外周血白细胞DNA甲基化与肿瘤发病相关性Meta分析

目的通过Meta分析探讨外周血DNA甲基化与癌症风险相关性。方法分别在4个英文数据库（PubMed,ISI WOK databases,Science Online,OVID）和3个中文数据库（CNKI,万方和VIP）中系统检索文献,检索日期截至2013-08,英文数据库检索的主题词为DNA methylation,blood or leukocyte和cancer,tumor,carcinoma,neoplasm or malignancy,不限制语言,中文数据库检索的主题词为DNA甲基化,外周血或白细胞和肿瘤或癌。文献质量评估应用Newcastle-Ottawa Scale（NOS）。应用固定效应模型（异质性检验I2〈25%）或随机效应模型（异质性检验I2≥25%）估计总体比值比（OR）和95%可信区间（95%CI）。结果共有22项外周血全基因组DNA甲基化和20项外周血特定基因DNA甲基化研究纳入分析,外周血全基因组DNA低甲基化（OR=1.34,95%CI：1.12-1.60,I2=89.1%,P=0.001）和外周血特定位点DNA过甲基化（OR=1.37,95%CI：1.24-1.52,I2=93.2%,P〈0.001）增加肿瘤总体发病风险。肿瘤类型亚族分析发现,外周血全基因组DNA低甲基化水平增加膀胱癌（OR=1.96,95%CI：1.44-2.48,I2=85.1%,P=0.001）、结直肠癌（OR=1.85,95%CI：1.36-2.35,I2=61.1%,P=0.012）、胃癌（OR=1.38,95%CI：1.08-1.68,I2=37.7%,P=0.170）和肝细胞肝癌（OR=1.38,95%CI：1.03-1.73,I2=77.3%,P=0.012）的发病风险。结论外周血DNA甲基化水平与肿瘤发生存在相关性,可能成为流行病学人群筛查的重要生物指标。     

后全基因组病例对照研究时代的功能研究策略

自首次报道了有关人类年龄相关性黄斑变性的全基因组关联研究（GWAS）以来, 人们通过 GWAS 方法发现并鉴定了大量与人类复杂性疾病关联的遗传变异。 但是, 对这些遗传变异位点的生物学功能尚不十分清楚。 本文重点介绍了在后 GWAS 时代, 对疾病易感基因位点进行精细定位的方法和功能学研究进展。 在后 GWAS 时代, 遗传机制研究可以帮助临床深入地理解疾病的发病机制。     

不同年龄组人群CA125筛查卵巢癌最佳切点值探讨及验证

[目的]探索并验证不同年龄组人群CA125筛查卵巢癌的最佳切点值。[方法]基于天津市常见恶性肿瘤联合筛查项目人群及同期天津市常见恶性肿瘤病例队列人群，选取2017年以来基线未患癌且接受CA125检测的女性，通过多渠道随访匹配获得卵巢癌结局。采用Logistic回归的ROC曲线和曲线下面积（AUC）评价CA125筛查卵巢癌的总体准确性及最佳切点值。同时分别探讨<60岁、60～69岁和≥70岁不同年龄组的CA125筛查准确性及最佳切点值，以及相应年龄别特异性CA125筛查切点值下，卵巢癌筛查的灵敏度和特异度。采用Bootstrap重抽样方法进行内部验证，并采用PLCO试验人群进行外部验证。[结果]本研究纳入女性共41 620名，中位随访1.22年后，共计发现413例卵巢癌病例。CA125筛查卵巢癌的总体AUC为83.0%，最佳切点值为26.8 U/mL。根据年龄分组后，<60岁、60～69岁和≥70岁女性CA125筛查卵巢癌的AUC分别为78.8%、88.6%和89.1%，最佳切点值分别为26.8 U/mL、20.3 U/mL和28.0 U/mL。基于年龄别特异性的CA125筛...     

人SRGAP1蛋白结构和功能预测

目的: 利用生物信息学对人Slit-Robo GTP 酶激活蛋白1（SRGAP1） 蛋白质的理化性质,信号肽,亲水性/疏水性,跨膜区域,蛋白质二级结构、三级结构,蛋白质间的相互作用及GO注释进行预测分析。方法:使用多种分析软件对SRGAP1蛋白进行在线预测分析。结果:SRGAP1理化性质分析结果显示,人SRGAP1 蛋白有1 085个氨基酸,等电点为6.36;生物信息学预测分析结果显示,SRGAP1无信号肽,无跨膜结构的亲水不稳定蛋白质。二级结构存在19个α螺旋和11个β折叠,预测到10个与SRGAP1存在相互作用的蛋白。SRGAP1蛋白在调控GTP酶活性,细胞迁移,信号通路中有重要的作用。结论:系统预测分析了等电点为6.36的人SRGAP1蛋白理化性质、结构和功能,为将来探索SRGAP1具体功能和分子机制提供了一定的思路和理论基础。?     

成年人睡眠时间对体重增加和肥胖风险的Meta分析

目的 通过对前瞻性队列研究进行Meta分析, 探讨成年人睡眠时间和体重增加以及肥胖发生风险的关联。方法 在3个英文数据库PubMed、Embase和Cochrane Library以及3个中文数据库万方、维普、CNKI系统检索了截至2014年10月前发表的前瞻性研究, 英文检索词为sleep和body mass index或BMI或obese或obesity或weight, 中文检索词为睡眠和体重或肥胖或BMI。采用固定效应模型或者随机效应模型估计总体相对危险度(RR)和95%置信区间(CI)。结果 共有16篇文献符合纳入标准, 样本总量为285 452。相对于对照组, 睡眠过短或过多均与体重增加5 kg以上的风险有关, RR值分别为1.26(95%CI:1.12～1.42)和1.12(95%CI:1.04～1.20)。此外, 睡眠过短能显著增加肥胖的发生风险(RR=1.35, 95%CI:1.22～1.50, P<0.001), 而睡眠过久与肥胖的关联不显著。在亚组分析中, 该关联在高质量研究、以<6 h和≥8 h为界值的亚组中更强。结论 睡眠过短或过多均能显著导致体重增加, 同时睡眠过短显著增加肥胖的风险, 保持正常睡眠时间有助于防控肥胖的流行。