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目的:利用生物信息学筛选不同阻滞阶段非梗阻性无精子症(NOA)相关的调控因子及其调控途径,为后续的功能研究提供依据。方法:从GEO(Gene Expression Omnibus)数据库中获得GSE45885的基因表达谱矩阵,筛选其中的正常样本以及不同阻滞阶段NOA样本,包括4例正常生精样本和20例NOA患者样本,20例NOA患者中有2例患者处于减数分裂前期阻滞阶段(PRE),7例处于减数分裂期阻滞阶段(MEI),11例处于减数分裂后期阻滞阶段(POST)。将正常生精样本设置为对照组(CON),使用GEO2R在线工具鉴定正常生精样本与不同阻滞阶段NOA样本之间的差异基因,对GEO芯片中不同阻滞阶段的NOA数据整合归一化并进行矫正后取交集。对差异表达的基因以及其靶基因进行GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)富集分析,获取关键通路;基于在线工具(STRING)构建蛋白质相互作用(PPI)网络图。然后利用Cytoscape中的CytoHubba插件对枢纽基因进行筛选。结果:在PRE中筛选出463个上调基因,12个下调基因;在MEI和POST中分别发现2个和3个下调基因,无上调基因。PRE中上调基因通过一些重要途径,如精子发生、精子细胞发育、精子的运动、纤毛运动和微管形成等功能来调控生精过程。在上述的3个阻滞阶段NOA中筛选出2个共同差异基因,均为微小RNA(miRNA),2个miRNA有58个共同靶基因。利用在线生物信息学工具STRING成功构建PRE中上调基因的PPI网络图,并使用Cytoscape筛选出网络中前10个枢纽基因,包括DNAI1、DNAI2、PGK2、ROPN1L、ARMC4、DRC1、DNAAF3、CABYR、ZMYND10和CCDC65。结论:识别枢纽基因和共同差异基因及其通路为后续研究NOA的发生机制提供了有价值的参考,DRC1、ARMC4、MIR15A和MIR509-3可作为后续NOA发病机制研究的潜在靶点。 相似文献
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目的 研究甘草中有效组分对脓毒血症的防治作用及机制。方法 采用小鼠骨髓来源巨噬细胞(bone marrow-derived macrophages,BMDM)构建体外NOD样受体热蛋白结构域相关蛋白3(NOD-like receptor thermal protein domain associated protein 3,NLRP3)炎症小体激活模型及H2O2诱导的氧化应激模型筛选出甘草抗炎、抗氧化应激的有效组分,采用ip脂多糖(lipopolysaccharide,LPS,20 mg/kg)诱导C57BL/6小鼠脓毒血症致死模型以及脓毒血症模型,评价致死模型中小鼠的生存率及脓毒血症模型小鼠腹腔灌洗液中巨噬细胞和中性粒细胞在渗出细胞中的占比以及外周血和腹腔灌洗液中白细胞介素-1β(interleukin-1β,IL-1β)及肿瘤坏死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)水平。结果 基于BMDM细胞NLRP3炎症小体激活模型筛选出甘草中有效组分刺甘草查耳酮,可显著抑制半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-1(cystein-asparate protease-1,Ca... 相似文献
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目的探究扩张性心肌病(dilated cardiomyopathy,DCM)患者骨代谢指标水平状况及其临床意义。方法选取2016年3月至2018年3月在我院诊治的DCM患者48例作为研究对象并归入DCM组,选择同期在我院接受健康体检的成年人30名归入健康组,测定和比较两组的血清骨钙素(BGP)、钙(ICa)、骨特异性碱性磷酸酶(BALP)、甲状旁腺激素(PTH)、25羟基维生素D_3[25(OH) D_3]等骨代谢指标水平,以及大粗隆、股骨颈、腰椎等部位的骨密度(BMD),分析骨代谢指标BGP、ICa、BALP、PTH和25(OH) D_3分别与患者年龄、DCM病程、BMI、肌酸激酶同工酶、肌钙蛋白I和心功能分级等因素的相关性。结果(1) DCM组的BGP、ICa、25(OH) D_3等水平均低于健康组,BALP、PTH水平均高于健康组,差异均有统计学意义(P均0.05)。(2) DCM组大粗隆部位的BMD与健康组比较,差异无统计学意义(P0.05); DCM组的股骨颈及腰椎部位的BMD均低于健康组,差异均有统计学意义(P均0.05)。(3) BGP、ICa和25(OH) D_3分别与年龄、DCM病程及心功能分级呈负相关,BGP与肌酸激酶同工酶、肌钙蛋白Ⅰ呈负相关; BALP与年龄、DCM病程、肌酸激酶同工酶、肌钙蛋白Ⅰ及心功能分级呈正相关,PTH与心功能分级呈正相关(P均0.05)。结论 DCM患者的血清BGP、ICa、BALP、PTH、25(OH) D_3等骨代谢相关指标水平有明显波动,且骨代谢相关指标水平与DCM患者年龄、病程、肌酸激酶同工酶、肌钙蛋白Ⅰ及心功能分级等相关,DCM可能是造成骨代谢指标水平发生异常的重要原因。 相似文献
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