乳腺癌新辅助化疗前后肿瘤相关巨噬细胞相关基因变化的生物信息学分析

背景与目的 乳腺癌是全球女性发病率最高的恶性肿瘤,化疗是乳腺癌最重要的治疗方式之一,最近的研究表明,化疗可能通过增强肿瘤微环境中的抗肿瘤免疫力来发挥抗肿瘤效应。因此,本研究通过生物信息学分析明确乳腺癌患者新辅助化疗（NAC）前后肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）及相关基因的变化,评估NAC对乳腺癌患者免疫影响。方法 GEO数据库输入“Breast Cancer”,“TAMs”,“Chemotherapy”进行检索,选择人乳腺癌组织的GSE134600数据集进行分析。通过R包（limma函数）筛选乳腺癌患者NAC前后组织样本中差异表达基因（DEGs）。对所有DEGs进行GO功能富集和KEGG通路分析。通过Cytoscape软件对DEGs进行蛋白互作网络可视化,并筛选关键核心基因,通过cBioPortal对10个关键基因进行突变分析。使用R包（CIBERSORT）对GSE134600数据中的免疫细胞分布及相关性进行评估。结果 鉴定出751个乳腺癌NAC前后DEGs（409个上调基因和342个下调基因）。通过GO富集分析DEGs的生物过程（BP）、细胞组分（CC）和分子功能（MF）。在BP中主要富集在I型干扰素（IFN-I）信号通路/病毒应答与防御和病毒生命周期方面;在CC中主要富集在细胞膜的外在成分和细胞膜的细胞质侧方面;在MF中主要富集在细胞因子受体结合、双链RNA结合和脂肽结合方面。KEGG通路富集分析中,DEGs主要富集在甲型H1N1流感、麻疹、丙型肝炎、冠状病毒病COVID-19、NF-κB信号通路、EBV病毒感染、NOD样受体信号通路和阿米巴病信号通路。通过CytoHubba插件筛选出乳腺癌NAC前后TAMs相互作用程度最高的前10个关键基因：IFIT1、ISG15、MX1、MX2、IRF7、RSAD2、IFIT3、IFI35、IFI6、IFITM1。多组学分析发现IFIT1、MX1和MX2主要发生缺失突变,IFIT1主要发生基因深度删除,而MX1和MX2主要发生基因扩增。NAC后乳腺癌组织中M0巨噬细胞、CD8⁺T细胞及M2巨噬细胞含量减少,M0巨噬细胞与记忆性B细胞成正相关（r=0.64）,与未活化的CD4⁺记忆性T细胞呈负相关（r=-0.66）。结论 所发现的乳腺癌患者NAC前后TAMs相关的DEGs与干扰素信号通路密切相关,提示干扰素信号通路在NAC可能通过改变TAMs而发挥重要作用。同时NAC前后M0巨噬细胞发生明显改变,提示化疗可能通过改变M0巨噬细胞分布及免疫功能调节对肿瘤的免疫应答。     

海马sortilin在链脲佐菌素诱导的糖尿病认知损伤小鼠中的作用

目的 探讨海马sortilin在链脲佐菌素（STZ）诱导的糖尿病认知损伤小鼠中的作用。方法 24只成年雄性ICR小鼠,随机分为溶媒对照组（NS）和实验组（STZ）。STZ腹腔注射诱导糖尿病认知损伤动物模型,注射后用血糖仪检测血糖改变,注射后第8周采用新旧事物识别实验检测各组小鼠认知功能;免疫组织化学方法检测sortilin免疫阳性产物表达变化;Western blotting和Real-time PCR方法检测各组小鼠海马sortilin和脑源性神经营养因子（BDNF）蛋白及mRNA表达变化。结果 与NS组相比,STZ组小鼠空腹血糖显著增高（P<0.01）;在新旧事物识别实验中新事物辨别指数明显降低（P<0.05）;海马区sortilin的免疫阳性产物（P<0.05）、蛋白（P<0.01）以及mRNA（P<0.05）表达均显著下调;海马区BDNF mRNA（P<0.01）及蛋白（P<0.05）表达均明显降低。结论 STZ诱导的糖尿病小鼠认知损伤可能与海马sortilin的表达下调有关。     

二烯丙基二硫诱导人胃癌细胞G_2/M期阻滞中p-CDK1、cyclin B1和p21~(WAF1)蛋白的表达

二烯丙基二硫(diallyl disulfide, DADS)是大蒜中提取的一种低分子量的脂溶性成分,也是大蒜中的主要有效成分,对结肠癌、乳腺癌、肝癌、肺癌、膀胱癌、前列腺癌和白血病等多种肿瘤均有明显的抑制作用.本实验室以前研究表明[1],DADS对人类白血病细胞HL60有诱导分化作用,对体外[2]和体内[3]的人胃癌MGC803细胞均有生长抑制作用、G2/M期阻滞作用.对体内的人胃癌细胞有诱导分化作用[3],对体外的人胃癌细胞有诱导凋亡作用[4].     

Bcl-2与Ki-67蛋白在喉鳞癌中的表达检测及临床相关性分析

目的 检测喉鳞状细胞癌中Bcl-2蛋白和Ki-67蛋白的表达水平并分析两者的相关性. 方法 收集54例喉鳞癌组织和42例正常喉粘膜组织的样本,采用SP免疫组化法观察石蜡切片中Bcl-2、Ki-67蛋白的表达,并结合临床相关病理因素分析在喉鳞状细胞癌中两者的相关性. 结果 在喉鳞癌组织中,Bcl-2蛋白高表达,阳性表达率70.37％（38/54）,正常的喉粘膜组织中Bcl-2蛋白阳性微弱表达或不表达,阳性率9.5％ （4/42）（P＜0.05）;Bcl-2蛋白表达水平与临床分期、淋巴结转移有明显相关性：在晚期（Ⅲ～Ⅳ期）的表达高于早期（Ⅰ～Ⅱ期）（P＜0.05）,而其在不同年龄、性别中的表达,差异无统计学意义（P＞0.05）.Ki-67蛋白在喉鳞状细胞癌中的表达为81.48％（44/54）,在正常组织中表达明显下调仅为16.67％ （7/42）;在喉鳞癌中Bcl-2蛋白与Ki-67蛋白的表达呈正相关（rs=0.317,P＜0.05）. 结论 与正常组织比较,在喉鳞癌中Bcl-2蛋白与Ki-67蛋白表达明显上调,并呈正相关,可能两者在喉鳞癌癌变中发挥了协同作用.     

癌组织中S100A2基因的表达及其临床病理学意义

目的 检测胃癌组织中S 100A2基因的mRNA和蛋白表达水平,分析S100A2基因在胃癌发生、发展过程中的作用机制.方法 应用免疫组化、Western Blotting技术、RT-PCR技术检测胃癌组织中S100A2mRNA、蛋白表达水平的改变.结果 S100A2蛋白定位于胃黏膜上皮细胞的胞浆及胞核,胃癌组织中S100A2mRNA、蛋白表达下调,低分化胃癌与淋巴结转移胃癌S100A2表达降低最明显.结论 胃癌组织S100A2蛋白、mRNA表达降低,且其表达与胃癌分化程度和淋巴结转移相关.     

5-烯丙基-7-二氟亚甲氧白杨素体外抗肝癌作用

目的研究白杨素（ChR）衍生物5-烯丙基-7-二氟亚甲氧白杨素（5-ally-7-gen-difluormethylenechrysin,ADFMChR）对体外培养肝癌SMMC-7721细胞生长抑制作用及诱导凋亡的作用机制。方法 1）细胞计数法研究ADFMChR对SMMC-7721细胞生长曲线及细胞倍增时间的影响;2）Western blot法分析ADFMChR对SMMC-7721细胞Bcl-2、Bax蛋白表达变化情况。结果 1）细胞计数结果表明：0.3μM～30.0μM浓度的ADFMChR与对照组相比均可抑制SMMC-7721细胞生长,且呈浓度和时间依赖性;常规培养SMMC-7721细胞群体倍增时间为23.81小时,当ADFMChR为30.0μM时则可使其延长至61.22小时;2）Western Blot分析证实ADFMChR上调Bax和下调Bcl-2呈浓度依赖性。结论以ChR为先导物,选择性引入烯丙基和二氟亚甲氧基的衍生物ADFMCHR对肝癌的生长抑制作用较ChR明显增强,可能与细胞增殖周期延长,Bcl-2/Bax比值下降,诱导细胞凋亡相关。     

急性放射性皮炎防治研究进展

急性放射性皮炎是一种由肿瘤放射治疗、职业性或意外事故以及战时核辐射等大剂量射线照射后引起的皮肤损伤,常发生于辐射后数天至数月内。急性放射性皮炎发病机制未完全阐明,目前主要认为与放射线直接或间接诱导细胞DNA损伤,引起细胞凋亡、坏死相关。现代医学对急性放射性皮炎有效防治尚无统一共识。本文旨在将近年来针对急性放射性皮炎药物和物理防治研究作一综述,以期为今后的临床治疗和学术研究提供科学参考和研究方向。     

RTN4在胃癌发病机制中的作用

目的 了解RTN4蛋白在胃癌发病过程中的作用,为揭示胃癌发病的分子机制提供实验资料。方法 将pIRESneo3-RTN4真核表达载体转染胃粘膜上皮GES1细胞,建立RTN4高表达的GES1-RTN4细胞系;通过细胞生长曲线、平皿克隆与软琼脂集落形成实验、流式细胞仪,观察RTN4高表达对GES1细胞生长与增殖、周期与凋亡的影响;利用Western-blot检测GES1-RTN4细胞中IκBα蛋白的表达。结果 GES1-RTN4细胞的生长速度较GES1和GES1-pIRESneo3细胞加快,统计学意义显著（P＜0.01）;GES1-RTN4细胞较GES1和GES1-pIRESneo3细胞克隆体积大、数目多,统计学意义显著（P＜0.01）;GES1-RTN4细胞中S期细胞比例较GES1和GES1-pIRESneo3细胞增加,细胞增殖指数增加,细胞凋亡率降低,统计学意义显著（P＜0.01）;GES1-RTN4细胞中IκBα蛋白表达较GES1和GES1-pIRESneo3细胞减少,统计学意义显著（P＜0.01）。结论 RTN4通过活化NF-κB信号通路,提高细胞增殖指数,抑制细胞凋亡,促进GES1细胞的增殖。     

组织芯片检测p16蛋白在不同胃组织中的表达意义

[目的]分析胃癌相关差异表达蛋白p16在不同胃组织中的表达意义,为临床早期发现胃癌及评估胃癌患者预后提供有价值的资料.[方法]采用免疫组织化学染色,检测胃组织芯片(包括正常胃黏膜、癌旁、非典型增生、胃癌及淋巴结转移癌组织)中p16蛋白的表达,分析其在胃癌组织中表达与临床病理特征的关系.[结果] p16蛋白在正常胃黏膜、癌旁、非典型增生和胃癌组织中的表达率分别为76.47％ (26/34)、79.59％( 39/49)、34.62％ (9/26)和8.64％(7/81);p16蛋白在胃癌组织中阳性表达率较正常胃黏膜、癌旁组织和非典型增生组织降低(P＜0.01),而非典型增生组织中阳性表达率较正常胃黏膜和癌旁组织降低(P＜0.05);p16蛋白表达与胃癌患者年龄、肿块大小和淋巴结转移有关(P＜0.05).[结论] p16蛋白表达与胃癌的发生发展、患者年龄、肿块大小及淋巴结转移有关.     

骨巨细胞瘤nm23,mdm2和HER—2基因表达及其临床意义

为探讨nm23,mdm2和HER－2在骨巨细胞瘤（GCT）的表达及与GCT病理分级和复发的关系。应用SP免疫组织化学方法检测nm23,mdm2和HER－2在52例GCT中的表达（GCT按Jaffe分级,I级15例,Ⅱ级25例,Ⅲ级12例）。结果52例GCT中nm23,mdmd2和HER－2的阳性表达率分别为40．4％（21／52）,34．6（1852）和21．2％（1152）,其阳性表达与病理分级差异均无显著性（P＞0．05）,nm23,mdm2和HER－2在复发的病例中,阳性表达率分别为69．2％（9／13）,61．5％（8／13）和38．5％（5／13）,nm23,mdm2表达与GCT复发率差异有显著性（P＜0．05）。