药情况,合理调整治疗方案。     

云南省64例HIV-1独特重组毒株重组特征及流行病学分析北大核心CSCD

目的 调查云南省64株HIV-1独特型重组毒株的重组特征及流行病学特征。方法 选择2017年云南省传染病医院样本库HIV-1感染者和艾滋病患者血浆样本,采样集时患者抗病毒治疗时间持续大于半年,同时收集其人口学信息,运用RT-PCR方法扩增gag-pol区半分子基因序列,使用RIP和jpHMM软件进行重组分析,采用MEGA6.06软件共同构建Neighbor-joining系统进化树对该毒株的同源性关系进行分析。结果 64例独特型重组毒株主要以男性为主,感染途径以异性性传播和静脉药瘾为主,样本来源于云南省11个州市,主要来自于昆明、红河、德宏、临沧、大理和保山。64例独特型重组毒株主要有4类重组模式,分别是B/C重组、01_AE/B/C重组、01_AE/B重组和01_AE/C重组,分别占到70.31%、18.75%、7.81%和3.13%,其中4种不同类型的重组模式在不同年龄段的差异有统计学意义,64株毒株在系统进化树上分别形成不同的进化簇。结论 云南省近年来重组毒株占比逐年增加,其重组的类型和模式比较复杂,对疾病的防控带来较大的困难,这提示应密切监测重组毒株流行趋势变化,同时加强对这一特殊人群的管理,以减少独特型重组毒株的传播。     

云南省住院HIV/AIDS患者合并伤口感染的病原菌分布特点

目的 分析云南省住院HIV/AIDS患者合并伤口感染的病原菌分布特点,为临床诊疗提供依据。方法 回顾性分析云南省传染病医院2016—2020年住院HIV/AIDS患者分泌物或脓液标本检出阳性的294名患者的临床资料。结果 294份病例中分离出病原菌357株,其中革兰阴性杆菌（G^-b）123株,占比34.5%,以大肠埃希菌（15.4%）、肺炎克雷伯菌（3.9%）、铜绿假单胞菌（3.6%）为主;革兰阳性杆菌（G⁺b）14株,占比3.9%;革兰阳性球菌（G⁺c）108株,占比30.3%,其中凝固酶阳性的金黄色葡萄球菌44株（12.3%）,凝固酶阴性葡萄球菌以表皮葡萄球菌（4.2%）、溶血葡萄球菌（2.8%）为主;真菌37株,占比10.4%,主要为白色假丝酵母（5.9%）;分枝杆菌75株,占比21.0%。其中结核分枝杆菌41株（11.5%）,非结核分枝杆菌34株（9.5%）。294例HIV/AIDS患者中有52例为混合感染,占比17.7%。不同标本来源中G⁺c、G^-b、分枝杆菌和混合感染四类病原菌的分布差异有统计学意义（P<0.05）,不同CD4⁺T淋巴细胞计数之间分枝杆菌的分布差异有统计学意义（P<0.05）。不同年龄段的患者CD4⁺T淋巴细胞水平差异有统计学意义（P<0.05）,标本来源于术后切口与来源于其他部位的CD4⁺T淋巴细胞水平差异有统计学意义（P<0.05）。结论 HIV/AIDS患者易合并各种病原菌的伤口感染,对该类患者应及时送检分泌物或脓液培养,特别是对CD4⁺T淋巴细胞数量低的患者应及时送检,从而对患者进行有针对性的治疗,改善患者的预后。     

HIV/AIDS住院患者伤口感染的细菌分布及药物敏感性分析

目的 分析云南省HIV/AIDS患者合并伤口感染的细菌分布及药敏情况，为临床诊疗提供依据。方法 回顾性分析云南省传染病医院2018—2021年住院HIV/AIDS患者合并伤口感染的细菌分布及药敏情况，采用Whonet 5.6软件导出数据后用SPSS 26.0软件对耐药数据进行统计描述，检验水准α=0.05。结果 HIV/AIDS住院患者合并伤口感染男性占比最高（73.6%），年龄以41～60为主（52.8%），民族以汉族为主（71.9%），农民占比最高（84.3%）;222株病原菌中革兰阴性杆菌（G-b）占比最高，其中以大肠埃希菌（23.0%）、肺炎克雷伯菌（6.8%）及铜绿假单胞菌（5.4%）为主；革兰阳性球菌（G+c）主要为金黄色葡萄球菌（17.1%）、溶血葡萄球菌（5.4%）和表皮葡萄球菌（4.1%）。大肠埃希菌对氨苄西林耐药率最高为94.0%，其次为头孢唑啉和复方新诺明分别为70.0%和68.6%；肺炎克雷伯菌对氨苄西林耐药率为100.0%；铜绿假单胞菌对复方新诺明、头孢曲松、头孢唑啉和氨苄西林耐药率为100.0%；金黄色葡萄球菌耐药率最高为青霉素86.8%，其次为克林霉素和红...