基于气相色谱质谱联用仪的糖尿病胃轻瘫大鼠血清代谢组学研究

目的:分析2型糖尿病胃轻瘫组大鼠与正常组大鼠血清分子代谢物代谢轮廓的变化?方法:应用气相色谱和质谱联用仪方法,通过偏最小二乘法-判别分析方法(partial least squares linear discriminant analysis,PLS-DA)和正交偏最小二乘法-判别分析方法(orthogonal partial least squares linear discriminant analysis,OPLS-DA),鉴别糖尿病胃羟瘫组和正常组间血清小分子代谢物的区别?结果:两组血清的多种氨基酸成分有显著差异,与正常组比较,糖尿病胃轻瘫组苏氨酸?丙氨酸?甘氨酸?肌酸及苯丙氨酸含量明显下降,尿酸含量明显上升?结论:甘氨酸?肌酸?苯丙氨酸等多种氨基酸含量的变化可能与糖尿病胃轻瘫的发病机制有关?     

标准化方法对大鼠尿液 1H磁共振谱 代谢物分析结果的影响

目的：采用磁共振（magnetic resonance, MR）波谱技术测试不同性别大鼠尿液代谢物并用不同标准化方法进行预处理,探讨不同标准化方法对分析结果的影响。方法：大鼠尿液MR 图谱数据经过中心化（mean-centering and not scaling,Ctr）和自动规格化（unit variance scaling,UV）两种不同标准化方法处理后用正交偏最小二乘判别分析（orthogonal to partial least squares discriminant analysis, OPLS-DA）法分析,通过相关系数的计算确定不同性别大鼠尿液中含量有差异的代谢物。结果：数据进行中心化处理后判别出两组大鼠尿液中缬氨酸、乙酸、鸟氨酸、氨基马尿酸、苯乙胺、氧氨嘧啶、甲胺、二甲胺、尿囊素、延胡索酸、丙氨酸、柠檬酸和化学位移在δ4.14的一种未知代谢物等13种代谢物含量有差异。进行自动规格化处理后,判别出以上除柠檬酸外的12种代谢物以及硫胺、肌酸酐、甲酸和化学位移在δ2.92的一种未知代谢物等4种代谢物含量有差异。结论：自动规格化处理是代谢组学研究中比较灵敏的数据预处理手段。     

标准化方法对大鼠尿液~1H磁共振谱代谢物分析结果的影响（英文）

目的：采用磁共振（ magnetic resonance, MR）波谱技术测试不同性别大鼠尿液代谢物并用不同标准化方法进行预处理,探讨不同标准化方法对分析结果的影响。方法：大鼠尿液MR图谱数据经过中心化（ mean-centering and not scaling,Ctr）和自动规格化（unit variance scaling,UV）两种不同标准化方法处理后用正交偏最小二乘判别分析（orthogonal to partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA）法分析,通过相关系数的计算确定不同性别大鼠尿液中含量有差异的代谢物。结果：数据进行中心化处理后判别出两组大鼠尿液中缬氨酸、乙酸、鸟氨酸、氨基马尿酸、苯乙胺、氧氨嘧啶、甲胺、二甲胺、尿囊素、延胡索酸、丙氨酸、柠檬酸和化学位移在δ4.14的一种未知代谢物等13种代谢物含量有差异。进行自动规格化处理后,判别出以上除柠檬酸外的12种代谢物以及硫胺、肌酸酐、甲酸和化学位移在δ2.92的一种未知代谢物等4种代谢物含量有差异。结论：自动规格化处理是代谢组学研究中比较灵敏的数据预处理手段。     

基于超高效液相色谱-高分辨质谱联用技术研究苦参醇提物致大鼠肝毒性的尿液代谢组

目的 观察苦参醇提物（Sophora flavescens alcohol extract,SFAE）对大鼠尿液代谢轮廓的影响,探讨SFAE可能的肝毒性机制。方法 将雄性SD大鼠分为3组,每组6只,分别灌胃给予SFAE 0、1.25、2.5 g/kg,14 d后,采用超高效液相色谱-高分辨质谱（ultra-performance liquid chromatography-high resolution mass spectrometry,UPLC-HRMS）检测大鼠尿液中代谢物的变化。采用主成分分析（principal components analysis,PCA）和正交偏最小二乘法判别分析（orthogonal partial least squares discriminant analysis,OPLS-DA）对组间代谢物进行多元统计分析,筛选潜在的生物标志物,并分析相关的代谢通路。结果 3组大鼠尿液中代谢物在14 d后得到很好的区分,发现并鉴定出15个主要的差异代谢物,其中N6,N6,N6-三甲基-L-赖氨酸、胆酸、甘氨胆酸、脱氧胆酸、马尿酸和肌酸与肝脏毒性关系密切,二氢鞘氨醇和酮戊二酸表达水平降低,其余13种差异代谢物表达水平升高,苦参主要干扰大鼠体内胆汁酸代谢、能量代谢和氨基酸代谢等代谢通路。结论 SFAE对大鼠产生肝毒性,且肝毒性与给药剂量呈正相关。     

基于~1HNMR法对痰热壅肺型COPD急性加重期患者血清代谢组学的研究

目的:采用~1H核磁共振(~1H nuclear magnetic resonance,~1HNMR)法研究痰热壅肺型慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)急性加重期患者血清的特征性代谢物。方法:30例痰热壅肺型COPD急性加重期患者入院后24 h内且经过中西医结合治疗进入稳定期后各采集空腹静脉血2 mL,应用~1HNMR方法检测得到两组患者血清的一维氢谱图,采用SIMCA-P+软件对氢谱图的积分值进行主成分分析(principal component analysis,PCA)和偏最小二乘法判别分析(partial least squares discrimination analysis,PLS-DA)以判别两组血清代谢物有无差异。采用正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least square-discriminant analysis,OPLS-DA)判断特征性差异代谢物。结果:PCA和PLS-DA提示两组血清代谢物及其积分值存在部分交叉,但差异有统计学意义(P0.05)。OPLS-DA提示,R~2X=32.6%,Q~2=-0.448,说明模型预测效率中等。与稳定组比较,急性加重组血清丙酮酸、3-羟基丁酸、赖氨酸、谷氨酸和谷氨酰胺水平明显升高(P0.05),而缬氨酸、亮氨酸、异亮氨酸、丙氨酸、胆碱、1-甲基组氨酸、组氨酸等水平明显下降(P0.05),说明COPD急性加重期存在明显的能量、蛋白质代谢紊乱。结论:痰热壅肺型COPD急性加重发作主要与能量和蛋白质代谢紊乱有关。     

寻常痤疮患者血清脂质代谢组学分析

目的 分析中重度痤疮患者与健康对照之间血清脂质代谢组学差异，了解痤疮患者血清脂质代谢特征。方法 2019年5月—2020年4月于西南医科大学附属医院皮肤科采集30例中重度痤疮患者血清，同时收集30例年龄、性别、体质量指数匹配的健康对照者血清，采用液相色谱-串联质谱法（liquid chromatograph mass spectrometer, LC-MS）进行血清脂质代谢组学分析。采用偏最小二乘法判别分析（partial least squares discrimination analysis, PLS-DA）对差异表达的脂质代谢物进行多变量统计分析。通过京都基因与基因组百科全书（Kyoto encyclopedia of genes and genomes, KEGG）数据库筛选两组间具有显著差异的代谢途径。利用Mann-Whitney U检验方法计算差异代谢产物。采用Spearman相关性分析，分析血清PC(18:2e/20:2)浓度和痤疮严重程度相关性。结果 PLS-DA结果显示，痤疮患者血清脂质代谢物组成与健康对照呈明显分离趋势，在差异最显著的前30种脂质代谢产物中，痤疮患...     

基于核磁共振波谱的鼻咽癌患者血清代谢组研究

目的 应用核磁共振氢谱(nuclearmagnetic resonancc1H,1H NMR)和偏最小二乘法.判别分析(partial least square-discriminant analysis,PLS-DA)研究鼻咽癌(NPC)患者血清中代谢物的代谢组变化.方法 健康人血清10例和鼻咽癌患者血清2l例,采用...     

HPLC-UV技术用于川木香煨制前后代谢物轮廓差异研究

目的 比较川木香煨制前后代谢物轮廓（metabolic profiling）差异,筛选出导致差异的特征性化学成分。方法 经HPLC-UV分析获得川木香生品、煨品的色谱图数据集;采用主成分分析（principal component analysis,PCA）、偏最小二乘法-判别分析（partial least square-discriminant analysis,PLS-DA）、聚类分析（hierarchical cluster analysis,HCA）等多变量统计分析方法比较川木香生品、煨品的代谢物轮廓差异及筛选导致差异的特征性化学成分。结果 川木香生品和煨品代谢物轮廓明显不同,导致差异的特征性化学成分有7个（包含木香烃内酯和去氢木香内酯）。结论 从代谢物轮廓角度,川木香煨制前后具有显著差异。     

密蒙花中4种成分的含量测定及其主成分、偏最小二乘判别分析

目的 建立同时测定密蒙花药材中4种成分含量的方法,并进行主成分分析（principal component analysis,PCA）和偏最小二乘判别分析（partial least squares discriminant analysis,PLS-DA）。方法 采用超高效液相色谱法,色谱柱为Waters ACQUITY UPLC BEH C18,流动相为乙腈-0.1％磷酸溶液（梯度洗脱）,流速为0.15 mL/min,检测波长为330 nm,柱温为30 ℃,进样量为2 μL。采用SIMCA 14.1统计软件对含量测定结果进行PCA和PLS-DA研究。结果 4种指标性成分的线性、分离度、稳定性、重复性与精密度良好;24批药材样品有2个主成分,PLS-DA分析确定了2个分类标志物。结论 本研究建立的方法的精密度、稳定性、重复性均较好,可用于密蒙花药材中4种成分含量的同时测定;不同产地的密蒙花药材质量差异较大。     

老龄肾阳虚证患者血清代谢组学特征研究

目的 运用代谢组学方法探究老龄肾阳虚证患者血清特征性生物代谢标志物及相关代谢通路，以期阐明老龄肾阳虚证的本质。方法 收集中医辨证符合老龄肾阳虚证患者15例及同年龄段健康者12例血清样品，采用超高效液相色谱-串联质谱(UPLC-MS/MS)技术检测两组血清样本中代谢物及代谢提取物，并结合主成分分析(principal component analysis,PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(orthogonal partial least squares-discriminant Analysis,OPLS-DA)等技术对血清样品进行研究，找出不同代谢物，运用Metaboanalyst 5.0数据处理软件对差异代谢物进行网络分析，聚焦关键代谢通路。结果 代谢组学分析表明老龄肾阳虚证患者血清代谢物轨迹变化明显，通过生物信息学分析，筛选到49种差异代谢物，涉及氮代谢、苯丙氨酸代谢、D-谷氨酰胺代谢、D-谷氨酰胺代谢、丁酸代谢、泛酸酯和CoA合成、酪氨酸、色氨酸、精氨酸、氨基酰-tRNA等多种代谢途径。结论 与同年龄段健康者相比，老龄肾阳虚证患者体内存在着能量代谢、脂肪代谢和氨基酸代谢活动减退...