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1.
目的 将铁死亡与机器学习相结合,建立一种基于遗传算法的反向传播网络(GA-BPNN)模型,以预测脓毒症患者的28 d存活情况。方法 通过高通量基因表达数据库(GEO)下载脓毒症相关数据。从分子签名数据库(MSigDB)下载与铁死亡相关的基因65个。使用基因集富集分析(GSEA)、基因集变异分析(GSVA)、加权基因共表达网络分析(WGCNA)和蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析筛选脓毒症患者的铁死亡相关基因。同时利用短时间序列挖掘分析(STEM)筛选与脓毒症发展进程相关的基因,并与脓毒症患者铁死亡相关基因取交集,获得脓毒症预后的关键基因。在传统的反向传播网络(BPNN)的基础上,采用遗传算法(GA)优化权值和阈值,建立脓毒症预后预测GA-BPNN模型。结果 脓毒症存活组和未存活组之间铁死亡相关基因集活性差异显著。共筛选出97个脓毒症铁死亡相关基因。同时确定了191个在脓毒症发展进程中显著上调或下调的基因。取交集基因建立脓毒症四基因预测预后GA-BPNN模型。在训练集中经过迭代后训练的均方误差在0.05以下,曲线下面积(AUC)为0.98。为验证GA-BPNN模型的泛化能力和分类效...  相似文献   
2.
徐世茹  陈锐  吴朝阳  马玉花  封顺 《华西医学》2012,(10):1505-1509
目的对尿液特征组分与糖尿病早期肾损害的关系进行了初步探索。方法对2011年12月-2012年5月间28例2型糖尿病组、33例2型糖尿病肾病组及26例健康对照组尿液中尿蛋白含量和几种常见非蛋白氮物质,包括肌酸、尿囊素、肌酐、尿酸和假尿嘧啶核苷的浓度进行测定,采用多种归一化方法对数据进行对比分析,并通过t检验减少高效液相色谱测定的变量信息,保留P〈O.05的检出峰进行主成分分析,获得分类结果。结果采用体积归一化方法,发现健康对照组尿液中肌酸、尿囊素和尿酸的含量与2型糖尿病组和糖尿病肾病组相比,差异均有统计学意义(P〈0.05),2型糖尿病组尿液中尿蛋白的浓度与糖尿病肾病组相比,差异有统计学意义(P〈0.05)。结论通过肌酸、尿囊素、尿酸和尿蛋白的联合测定为肾脏损伤程度的监测及疗效观察提供依据,为2型糖尿病患者肾功能损坏的早期预防与诊断进行初步判断提供了新的方法。  相似文献   
3.
4.
亚叶酸钙消旋体在牛血清白蛋白手性柱上的拆分   总被引:4,自引:0,他引:4  
目的:寻找一种快速、有效的分离定量亚叶酸钙(LV)的方法。方法:采用高效液相色谱法,利用采用新方法合成的牛血清白蛋白手性固定相,以50 mmol·L~(-1)磷酸盐缓冲溶液(pH 6.5)为流动相对其进行拆分。结果:[6S]-、[6R]-LV分别在4.46 min和7.59 min时出峰,全过程可在10 min内实现基线分离,其分离度α=2.10,Rs=2.78。结论:流动相pH值、缓冲溶液浓度以及温度对[6S]-LV、[6R]-LV的容量因子都有较大的影响,并初步推测[6S]-、[6R]-LV与牛血清白蛋白之间是单个位点的作用。  相似文献   
5.
目的 采用网络药理学研究柴胡蚤休汤治疗肝细胞癌的关键靶点,并构建风险评分模型用于解决肝癌的预后问题。方法 通过网络药理学、LASSO COX建模和体外细胞实验方法,探讨柴胡蚤休汤治疗肝细胞癌的主要药用活性成分、作用分子靶点及相关基因预后能力。结果 柴胡蚤休汤可能通过作用于ESR1、G6PD、AKR1C3、NQO1、CDK1等关键靶点和p53信号通路发挥治疗肝细胞癌的作用。这些关键靶点与活性成分分子对接的结合性良好。构建治疗靶点风险评分模型表明:其具有良好的预后效果和独立预后能力。柴胡蚤休汤对体外人肝癌细胞HepG2的细胞毒性具有浓度和时间依赖,且能够显著抑制G6PD、CDK1核心靶点的表达。结论 柴胡蚤休汤可通过调控G6PD、CDK1关键靶点和p53信号通路治疗肝细胞癌,基于G6PD、CDK1关键靶点建立的新型风险评分模型对肝细胞癌具有良好的独立预后功能。可为后续研究提供新思路。  相似文献   
6.
目的建立同时分析酒石酸美托洛尔、富马酸比索洛尔和阿替洛尔的气相色谱-质谱联用法。方法样品经N,O-双(三甲基硅烷)三氟乙酰胺衍生化后,用气相色谱-质谱联用仪进行分离与分析。结果3种心脏病常用药物酒石酸美托洛尔、富马酸比索洛尔和阿替洛尔的检出限分别为16.73、33.58、21.46mg/L,对应的线性范围均为0.05—1.00g/L,回收率为91.2%、98.8%、88.4%。结论建立了同时分离分析3种心脏病药物的方法,该方法样品处理简便,色谱分离完全,结果准确可靠,为后期心脏病患者尿液中的药物代谢组学研究提供了基础。  相似文献   
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