RNA sequencing steps toward the first line

• DNA is the sequence that codes for proteins.
• Messenger RNA is transcribed from the DNA sequence of genes and translated into protein.
• It can be difficult to predict how a change in the DNA sequence will affect messenger RNA and protein quantity and quality.
• DNA translocation changes can cause the joining of sequences from two different genes or different parts of the same gene.
• DNA sequencing is often used clinically to predict how DNA changes might affect proteins.
• Alternatively, RNA sequencing can be used as a more direct measure of the effect of DNA changes on the protein products.
• This sequencing is important for identifying changes in cancer that may indicate response to targeted therapy, prognosis, or diagnosis.

     

红外光谱数据融合对栽培滇重楼产地鉴别*

目的 多样的环境因素使得不同产地栽培滇重楼的化学成分也丰富多样，不同居群栽培滇重楼的甾体皂苷类成分具有很大的差异，多源数据融合分析能更全面的表征药材化学信息，建立一个高效而准确的产地鉴别模型，为其资源合理开发利用提供依据。方法 以来自云南和四川的8个产地（保山、楚雄、大理、红河、丽江、成都、文山、玉溪）共366份栽培滇重楼根茎为实验材料，采集其傅里叶变换近红外光谱（FT-NIR）和衰减全反射-傅里叶变换中红外光谱（ATR-FTMIR）数据。采用Kennard-Stone算法将不同产地的样品分为2/3的训练集和1/3的预测集，基于4种特征变量提取方法（CARS、VIP、SPA、SO-Covsel）结合2种数据融合策略（低级数据融合和中级数据融合），建立偏最小二乘产地判别分析模型。根据模型参数交叉验证均方根误差（RMSECV）和预测均方根误差（RMSEP）评估模型的稳定性，模型训练集和预测集准确率（ACC）评估模型分类性能。结果 近红外光谱和中红外光谱均能反应不同产地栽培滇重楼的化学成分差异，在中级数据融合中，基于VIP和SPA提取的特征变量建立的模型正确率均大于94%。相较于中级数据融合，低级数据融合模型得到了最为满意的结果，其预测集分类正确率达到100%。结论 根据近红外和中红外数据建立的低级数据融合PLS-DA模型，能够用于栽培滇重楼的产地鉴别分析。     

不同直腿抬高扳腿法对推拿治疗腰椎间盘突出症临床疗效的影响

目的探讨不同直腿抬高扳腿法对推拿治疗腰椎间盘突出症临床疗效的影响。方法选择2018年5月—2019年1月在广西中医药大学第一附属医院推拿科治疗的腰椎间盘突出症患者100例,随机分为对照组与观察组各50例。2组均采用相同的松解类推拿手法治疗,治疗过程中观察组采用改进的直腿抬高扳腿法,对照组采用常规的直腿抬高扳腿法。2组均以治疗6次为1个疗程,疗程之间间隔1 d,共治疗4个疗程。观察2组治疗效果及治疗前后患侧直腿抬高角度、疼痛视觉模拟评分(VAS评分)、日本骨科学会腰椎功能量表评分(JOA评分)变化和治疗过程中可能发生的不良反应。结果观察组与对照组愈显率分别为74%(37/50)、54%(27/50),总有效率分别为96%(48/50)、94%(47/50),观察组愈显率明显高于对照组(P<0.05),2组总有效率比较差异无统计学意义(P>0.05)。与治疗前比较,治疗后2组患者患侧直腿抬高角度均显著增大(P均<0.05),VAS评分均显著降低(P均<0.05),JOA评分均显著升高(P均<0.05);治疗后2组比较,观察组患侧直腿抬高角度显著大于对照组(P<0.05),VAS评分显著低于对照组(P<0.05),JOA评分显著高于对照组(P<0.05)。观察组患者均未出现疼痛症状加重等手法反应,对照组有7例患者出现不同程度的腰臀疼痛症状加重。结论在采用推拿手法治疗腰椎间盘突出症时,改进的直腿抬高扳腿法较常规的直腿抬高扳腿法疗效更为显著,可能发生的不良反应更少。     

推拿联合针灸治疗血瘀型腰椎间盘突出症的临床疗效观察

目的:观察推拿手法联合针灸对血瘀型腰椎间盘突出症的临床疗效。方法:选取2015年6月至2017年12月秦皇岛市中医医院收治的血瘀型腰椎间盘突出症患者100例作为研究对象,按照随机数字表法随机分为对照组和观察组,每组50例。对照组接受单纯针灸治疗,观察组在对照组基础上加用脊柱推拿手法,2组均以10次为1个疗程,连续治疗2个疗程。比较2组患者治疗前、治疗3 d、10 d后JOA评分系统(Japanese Orthopaedic Association Scores,JOA)、Oswestry功能障碍指数的变化、血小板计数、血浆凝血酶原时间(PT)、活化部分凝血酶原时间(APTT)、血栓弹力图及临床总有效率的变化、腰椎疼痛评分(VAS)、血清学指标、炎性因子的变化。结果:推拿手法联合针灸可明显改善血瘀型腰椎间盘突出症的JOA评分、Oswestry功能障碍指数及凝血状态,降低患者外周血SP、NPY、IL-1β、TNF-α水平,且具有时间依赖性。结论:推拿联合针灸可明显改善血瘀型腰椎间盘突出症症状,调节患者的高凝状态,该法具有一定的时间依赖性。     

Focal hole versus screw stimulation to prevent false negative results in detecting pedicle breaches during spinal instrumentation

ObjectiveWe describe a stimulus-evoked EMG approach to minimize false negative results in detecting pedicle breaches during lumbosacral spinal instrumentation.MethodsIn 36 patients receiving 176 lumbosacral pedicle screws, EMG threshold to nerve root activation was determined using a focal probe inserted into the pilot hole at a depth, customized to the individual patients, suitable to position the stimulating tip at the point closest to the tested nerve root. Threshold to screw stimulation was also determined.ResultsMean EMG thresholds in 161 correctly fashioned pedicle instrumentations were 7.5 mA ± 2.46 after focal hole stimulation and 21.8 mA ± 6.8 after screw stimulation. Direct comparison between both thresholds in individual pedicles showed that screw stimulation was always biased by an unpredictable leakage of the stimulating current ranging from 10 to 90%. False negative results were never observed with hole stimulation but this was not true with screw stimulation.ConclusionsFocal hole stimulation, unlike screw stimulation, approaches absolute EMG threshold as shown by the lower normal limit (2.6 mA; p < 0.05) that borders the upper limit of threshold to direct activation of the exposed root.SignificanceThe technique provides an early warning of a possible pedicle breakthrough before insertion of the more harmful, larger and threaded screw.     

微创和传统开放后路腰椎椎间融合术治疗腰椎退行性疾病的远期预后

目的探讨微创后路腰椎椎间融合术(MIS-PLIF)和传统开放PLIF对腰椎退行性疾病(LDD)远期疗效及安全性的影响。方法 2011年1月-2014年12月收治LDD患者182例,其中96例采用传统开放PLIF治疗(PLIF组),86例采用MIS-PLIF治疗(MIS-PLIF组)。比较2组腰椎矢状位参数、多裂肌横截面积及萎缩率、融合率、疼痛视觉模拟量表(VAS)评分、日本骨科学会(JOA)评分、Oswestry功能障碍指数(ODI)及术后并发症发生情况,分析多裂肌萎缩率与顽固性腰背痛的相关性。结果 2组术后各随访时间点椎间隙高度恢复值和节段性前凸角恢复值差异均无统计学意义(P > 0.05)。2组术后1年腰椎前凸角恢复值差异无统计学意义(P > 0.05);但术后5年和末次随访时,MIS-PLIF组腰椎前凸角恢复值显著高于PLIF组,差异均有统计学意义(P < 0.05)。MIS-PLIF组术后各随访时间点多裂肌横截面积大于PLIF组,多裂肌萎缩率低于PLIF组,差异均有统计学意义(P < 0.05)。2组术后随访6个月融合率差异无统计学意义(P > 0.05)。2组术后各随访时间点下肢痛VAS评分差异无统计学意义(P > 0.05);MIS-PLIF组术后各随访时间点腰痛VAS评分、JOA评分及ODI均优于PLIF组,差异有统计学意义(P < 0.05)。MIS-PLIF组顽固性腰背痛发生率显著低于PLIF组,差异有统计学意义(P < 0.05)。合并顽固性腰背痛患者多裂肌萎缩率高于未合并顽固性腰背痛的患者,差异有统计学意义(P < 0.05)。结论术后多裂肌萎缩可能是导致顽固性腰背痛的重要原因,相较于传统开放PLIF,MIS-PLIF治疗LDD能够更有效地保持腰椎生理曲度,改善肢体活动功能,降低多裂肌萎缩程度,有助于避免顽固性腰背痛的发生。