A systematic review of the methodological quality of economic evaluations in genetic screening and testing for monogenic disorders

PurposeUnderstanding the value of genetic screening and testing for monogenic disorders requires high-quality, methodologically robust economic evaluations. This systematic review sought to assess the methodological quality among such studies and examined opportunities for improvement.MethodsWe searched PubMed, Cochrane, Embase, and Web of Science for economic evaluations of genetic screening/testing (2013-2019). Methodological rigor and adherence to best practices were systematically assessed using the British Medical Journal checklist.ResultsAcross the 47 identified studies, there were substantial variations in modeling approaches, reporting detail, and sophistication. Models ranged from simple decision trees to individual-level microsimulations that compared between 2 and >20 alternative interventions. Many studies failed to report sufficient detail to enable replication or did not justify modeling assumptions, especially for costing methods and utility values. Meta-analyses, systematic reviews, or calibration were rarely used to derive parameter estimates. Nearly all studies conducted some sensitivity analysis, and more sophisticated studies implemented probabilistic sensitivity/uncertainty analysis, threshold analysis, and value of information analysis.ConclusionWe describe a heterogeneous body of work and present recommendations and exemplar studies across the methodological domains of (1) perspective, scope, and parameter selection; (2) use of uncertainty/sensitivity analyses; and (3) reporting transparency for improvement in the economic evaluation of genetic screening/testing.     

全身性遗传疾病对角膜移植排斥的影响

角膜移植为治疗角膜盲的主要手段，而角膜移植排斥则是决定角膜植片存活时间和病人术后视力的关键。角膜得益于其特殊的眼前节“免疫赦免”状态，使得角膜移植能够在众多器官移植中享有极低的排斥率，然而排斥反应发生的风险依然存在。当机体处于遗传物质异常的特殊状态时，宿主将通过宏观调控“免疫赦免”状态对植片的保护作用或受体对移植物排异产生的有害作用，延迟或促进角膜移植排斥反应的发生，进而影响移植物的存活时间和透明度。该文综述与角膜移植排斥相关的多种全身性遗传疾病，总结全身性遗传疾病对角膜移植排斥的影响，浅析其发生的病理生理学机制以及诊疗的特殊性。     

Deciphering the molecular landscape of microcephaly in 87 Indian families by exome sequencing

Microcephaly is a frequent feature of neurodevelopmental disorders (NDDs). Our study presents the heterogeneous spectrum of genetic disorders in patients with microcephaly either in isolated form or in association with other neurological and extra-neural abnormalities. We present data of 91 patients from 87 unrelated families referred to our clinic during 2016–2020 and provide a comprehensive clinical and genetic landscape in the studied cohort. Molecular diagnosis using exome sequencing was made in 45 families giving a yield of 51.7%. In 9 additional families probable causative variants were detected. We identified disease causing variations in 49 genes that are involved in different functional pathways Among these, 36 had an autosomal recessive pattern, 8 had an autosomal dominant pattern (all inherited de novo), and 5 had an X-linked pattern. In 41 probands where sequence variations in autosomal recessive genes were identified 31 were homozygotes (including 16 from non-consanguineous families). The study added 28 novel pathogenic/likely pathogenic variations. The study also calls attention to phenotypic variability and expansion in spectrum as well as uncovers genes where microcephaly is not reported previously or is a rare finding. We here report phenotypes associated with the genes for ultra-rare NDDs with microcephaly namely ATRIP, MINPP1, PNPLA8, AIMP2, ANKLE2, NCAPD2 and TRIT1.     

山白树微卫星特征分析及分子标记开发

目的:山白树是中国特有珍稀濒危植物。分析微卫星特征,开发其微卫星分子标记。方法:采用Illumina二代测序技术建立山白树基因组文库和微卫星文库,分析微卫星组成类型,设计山白树引物,用5个山白树种群进行扩增和检测以分析其多态性。结果:二代测序共返回38,942,660条100 bp配对序列,通过质量修剪及拼接得到200,386条拼接序列,其中长度 335 bp的为7 614条;在7 614条序列中检测出微卫星位点694个,其中单核苷酸重复最多,单核苷酸重复中A/T重复数量最多;二核苷酸长度变异最大,其中AG/CT重复数量最多,重复长度变异情况与微卫星丰度呈正相关。为36条山白树微卫星重复次数高的序列设计引物,经聚合酶链式反应(PCR)扩增和聚丙烯酰胺凝胶电泳检测,20对引物多态性丰富且条带清晰,等位基因数(NA)在3~6之间,平均为4,多态性信息含量(PIC) 0. 535 5~0. 754 0,平均值0. 615 5。对5个山白树种群的群体遗传分析发现,该物种遗传多样性较高(h=0. 697 5,I=1. 436 8,HE=0. 702 2),种群遗传分化显著(Fst=0. 374)。结论:通过部分山白树的群体遗传也可以说明本次开发的引物可用性较好。该研究开发了山白树微卫星分子标记引物,为山白树分子遗传学奠定了基础。     

胃癌患者根治术后腹腔灌洗液中CEA mRNA表达的临床意义

目的：探讨胃癌患者根治术后腹腔冲洗液中CEA mRNA表达情况及其临床意义。方法: 回顾性分析了2013 年1 月至2017 年12 月在南京大学医学院附属鼓楼医院接受胃癌根治切除术后进行腹腔灌洗液CEA mRNA检测的139 名患者的病历资料，并进行术后常规随访。用RT-PCR检测139 胃癌患者根治术后腹腔灌洗液中CEA mRNA表达情况。卡方检验分析腹腔灌洗液中CEA mRNA表达与临床基本特征、组织病理学资料、血液学指标及复发方式之间的关系。采用Logistic 单因素及多因素回归分析筛查影响CEA mRNA表达水平的因素。结果：139 名患者中44 名（31.7%）患者腹腔灌洗液CEA mRNA阳性。分析显示，胃癌患者腹腔灌洗液CEA mRNA阳性表达与性别、年龄、病理分级、Lauren 分型和HER2、EGFR、VEGFR等标记物间均没有明显的关联（均P>0.05），与病理类型、脉管是否侵犯、局部浸润深度、淋巴结转移程度和临床AJCC 分期有明显的关联（均P<0.05）。CEA mRNA阳性患者腹膜复发率明显高于阴性患者（P=0.012）。Logistic 单因素回归分析显示，印戒细胞癌（P=0.04，HR=2.810，95% CI: 1.050~7.520）、T 分期（P=0.016，HR=6.329，95% CI: 1.417~28.264）、N 分期（P=0.022，HR=3.068，95% CI: 1.172~8.027）、AJCC分期（P=0.016 ，HR=3.971 ，95% CI: 1.295~12.173 ）、神经侵犯（P=0.002 ，HR=6.738，95% CI: 1.995~22.757）、脉管侵犯（P<0.001，HR=16.36，95% CI: 3.85~69.512）为胃癌患者腹腔灌洗液CEA mRNA阳性表达的危险因素。Logistic 多因素回归分析显示，经过对其他因素的校正，脉管侵犯（P<0.001，HR=21.314，95% CI: 4.21~107.907）为胃癌患者腹腔灌洗液CEA mRNA阳性表达的独立危险因素。结论：胃癌腹腔灌洗CEA mRNA阳性的患者腹膜复发转移风险高且预后不良，应考虑包括腹腔局部治疗在内的更加积极的抗肿瘤治疗。     

烟雾病临床分型研究进展

烟雾病（moyamoya disease，MMD）是一种颈内动脉末端及其分支起始处进行性狭窄伴颅底异常血管网形成的脑血管疾病，临床上常将其分为缺血型、出血型和无症状型。随着诊疗技术的进步，对MMD临床分型的流行病学特征认识也在不断发展。在成年患者中，缺血型MMD占有重要地位，无症状型亦呈逐渐增多的趋势。不同临床分型MMD的发病年龄、遗传背景、病理生理机制、侧支血管代偿、受累血管分布及其预后存在显著差异。本文总结了对MMD临床分型流行病学特征认识的历史演变，不同临床分型可能的遗传背景、病理生理机制和影像学表现上的差异，为基于不同临床分型的MMD治疗决策提供新的思路。     

CD44基因多态性与宫颈癌及非小细胞肺癌的相关性

背景与目的：CD44分子是众多肿瘤细胞的标志分子，其表达水平与肿瘤细胞的恶性程度有关。该研究探讨CD44基因中的单核苷酸多态性（single nucleotide polymorphism，SNP）位点与云南汉族人群宫颈癌和非小细胞肺癌（nonsmall cell lung cancer，NSCLC）易感性的相关性。方法：选取了CD44基因中的两个SNP位点rs13347和rs8193，采用TagMan基因分型的方法，分析这两个多态性位点在497例宫颈癌患者和500例健康对照个体以及483例NSCLC患者和471例健康对照个体中的分布特征，并分析CD44基因中的多态性位点与云南汉族人群宫颈癌和NSCLC的相关性。结果：rs13347和rs8193位点等位基因和基因型在宫颈癌组和对照组中的分布频率的差异无统计学意义（P>0.05）。而在NSCLC组和对照组的比较中：rs13347和rs8193位点等位基因在NSCLC组和对照组中的分布频率的差异有统计学意义（P=0.020和P=0.004）；这两个位点基因型在NSCLC组和对照组中分布频率的差异有统计学意义（P=0.027和P=0.020）；其中rs13347位点等位基因C在NSCLC组中的分布频率显著高于对照组，可能是NSCLC发生的风险因素（OR=1.250，95% CI：1.035～1.509），rs8193位点等位基因C在对照组中的分布频率显著高于NSCLC组，可能是NSCLC发生的保护性因素（OR=0.768，95%CI：0.641～0.921）。单倍型分析结果显示，rs13347C-rs8193T和rs13347T-rs8193C在NSCLC组和对照组中的分布频率差异有统计学意义（P=0.003和0.022）；该结果说明单倍型rs13347C-rs8193T可能是云南汉族人群NSCLC发生的风险性因素（OR=1.316，95%CI：1.096～1.579）。结论：CD44基因中的两个SNP位点rs13347和rs8193可能与云南汉族人群宫颈癌发病风险无关，而可能与云南汉族人群NSCLC具有相关性。     

输尿管支架管结壳患者尿液菌群的分布特点

目的探讨输尿管支架管结壳患者尿液菌群的分布特点。方法选取2018年10月至2019年3月在山东省立第三医院、山东大学齐鲁医院、济南市中心医院和济南市济钢医院就诊的35例输尿管支架管置入术后患者。纳入标准:年龄18~65岁;输尿管镜碎石术后留置内支架管4周。排除标准:尿液细菌培养阳性;严重肉眼血尿;近期口服抗生素;存在明显残石患者。本研究采用横断面研究方法(临床研究注册号为ChiCTR1800020025),根据有无支架管结壳将患者分为结壳组23例和无结壳组12例。收集拔管当日患者尿液行细菌16s DNA检测。使用UPARSE、UCHIME和RDP calssifier等软件分析两组患者尿液菌群分布特点,明确两组患者尿液中细菌种类总数、细菌丰度,以及丰度占比较大的细菌类别,比较两组患者尿液细菌种类、数量及细菌丰度的差异,明确结壳组患者尿液中丰度占比较大的细菌菌属。结果两组患者的年龄、性别、体质指数、置管侧别、内支架管型号及结石成分差异均无统计学意义(P>0.05)。16s DNA检测结果显示,结壳组丰度占比>1%的菌属数量为11个,丰度占比>0.01%的菌属数量为74个;无结壳组丰度占比>1%的菌属数量为7个,丰度占比>0.01%的菌属数量为11个,两组丰度占比>1%的菌属数量比较差异有统计学意义(t=5.12,P=0.000)。结壳组中菌属丰度占比前3位分别为乳杆菌属(23.1%)、拟杆菌属(18.8%)和未分级拟杆菌属(17.1%),非结壳组中菌属丰度占比前3位分别是为埃希菌-志贺菌属(32.2%)、肠球菌属(24.9%)和假单胞菌属(18.2%)。两组间差异最大的3种细菌是乳杆菌属(P=0.010),拟杆菌属(P=0.004)和未分级拟杆菌属(P=0.004)。结论支架管结壳患者尿液中细菌种类和数量都明显多于非支架管结壳患者。拟杆菌属细菌在支架管结壳患者尿液中的细菌种类丰度较大。     

桃红四物汤化学成分、药理作用、临床应用的研究进展及质量标志物的预测分析

桃红四物汤,活血祛瘀之经典名方。该文对近年来桃红四物汤的化学成分、药理作用以及临床应用研究进展进行总结与分析。目前,桃红四物汤不同提取部位化学成分的研究较为系统,其药理作用研究主要集中在活血化瘀、调经镇痛、促进骨折愈合等方面,临床可应用于多系统、多脏腑疾病的治疗,例如妇科疾病、内科疾病、骨伤科疾病、皮肤科疾病等。在此基础上,依照质量标志物(Q-marker)有效、特有、传递与溯源、可测和处方配伍的"五原则"对桃红四物汤Q-marker进行预测分析,提示阿魏酸、芍药苷、苦杏仁苷、芍药内酯苷、梓醇、没食子酸、羟基红花黄色素A可作为该复方的Q-marker,后续可选择这些Q-marker为指标,根据药材、饮片、中间体、对应实物的量值传递进行桃红四物汤全程质量控制并创建其质量可溯源体系。     

安息香药材化学成分、药理作用研究进展及质量标志物预测分析＊

安息香为安息香科白花树Styrax tonkinensis （Pierre） Craib ex Hart.的干燥树脂，主要化学成分为香脂酸类和三萜类物质，及少数木脂素类物质，其中香脂酸类化合物是其主要活性成分。安息香主要药理活性有抗炎解热、抗肿瘤、血脑屏障保护等。本文对安息香药材的化学成分和药理作用进行了综述，并从多角度分析预测了安息香可能的质量标志物，为安息香药材的质量控制、合理开发与利用提供参考。