CDKN2A基因在非小细胞肺癌中表达及生物学功能生物信息分析

目的探讨细胞周期蛋白依赖激酶抑制剂2A(CDKN2A)在人非小细胞肺癌(NSCLC)中表达、生物学功能和患者预后的关系。方法应用生物信息分析技术探讨癌症基因组图谱数据库(TCGA)中CDKN2A在NSCLC患者肿瘤组织和正常肺组织中的表达情况。采用蛋白-蛋白相互作用(PPI)数据库STRING分析CDKN2A编码蛋白作用网络,并进行聚类分析。采用基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEEG)富集CDKN2A和相关蛋白的生物学功能和信号通路。同时分析CDKN2A高低表达与NSCLC患者的无疾病进展生存和总生存的关系。同时采用免疫组化检测62例NSCLC患者癌组织和癌旁组织中CDKN2A表达情况分析CDKN2A阳性和阴性表达组患者生存期是否存在差异。结果CDKN2A基因在多种实体肿瘤包括乳腺癌、食管癌、肠癌等中表达水平明显上调。在NSCLC患者癌组织中CDKN2A表达水平明显高于正常肺组织(P<0.05)。而CDKN2A表达水平与肿瘤分期无明显相关性(P>0.05)。CDKN2A相关蛋白PPI网络中,相互作用关系指数为24.8,区域聚类指数为0.74,相互作用蛋白呈现明显的聚类表达(P<0.05)。CDKN2A编码蛋白主要定位在细胞核、细胞膜和囊泡;分子功能主要为蛋白结合、核蛋白结合和铁结合。而生物学过程主要集中于代谢、细胞增殖及对刺激的反应。KEGG信号通路主要为细胞周期调控、DNA蛋白结合以及Wnt信号通路。CDKN2A高表达NSCLC患者总生存期明显低于低表达组,且差异有统计学意义(HR=1.3,P=0.02),而CDKN2A高低表达组间NSCLC患者无疾病进展生存无统计学差异(HR=0.94,P=0.59)。62例NSCLC患者癌组织中CDKN2A阳性表达11例(17.7)而对应癌旁组织中阳性表达49例(79.0%),癌组织中CDKN2A阳性标的率显著高于癌旁组织(P<0.05)。而CDKN2A阳性组与阴性组患者生存期差异无统计学意义(HR=0.99,P>0.05)。结论CDKN2A在NSCLC患者癌组织中表达升高,并与患者预后不良有关,有望成为NSCLC预后和治疗的靶点。     

MAGEA4在非小细胞肺癌中的表达以及与患者预后的关系

目的探讨MAGEA4基因在非小细胞肺癌(NSCLC)患者中的表达、相关生物学功能及其与患者生存期的关系。方法检索肿瘤基因表达谱数据库(TCGA)中MAGEA4基因在NSCLC患者癌组织和癌旁组织中的表达情况;应用STRING数据构建MAGEA4基因编码蛋白-蛋白相互作用网络,并对网络中的蛋白进行基因本体论(GO)和KEGG信号通路富集;应用linkedomics在线分析软件,分析TCGA数据中与MAGEA4正负相关表达基因。同时回顾性分析我院手术治疗的68例NSCLC患者组织标本,采用免疫组织化学法(IHC)检测患者癌和癌旁组织中MAGEA4蛋白表达水平并分析其与患者临床病理特征的关系,对前述生物信息分析结果进行验证。结果 MAGEA4基因mRNA在NSCLC患者癌组织中的表达水平明显高于癌旁组织(P0.05);与MAGEA4蛋白相互作用网络中,区域聚类指数为0.90,蛋白相互作用网络富集明显(P0.05);与MAGEA4正相关表达最为显著的基因为MAGEA410(r=0.80,P0.05),而负相关表达最为显著的基因为DE4D (r=-0.37,P0.05);功能富集分析显示,MAGEA4生物学过程、细胞成分及分子功能分别主要富集于磷脂酰肌醇3激酶结合、细胞粘附的蛋白质复合物和核苷酸受体活性;KEGG信号通路富集显示,MAGEA4及相关共表达基因主要富集于Notch信号通路、维生素代谢信号通路和DNA复制相关信号通路等。生存分析显示,MAGEA4基因mRNA高表NSCLC患者总生存低于低表达患者(HR=1.3,95%CI:1.04～3.21,P0.05);而高低表达组无疾病进展生存无统计学差异(HR=0.82,95%CI:0.36～1.94,P0.05);IHC分析显示,MAGEA4蛋白表达水平与NSCLC患者肿瘤分化程度(P0.05)和淋巴结转移(P0.05)存在相关性,MAGEA4蛋白高表达者肿瘤分化程度较低,淋巴结转移率较高。结论 MAGEA4在NSCLC癌组织中表达明显增强,MAGEA4高表达与患者的预后不良有关。抑制MAGEA4基因表达有望成为NSCLC治疗的新靶点。     

PPP1R105基因在肝细胞癌中的表达相关信号通路及其与患者预后关系

背景肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是临床上常见的实体恶性肿瘤,预后较差.本文拟采用生物信息学技术分析PPP1R105基因在肝细胞癌中的表达相关信号通路及其与患者预后关系.同时,采用免疫组织化学法对PPP1R105生物信息数据进行验证.目的探讨PPP1R10基因(Ki-67或MKI67)在HCC中的表达及其临床意义.方法在TCGA数据中,检索PPP1R105基因在各个肿瘤组织中的相对表达情况;分析PPP1R105基因在肝细胞癌组织和癌旁组织中的相对表达水平,并比较是否存在差异.应用蛋白相互作用数据库STRING构建PPP1R105基因编码蛋白相互作用网络.比较PPP1R105高低表达组患者无疾病进展生存(disease free survival, DFS)和总生存(overall survival, OS)是否存在差异.选取我院手术治疗的原发性肝细胞癌患者81例进行回顾性分析,采用免疫组织化学法检测肝细胞癌组织中PPP1R105蛋白表达情况,并与患者的临床特征进行相关性分析.结果PPP1R105基因mRNA在不同肿瘤中表达水平差异并不显著,其表达不具备肿瘤间特异性.在肝细胞癌中,癌组织PPP1R105m RNA表达水平显著高于癌旁正常肝组织(P0.05),且表达水平与患者临床分期有关(P 0.05).蛋白相互作用网络区域聚集指数为0.99,蛋白相互作用网络富集明显(P0.01). PPP1R105及其相关基因信号通路主要富集于细胞周期、细胞衰老、病毒致癌及p53信号通路. KIF18B与PPP1R105正相关表达最为显著(rpearson=0.91, P 0.05);而MCELL基因与PPP1R105负相关表达最为显著(rpearson=-0.59, P 0.05);PPP1R105高表达组OS (HR=1.90, P 0.01)和DFS(HR=1.90, P 0.01)显著低于低表达组.PPP1R105蛋白主要表达于细胞核质及核仁, 81例患者中高表达者30例(37.0%).PPP1R105蛋白高表达患者肿瘤大于5cm及TNM分期Ⅲa期患者比例显著高于MIK67蛋白低表达者(P0.05).结论肝细胞癌患者PPP1R105高表达,其与患者总生存和无疾病进展生存较短有关,可作为肝细胞癌患者预后不良分子标志物.     

CCNA2基因在肝细胞癌中的表达、信号通路和预后关系生物信息分析及验证

背景肝细胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是消化系统常见恶性肿瘤,预后较差.本文拟采用生物信息学方法探讨CCNA2基因在HCC中的表达情况,及其作为HCC患者预后分子标志物的可行性.同时,采用免疫组织化学法对CCNA2生物信息分析结果进行验证.目的探讨CCNA2在HCC中的表达,相关信号通路及与患者预后关系.方法应用生物信息分析工具比对TCGA数据库中CCNA2基因m RNA在HCC组织和癌旁组织中表达水平;在STRING数据库中构建CCNA2蛋白-蛋白相互作用网络,并对相关蛋白功能和KEGG信号通路进行富集.根据CCNA2表达水平分为高低表达组,比较CCNA2高低组患者总生存(overall survival, OS)和无疾病进展生存(disease free survival, DFS)是否不同.回顾性分析72例手术治疗的HCC患者,采用免疫组织化学法检测患者癌组织中CCNA2蛋白表达水平与患者临床病理特征的关系,对生物信息分析结果进行验证.结果在HCC中, CCNA2中m RNA表达水平明显高于癌旁正常肝组织;与CCNA2蛋白相互作用较为紧密的蛋白10个,蛋白间相互作用关系edge=50,区域聚类指数为0.931,与CCNA2蛋白相互作用较为紧密的10蛋白相互作用网络富集显著(P 0.05); TOP2基因m RNA与CCNA2正向相关表达(r=0.85, P 0.05),而CCL14基因与CCNA2负相关表达(r=-0.54, P 0.05).CCNA2基因相关信号通路主要富集于细胞周期、病毒致癌、乙型肝炎、p53信号通路和PI3K-Akt信号通路等.预后分析提示CCNA2基因m RNA高表达患者OS(HR=1.7, P=0.0037)和DFS低于低表达组(HR=1.6, P=0.0037).免疫组化显示CCNA2蛋白在HCC患者癌组织中的高表达率为34.7%(25/72). CCNA2蛋白高表达与HCC患者肿瘤直径(P0.05)、DC浸润(P 0.05)、术后2年复发/转移(P 0.05)有关.结论CCNA2基因在HCC患者癌组织中表达水平上调,并可作为HCC预后不良的分子标记物.     

EFhd1蛋白在非小细胞肺癌组织中的表达及临床意义

目的探讨EFhd1蛋白在非小细胞肺癌(NSCLC)组织中的表达及临床意义。 方法收集南通大学附属医院心胸外科2004年1月至2011年4月收治的178例NSCLC手术患者的病例及其相应的临床病理和随访资料,并制备组织芯片;采用免疫组化方法检测EFhd1蛋白的表达,统计分析EFhd1蛋白与NSCLC患者临床病理参数、预后之间的相关性。 结果EFhd1在NSCLC组织(43.3%,77/178)中的表达明显高于癌旁组织(2.0%,1/51),差异有统计学意义(P<0.05)。统计分析显示：EFhd1的表达与T分期有关(P<0.05);Cox单因素分析显示,患者的TNM分期、T分期、N分期与NSCLC的预后密切相关(P<0.01);多因素分析显示EFhd1的高表达以及TNM分期为NSCLC的独立预后因素(P<0.05)。生存曲线提示EFhd1高表达的患者较EFhd1低表达患者生存期短,预后差,TNM分期越晚则生存时间越短。 结论EFhd1在NSCLC癌组织中的表达较癌旁组织中明显增高;TNM分期和EFhd1蛋白表达程度是影响患者预后的独立危险因素;EFhd1基因的高表达与患者的不良预后密切相关;EFhd1可作为NSCLC诊断及判断预后的潜在分子标记物,为后续研究其作为NSCLC靶向治疗的基因靶点的可能性提供了理论基础。     

EZH2和VEGF在结直肠癌中的表达其与患者预后关系生物信学分析及验证

背景结直肠癌(colorectal carcinoma, CRC)是临床上常见的消化系统恶性肿瘤.但其确切发病机制和预后独立因素仍未阐明.本研究通过生物信息学方法分析了zeste基因增强子同源物2(enhancerofzestehomolog2,EZH2)和血管内皮生长因子(vascular endothelial growth factor, VEGF)基因在CRC中的表达情况及其和患者预后的感谢.并采用免疫组化检测了EZHE2和VEGF蛋白的表达情况及其与患者临床特征的关系.目的探讨EZH2和VEGF在CRC中的表达、突变情况及其与患者临床病理特征和预后的关系.方法首先在TCGA数据库中比较EZH2和VEGF基因mRNA在肠癌患者癌和癌旁组织中的表达,同时分析EZH2和VEGF基因的突变情况;采用STRING数据库建立EZH2和VEGF基因表达网络并筛选网络中的关键基因.根据EZH2和VEGF在肿瘤组织中的表达分为高低表达组, Cox回归模型Log-rank检验比较高低表达组患者总生存和无疾病进展生存是否存在差异.同时选取80例肠癌手术患者,留取患者癌组织和癌旁组织,采用免疫组织化学法检测上述组织中EZH2和VEGF蛋白表达水平.结果 TCGA数据库显示EZH2和VEGF基因在CRC组织中的表达水平显著高于对应的正常肠上皮组织(P <0.05),而与肠癌患者的临床分期并无明显相关性(P>0.05);EZH2和VEGF基因在人肠癌中的突变率分别为1.5%和1.9%,且EZH2和VEGF不同突变组织中mRNA表达水平存在明显差异.网络中共有22个蛋白,各蛋白平均相互作用指数为10.5,区域聚集指数为0.8,各蛋白富集明显(P<0.01). Cytohubb软件筛选出EZH2, DNMT1, HDAC2, YY1和SUZ12为网络中的关键基因;EZH2和VEGF高低表达与患者总生存期均无相关性(P>0.05),而VEGF高表达组患者无疾病进展生存期显著低于低表达组(HR=1.8, P<0.05).免疫组化显示, EZH2和VEGF在肠癌组织中的阳性表达率均显著高于癌旁组织(P<0.01).EZH2阳性表达与肠癌肿瘤直径、分化程度和Duke分期有关(P<0.05).而VEGF阳性表达与肠癌患者分化程度和Duke分期存在相关性(P<0.05).结论 EZH2和VEGF在肠癌组织中呈现明显上调表达和突变,其高表达与肿瘤大小、分会程度和Duke分期有关,并可作为肠癌预后的潜在分子标志物.     

非小细胞肺癌差异表达基因筛选、生物学功能富集及其与患者预后关系

目的采用生物信息学方法探讨非小细胞肺癌(NSCLC)差异表达基因筛选、生物学功能富集及其与患者预后关系。方法采用生物信息数据挖掘基因表达数据库(GEO),肿瘤生存数据库Kaplan-Meier Plotter和蛋白相互作用(PPI)数据库String中NSCLC差异表达基因。首先在GEO数据库中筛选NSCLC患者癌组织与正常肺组织差异表达基因芯片数据集,下载数据后选取三个数据集中重叠的差异表达基因为研究对象。对筛选出的差异表达基因进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEEG)生物功能及信号通路富集分析,同时应用蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)预测相关基因编码蛋白相互作用网络(PPI)。并对关键基因高低表达与患者预后关系进行分析。结果差异表达数据集GSE19804,GSE101929和GSE33532为研数据。选取了在三个数据集中均存在差异表达的65个基因为进一步分析对象。层次聚类分析显示65个基因在肿瘤组织与正常肺组织呈现明显的聚类。65个异常表达基因生物学过程主要富集于GTP酶活性调节,单细胞-细胞粘附,凋亡过程的负调节,细胞增殖的正调控,正调控血管生成,蛋白质自磷酸化等;细胞学组分为定位于膜的组成部分,质膜,质膜组成,细胞表面,细胞-细胞连接和肌动蛋白细胞骨架等;而分子功能富集于蛋白质结合,受体活性,ras鸟嘌呤核苷酸交换因子ac等。KEEG信号通路分析显示,上述差异表达基因主要富集于ll粘附分子(cams)。PPI主要为血管生成和细胞粘附等功能通路。CDH5,TEK,CALCRL,RXFP1和TNNC1为信号通路关键基因,上述基因高表达患者总生存时间显著低于低表达患者(P0.05)。结论 NSCLC患者存在差异表达基因普,差异表达基因大多参与了肺癌细胞发生、发展及迁移等生物学相关功能。CDH5,TEK,CALCRL,RXFP1和TNNC1为NSCLC信号通路关键基因,并与患者的预后相关。     

NSCLC组织SFRP1和β-连环蛋白表达与临床病理特征

目的分析非小细胞肺癌(NSCLC)组织分泌型卷曲相关蛋白1(SFRP1)和β-连环蛋白(β-catenin)表达与临床病理特征及预后的相关性。 方法选取2018年1月至2020年1月收治的35例NSCLC患者,采集患者癌组织和癌旁组织标本。采用免疫组化技术检测癌组织和癌旁组织中SFRP1、β-catenin表达,分析NSCLC患者癌组织SFRP1、β-catenin表达与病理特征的关系,癌组织SFRP1、β-catenin表达与预后的相关性。 结果癌组织SFRP1阳性表达率低于癌旁组织(P<0.05),癌组织β-catenin阳性表达率高于癌旁组织(P<0.05);NSCLC患者癌组织SFRP1、β-catenin表达与分化程度、淋巴结转移、临床分期有关(P<0.05)。35例NSCLC患者总生存率为58.82%,癌组织SFRP1阳性、阴性表达患者生存率分别为84.62%和45.450%,癌组织SFRP1阳性表达与阴性表达患者的生存曲线比较,差异有统计学意义(χ²＝5.221,P＝0.022);癌组织β-catenin阳性、阴性表达患者生存率分别为51.72%和100.00%。癌组织β-catenin阳性表达与阴性表达患者的生存曲线比较,差异有统计学意义(χ²＝4.828,P＝0.028)。 结论NSCLC组织SFRP1、β-catenin表达与分化程度、淋巴结转移、临床分期有关,临床检测癌组织SFRP1、β-catenin表达可用于非小细胞肺癌患者预后评估。     

SCNN1B基因在非小细胞肺癌中的表达及其临床意义

目的探讨SCNN1B基因在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达情况及其临床意义。方法以基因表达综合数据库中的GSE18842、GSE101929和GSE30219等三个数据集为研究对象,比较SCNN1B在NSCLC患者肿瘤组织和癌旁组织中的表达差异。同时,分析SCNN1B基因水平与NSCLC患者临床特征和预后的关系,并采用PROGgenV2在线工具对预后进行验证。最后,运用基因探针富集分析(GSEA)探究SCNN1B在NSCLC中的可能作用机制。结果 SCNN1B基因在NSCLC肿瘤组织中的表达量均低于癌旁组织,差异具有统计学意义(P0.001)。SCNN1B基因的表达与NSCLC患者的组织学分型、T分期和N分期具有显著相关性(P0.01)。高表达SCNN1B基因的NSCLC患者的总生存期(HR:0.62,95%CI:0.46-0.85;P=0.003)和无复发生存期(HR:0.44,95%CI:0.29-0.65;P0.001)均优于SCNN1B低表达者,并且PROGgenV2在线工具能进一步验证该结果(P0.05)。GSEA结果表明SCNN1B基因主要与细胞周期、DNA修复、错配修复、同源重组、剪接体、核苷酸剪切修复、蛋白酶体、p53信号通路、卵母细胞减数分裂和RNA降解等信号通路有关。结论 SCNN1B是NSCLC的一种抑癌基因,高表达SCNN1B基因的NSCLC患者临床预后更好。     

PROX1对早期非小细胞肺癌微创切除术后复发的预测意义

目的分析Prospero相关同源异形盒蛋白1(PROX1)对早期非小细胞肺癌(NSCLC)微创切除术后复发的预测意义。 方法选择2019年12月至2021年12月我院收治的54例拟接受微创切除术的NSCLC患者,采用免疫组织化学染色法检测患者NSCLC癌组织和对应癌旁组织中PROX1表达情况。统计NSCLC复发情况,比较复发者与未复发者临床资料,采用Logistic多因素回归分析影响NSCLC患者术后复发的因素,采用受试者工作特征曲线(ROC)分析NSCLC癌组织中PROX1表达水平预测术后复发。 结果癌组织中PROX1表达水平比癌旁组织高(P<0.05),癌组织中PROX1高表达例数比癌旁组织高(P<0.05);13例患者复发(24.07%)。复发患者淋巴结转移、PROX1高表达、TNM分期为Ⅱ期例数比未复发患者高(P<0.05);Logistic多因素回归分析显示PROX1高表达、淋巴结转移、TNM分期为Ⅱ期是NSCLC术后复发危险因素(P<0.05);ROC分析显示,癌组织中PROX1表达水平预测NSCLC术后复发的最佳截点为8.36,灵敏度为84.78%,特异度为89.13%。 结论NSCLC癌组织PROX1高表达,PROX1蛋白表达是NSCLC术后复发的危险因素,为预测NSCLC术后复发的指标。     

荧光定量PCR检测非小细胞肺癌中MTA1和E-cadherin的表达及意义

目的探讨肿瘤转移相关蛋白家族1(MTA1)和E-钙黏蛋白(E-cadherin)在人非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达及意义。方法采用实时荧光定量PCR(Q-PCR)联合检测40例NSCLC组织、12例癌旁组织、12例良性病变肺组织中MTA1和E-cadherin mRNA表达的相对水平,分析他们的表达与临床组织病理学特征的关系。结果MTA1 mRNA在NSCLC中平均表达水平高于癌旁和良性疾病组织(P<0.05);E-cadherin mRNA在NSCLC中平均表达水平低于癌旁和良性疾病组织(P<0.05);在NSCLC中MTA1和E-cadherin的表达呈负相关(r=-0.561,P<0.05);在癌旁组织和良性疾病组织中MTA1和E-cadherin的表达无统计学差异(P>0.05);MTA1和E-cadherinmRNA表达水平与淋巴结转移及临床分期有关(P<0.05)。结论 MTA1过度表达及E-cadherin表达的下调或缺失与NSCLC浸润和转移呈正相关,联合检测NSCLC中MTA1和E-cadherin的表达,可用于预后评估。     

非小细胞肺癌患者癌组织中的ERCC1、EGFR、K-ras表达与其预后的关系

目的检测非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织中的切除修复交叉互补基因1(ERCC1)、表皮生长因子受体(EGFR)和原癌基因Kirsten-Rous肉瘤病毒(K-ras)表达,探讨其与患者预后的关系。方法应用免疫组化法检测97例NSCLC患者癌组织(观察组)及30例癌旁组织(对照组)的ERCC1、EGFR、K-ras表达,比较三者表达与患者生存时间的关系。结果观察组ERCC1、EGFR、K-ras表达阳性率分别为29.9%、22.7%、32.0%,均高于对照组的0、3.3%、0(P均<0.05);且EGFR与K-ras呈负相关(r=-0.371,P<0.01)。NSCLC化疗组ERCC1阳性者的生存时间有低于阴性者的趋势(P>0.05),而非化疗组ERCC1阳性者的生存时间长于化疗组(P<0.05);EGFR阳性而K-ras阴性表达者的生存时间长于EGFR阴性而K-ras阳性表达者(P<0.05)。结论 ERCC1、EGFR、K-ras表达与NSCLC发生、发展有关,是评估患者疗效和预后的重要指标。     

非小细胞肺癌组织及癌旁组织VEGF、P16蛋白的表达及意义

目的分析P16蛋白、血管内皮生长因子(VEGF)在非小细胞肺癌(NSCLC)组织及癌旁组织的表达情况。方法应用免疫组化SP法检测NSCLC组织65例,距肿瘤边缘5 cm以上癌旁正常组织20例中VEGF、P16蛋白的表达。结果①VEGF在肺癌组织的阳性表达率72.3%,明显高于癌旁组织的阳性表达率35.0%(P<0.05);P16蛋白在肺癌组织的阳性表达率47.7%,明显低于癌旁组织的阳性表达率85.0%(P<0.05)。②P16蛋白的表达与肺癌淋巴结转移、临床分期、分化程度有关,而与病理类型无关;VEGF的表达与临床分析、淋巴结转移有关。NSCLC组织中P16蛋白与VEGF之间呈负相关(rs=-0.537,P<0.01)。结论 NSCLC组织中存在VEGF与P16蛋白表达的异常,且两者表达呈负相关,推测NSCLC的发病与血管生成及P16表达异常有关。     

非小细胞肺癌组织中耐药相关基因的表达及意义

目的探讨耐药相关基因在非小细胞肺癌（NSCLC）中的表达及意义。方法应用RT-PCR半定量法检测60例未行化放疗的NSCLC患者癌组织及癌旁组织中耐药相关基因[多药耐药相关蛋白1（MRP1）、肺耐药蛋白（LRP）、乳腺癌耐药蛋白（BCRP）、切除修复交叉互补基因1（ERCC1）]mRNA的表达。结果与癌旁组织比较,癌组织中MRP1、LRP、ERCC1 mRNA表达显著升高,BCRP mRNA显著降低（P〈0.05）;BCRP mRNA在癌组织和癌旁组织中的表达呈正相关（rs=0.339,P=0.008）,癌组织中MRP1 mRNA与LRP mRNA、BCRP mRNA与ER-CC1 mRNA呈正相关。COX多因素回归分析示,MRP1 mRNA高表达是影响预后的独立因素（RR=4.784,P=0.026）。结论检测MRP1 mRNA对预测NSCLC患者生存期、协助临床选择化疗方案可能具有一定意义。     

BCL6共抑制因子样蛋白1在老年非小细胞肺癌患者组织中表达及其对远期预后的影响

目的探讨BCL6共抑制因子样蛋白(BCORL)1在老年非小细胞肺癌(NSCLC)患者组织中的表达及其对远期预后的影响。方法 79例手术后NSCLC癌组织标本及其癌旁组织标本,采用免疫组化染色检测BCORL1蛋白表达,并采用Cox比例风险回归模型分析BCORL1蛋白表达对老年患者远期预后的影响。结果 NSCLC老年患者癌组织BCORL1蛋白表达率(70.89%)显著高于癌旁组织(25.32%,P0.05);癌组织BCORL1蛋白阳性表达率与老年患者年龄、性别、病灶直径、病理学类型无关(P0.05),与TNM分期、淋巴结转移有相关性(P0.05);79例接受了12～36个月的随访观察,BCORL1蛋白阳性表达者3年生存率[21.42%(14/56)]显著低于阴性表达者[47.83%(11/23);χ~2=5.505,P=0.019]。分化程度减低、淋巴结转移、BCORL1蛋白阳性表达是NSCLC老年患者不良预后的独立危险因素(P0.05)。结论 BCORL1在NSCLC组织中表达水平上调,并且与临床病理学特征及预后有相关性。     

长链非编码RNA HOTAIR在乳腺癌患者中表达及其临床意义

目的采用生物信息方法探讨长链非编码RNA同源异型框基因翻译基因间RNA(HOTAIR)在乳腺癌患者中的表达及其与患者预后关系。方法检索Oncomie数据库中乳腺癌患者HOTAIR基因表达的相关芯片数据。根据HOTAIR表达水平分为高低表达组,并用Kaplan-Meier Plotter数据库中生存数据构建生存曲线,比较高低表达组总生存期(OS)。采用TCGA数据分析乳腺癌患者HOTAIR基因变异情况。同时选取72例乳腺癌患者,q-PCR检测肿瘤组织中HOTAIR表达情况并与患者预后做相关分析。结果 Oncomine数据库分析显示,HOTAIR在乳腺癌组织中表达水平明显高于正常乳腺组织(P0.05);高低表达组239153_at (HR=1.29,95%CI:0.94～1.76,P0.05)和1557051_s_at(HR=0.92,95%CI:0.67～1.29,P0.05)两个数据集OS差异无统计学意义(P0.05),但数据集239153_at呈现出高表达患者生存期较短的趋势。TCGA数据中HOTAIR在乳腺癌中拷贝数异常率为0.1%,HOTAIR表达水平在各种突变情况下差异无统计学意义(P0.05)。且癌组织显著高于癌旁组织(P0.05),高表达组生存期显著低于低表达组(HR=1.45,9%CI:1.08～2.32,P0.05)。结论 HOTAIR在乳腺癌中高表达,且可能与患者预后相关,可作为乳腺癌患者预后潜在的分子标志物。     

ERCC1、RRM1在非小细胞肺癌中的表达及其与铂类化疗敏感性的关系

目的通过对非小细胞肺癌(NSCLC)组织与癌旁组织中切除修复交叉互补基因1(ERCC1)、核糖核苷还原酶调节因子1(RRM1)蛋白检测,探讨其表达与NSCLC临床特征及预后的关系,为NSCLC个体化治疗提供实验依据。方法采用免疫组化方法检测121例NSCLC患者术后癌组织和癌旁组织标本中ERCC1、RRM1蛋白的表达水平,探讨ERCC1、RRM1的表达与NSCLC患者总生存期(OS)、疾病进展时间(TTP)及中位OS、中位TTP之间的关系。结果①ERCC1、RRM1在NSCLC患者癌组织与癌旁组织中的阳性表达率比较,差异具有统计学意义(53.72%、46.28%vs 23.14%、25.62%,P均<0.05);②接受术后铂类方案化疗并随访,ERCC1阴性表达者中位OS较阳性表达者明显延长(18.30 vs 11.00个月;χ2=8.756,P=0.003),中位TTP亦较阳性表达者明显延长(15.00 vs 9.30个月;χ2=8.740,P=0.003)。RRM1阴性表达者中,中位OS较RRM1阳性表达者明显延长(18.30vs 11.00个月;χ2=6.836,P=0.009),同时中位TTP亦较RRM1阳性表达者明显延长(11.20 vs 6.60个月;χ2=5.764,P=0.016);③121例NSCLC患者中,ERCC1、RRM1蛋白阴性表达者的中位OS、中位TTP较阳性表达者明显延长(P均<0.05)。结论 ERCC1、RRM1蛋白可能成为NSCLC患者对铂类药物敏感性的预测因子;二者联合检测有助于NSCLC患者个体化治疗方案的选择。     

iNOS在老年NSCLC患者中表达及其与患者临床病理特征和预后的关系

目的 探讨诱导型一氧化氮合酶(iNOS)在老年非小细胞肺癌(NSCLC)患者中表达及其与患者临床病理特征和预后的关系。方法 选择行手术切除的老年NSCLC患者100例,取患者癌组织及其癌旁正常组织。收集患者临床病理特征,包括性别、吸烟史、肿瘤大小、病理类型、组织学分化、TNM分期和淋巴结转移。比较癌组织与癌旁正常组织iNOS阳性表达情况;比较不同病理特征iNOS阳性表达情况;生存曲线分析NSCLC患者iNOS表达与预后关系;采用多因素Logistic回归分析影响预后独立危险因素。结果 癌组织iNOS阳性表达显著高于癌旁组织(P<0.001)。不同性别、吸烟史、肿瘤大小、组织学分化iNOS阳性表达比较差异无统计学意义(P>0.05);Ⅲ～Ⅳ期iNOS阳性表达显著高于Ⅰ～Ⅱ期(P<0.05);淋巴结转移iNOS阳性表达显著高于无淋巴结转移(P<0.05)。NSCLC患者iNOS阳性表达总生存期(OS)时间显著短于iNOS阴性表达(P<0.05)。经多因素Logistic回归分析显示,Ⅲ～Ⅳ期、淋巴结转移和iNOS阳性表达为影响预后独立危险因素。结论 老年NSC...     

DLC-1蛋白在非小细胞肺癌组织中的表达及临床意义

目的探讨肝癌缺失基因(DLC-1)蛋白在非小细胞肺癌(NSCLC)发生、发展中的作用。方法选择手术切除的NSCLC组织标本40份(肿瘤组),癌旁组织标本40份(癌旁组),采用免疫组化法检测两组NSCLC蛋白表达情况,并分析其与NSCLC临床病理特征的相关性。结果肿瘤组及癌旁组DLC-1蛋白阳性率分别为42.5%(17/40)、0,P<0.05;DLC-1蛋白表达与病理分期、淋巴结转移及肿瘤分化程度相关,而与性别、组织类型、肿瘤大小无关。结论 DLC-1蛋白在NSCLC的发生、发展中起重要作用。     

S100A8在非小细胞肺癌中的表达及其临床意义

目的探讨非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中S100A8基因的表达以及其与NSCLC患者临床病理特点之间的关系。方法以免疫组织化学方法检测96例NSCLC及35例癌旁肺组织中S100A8蛋白的表达,并分析其与临床病理特点之间的关系。结果免疫组化结果显示,S100A8在肿瘤组织中的水平显著高于癌旁组织(P0.05)。在TNM分期较晚的患者中S100A8表达显著增高(P0.05)。高分化NSCLC中S100A8表达水平显著低于中低分化NSCLC(P0.05)。结论 S100A8蛋白表达在NSCLC组织中明显高于癌旁肺组织,随病理分期增高及肿瘤分化程度减低,S100A8蛋白表达阳性率增高,提示S100A8蛋白与NSCLC的关系密切相关。