野生红景天的RAPD和ISSR遗传多样性分析

目的采用RAPD和ISSR分子标记进行野生红景天种间亲缘关系及种内的遗传多样性分析。方法用CTAB法提取基因组DNA,然后通过筛选得到的11个RAPD及11个ISSR引物对不同采集地的4种野生红景天进行遗传多样性分析。结果 11条RAPD引物共扩增出96条条带,多态性百分比为90.62%;11条ISSR引物共扩增出102条条带,多态性百分比为100%。ISSR多态性的检测能力优于RAPD;聚类分析结果表明,ISSR法、RAPD和ISSR联用法均将17个样品聚为3大类;RAPD将样品聚为4大类。结论 2种标记均可用于红景天属植物种间亲缘关系与种内遗传多样性研究;4种红景天种内存在一定的遗传差异,种间基因流较小。     

泽泻种质资源ISSR遗传多样性研究

目的建立泽泻ISSR分子标记的方法,对23份不同产地泽泻的遗传多样性和亲缘关系进行分析。方法采用ISSR分子标记技术和非加权平均距离法(UPGMA)对23份泽泻样品进行遗传多样性和聚类分析。结果从100条ISSR引物中筛选出35条多态性稳定、清晰的引物,在23份泽泻样品中扩增出172个稳定的扩增点,其中122个有多态性,多态位点百分率为70.5%。Nei's基因多样性(He)为0.4196,Shannon's信息指数为0.6081。结论 23个不同产地泽泻品种间多态性较高,但没有呈现明显的地域性差异。     

利用SRAP和ISSR标记分析穿龙薯蓣遗传多样性

目的:对30个野生居群的穿龙薯蓣进行遗传多样性与亲缘关系分析。方法:采用ISSR、SRAP分子标记法。结果:ISSR标记平均每条引物扩增条带数为16.1个DNA片段,SRAP标记平均每条引物扩增条带数为29.5个DNA片段,多态性条带百分率均为100%。SRAP标记多态性比率高于ISSR标记;按照种质间相似系数得出聚类图,表明基于SRAP分子标记的野生穿龙薯蓣居群间的遗传相似性与其实际生长的地理位置(距离)间有一定关系。结论:利用SRAP和ISSR标记方法可以确定穿龙薯蓣的遗传多样性。     

人参种源遗传关系的ISSR分析

目的阐明不同种源人参的遗传关系。方法用ISSR分子标记研究来自人参主要分布区17个种源样本。结果从100个ISSR引物中筛选出10个条带清晰、多态性高的引物,共扩增出95条带,其中80条带为多态性位点,多态性条带比率(PPB)为84.21%,通过聚类分析,可将17个人参种源聚为4类。结论分子标记研究结果与人参的形态性状存在显著的相关性,较好地揭示了人参种源间的遗传关系,可为人参资源保育和良种选育提供科学依据。     

白及遗传多样性的ISSR分析

目的对白及遗传多样性进行ISSR分析。方法以全国50批不同产地来源的白及为实验材料,采用ISSR分子标记方法进行各材料间的遗传距离分析。结果 10个ISSR引物共扩增出117个条带,平均每个引物产生11.7个条带,其中多态性条带111条,平均多态性百分率为94.9%。通过聚类分析,50份白及样品在遗传系数0.57的水平上共聚类为2大类群。结论不同产地的白及具有较丰富的遗传多样性,ISSR可有效应用于白及的遗传多样性研究。     

不同种源益母草遗传关系的ISSR分析

目的:阐明不同种源益母草的遗传关系.方法:用ISSR分子标记研究来自益母草主要分布区19个种源样本.结果:从100个ISSR引物中筛选出20个条带清晰、多态性高的引物,共扩增出164条带,其中117条带为多态性位点,多态性条带比率(PP8)为71.34%,通过聚类分析,可将19个益母草种源聚为3类.结论:分子标记研究结果与益母草的地理位置、形态性状存在显著的相关性,较好地揭示了益母草种源间的遗传关系,可为益母草资源划分和良种选育提供科学依据.     

石斛属植物遗传多样性的简单重复间系列分析

目的 研究我国石斛属植物间的亲缘关系.方法 从55个ISSR引物中筛选出14个多态性好的引物对石斛属(Dendrobium)植物基因组DNA进行简单重复间序列(ISSR)分析.利用POPGENE32软件计算ISSR扩增产物的Nei's基因多样性指数(H)和Shannon信息指数(I),标记系统的有效等位基因数(effective number of alleles, NE).应用NTSYS(3.0)软件计算Nei's遗传距离和遗传相似系数.按照非加权平均距离法(UPGMA)构建聚类关系图.结果 14条引物共扩增出123条带,多态性带112条,约占总数的91.06%,平均每个引物扩增的DNA带数为8.79条.Nei's基因多样性指数(H)为0.351 9,Shannon信息指数(I)为0.528 2,有效等位基因数(NE)为1.594 5,种间的相似系数介于0.090 9～0.695 7,平均为0.377 9.结论 我国石斛品种的遗传基础比较丰富,ISSR分子标记构建的亲缘关系树状图与经典分类系统基本一致.     

川芎简单序列重复间区多态性和扩增片段长度多态性分子标记技术多态性比较研究

目的 寻找川芎的高效分子标记.方法 以四川崇州、都江堰、新都3个产地的川芎为材料,应用100 条简单序列重复间区多态性(ISSR)引物、64对扩增片段长度多态性(AFLP)引物对30个川芎个体进行多态性筛选.结果 筛选到简单序列重复间区多态性特异性引物共10 条,扩增片段长度多态性特异性引物共6对;分别扩增出106和256条条带,多态条带百分率分别为22.64%和 22.27%.平均标记指数AFLP 的检测效率(1.78)明显高于ISSR(0.42).两种标记基于遗传相似值聚类分析结果存在着一定的差异,但用Mantel测试对两种方法检测的遗传一致度进行相关性分析表明,它们之间存在着显著的相关性( r=0.6975,p=0.014).结论 川芎具有较低的遗传多样性,AFLP更有效于ISSR.     

采用ISSR分子标记进行草珊瑚8个种源的遗传多样性分析

目的研究草珊瑚的遗传多样性及不同种源之间的遗传关系,为保护种质资源奠定基础。方法采用ISSR分子标记对8个种源共51个草珊瑚样品进行了DNA分子水平的分析评价,用Popgen32软件计算遗传多样性和遗传距离,通过UPCMA法进行聚类分析。结果筛选出10条多态性ISSR引物用于草珊瑚不同样品的ISSR-PCR,检测得到111个位点,其中106个为多态性位点,约占95.50%。草珊瑚不同种源间遗传距离在0.0347～0.1850。8个种源总遗传多样性主要来自种源内遗传变异,种源间分化指数Gst=0.3403。结论8个草珊瑚种源大体可以分成2大类群。且根据遗传距离与产地海拔高度的关系,可以将其划分为较高海拔类群(800～900m)、较低海拔类群(250～300m)、中等海拔类群(600m)。     

苦豆子ISSR标记的遗传多样性分析

目的 通过对产白宁夏、甘肃、青海、新疆和内蒙的苦豆子遗传多样性和亲缘关系的分析,为野生苦豆子资源的驯化和保护等提供依据.方法 采用ISSR分子标记技术,对22个苦豆子居群的DNA进行扩增,对其扩增条带进行遗传多样性分析,在所得遗传距离的基础上进行UPGMA聚类和主成分分析(PCA),并绘制亲缘关系树状聚类图.结果 51条ISSR引物共检测到433个位点,每条引物5～12个,平均8.49个;平均多态性位点百分率(PPB) 93.30％; Nei's遗传多样性指数(H)和Shannon信息指数(Ⅰ)分别为0.335 1、0.499 8;遗传距离变幅范围0.173 6～0.650 2.结论 22个苦豆子居群间具有较高的遗传多样性,各居群间遗传距离与地理距离没有明显关系.