基于网络药理学探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制。方法:通过TCMSP数据库和UniProt数据库校正筛选出丹参、砂仁和檀香的有效活性成分;运用GeneCards数据库、NCBI基因数据库及OMIM数据库获取心力衰竭的疾病靶点,通过STRING数据库对交集靶点构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,运用拓扑分析和MCODE聚类分析获得核心作用靶点,并对核心作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从丹参饮3味中药中筛选出78个化合物、264个靶点,心力衰竭靶点2 273个,交集靶点86个,关键靶点36个。GO功能富集分析生物学过程共1 900条,KEGG筛选出通路165条。结论:丹参饮通过多靶点、多途径、多通路干预心力衰竭,可能涉及的靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、低聚果糖(FOS)等,涉及的信号通路包括白细胞介素-17(IL17)、晚期糖基化终末产物-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、松...     

基于网络药理学探讨麝香通心滴丸治疗心力衰竭的潜在机制

目的应用网络药理学方法分析麝香通心滴丸治疗心力衰竭的潜在机制。方法利用中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中药综合数据库(TCMID)筛选麝香通心滴丸潜在的活性成分与靶点,通过GeneCards数据库检索心力衰竭相关的靶点,采用STRING数据库构建共有靶点的蛋白互作网络,最后应用R Studio的clusterProfiler包进行基因本体(GO)与京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。结果根据口服生物利用度(OB)≥30%且类药性(DL)≥0.18为标准筛选出化合物92个有效成分。从GeneCards数据库中获得13194个与心力衰竭相关的靶基因,有效成分靶点与疾病靶点共筛选出140个共有基因。这些基因主要参与细胞对药物的反应、循环系统血管过程、对类固醇激素的反应、管径的调节、血管直径的调节等生物学过程。分子功能主要包括神经递质受体活性、G蛋白偶联氨受体活性、突触后神经递质受体活性、肾上腺素能受体活性等。活性物质主要作用于神经活动配体-受体相互作用、磷脂酰肌醇3-激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路、人巨细胞病毒感染等通路。结论麝香通心滴丸中的有效成分可能通过调节血管直径、改变激素作用、改善代谢等机制对心力衰竭产生治疗作用。     

补益强心片治疗慢性心力衰竭的网络药理学研究

目的:确定补益强心片的有效成分和治疗慢性心力衰竭的靶点,以研究补益强心片治疗慢性心力衰竭的潜在机制。方法:通过中药系统药理分析平台(TCMSP)数据库获得补益强心片的有效成分和预测靶点。使用疾病数据库筛选慢性心力衰竭的疾病靶点,使用在线工具Draw Venn Diagram获取药物和疾病的共同靶点,将获得的共同靶点上传到STRING数据库,用于蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析。然后,使用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-靶点网络图和PPI网络的可视化分析。通过DAVID数据库进行基因本体(GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。最后,使用Autodock Vina进行分子对接。结果:共获得115个药物活性成分、247个药物靶点、2 685个疾病靶点和153个与药物和疾病相关的共同靶点。通过PPI网络分析确定了蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素6(IL-6)、血管内皮生长因子A(VEGFA)、肿瘤蛋白P53(TP53)、白细胞介素-1β(IL-1β)、半胱氨酸蛋白酶3基因(CASP3)、表皮生长因子受体(EGFR)、JUN、基质金属...     

基于网络药理学和分子对接探究余甘子治疗肝细胞癌的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接虚拟预测方法,探究余甘子治疗肝细胞癌的潜在分子机制。方法:通过公共数据库获取余甘子的有效活性成分及作用靶点,并筛选肝细胞癌相关靶点,构建“活性成分-靶点”关系图与PPI网络,进行GO分析和KEGG、Reactome通路富集,采用分子对接评价活性成分与核心靶点的结合活性。结果:共获得19个有效活性成分和12个重要靶点。通过GO分析获得了1794个细胞生物过程,而KEGG和Reactome富集分析分别涉及315和391个相关通路。结论:余甘子的主要有效活性成分为鞣花酸、木犀草素、槲皮素和山奈酚,可能作用于AKT1、MMP9、SRC、ESR1、PPARG和AR等关键靶点,调控内分泌抵抗、癌症中的蛋白多糖、癌症通路、受体酪氨酸激酶信号、白细胞介素信号通路、生长因子受体和第二信使信号转导、PI3K/AKT信号通路等以治疗肝癌。除了直接的肿瘤相关信号通路,间接的炎症、代谢通路在抑制肝癌进展中发挥了重要作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学及分子对接探究党参治疗射血分数保留性心力衰竭的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接预测党参治疗射血分数保留性心力衰竭的相关靶点及信号通路,探讨其发挥治疗作用的潜在机制。方法:利用中药系统网络药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索党参的有效成分;通过Swiss Target Prediction数据库预测其潜在靶点;通过检索DisGeNET数据库获得射血分数保留性心力衰竭的相关靶点后,构建“药物-疾病”共同靶点韦恩图;使用Cytoscape 3.7.2软件构建“党参-有效成分-潜在靶点”网络;利用STRING数据库构建靶蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图;借助Cytoscape软件获取核心成分、关键靶点;利用Metascape数据库进行基因本体(GO)功能与京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;采用分子对接将核心成分与关键靶点进行结果验证。结果:筛选获得党参作用于射血分数保留性心力衰竭有效成分16个,疾病共同靶点116个,关键靶点5个;GO功能富集获得党参治疗射血分数保留性心力衰竭生物学过程主要富集在丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)级联反应的正调控、循环系统过程、激素水平的调节、调节离子传输、细胞对氮化合物的反应等;KEG...     

基于网络药理学分析七福饮治疗老年性痴呆的药理机制

目的利用网络药理学研究七福饮治疗老年性痴呆的药理机制。方法采用TCMSP等分析平台检索七福饮的活性成分,并且得到其活性成分对应的靶点;然后通过OMIM、Genecards数据库检索老年性痴呆相关靶点,使用DAVID软件对获得靶点进行GO注释分析和KEGG通路分析,采用Cytoscape 3.7.1软件建立活性成分-靶点-通路网络模型。结果七福饮靶点基因和老年性痴呆的相关基因取交集,共有23个相关基因,由KEGG分析,以P≤0.05为标准筛选通路,得到47条通路。结论七福饮可通过多成分、多靶点、多通路治疗老年性痴呆。     

基于网络药理学探讨参附养心汤治疗心力衰竭的作用机制

目的探讨参附养心汤治疗心力衰竭的可能作用机制。方法采用网络药理学研究方法,应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库和BATMAN-TCM,筛查参附养心汤的有效成分及其作用靶点。通过GeneCards、OMIM、MalaCards、TTD数据库综合筛选心力衰竭的靶标,采用String在线数据库对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络,并在Cytoscape 3.7.1软件中进行可视化处理,筛选关键基因。使用DAVID工具对查到的基因进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析,探讨潜在靶标可能具有的生物学功能及通路。结果从参附养心汤中筛选出55个化合物,涉及治疗心力衰竭的49个靶点,网络分析结果表明该方可能通过缺氧应答、胰岛素分泌调节、胆固醇代谢过程、衰老、血压调节等生物过程,酶结合、脂肪酰基-辅酶A结合、NADP结合、胆固醇结合、类固醇激素受体活性等分子功能发挥作用;其作用机制与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、心肌细胞的肾上腺素能信号通路、醛固酮调节钠重吸收、环磷酸鸟苷(cGMP)-蛋白激酶(PKG)信号通路、甲状腺激素信号通路、钙信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、细胞凋亡、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等有关。结论参附养心汤治疗心力衰竭具有多成分、多靶点、多途径的特点。其主要生物学机制可能与以TNF为中心的信号通路有关。     

基于网络药理学及分子对接探讨当归补血汤治疗动脉粥样硬化的机制

目的]利用网络药理学及分子对接技术探讨当归补血汤治疗动脉粥样硬化(As)的作用机制。 [方法]借助TCMSP数据库获得当归补血汤的活性成分,使用Swiss Target Prediction平台预测其潜在作用靶点。应用GeneCards及DisGeNET数据库筛选As靶点,并将活性成分预测靶点与疾病靶点取交集获得关键交集靶点。采用STRING平台构建交集靶点PPI互作网络,Cytoscape软件网络拓扑分析筛选潜在关键靶点。再次使用Cytoscape软件构建药物-成分-靶点,并找到核心活性成分。通过Metascape数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,最后通过分子对接,进一步明确其发挥治疗效用的成分与靶点作用机制。 [结果]筛选当归补血汤活性成分共19个,预测靶点204个,疾病靶点5 213个,筛选得到治疗As的交集靶点176个,排名前5位的核心靶点为Akt1、JUN、TP53、TNF、IL-6。GO和KEGG富集分析主要指向氧化应激反应、转录调节复合物等功能,参与的信号转导主要包括FoxO信号通路、JAK-STAT信号通路、IL-17信号通路等。分子对接结果显示5个活性成分及5个重要核心靶点对接结合能均小于－5 kJ/mol,提示其受体蛋白与配体小分子之间结合稳定,数值越低,结合稳定性越高,且结合能排名前5位的包含β谷固醇与槲皮素两种活性成分,其中活性成分β谷固醇与TNF结合能最低,为－10.52 kJ/mol,说明β谷固醇与槲皮素两种中药有效成分可能在治疗动脉粥样硬化性疾病中起重要作用。 [结论]当归补血汤中槲皮素、β谷固醇等核心活性成分可能通过作用于Akt1、JUN、TP53、TNF、IL-6等核心靶点,调节炎症反应、脂质代谢和其他相关通路,从而发挥治疗As的作用。     

基于网络药理学及分子对接探讨灵芝的免疫调节机制

［摘要］　目的　通过网络药理学及分子对接探讨灵芝调控免疫功能的作用机制。方法　通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索和筛选灵芝有效成分,使用Swiss Target Prediction数据库预测其潜在作用靶点。从GeneCards、DrugBank、OMIM、PharmGKB、TDD数据库中获取免疫调控相关靶点,整合药物靶点和疾病靶点,取交集靶点。使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图,筛选核心成分。利用String平台构建蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白。利用R软件进行GO富集分析和KEGG通路分析。通过分子对接技术进行活性成分和核心靶点的分子对接验证。结果　共获取灵芝活性成分43个,作用靶点499个,免疫相关靶点12 454个,药物与疾病的交集靶点483个。KEGG通路分析显示交集基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、蛋白多糖与癌症等信号通路。GO富集分析显示,交集基因主要参与脂质代谢过程的调节、肽基-丝氨酸磷酸化、肽基-丝氨酸修饰等过程。分子对接结果显示,主要核心成分与核心蛋白有较好的结合活性。结论　研究构建的灵芝“成分-靶点-通路-疾病”网络,一定程度上揭示了灵芝多成分、多靶点的复杂作用机制,为灵芝的临床应用和产品开发提供理论基础。     

基于网络药理学和分子对接探讨养心氏片抗心肌纤维化的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接探讨养心氏片抗心肌纤维化的作用机制。方法:通过中医药系统药理学平台(TCMSP)检索养心氏片中13味中药的活性成分;运用基因名片数据库(GeneCards)、药物遗传学与药物基因组学知识库(PharmGKB)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank数据库及治疗靶点数据库(TTD)检索获得心肌纤维化相关靶点;将养心氏片活性成分靶点和疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.8.0软件绘制“药物-活性成分-靶点”网络图;将交集靶点上传至STRING平台进行蛋白相互作用(PPI)网络分析;运用R软件对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Vina 1.1.2对养心氏片的核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:养心氏片通过β-谷甾醇、山柰酚、槲皮素等核心成分作用于表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体(ESR1)、白介素1B(IL1B)等核心靶点,可调节心肌纤维化中晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE/RAGE)信号通路、低氧诱导因子(HIF-1)信号通...     

川芎抗动脉粥样硬化作用机制的网络药理学与分子对接技术研究

目的使用网络药理学与分子对接技术探究川芎抗动脉粥样硬化的作用机制。方法运用中药系统药理(TCMSP)数据库筛选川芎的活性成分及质控成分,通过Swiss Target Prediction预测药物靶点。在DrugBank和DisGeNET数据库筛选出动脉粥样硬化的相关靶点。通过STRING构建靶点蛋白互作网络,运用Cytoscape绘制网络并进行拓扑学分析。使用Omicshare对相关靶点进行GO富集分析与KEGG富集分析。运用DockThor进行分子对接。结果获得川芎抗动脉粥样硬化的167个相关治疗靶点,通过网络拓扑分析发现钙敏感受体、丝裂原活化蛋白激酶3等46个靶点为核心靶点。GO富集分析发现川芎在生物过程、分子功能、细胞组成多方面影响动脉粥样硬化的发生发展。KEGG通路富集分析发现,川芎可能通过调节神经活性配体-受体相互作用、钙信号通路等多条代谢通路来发挥抗动脉粥样硬化的作用。结论运用网络药理学的方法证实了川芎抗动脉粥样硬化具有多途径、多靶点作用的特点。预测了川芎抗动脉粥样硬化的可能机制,为其后续基础研究提供了参考和理论依据。     

基于网络药理学探讨左归丸“补肾生髓成肝”的疗效机制

目的:利用网络药理学方法探讨左归丸"补肾生髓成肝"的疗效机制。方法:采用中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)和中药分子机制生物信息学分析工具(BATMAN-TCM)筛选左归丸的药效活性成分和潜在作用靶点,利用生物学信息注释数据库(DAVID)和KEGG通路数据库(KEGG PATHWAY Database)分析靶点基因功能分类及其涉及的信号通路。利用蛋白质相互作用数据库(STRING Database)构建靶点基因编码蛋白质的相互作用网络模型。结果:通过TCMSP和BATMAN-TCM筛选左归丸药效活性成分65个、潜在靶点基因351个,靶点基因功能包括药物反应、乙醇应答、凋亡过程及正负调控、细胞增殖及正负调控、衰老、信号转导、基因转录调控等生物学过程,涉及癌症相关通路、乙型肝炎、前列腺癌、HIF-1信号通路、TNF信号通路等32条信号通路,根据蛋白质相互作用关系确定45个左归丸药效活性成分关键靶点。结论:左归丸"补肾生髓成肝"的疗效机制可能是其药效活性成分通过靶基因-信号通路网络调节药物、乙醇及病毒因素等引起的肝组织应答,动态调节肝组织细胞增殖/凋亡,多层次、多途径实现减轻组织损伤、优化肝脏再生修复。     

基于网络药理学和实验探讨半夏-陈皮药对治疗卒中后抑郁的作用机制

目的:基于网络药理学和实验的方法探讨疏脑解郁汤中半夏-陈皮药对治疗卒中后抑郁的作用机制。方法:通过中医药系统药理学平台(TCMSP)数据库检索半夏、陈皮的主要化学成分及相关靶点,并结合相关文献对TCMSP所获得的有效成分进行补充。根据药物动力学筛选出中药活性组分;通过UniProt数据库进行靶点信息筛选;运用GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获取卒中后抑郁的主要靶点;通过Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点”网络,通过STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络并挖掘网络中潜在的功能。通过Metascape平台进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,通过实验运用蛋白质印迹法对重要靶点进行验证。结果:共筛选出半夏、陈皮13个有效成分、118个作用靶点;卒中后抑郁相关靶点1 366个。半夏、陈皮作用于卒中后抑郁的GO生物过程主要涉及细胞对有机环状化合物的反应、膜电位的调控、正调控细胞凋亡、离子运输的调节、对缺氧的反应;KEGG通路主要涉及癌症通路、血清素能突触、雌激素信号通路、环磷酸腺苷信号通路、神经活性配体-受体通路、内质...     

基于网络药理学的赤芍治疗动脉粥样硬化作用机制研究

目的采用网络药理学方法探讨赤芍治疗动脉粥样硬化(AS)的物质基础和作用机制。方法借助中药系统药理学分析平台(TCMSP)检索赤芍的化学成分和作用靶点;在人类基因数据库(GeneCards)、人类孟德尔遗传数据库(OMIM)中搜索AS靶点;使用String数据库构建蛋白质-蛋白质相互作用网络,并利用DisGeNET数据库对作用靶点类型进行归属;采用Cytoscape 3.7.1软件构建赤芍-活性成分-抗动脉粥样硬化靶点网络;利用Metascape平台对靶基因进行基因功能注释(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果通过口服生物利用度(OB)和生物活性分子的类药性(DL)参数筛选得到赤芍29个潜在活性成分,共涉及41个作用靶点,与疾病靶点有关的活性成分有12个,与疾病有关的靶点有36个。主要通过调控细胞凋亡、白介素-17(IL-17)信号通路、流体剪切应力(FSS)与AS、缺氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、Th17细胞分化、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、甲状腺激素信号通路、p53信号通路、Toll样受体(TLR4)信号通路及磷酸肌醇3-激酶(PI3K)-Akt信号通路等多种途径发挥抗AS作用。结论网络药理学分析显示,赤芍通过多成分、多靶点、受途径共同发挥抗AS作用,有助于进一步了解赤芍的药理学作用机制,证实了网络药理学方法可以作为从整体角度揭示中医药作用机制的有效工具。     

基于网络药理学与分子对接技术探究加味泽泻汤治疗梅尼埃病的作用机制

目的:探讨加味泽泻汤治疗梅尼埃病的潜在作用机制。方法:从TCMSP、TCMID、BATMAN-TCM平台中收集加味泽泻汤组方中药物的活性成分及靶点,经标准化处理后利用Cytoscape软件绘制加味泽泻汤活性成分-靶点网络图并分析其核心成分;从GeneCards、OMIM、DisGeNET及CTD疾病数据库中收集梅尼埃病相关的疾病靶点,从而得到药物-疾病共有靶点,筛选出加味泽泻汤治疗梅尼埃病的潜在作用靶点并绘制药物活性成分-疾病靶点网络图;筛选提取加味泽泻汤和梅尼埃病的交集网络制作药物-疾病互作网络,通过计算相关属性值得到核心靶点,利用Metascape数据库对核心靶点进行基因本体(GO)功能及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并可视化。最后使用分子对接技术对加味泽泻汤核心活性成分与核心靶点对接并进行可视化处理。结果:经过筛选共得到加味泽泻汤药物活性成分39个,相关靶点144个;梅尼埃病疾病相关靶点1 556个,其中,有药物-疾病共同靶点44个,通过富集分析及筛选,得到排名靠前的GO功能条目及KEGG信号通路。分子对接得到4个关键化合物和3个核心靶点,具有较好的结合性,验...     

基于网络药理学和分子对接探讨苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术，探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分，利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分，采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点，经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点，结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后，利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果 苗药黑骨藤的活性成分共24个，对应靶点574个，1 513个AD靶点，交集靶点159个；GO分析得到2 661条生物过程，587条分子功能，311条细胞成分；KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结...     

基于网络药理学探讨人参-钩藤药对治疗原发性高血压的作用机制

目的基于网络药理学探究人参-钩藤药对治疗原发性高血压有效成分的靶基因及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)中药数据库检索人参-钩藤药对的化学成分和靶基因,以生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为条件筛选药对的潜在有效成分,并通过TCMSP数据库预测药对的潜在靶点。运用Uniprot数据库寻找到潜在靶点相对应的人类基因名称,通过GeneCards数据库检索原发性高血压的疾病靶点,与药对的潜在靶点相映射,绘制韦恩图,将映射找到的有效成分的靶基因导入Cytoscape 3.7.2构建疾病-药对-成分-靶点网络图。利用STRING数据库构建蛋白互作网络图选出核心靶标,最后将人参-钩藤药对治疗原发性高血压的有效靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得人参-钩藤药对46个有效成分和176个有效靶点。GO分析发现,主要途径有调控核受体活性、转录因子活性、肾上腺素能受体活性、类固醇激素受体活性、G蛋白偶联胺受体活性等。KEGG通路富集分析发现,主要通路为丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论人参-钩藤药对通过多种靶点、多种途径、多种信号通路协同发挥治疗原发性高血压的作用,为进一步药物作用机制的研究提供理论基础,并为指导临床提供依据。     

基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制。方法采用检索中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)检索侯氏黑散的14味药(牡蛎为动物药,未纳入分析范围)中所有化学成分,筛选活性成分及作用靶点;通过GeneCards检索缺血性脑卒中疾病靶点;利用Venny工具绘制韦恩图,找出交集靶点;应用STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共筛选到155个中药活性成分、164个作用靶点,缺血性脑卒中相关靶点3173个,从而得到药物-疾病的共同靶点121个。富集于分子功能、生物过程和细胞组分及47条信号通路,包括NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路、钙信号通路等。预测侯氏黑散居前5位的主要活性成分是前列腺素内过氧化物合酶2、槲皮素、山奈酚、前列腺素内过氧化物合酶1、热休克蛋白90,主要通过调节白细胞介素6(IL-6)、血清对氧磷酶1(PON1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素2(IL-2)、趋化因子(CCL2)等靶点,调控NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路等达到治疗缺血性脑卒中的目的。结论侯氏黑散通过多成分、多靶点、多通路治疗缺血性脑卒中。     

基于网络药理学探讨太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的作用机制

目的应用网络药理学的研究方法挖掘太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的物质基础及其作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库检索太子参、赤芍两味中药的化学活性成分,并进行靶点预测。通过TTD、DisGeNET、OMIM数据库分别检索糖尿病和冠心病的相关疾病靶点,将中药靶点与疾病靶点进行交集,筛选得到共同作用靶点。应用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络模型。使用Cytoscape软件对该网络进行拓扑学分析得到核心靶点,并对核心靶点进行GO-BP生物功能富集分析,应用DAVID平台对其进行KEGG通路分析。结果经数据库分析共筛选出6个太子参有效活性成分、25个赤芍有效活性成分和451个潜在作用靶点,与糖尿病合并冠心病共同作用靶点173个。通过对共有靶点的拓扑分析,筛选出49个核心靶点。GO-BP生物功能富集分析发现,太子参、赤芍可通过脂多糖的调节、活性氧物质的代谢过程、血液循环的调节、血管收缩的调节等过程,从而共同发挥治疗糖尿病合并冠心病的作用。KEGG通路富集分析发现,其可通过脂肪细胞因子信号通路、ErbB信号通路、间隙连接通路、焦点黏附通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、促黄体生成素释放激素(GnRH)信号通路等代谢通路起到治疗作用。结论太子参与赤芍可通过多靶点、多通路治疗糖尿病合并冠心病。