啮齿动物携带冠状病毒及其跨种传播研究进展

2019冠状病毒病(COVID-19)的大流行,引起了公众对冠状病毒前所未有的关注。鼠类等啮齿动物是许多病毒的天然宿主和储备库,其中也包括冠状病毒。啮齿动物的种类繁多,数量庞大,通常生活在家畜或人类附近,这增加了通过密切接触将病毒传播给人类的潜在风险。本文主要就冠状病毒的分类、基因组、结构以及啮齿动物所携带的冠状病毒流行情况进行系统阐述,并分析其跨种传播的风险,以深入了解啮齿动物携带的冠状病毒,为预防新发冠状病毒的发生和传播提供依据。     

多位点基因序列分型在沙门菌鉴定中的应用

目的探讨多位点基因序列分型方法在沙门菌分型鉴定研究中的应用,初步掌握广州地区沙门菌多位点基因序列分型数据。方法选取沙门菌7对保守管家基因aroC、dnaN、hemD、hisD、purE、sucA、thrA作为研究靶标,对其进行扩增、测序及序列分析。结果 41株沙门菌分离株有8个血清群和14个ST型,食品来源沙门菌菌株的血清群有7个,ST型为10个,患者来源菌株血清群为5个,ST型为10个,实验中还发现2个新的ST型。结论沙门菌血清学分群结果与MLST分型结果的对应关系密切,很多ST型菌株的血清群固定,相同血清群菌株也有较固定的ST型,因而,可运用多位点基因序列分型方法对沙门菌进行分型鉴定。     

广州市2006—2021年人感染链球菌病流行特征分析

目的 分析广州市人感染猪链球菌病流行病学特征，为有针对性开展人感染猪链球菌病防控工作提供依据。方法 开展流行病学个案调查，采集病例的脑脊液或血液标本进行细菌培养与分离、生化鉴定、血清分型和PCR检测。结果 2006年至2021年，广州市共累计报告75例人感染猪链球菌病例，其中，本地病例46例，输入病例29例。报告了1例死亡病例，病死率为1.33%。以夏秋季多发，占比74.67%，病例年龄分布中位数为58（47，66）岁，患者以男性为主，男女比例为3.17[DK]∶1；发病人群的职业分布为来自屠宰场或从事猪肉零售相关工作、离退人员、家务及待业、农民、餐饮食品业、工人；职业和生活接触暴露占56.00%，暴露前手部有伤口病例占28.57%；猪链球菌的血清型以2型为主，占比76.60%。结论 广州市人感染猪链球菌的防控形势较为严峻，需完善联防联控机制，加强与动物防疫部门的交流与协作，提高疾病的监测预警能力。     

次氯酸钠消毒口腔综合治疗台水路的效果评价

目的 评价口腔综合治疗台独立水源水路经525 mg/L次氯酸钠消毒前、后水样微生物种类和总菌落数的差异.方法 分别选择10台独立水源口腔综合治疗台为实验组和对照组.采集水路经525 mg/L次氯酸钠消毒前、后治疗台三用枪水样,计算总菌落数,定性检测水样中微生物种类与条件致病菌.利用SPSS 10.0统计软件进行两样本t检验、配对t检验和单因素方差分析,α=0.05.结果 (1)525 mg/L次氯酸钠消毒前、后口腔综合治疗台总菌落数几何均值分别为2.23×103和0 CFU/ml(P<0.05),差异有统计学意义;(2)消毒前、后微生物种类分别为8种和3种:消毒前检测出铜绿假单胞菌(检出率为36%),未检出大肠埃希氏菌和嗜肺军团菌;消毒后均未检出.结论 口腔综合治疗台水路存在微生物污染,并且包含条件致病菌铜绿假单胞菌,存在引起医患医院感染的潜在风险.525 mg/L次氯酸钠消毒剂对口腔综合治疗台水路具有良好消毒效果,能有效杀灭水样中微生物,可用于独立水源口腔综合治疗台水路的消毒处理.     

广州市市售食品沙门菌污染状况及耐药性分析

目的按国家食源性致病菌监测项目要求,对广州市市售食品的沙门菌污染状况以及对抗生素的药物敏感性进行调查。方法采集广州肉菜市场、大型超市、饭店提供的肉、水产品、凉拌菜及沙拉冷饮食品,按国标方法进行沙门菌检测,并用纸片法进行抗生素敏感性测定。结果 413份食品中有41份检出沙门菌,检出率为9.9%,其中生肉类食品的污染状况最为严重,检出率达18.8%,其次是生吃水产品为14.0%,熟肉和凉拌菜较低分别为4.5%和3.9%。在检出的17种血清型中德尔卑沙门菌比例最高为29.3%。对16株抗生素的药敏试验结果显示,对四环素耐药率最高,达61.0%;并且发现有6株多重耐药菌株以及对头孢类耐药的菌株。结论广州市市售食品中存在沙门菌污染,并存在有多重耐药和对头孢类抗生素耐药的现象。     

胎儿弯曲菌的感染现状、检测方法和分子分型的研究进展

胎儿弯曲菌是可导致人类肠外感染(菌血症、脑膜炎、关节炎等)、牲畜流产不育的人兽共患传染病病原体。胎儿弯曲菌在牛羊及爬行动物中较为普遍,对人类感染较少,多感染本身具有基础性疾病的患者。可以利用生化反应、核酸技术的方法检测胎儿亚种和性病亚种,并发现42 ℃生长实验存在争议性。对胎儿弯曲菌的4种分子分型方法:随机扩增多态性分析(RAPD)、扩增片段长度多态性分析(AFLP)、脉冲场凝胶电泳(PFGE)和多位点序列分析(MLST)各有其优缺点及应用范围。     

广州某河段河水卫生状况研究

目的研究天然河道河水的卫生状况,探讨游泳最佳时点,筛选河水卫生状况评估的参数,为广州建立天然游泳场提供科学依据。方法于2006年3月至2008年7月每月1次,在每年6-7月相应增加次数(3次)对广州某天然河道上游、前后航道共13个点,按《游泳场所卫生标准》GB9667-1996、《工业企业设计卫生标准》(TJ36-79)表3检测项目、《地表水环境质量标准》GB3838-2002进行监测与评价,并参考《生活饮用水卫生标准》GB5749-2006。结果主要不合格指标是粪大肠菌群、氨氮、溶解氧、耗氧量、五日生化需氧量、石油类、磷酸盐,其中检出5宗霍乱弧菌,贾第鞭毛虫卵囊和隐孢子虫卵囊的检出率达97.4%和11.5%,粪大肠菌群合格率为0,溶解氧合格率为3.0%,氨氮合格率为4.8%。丰水期水质比枯水期水质污染物含量低。后航道相应的污染物浓度也较低,水质明显比西航道、前航道好。结论该河道河水的污染较严重,应从根本上做好截污、改水工作,降低有机物和生物性污染,采取共同治理等改善水质的措施及做好个人防护才能进行游泳。     

广州市2012年腹泻病人沙门菌血清学、耐药及PFGE分型分析

目的研究引起患者感染性腹泻的沙门菌的血清学分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自广州市8所哨点医院腹泻病人粪便的沙门菌,用血清凝集实验确定血清型,用K-B纸片法检测对12种抗生素的敏感性,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌进行分子分型。结果从分离的205株沙门菌中,鼠伤寒沙门菌是主要的血清型,占43.4%,其次是肠炎沙门菌,占13.7%。在抗生素敏感性测试中,磺胺复合物耐药率最高,达66.8%;其次是氨苄西林,65.4%;对头孢吡肟和头孢噻肟也出现了耐药,分别为9.8%和9.3%。PFGE分型结果显示71株鼠伤寒沙门菌可分为47个PFGE型,28株肠炎沙门菌可以分为17个PFGE型。结论本研究表明引起腹泻沙门菌血清型以鼠伤寒和肠炎为主。PFGE分型较为分散。值得注意的是,对头孢类抗生素出现较高的耐药率,应当引起重视。     

口腔综合治疗台水路生物膜观察与消毒干预

目的评价口腔综合治疗台独立水源水路经次氯酸钠消毒前、后生物膜结构和菌落数情况。方法选择10台独立水源口腔综合治疗台,采集经525 mg/L次氯酸钠消毒水路前、后治疗台工作端水管内壁生物膜,计算总菌落数,并应用激光共聚焦扫描显微镜和扫描电镜观察生物膜结构。结果口腔综合治疗台水路消毒前、后生物膜菌落数几何均值分别为1.7×103 CFU/cm2和0 CFU/cm2,两者比较,差异有显著性（t=12.03,P=0.02）。激光共聚焦扫描显微镜及扫描电镜观察结果显示,消毒前口腔综合治疗台水路内壁存在生物膜,呈特征性结构,杆菌与球菌分布于基质中;消毒后,其生物膜结构受到一定程度破坏,但基质仍然存在。结论口腔综合治疗台水路存在微生物污染,其内壁有生物膜,并含有高浓度细菌,存在引起医患医院感染的潜在风险。525 mg/L的次氯酸钠消毒剂对口腔综合治疗台水路具有较好的消毒效果,可常规应用于临床独立水源口腔综合治疗台水路的消毒处理。     

广州市首例利齐菲尔德沙门菌食物中毒的病原学分析

目的对2011年7月广州市发生的一起细菌性食物中毒进行病原学特征分析。方法对送检病人粪便、厨工肛拭及食物等样品进行荧光PCR检测和分离培养,对分离株进行生化鉴定,血清分型、脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型和药敏分析。结果从病人粪便、肛拭和厨房抹布共分离到18株利齐菲尔德沙门菌,为相同的PFGE型别,药敏结果显示菌株对实检和定阿米卡星,庆大霉素及妥布霉素耐药,对头孢噻肟、亚胺培南、甲氧苄啶/磺胺甲恶唑等15种抗生素均敏感。结论实验判定这是一起由同一克隆型的利齐菲尔德沙门菌污染厨房环境所引起的食物中毒事件,PFGE分型法为暴发溯源提供分子流行病学证据和支持。