中国回族人群CYP4F2和VKORC1的基因多态性

目的考察中国回族人群华法林治疗反应相关基因CYP4F2和VKORC1的基因多态性。方法从159名健康中国回族志愿者的外周血提取DNA,CYP4F2的13个外显子及VKORC1的3个外显子及其外显子-内含子交接处的碱基序列通过多聚酶链反应进行扩增,相应的扩增产物经Sanger测序法进行测序分析。所得基因变异体通过软件HAPLOVIEW进行单体型和连锁不平衡分析。错义突变对蛋白的影响通过3个在线软件Poly Phen-2,SIFT和MutationTaster-2进行预测。结果CYP4F2共有18个基因变异体被发现,内含子和外显子各9个,其中有3个变异体是首次报道,即第1内含子-14G>C,第4外显子5039C>T(p.Ala118Val)和第12外显子18227A>C(p.Glu452Ala)。VKORC1共有9个单核苷酸多态性被发现,其中3个位于外显子区。CYP4F2 Val433Met和VKORC1-1639 G>A的变异体等位基因频率分别是0.370和0.608,与千人基因组人群相比均有显著性差异(P<0.05)。CYP4F2和VKORC1所发现的基因变异体有显著的连锁不平衡。结论中国回族人群CYP4F2和VKORC1的群体遗传学模式具有不同的特征,在使用华法林等药物时应进行药物剂量的相应调整。     

基于SNP芯片研究PI3K/Akt/mTOR通路上自噬相关基因SNPs与胃癌的关联

目的： 探讨与胃癌发生相关的PI3K/Akt/mTOR通路上新的与自噬相关基因单核苷酸多态性位点（SNPs），为寻找有价值的胃癌发生相关的分子标志物提供新的依据。方法： 采用1：1配对病例-对照研究的方法。通过KEGG pathway网站和Gene Ontology、Ensemble数据库及HaploView、STRING、Cytoscape软件联合SNP芯片筛选目标SNPs，采用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱（MALDI-TOF-MS）对筛检出来的SNPs位点在来自福建省仙游县的622例胃癌患者和622例健康人群基因组中进行验证。结果： SNP芯片及生物信息学分析筛选出IRS1 rs10205233、PIK3CD rs3934934、PIK3R1 rs706711、PIK3R1 rs706714和AKT1 rs35285446为候选位点。扩大样本验证发现IRS1 rs10205233的多态性变异（C > T）显著降低了胃癌的发病风险[共显性模型、显性模型的OR（95% CI）分别为0.761（0.595，0.975）、0.764（0.601，0.973）]。进一步分层分析，该位点显性模型、隐形模型、共显性模型以及等位基因在贲门癌和非贲门癌人群中均未见统计学差异（P > 0.05）。并未见其他位点与患胃癌风险的关联有统计学意义。对PIK3R1基因2个位点（rs706711、rs706714）的单体型分析也未见统计学差异。结论： IRS1 rs10205233位点与福建省胃癌高发区仙游县的胃癌发生存在关联，T等位基因可能是胃癌发生的一个遗传保护因素。     

循环DNA中TP53基因多态性与非霍奇金淋巴瘤的关系研究

目的探讨和研究循环DNA中TP53基因多态性与非霍奇金淋巴瘤的关系。方法施行PCR-单链构象多态性分析法(PCR-SSCP对所选取的45例非霍奇金淋巴瘤组织进行TP53基因外显子5～8的多态性测验:①检测TP53基因多态性的方法 :施行PCR-单链构象多态性分析法(PCR-SSCP)对所选取的45例非霍奇金淋巴瘤组织进行TP53基因外显子5～8的多态性测验,扩增后形成的产物可以通过单链构象多态性分析(SSCP)的方式进行分析和研究。②成像研究方法 :运用全自动凝胶成像系统进行分析和研究。结果 TP53基因发生突变的具体情况:在45例非霍奇金淋巴瘤患者中,其中有20例患者的TP53基因组的DNA具有异常迁移率带,这充分显示出这类肿瘤很可能具有TP53基因多态性,总多态率为56.3%。其中按照肿瘤组织细胞源头进行分组:B细胞组与T-NK细胞组的多态率分别为57.4%、36.8%,二者之间进行差异比较,结果均没有统计学意义(P>0.05);按照肿瘤生物学行为进行分组:侵袭性、惰性组以及高侵袭性组之间进行差异比较,结果均有统计学意义(P<0.05)。结论 TP53基因多态性存在于非霍奇金淋巴瘤中,TP53基因的多态性在非霍奇金淋巴瘤的发展过程中起着非常重要的作用。     

自身免疫性疾病患者CYP3A4、CYP2C8和CYP3A5基因多态性与羟氯喹不良反应/血药浓度的相关性研究

目的:研究自身免疫性疾病(AID)患者细胞色素P_(450)(CYP)酶的亚型CYP3A4、CYP2C8和CYP3A5的基因多态性与羟氯喹不良反应、血药浓度的相关性,为羟氯喹的临床个体化用药提供参考。方法:病例来自安徽医科大学第一附属医院风湿免疫科2017年7月-2018年8月收治的因长期(>6个月)服用羟氯喹(日剂量为200～400 mg)出现不良反应的77例AID患者,收集患者信息、血样和不良反应发生情况,按不良反应发生部位分为肝功能正常组和肝功能异常组、肾功能正常组和肾功能异常组、眼部正常组和眼部异常组,采用高效液相色谱法测定羟氯喹全血药物浓度,MassARRAY系统检测患者CYP3A4、CYP2C8和CYP3A5的基因型,通过χ~2检验分析不同基因型患者羟氯喹不良反应的发生差异,通过两独立样本t检验和单因素方差分析不同基因型患者羟氯喹血药浓度的差异。结果:CYP3A5 rs4646453位点在肾功能正常组与肾功能异常组的分布差异具有统计学意义(P<0.05),肾功能异常组患者中CC基因型较AA+AC基因型的发生率高;CYP2C8 rs10882526位点在肝功能正常组与肝功能异常组的分布差异具有统计学意义(P<0.05),肝功能异常组患者中等位基因G较等位基因A的发生率高,AG基因型较AA基因型的发生率高。77例AID患者CYP3A4、CYP2C8和CYP3A5的基因多态性与血药浓度无显著相关性。在亚组分析时,58例系统性红斑狼疮(SLE)患者中CYP2C8 rs10882521的GT、GG和TT基因型的平均血药浓度分别为514.1、735.3、785.9 ng/mL,其中GG和TT基因型明显高于GT基因型(P<0.05)。结论:AID患者携带CYP3A5 rs4646453 CC基因型服用羟氯喹肾功能异常的发生率更高,携带CYP2C8 rs10882526位点的等位基因G和AG基因型服用羟氯喹肝功能异常的发生率更高。SLE患者服用相同剂量羟氯喹,携带CYP2C8 rs10882521 GT基因型较其他基因型患者血药浓度低。     

中国人群血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因相关性的荟萃分析

目的:系统评价中国冠心病患者血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因的相关性。方法:计算机检索PubMed、Embase、Cochrane图书馆、CNKI、VIPH和万方数据库,检索时间截至2018年6月。纳入有关血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因相关性的临床试验,根据Cochrane Handbook 5.0.2质量评价标准评价纳入研究的质量。采用RevMan 5.0软件对数据进行定量合并分析。结果:共纳入7个研究1 611例患者,包括抗血小板药物抵抗组772例,对照组839例。Meta分析结果显示,虽有个别研究显示血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因T、C相关,但将已报道的中国人群血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因的所有研究结果综合来看,血小板抵抗与血小板糖蛋白受体基因无明显相关性。T等位基因与C等位基因[OR=0.39,95%CI:(0.11,1.31),P=0.13]、基因型TT+TC与CC[OR=0.33,95%CI:(0.06,1.76),P=0.19]、基因型TT与CC[OR=0.50,95%CI:(0.12,2.13),P=0.35]、基因型TC与CC[OR=0.25,95%CI:(0.03,2.21),P=0.21]均与血小板抵抗无明显关系。结论:中国人群血小板抵抗与血小板蛋白受体基因无明显相关性。     

STAT5A基因rs319502多态性与缺血性脑卒中痰瘀证凝血功能及炎性反应显著关联

目的:探讨STAT5A基因rs3198502多态性位点与缺血性脑卒中痰瘀证及其血脂代谢、凝血功能、炎性反应的关联。方法:共纳入缺血性脑卒中痰瘀证患者及对照各550例,采用MassARRAY SNP技术对rs319502位点进行基因分型。以PLINK、SPSS软件进行统计分析。结果:STAT5A基因的rs319502位点与缺血性脑卒中痰瘀证发生风险的关联无统计学意义(P 0. 050)。rs3198502位点与缺血性脑卒中痰瘀证患者的D-D[隐性模型:β(95%CI)=1. 85(0. 29-3. 42),Padj=0. 021]、INR[隐性模型:β(95%CI)=2. 40(0. 20-4. 61),Padj=0. 033]、PLT[显性模型:β(95%CI)=14. 51(1. 79-27. 23),Padj=0. 026]水平的相关性具有统计学意义。rs3198502与缺血性脑卒中痰瘀证患者的C反应蛋白水平的相关性具有统计学意义[加性模型:β(95%CI)=-7. 75(-14. 47--1. 03),Padj=0. 025;显性模型:β(95%CI)=-9. 33(-18. 42--0. 24),Padj=0. 046]。结论:STAT5A基因3198502位点可能影响缺血性脑卒中痰淤证的凝血功能、炎性反应。