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相似文献
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1.
基于网络药理学、分子对接技术和体外实验验证探究黑果小檗花色苷防治阿尔茨海默病(Alzheimer′s disease, AD)的潜在作用机制。借助数据库和在线平台筛选黑果小檗花色苷活性成分的潜在靶点和AD相关作用靶点,运用STRING数据库和Cytoscape软件对两者共同靶点进行蛋白相互作用网络构建和拓扑学分析,利用DAVID数据库进行基因本体(GO)功能注释和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,对活性成分和NF-κB/TLR4通路相关靶点进行分子对接,然后利用脂多糖诱导BV2细胞构建AD神经炎症模型进行体外实验验证。该研究共筛选出黑果小檗活性成分潜在作用靶点426个,药物-疾病共同靶点329个,蛋白-蛋白网络互作筛选出14个关键靶点,富集分析得到623个GO功能富集条目和112个KEGG通路富集条目;分子对接结果显示活性成分和NF-κB、IκB、TLR4和MyD88有较好的结合能力,其中结合能力最强的是锦葵素-3-O-葡萄糖苷;同时,与模型组比较,不同剂量锦葵素-3-O-葡萄糖苷在不影响BV2细胞存活率的情况下,一氧化氮浓度均显著下降;同时锦葵素-3-O-葡萄糖苷可下...  相似文献   

2.
张国玉  燕树勋 《中成药》2023,(4):1358-1363
目的 探讨雷公藤多苷治疗桥本病的潜在作用机制。方法 利用TCMSP数据库、文献挖掘获得雷公藤多苷活性成分,PharmMapper数据库预测活性成分靶点,GeneCards、OMIM数据库获得桥本病相关靶点,利用Venn在线工具筛选两者的交集基因,STRING平台构建蛋白相互作用(PPI)网络,DAVID数据库对交集基因进行GO功能、KEGG通路富集分析,构建活性成分-靶点-通路网络。最后通过分子对接工具SYBYL X2.0进行分子对接。结果 筛选出雷公藤多苷活性成分30种,成分靶点82个,疾病靶点1 373个,交集靶点38个,GO分析8个条目,KEGG分析46条通路,成分-靶点网络的重要靶点与成分-桥本病靶点-通路网络的重要靶点的交集是CASP3、EGFR、MAPK1、MAPK8,雷公藤弗定B1是唯一与4个靶点均有关联的化合物。分子对接结果显示,雷公藤弗定B1与交集靶点结合良好。结论 雷公藤多苷中多种活性成分通过调控NF-κB、MAPK、PI3K/Akt等信号通路作用于介导细胞凋亡的CASP3、EGFR等多个靶点来治疗桥本病。  相似文献   

3.
目的:采用网络药理学方法筛选三仁汤君药药对(SRJMP)的活性成分及核心靶点,探讨三仁汤君药药对治疗肺癌的作用机制。方法:依托中药系统药理学分析平台(TCMSP),检索三仁汤 3 味中药相关的所有化学成分及预测作用靶点,采用STRING 数据库与 Cytoscape 软件构建“药物-活性成分-靶点”网络和蛋白互作网络,通过 ClusterProfiler、ClueGO、DAVID 数据库对核心靶点进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集。把候选作用靶点映射在 KEGG 通路图上分析结果,最后应用 AutoDock 软件进行分子对接。结果:共筛选出 40 个活性成分和 222 个相应蛋白靶点。首要分析核心靶点47 个,GO 分析共包含 117 条富集结果,KEGG 通路富集筛选出 30 条通路。结论:通过网络药理学验证了 SRJMP 多成分、多靶点、多通路的特点,其可能是通过调控免疫细胞分化,肿瘤相关信号通路以及干预细胞代谢过程,达到抗肿瘤作用。  相似文献   

4.
王玉  杨雪  靳晓杰  杨飞霞  王玉霞  王菲  樊秦  张建  武晓玉  夏鹏飞  赵磊 《中草药》2020,51(20):5207-5219
目的采用GEO数据库、整合药理学平台v2.0和分子对接技术探讨大黄抗肝癌的活性成分及其分子机制。方法利用中医药整合药理学平台(TCMIP)筛选中药大黄的活性成分,借助TCMIP及Swisstarget在线数据库预测作用靶点;从GEO数据库下载肝癌基因芯片数据库,利用GEO2R分析肝癌组织与正常肝组织之间的差异表达基因。基于大黄潜在靶点与肝癌靶点的匹配结果筛选大黄抗肝癌的关键靶点,并对关键靶点进行基因本体论(GO)功能、基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。通过构建蛋白互作网络(PPI)、成分-靶点网络及中药-成分-靶点-通路网络,分析并筛选大黄抗肝癌的主要成分和核心靶点。进一步采用Schrodinger-Maestro软件对核心靶点与主要活性成分进行分子对接,以虚拟验证其结合能力并分析其结合模式。结果筛选得到大黄抗肝癌活性成分20个,作用靶点86个,涉及CDK1、AKR1C3、PTGS2、AR、CCNB1等。GO功能富集主要集中在细胞周期、有丝分裂、氧化还原过程、药物反应、类固醇代谢过程等。KEGG通路富集主要涉及细胞周期、细胞衰老、补体系统、花生四烯酸代谢、胆汁代谢等,且这些代谢通路与细胞凋亡、转移、炎症和免疫相关。分子对接结果显示92.2%的活性成分与10个核心靶蛋白均具有较好的结合力,且结合形式多以氢键、疏水键、π-π键和阳离子-π键为主。结论大黄中的大黄酸、大黄素、大黄酚-8-O-β-D-吡喃葡萄糖苷、大黄酚-1-O-β-D-葡萄糖苷、丹叶大黄素等活性成分能够作用于CDK1、CCNB1、CYP2C9、MMP9、PTGS2等多个靶点,通过调节与细胞凋亡、转移、炎症、免疫相关的信号通路进而发挥抗肝癌作用。  相似文献   

5.
目的:通过网络药理学和分子对接技术,探讨黄芪-白花蛇舌草抗非小细胞肺癌(NSCLC)的潜在活性成分和作用机制。方法:利用TCMSP和Uniprot数据库获取黄芪-白花蛇舌草的主要活性成分及靶点基因;GeneCards、OMIM数据库获取NSCLC靶点基因;绘制韦恩图得到疾病和活性成分共同靶点;STRING数据库构建中药成分靶蛋白-疾病靶蛋白的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络;Cytoscape 3.9.1软件绘制成分-靶点网络图,通过网络拓扑分析筛选出关键靶点及成分;DAVID数据库及Bioinformatics平台进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;PyMol软件和AotoDock软件绘制相应的分子对接图。结果:经筛选共得到653个黄芪-白花蛇舌草活性成分靶点和6178个疾病靶点,两者交集靶点154个。GO功能富集到747个生物过程、83个分子功能和150个细胞组分,KEGG通路富集分析得到167条信号通路。分子对接结果显示,PTGS1蛋白与活性成分槲皮素、山柰酚、芒柄花黄素均结合稳定。结论:黄芪-白花蛇舌草可能通过槲皮素、山柰酚、芒柄花黄...  相似文献   

6.
目的:基于网络药理学和分子对接技术探讨白头翁汤抗结直肠癌的作用机制。方法:利用中药系统药理学分析平台(TCMSP)筛选白头翁汤的活性成分和对应靶点,利用疾病靶点数据库查找结直肠癌靶点,并通过venny2.1.0软件得到交集靶点,通过STRING数据库构建靶点互作网络图;采用Cytoscape软件构建方剂-药物-成分-靶点网络,对交集靶点进行GO和KEGG富集分析,最后采用分子对接技术对主要活性成分和关键靶点的结合能力进行验证。结果:白头翁汤包括白头翁、黄连、黄柏、秦皮4个主要活性成分以及182个潜在作用靶点,GO富集分析显示基因富集于2226条生物过程(BP)、70个细胞组成(CC)及197种分子功能(MF);KEGG富集分析提示共同靶点富集于171条通路,分子对接提示主要活性成分与关键靶点具有较好对接活性。结论:白头翁汤对结直肠癌的治疗作用发挥可能与槲皮素、β-谷甾醇、豆甾醇等成分调控TP53、MAPK1、MAPK14、RELA等基因以及影响TNF、IL-17等信号通路相关。  相似文献   

7.
刘远财  周夏成  陈卓  杨佳颖  张爱琴 《新中医》2023,55(11):146-155
目的:运用网络药理学方法及分子对接初步预测苦杏仁-桔梗药对治疗肺癌的主要靶点及其作用机制,再通过体外实验验证部分关键靶点及其通路。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、SwissTargetPrediction、GeneCard数据库获取活性成分和靶点,利用UniProt数据库将靶点标准化,通过在线veny2.1绘制韦恩图。运用STRING数据库绘制靶点的PPI网络图,使用Cytoscape3.8.2软件建立“药物-成分-靶点”“核心蛋白-蛋白”网络关系图,利用Matescape数据库进行GO和KEGG通路富集分析。通过PyMOL、AutoDockTool 1.5.6软件进行分子对接。用不同浓度的小鼠含药血清培养Lewis肺癌细胞,CCK8检测细胞活性,流式细胞Annen V-FITC/PI标记法检测细胞凋亡率,实时荧光定量PCR技术、Western Blot检测Lewis肺癌细胞中SRC蛋白表达水平。结果:获得苦杏仁-桔梗有效活性成分23个,靶点为227个,关键靶点为SRC,KEGG富集程度较高的为PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路等。分子对接显示结合能良好...  相似文献   

8.
目的:基于网络药理学、分子对接技术预测正源方抗肝纤维化的作用机制,并进行细胞水平实验验证。方法:使用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)及文献检索获得正源方活性成分,通过PubChem、SwissTargetPrediction、Similarity Ensemble Approach数据库筛选活性成分潜在靶点,通过OMIM、GeneCards疾病数据库收集肝纤维化的相关靶点,运用Venny平台获得正源方与肝纤维化交集靶点,利用String数据库建立蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并通过Cytoscape-CytoNCA拓扑分析筛选核心靶点,利用String数据库进行基因本体功能注释(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,利用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点-通路网络,使用AutoDock Vina软件模拟关键候选活性成分与核心基因的结合活性。建立人转化生长因子-β1(TGF-β1)诱导的人肝星状细胞LX2活化模型,噻唑蓝(MTT)比色法检测细胞活性,蛋白免疫印迹法(WB)检测磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路相关蛋白表达。结果:网络药理学筛选得到正源方活性成分145个及相关靶点1109个,肝纤维化靶点1573个,正源方抗肝纤维化潜在作用靶点415个,拓扑分析得关键靶点61个;PPI网络分析核心靶点为Akt1、血管内皮生长因子A(VEGFA)、白细胞介素-1β(IL-1β)等,GO富集分析得到1753个条目,其功能主要与细胞凋亡、细胞增殖、酶结合等有关;KEGG富集分析得到174个条目,主要涉及癌症通路、PI3K-Akt通路、细胞凋亡通路等;分子对接显示,槲皮素、木犀草素、熊果酸等与Akt1、VEGFA、Jun原癌基因(JUN)等靶点结合活性较强;细胞实验结果表明,不同剂量的正源方给药后,可以显著抑制TGF-β1诱导的LX2细胞的活化,降低磷酸化PI3K(p-PI3K)/PI3K、磷酸化Akt(p-Akt)/Akt蛋白表达,且具有质量浓度依赖性。结论:正源方可能通过多靶点、多通路发挥抗肝纤维化作用,其机制可能与抑制肝星状细胞活化、调控PI3K-Akt信号通路有关。  相似文献   

9.
基于网络药理学、分子对接技术及细胞实验预测灵芝抗胃癌的分子机制。利用中药系统药理学分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集灵芝的活性成分和作用靶点。通过GeneCards和OMIM数据库获取胃癌相关的靶点。筛选获得两者的共同靶标后,利用STRING数据库进行构建蛋白互作网络,并且利用Bioconductor平台和R语言进行基因本体(Gene Ontology,GO)生物进程及京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。同时应用Cytoscape软件构建"草药-疾病-成分-靶点"网络和"草药-疾病-成分-靶点-通路"网络。另外选取灵芝的关键活性成分β-谷甾醇与蛋白互作网络前15个靶标进行分子对接。最后利用细胞实验进一步验证上述结果。该实验分别获取灵芝活性成分14个,灵芝相关靶点28个,并且收集灵芝与胃癌的共同靶点25个,包括caspase-3(CASP3)、caspase-8(CASP8)、caspase-9(CASP9)和B-cell lymphoma-2(BCL2)等。KEGG通路分析筛选了72条相关信号通路,显示细胞凋亡和p53信号通路可能在灵芝抗胃癌的过程中起关键作用。分子对接结果表明β-谷甾醇与蛋白互作网络前15个靶标对接良好。细胞实验表明β-谷甾醇通过调控细胞凋亡和细胞周期,有效抑制人胃癌细胞AGS增殖,这可能与p53信号通路有部分关系。以上结果表明,灵芝抗胃癌具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点,为后续深入研究灵芝抗胃癌的复杂机制提供了理论依据。  相似文献   

10.
基于网络药理学方法和分子对接技术研究金芪降糖片对胰岛β细胞的改善作用及潜在机制。通过TCMSP平台检索获取金芪降糖片中3味药的有效化学成分以及各化合物潜在作用靶点,利用UniProt数据库转换为gene symbol,与GeneCards和CTD数据库中与胰岛β细胞功能相关的靶标取交集,将药物、有效成分、共同靶标导入Cytoscape 3.8.2绘制"药物-成分-靶点"网络,利用软件分析功能得到主要药效成分及靶点。将药物作用靶点与胰岛β细胞功能相关靶点分别导入STRING平台中构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络,利用Cytoscape 3.8.2软件中Merge插件合并2个蛋白互作网络,并利用CytoNCA插件分析获取关键靶标。将"药物-成分-靶点"网络中所得核心靶点与蛋白互作网络中Merge所得核心靶点导入DAVID数据库进行GO分析和KEGG富集分析。最后利用AutoDock软件实现核心成分与关键靶点分子对接,并用Pymol软件绘制分子对接模式图。结果显示,与金芪降糖片相关有效成分共有371个,203个靶点。与胰岛β细胞受损相关靶点共2 523个,其中共同靶点136个,Cytoscape分析得到PTGS2、PTGS1、NOS2、ESR1、RXRA等关键靶点,槲皮素、山柰酚、木犀草素、β-胡萝卜素、β-谷甾醇等核心成分。KEGG富集分析主要涉及凋亡、炎症等信号通路。分子对接结果显示主要活性成分与靶点均能自发结合。该研究初步揭示了金芪降糖片通过多成分、多靶点、多通路改善胰岛β细胞受损的作用机制,为金芪降糖片的临床应用及改善胰岛β细胞受损提供科学依据和研究思路。  相似文献   

11.
流感相关性脑病是流感危重症患者死亡的主要原因之一,但因病例数量较少、科学研究有限等原因,尚无针对该病的系统、深入的阐述。为了提高临床医生及科研人员对该病的认识,文章广泛收集国内外流感相关性脑病的文献资料,从概念、流行病学特征、诊断、鉴别诊断、发病机制、治疗、预后、预防等几个方面进行了概述,以供同行参考。  相似文献   

12.
廖蓉 《内蒙古中医药》2011,30(3):146-148
目的:探讨甲型H1N1流感患者的护理方法。方法:回顾分析我院2009年8月至2010年1月收治的112例患者的临床资料。结果:112例患者治愈出院。结论:对甲型H1N1流感患者在治疗的同时,有针对性采取护理措施以及严格的消毒隔离制度,是救治甲型H1N1流感的保证。  相似文献   

13.
通过广泛收集中医药预防流行性感冒的相关资料,从预防方法、临床观察、辨证施防三方面对中医药预防流感的方法和进展情况做了综述。预防方法包括内服中药法、中药外用法、环境消毒法等。临床观察分为非对照研究和对照研究。同时列举了众多预防流感方药和方法。  相似文献   

14.
流感病毒裂解效果研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
目的 不同时间裂解甲乙型流感病毒,测定血凝效价,找出最佳裂解条件。方法 甲乙型单价病毒液中分别加入0.5%—0.6%TritonN—101,室温振荡一定时间后取样,电镜观察结果。结果 经过观察Al和A3型流感病毒在3—4h、乙型流感病毒在4—5h效果较好。结论 流感疫苗生产中甲乙型流感病毒的裂解应采取不同时间以获得最佳效果。  相似文献   

15.
目的探讨济宁市甲型H1N1流感确诊病例的临床特点。方法分析2009年11月5日至12月12日济宁市第一人民医院收治的甲型H1N1流30例确诊病例的流行病学及临床资料。结果30例甲型H1N1流感确诊病例的临床特点:(1)不同性别和各年龄段均可感染和发病,但主要见于青少年,女性患者偏多。(2)首发症状多为发热,大多数为中低热,发热持续时间为1~4d;主要症状包括发热(96.7%)、咳嗽(90%)、咽痛(30%)主要体征为咽部充血(86.7%)、扁桃体肿大(10%);少数患者可出现病毒性肺炎。(3)血清c反应蛋白升高和前白蛋白下降比较常见。(4)在奥司他韦治疗的前提下,患者病毒转阴时间1~7d,中位时间4d。结论济宁市30例甲流重症患者临床表现基本符合国家发布的甲流重症患者的临床表现。  相似文献   

16.
目的:观察辟秽香囊抗甲型、乙型流感病毒的作用。方法:将辟秽香囊与小鼠置于同一密闭容器,4d后使小鼠感染甲型和乙型流感病毒,比较小鼠肺指数和存活率。结果:辟秽香囊可减轻甲型、乙型流感病毒所致小鼠肺病变,降低肺指数值,且可明显降低甲型、乙型流感病毒感染小鼠的死亡数,延长小鼠存活天数。结论:辟秽香囊具有抗甲型、乙型流感病毒的作用。  相似文献   

17.
青天葵抗甲、乙型流感病毒作用研究   总被引:1,自引:0,他引:1  
王振华  杜勤  张奉学 《时珍国医国药》2007,18(12):2940-2941
目的研究青天葵在体外抗甲、乙型流感病毒株作用。方法选用狗肾细胞培养法考察青天葵不同极性部位对甲型(FM1)、乙型(昆40B)流感病毒的作用。结果青天葵水溶性部位对甲型流感病毒FM1有抑制作用。结论青天葵具有体外抗甲型流感病毒作用。  相似文献   

18.
目的 观察麻杏石甘汤加味治疗妊娠期流感的疗效以及对孕妇和胎儿的影响.方法 妊娠期流感患者100例随机分为2组,治疗组55例,对照组45例.对照组采用西医对症处理,合并感染者给予青霉素800万U静脉滴注,3d为1个疗程;治疗组在对照组的基础上给予麻杏石甘汤加味,头煎300ml,次煎200ml,早晚分服,3d为1个疗程.结果 病人持续发热、症状消失及住院时间比较,治疗组显著少于对照组(P<0.01);先兆流产发生率治疗组少于对照组(P<0.01).结论 麻杏石甘汤有抗流感作用,且对孕妇无不良影响.  相似文献   

19.
综述流感并肝损伤的发生概况,分析流感并发肝损伤的主要发生机制,为流感并发肝损伤患者的治疗提供一定依据。  相似文献   

20.
近年来流感频发,已经成为影响居民健康的重大公共卫生问题。文章广泛收集国内外流感相关心肌损害的文献资料,从概念、流行病学特征、诊断、鉴别诊断、发病机制、治疗、预后、预防等几个方面进行了概述。  相似文献   

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