顺德地区不同性别人群的肝癌影响因素分析

  目的  探讨顺德地区不同性别人群肝癌的影响因素,并了解男性肝癌影响因素的交互作用。  方法  应用交互效应超额相对危险度（relative excess risk of interaction,RERI）等指标评价两因素的交互作用,应用分类回归树（classification and regression tree,CART）模型评价多因素的交互作用。  结果  共纳入1 037例男性病例、1 069男性对照以及166例女性病例、185例女性对照。乙型肝炎病毒（hepatitis B virus,HBV）慢性感染和肝癌家族史均与男女性肝癌发病风险增高有统计学关联（均有P<0.001）。男性中,HBV慢性感染与吸烟、饮酒以及吸烟与饮酒之间存在正相加交互作用,其中HBV慢性感染与吸烟的RERI为121.90（95%CI:52.85%~190.95%）。运动与HBV慢性感染、吸烟之间有负相加交互作用。CART分析表明吸烟且饮酒的HBV慢性感染男性的肝癌风险最高。  结论  HBV慢性感染和肝癌家族史是男女性肝癌的共同危险因素。HBV慢性感染、吸烟和饮酒协同促进男性肝癌发病。运动可拮抗HBV慢性感染和吸烟的促肝癌效应。     

基于GWAS的乙肝相关肝癌关联lncRNA SNPs生物信息学分析

目的 利用生物信息学方法挖掘乙肝相关肝癌相关的lncRNA SNPs,为肝癌生物标志物筛选及致病机制研究提供线索和方向。方法 通过SNAP工具获取GWAS识别的乙肝相关肝癌关联SNPs的易感区域。结合dbSNP和lncRNASNP等数据库匹配易感区域上的lncRNA SNPs,并采用rVarBase、HaploReg等数据库对SNPs进行功能注释。利用TCGA数据库的乙肝相关肝癌基因表达数据进行lncRNA的差异表达分析。结果 基于GWAS和生物信息学工具共挖掘9个具有潜在功能的lncRNA SNPs(lnc-RP11-150O12.3 rs1008547、rs11776545、rs2275959、rs2298320 rs2298321和lnc-ACACA-1 rs7221955、rs9891142、rs9896574、rs9908998)。功能注释结果表明所有SNPs均位于染色质交互区域或转录因子结合位点;肝组织的组蛋白修饰标识显示多数SNPs位于启动子区或增强子区,且为DNase超敏感位点,可破坏转录因子的结合基序;其中3个SNPs在HepG2细胞系中被发现影响蛋白质结合。此外,两个lncRNAs在乙肝相关肝癌患者癌组织中的表达均高于癌旁组织。结论 lnc-RP11-150O12.3和lnc-ACACA-1上的9个SNPs具有潜在生物学功能,在乙肝相关肝癌的发生和发展中可能发挥重要作用。     

HOTAIR遗传变异及基因-环境交互作用 与肝癌临床特征的关联性分析

目的探讨长链非编码RNA HOX转录反义RNA(LncRNA HOTAIR)遗传变异及基因-环境交互作用与肝癌预后相关临床特征的关系。方法选取广东省南方医科大学顺德医院2010年10月-2016年10月收治的原发性肝癌新发患者923例,采用TaqMan荧光定量PCR技术检测HOTAIR rs17105613 T C、rs12427129 C T和rs3816153 G T基因型。采用χ~2检验分析肝癌临床特征分布的差异,应用logistic回归模型分析HOTAIR遗传变异对肝癌TNM分期、门静脉癌栓和发病年龄的影响。结果校正环境因素后,隐性遗传模式下rs17105613和rs3816153与肝癌TNM分期均有统计学关联(P值均0. 05),且rs12427129与吸烟对肝癌发病年龄存在统计学意义的相乘交互作用(P=0. 029)和临界统计学意义的相加交互作用(P=0. 092)。结论 HOTAIR rs17105613和rs3816153可能与肝癌TNM分期有关,rs12427129与吸烟交互作用可能对肝癌发病年龄有影响,因此HOTAIR遗传变异可能促进肝癌细胞的侵袭和转移。     

STAT4遗传变异与原发性肝癌病理特征的关联

  目的  探讨STAT4遗传变异及其与运动的交互作用对原发性肝癌患者病理特征的影响。  方法  在601例新发肝癌患者中,采用多因素Logistic回归分析模型分析rs7574865、rs897200、rs1031507与肿瘤淋巴结转移（tumor node metastasis,TNM）分期、门脉癌栓的关联。应用相乘交互项和"Delta"法分别评价相乘和相加交互作用。  结果  在显性模型下,rs897200变异与患者首诊时晚期的风险存在临界统计学关联（调整OR=0.64,95%CI:0.41~1.01,P=0.057）。携带rs1031507 CC+AC基因型的患者晚期风险低于AA基因型患者（调整OR=0.63,95%CI:0.40~0.99,P=0.046）。叉生分析中,与携带rs897200 CT+CC基因型且有运动的患者相比,缺乏运动的TT基因型患者晚期风险增高（OR=3.71,95%CI:1.97~6.98,P < 0.001）。类似,rs1031507AA基因型与缺乏运动共同升高患者的晚期风险（OR=3.78,95%CI:2.01~7.13,P < 0.001）。但未观察到rs897200、rs1031507与运动存在影响肝癌分期的统计学交互作用。  结论  STAT4 rs897200和rs1031507遗传变异的独立效应及与运动的联合效应影响肝癌患者首诊时的临床分期。