孟德尔随机化研究应用于因果推断的影响因素及其结果解读面临的挑战

孟德尔随机化（Mendelian randomization,MR）研究使用遗传变异作为工具变量,推断暴露因素与结局之间的因果关系,能够有效克服混杂和反向因果问题所导致的偏倚。然而,MR研究中的工具变量须满足关联性、独立性和排他性3个核心假设。即使核心假设成立,MR研究在因果推断中的应用还受到其他局限性的影响。此外,MR研究结果的解读需要基于综合证据。本文将围绕MR研究应用于因果推断的影响因素和研究结果的解读进行综述,以期为MR研究结果应用提供指导。     

两样本孟德尔随机化研究高血压与焦虑发生风险的因果关系

目的 采用两样本孟德尔随机化研究方法评估高血压与焦虑发生风险之间潜在的因果关系。方法 研究数据来自全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)汇总数据集,其中焦虑数据包含34 121例样本,高血压数据包含463 010例样本,选取71个与高血压密切相关的遗传位点作为工具变量。分别使用随机效应逆方差加权、加权中位数和Mr-Egger等方法进行两样本孟德尔随机化分析,以OR值评估高血压与焦虑之间的因果关系。同时采用Mr-PRESSO和Mr-Egger检测水平多效性,“leave-one-out”进行敏感性分析。结果 逆方差加权法分析结果显示高血压与焦虑发生之间呈显著正相关,比值比(odds ratio, OR)为1.276 ［95%可信区间(confidence interval,CI):1.074–1.515;P=0.005］;加权中位数回归结果显示了相似的因果关系 ［OR, 1.305, 95%CI:1.016–1.676),P=0.037］。此外,漏斗图和Mr-Egger(P=0.27)截距均没有观察到水平多效性和异质性。结论 研究表明,高血压与焦虑发生之间可能存在正向因果关系。     

孟德尔随机化探究细胞因子与深静脉血栓的因果效应

目的 深静脉血栓是一种受遗传和环境影响的复杂疾病。已有诸多研究证明免疫相关的细胞因子与深静脉血栓具有相关性,但尚无研究对它们之间的因果关系进行分析。因此,本研究利用孟德尔随机化模型系统地筛选对深静脉血栓有因果效应的细胞因子。方法 基于细胞因子和深静脉血栓的全基因组关联研究结果的数据,分别用IVW和MR-Egger两种两样本MR (Mendelian randomization)方法评估了包括生长因子、趋化因子、白介素、肿瘤坏死因子及其他类共计41个细胞因子与深静脉血栓和下肢深静脉血栓的因果关系,并利用多种方法检验多效性。结果 孟德尔随机化分析结果显示,白细胞介素12p70对深静脉血栓存在显著的正向因果效性(IVW: OR = 1.03; 95% CI: 1.01 ~ 1.04; P＜0.001),对下肢深静脉血栓的发生也有潜在的促进作用(IVW: OR = 1.02; 95% CI: 1.01 ~ 1.04; P = 0.008)。结论 本研究结果表明白细胞介素12p70会促进深静脉血栓的形成。     

基因预测的爬楼梯频率对肺癌风险的影响：孟德尔随机化研究

目的 采用孟德尔随机化(Mendelian randomization, MR)探索爬楼梯频率(frequency of stair climbing, FSC)与肺癌(lung cancer, LC)风险之间的因果关系。方法 首先,在IEU OpenGWAS数据库中获取FSC、LC风险因素和LC风险的相关全基因组关联研究(genome-wide association study, GWAS)数据;其次,通过MR确定FSC、LC风险因素和LC风险之间的因果联系,并分析体质量指数(body mass index, BMI)、慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease, COPD)和吸烟行为在FSC与LC风险之间的作用比例;然后,利用连锁不平衡分数回归进一步验证这一关系;最后,通过贝叶斯共定位方法探索可能影响FSC降低LC风险的分子机制。结果 MR分析的逆方差加权法(inverse-variance weighting, IVW)结果表明,基于GWAS预测的FSC与LC风险呈现出显著的负因果关系(IVW:OR 0.611,95%CI 0....     

联苯胺对大鼠P53基因损伤作用及器官特异性研究

目的探讨联苯胺对大鼠作用的主要靶器官及其遗传毒性作用机制。方法将联苯胺腹腔注射染毒SD大鼠,提取肝、肺、肾及膀胱组织的DNA,运用单链探针依赖随机化末端连接物聚合酶链反应（RDPCR）技术检测其对大鼠p53基因外显子7的DNA损伤作用。结果杂交显色后在大鼠肝、膀胱、肺组织检测到了杂交条带,而肾组织未检测到杂交条带。结论联苯胺对大鼠p53基因外显子7具有DNA损伤作用,其致癌机制可能与p53基因损伤有关,联苯胺对大鼠的主要靶器官为肝、膀胱和肺。     

倾向性评分方法在观察性研究中的应用

倾向性评分方法是通过综合系列已知的可测量的协变量来模拟随机对照试验的随机化、提高组间的均衡性,进而降低混杂因素影响的一种分析策略.倾向性评分方法在观察性研究中应用越来越广泛.本文介绍了倾向性评分方法的原理、类型及其在观察性研究中的应用,同时对倾向性评分方法与多元回归、临床试验方法进行了比较.当前对倾向性评分方法的选择尚...     

牙周炎与妊娠期糖尿病因果关系的孟德尔随机化研究

目的 采用横断面研究和两样本孟德尔随机化（MR）方法探索牙周疾病与妊娠期糖尿病（GDM）之间的关联。 方法 选取 2018 年 1 月至 2022 年 1 月安徽医科大学附属口腔医院和安徽医科大学第一附属医院就诊的 105 名孕妇为研究对象,根据是否合并 GDM 分为 G1 组（GDM 孕妇,n=55）和 G2 组（健康孕妇,n=50）。通过问卷调查获得人口统计学特征等信息,并记录牙周专科检查结果,全基因组关联研究（GWAS）数据集选取与暴露变量显著相关的单核苷酸多态性（SNP）位点作为工具变量。选择的 MR 分析方法包括逆方差加权法（IVW）、MR Egger 回归法、加权中位数法和加权众数法。采用 Cochran’s Q 检验评估结果的异质性,采用 MR-Egger 回归检验水平多效性,MR-PRESSO 检测多因子残差和异常值的存在。 结果 二分类 logistic 回归模型显示,牙龈指数（GI）与 GDM 患病风险增加有关（OR=2.53,95% CI：1.10~6.17,P=0.034）。IVW 结果显示,牙周炎症可能是引发 GDM 的危险因素（OR=1.13,95%CI：1.01~1.28,P=0.037）。 结论 牙周炎与 GDM 存在因果关联,可能是 GDM 的潜在危险因素。     

脓毒症与心力衰竭：两样本孟德尔随机化研究

目的 观察性研究提示脓毒症与心力衰竭关系密切,但由于受到各种混杂因素的影响,导致它们之间的关系仍不确定。因此,笔者使用双样本孟德尔随机化(MR)来探索脓毒症与心力衰竭风险之间的因果关系。方法 本研究从两项最广泛的全基因组关联研究中获得了脓毒症和心力衰竭的汇总统计数据。为了使结果更加稳健和可靠,使用了几种稳健的分析方法(逆方差加权、MR-Egger回归、MR-PRESSO、最大似然比、简单中位数和加权中位数)进行了补充分析。此外,本研究采用MR-Egger截距检验、Cochran’s Q检验、漏斗图和“留一法”等对上述纳入的遗传变异工具变量的多效性和异质性水平进行评估。结果 笔者发现,脓毒症可能会增加心力衰竭发生的相对风险(OR=1.684,95%CI 1.587～1.786,P=0.001),而上述关系同样在加权中位数(OR=1.726,95%CI 1.585～1.881,P=0.001),MR-Egger回归(OR=1.768,95%CI 1.508～2.075,P=0.001),最大似然比(OR=1.686,95%CI 1.607～1.769,P=0.001),MR-PRESSO(...     

儿童肥胖与冠状动脉疾病的孟德尔随机化研究

目的 利用孟德尔随机化研究（MR）方法评估儿童肥胖与冠状动脉疾病（CAD）是否具有因果关联。方法 利用早期生长遗传学数据库和人体测量学特征遗传学研究数据库中2015年2～10岁儿童BMI的汇总数据,选取27个与儿童BMI相关的遗传变异作为工具变量。从对欧洲最大队列UK Biobank 2015年发布的CAD病例全基因组关联研究的Meta分析中,提取工具变量与CAD汇总水平的关联结果。采用MR-Egger方法进行工具变量的多效性检验,使用基于众数的方法进行MR分析检验儿童肥胖与CAD是否具有因果关联。结果 MR-Egger回归得到的截距项95% CI包含0（-0.008～0.018）,提示所选取的工具变量不具有多效性。儿童BMI每增加1个标准差,成年期患CAD的风险增加37%（OR=1.37,95% CI：1.09～1.72）。结论 儿童肥胖可能与其成年期患CAD的风险具有因果关联。     

Kelch-like3和Cullin3基因突变导致高血压和电解质异常

高血压影响全球大约10亿人口,是一个主要的、可逆转的心血管疾病危险因素。假性醛固酮减少症2型(pseudohypoaldosteronism type2,PHA2)是一种罕见的遵循孟德尔遗传规律的综合征,以高血压、