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1.
目的:利用整合生物信息学手段分析EZH2(enhancer of zeste 2 polycomb repressive complex 2 subunit)基因在乳腺癌中的表达及其临床意义。方法:在肿瘤基因组计划数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中下载乳腺癌与正常乳腺组织的基因表达谱数据,进一步利用Ualcan数据库和人类蛋白质图谱(The Human Protein Atlas)数据库数据分析EZH2基因在乳腺癌中的mRNA及蛋白表达水平。利用Ualcan数据库分析EZH2基因的甲基化水平并筛选其共表达基因;对EZH2及其共表达基因进行GO(Gene Ontology)富集分析和KEGG通路分析以明确EZH2的共表达基因参与的生物学过程和相关通路;使用Kaplan-Meier生存分析法分析乳腺癌患者的总生存期、无病生存期、无远处转移生存期及后进展生存期与EZH2基因表达水平的关系并绘制生存曲线。结果:与正常乳腺组织相比,EZH2在乳腺癌组织中的mRNA及蛋白表达量明显升高。而EZH2的甲基化程度在乳腺癌组织与正常乳腺组织中则差异不明显。同时,EZH2的表达水平与年龄、乳腺癌分期及乳腺癌分子分型等因素密切相关。EZH2及其共表达基因主要参与了核碱基的调节、细胞周期调控、染色体分离、DNA复制、DNA修复等生物学过程,并参与了细胞周期、DNA 复制、M/G1期转化、M期、有丝分裂前中期、ATM通路等生物学通路。此外,EZH2基因表达水平高的乳腺癌患者的总生存期、无病生存期、无远处转移生存期及后进展生存期均明显低于EZH2基因低表达的患者。结论:EZH2在乳腺癌组织中高表达并且与患者不良预后密切相关。同时,EZH2的表达水平与乳腺癌的发生、发展密切相关。EZH2在乳腺癌诊断、靶向治疗及预后分析中具有重要的临床意义。  相似文献   
2.
目的:采用Meta分析方法系统性评估贝伐单抗联合紫杉类化疗药物对HER-2阴性转移性乳腺癌的治疗效果。方法:电子计算机检索自建库至2020年12月发表的有关贝伐单抗联合紫杉类药物治疗HER-2阴性转移性乳腺癌的文章。根据制定的纳入和排除标准对文献进行筛选以及质量评价,然后提取研究数据。选择PFS、OS、ORR以及1年生存率(1y SR)作为主要疗效结局指标,采用Stata软件对合并效应量风险比率(hazard ratio,HR)和相对危险度(relative ratio,RR)进行Meta合并分析,按照研究类型进行亚组分析。发表偏倚利用漏斗图法以及Egger检验进行定性和定量评估。结果:初检文献849篇,最终纳入9篇文献进入Meta分析,研究共包含患者6 242例,其中贝伐单抗联合紫杉组3 555例,紫杉单药组2 687例。文献质量评价均为中等或高等质量。Meta合并结果显示,贝伐单抗联合紫杉方案对比紫杉单药能够显著提升PFS(HR=0.65,95%CI 0.55~0.77,Z=5.01,P<0.001)、ORR(RR=1.59,95%CI 1.44~11.74,Z=9.61,P<0.001)以及1y SR(RR=1.11,95%CI 1.08~1.15,Z=6.26,P<0.001),但在OS方面的优势不具有显著统计学意义(HR=0.83,95%CI 0.69~1.00,Z=2.0,P<0.045)。结论:贝伐单抗联合紫杉类治疗方案,相比紫杉单药化疗方案可以明显提升PFS、ORR以及1年生存率,但并不能显著增加OS。因此,在临床实践中,应当谨慎选择化疗方案。  相似文献   
3.
目的:探究组蛋白甲基转移酶G9a 在胃癌组织中的表达及其与预后的相关性,并观察G9a 抑制剂对胃癌细胞增殖和凋亡的影响。方法:通过Kaplan-Meier Plotter 和Oncomine 数据库分析G9a 在胃癌组织中的表达水平及其与预后的相关性。选用人胃癌细胞株SGC-7901 和MKN-45 为研究对象,Western blotting 方法检测细胞中G9a 蛋白表达水平,以G9a 抑制剂BIX01294处理胃癌细胞,观察细胞形态变化,CCK-8 法和集落形成实验检测胃癌细胞增殖能力和集落形成率的变化,流式细胞术检测细胞凋亡的变化。结果:G9a 在胃癌组织中高表达(P<0.01),其高表达与预后不良呈正相关(P<0.01)。BIX01294 能使胃癌细胞体积缩小、细胞间连接消失,甚至细胞皱缩、变圆、脱落等。BIX01294 能显著抑制胃癌细胞集落形成和胃癌细胞的增殖(均P<0.05),同时促进胃癌细胞凋亡(P<0.05)。结论: G9a 在胃癌组织中高表达,其高水平表达与预后不良呈正相关;抑制G9a 的表达可显著抑制胃癌细胞的增殖和促进细胞凋亡。  相似文献   
4.
目的:联合多种生物信息学分析方法筛选结肠癌枢纽基因,进一步对枢纽基因进行分析并构建调控网络,以期探索结肠癌的发病机制。方法:从GEO基因芯片数据库筛选结肠癌组织的基因表达数据集,利用在线工具GEO2R筛选差异表达基因(differentially expressed genes,DEG),对差异基因进行Gene Ontolog(GO)分析、KEGG通路分析、蛋白相互作用网络构建等。结果:共纳入2个结肠癌GEO数据集(GSE41258和GSE44076),筛选出在这2个数据集中有交集的差异表达2倍以上的基因120个,其中表达上调的基因29个,表达下调的基因91个。对上述120个差异表达基因进行KEGG通路分析发现近端小管碳酸氢钠回收、氮素代谢、胰液分泌、PPAR信号通路等与结肠癌的发生密切相关。利用STRING及Cytoscape软件筛选得到包括趋化因子1(CXCL1)、基质金属蛋白酶1 (MMP1)、MMP7等在内的10个调控结肠癌发生的枢纽基因,进一步在TCGA数据库中验证这些基因的表达。结论:通过生物信息学方法有效地筛选出与结肠癌发生密切相关的枢纽基因,为进一步研究其机制提供了理论依据。  相似文献   
5.
6.
目的:检测成蛋白2(formin-2,FMN2)在胃腺癌组织中的表达水平,探讨FMN2 的表达与胃癌患者临床特征之间的关系及其对胃腺癌AGS细胞增殖的影响。方法:收集2015 年9 月至2017 年9 月空军军医大学第一附属医院消化病医院胃肠外科手术切除的胃腺癌组织及相应的癌旁组织标本84 例。采用免疫组织化学染色和肿瘤数据库检索检测分析胃腺癌组织中FMN2的表达水平,并探讨FMN2 蛋白表达与胃腺癌患者临床病理特征之间的相关性;MTT法检测FMN2 对胃腺癌AGS细胞增殖活性的影响,Western blotting 法检测FMN2 对胃腺癌AGS细胞凋亡蛋白Caspase-3 表达的影响。结果:胃腺癌组织中FMN2 表达水平明显低于癌旁组织(P<0.05 或P<0.05),其低表达与胃腺癌患者的TNM分期及肿瘤分化程度相关(均P<0.05);与AGS细胞对照比较,AGS/FMN2 稳转株的增殖率明显降低、凋亡相关蛋白Caspase-3 表达明显增加(均P<0.05)。结论:FMN2 在胃腺癌组织中表达明显下调,且与患者的肿瘤分化程度和TNM分期相关;过表达FMN2 的胃腺癌细胞其增殖率明显降低;FMN2 是胃癌预后的独立危险因素,可为胃腺癌的治疗提供新的思路。  相似文献   
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