肾癌环状RNA表达谱和调控通路分析

目的 检测肾癌环状RNA(circRNA)表达谱并预测其调控通路.方法 对3例肾癌患者的肾癌组织及癌旁正常肾组织标本进行高通量测序,结合生物信息学的方法预测差异表达的circRNA在肾癌中的调控通路.结果 共鉴定出4661个circRNA,其中1963个为新发现的circRNA,89.89％(4190/4661)circRNA是外显子circRNA,其余的circRNA包括4.66％(217/4661)内含子circRNA和5.45％(254/4661)基因间circRNA.这些cir-cRNA广泛分布在整个人类染色体中,其中2号染色体包含463个circRNA,而Y染色体仅包含10个circRNA.circRNA的长度为78～181652 nt,其中位长度为652 nt,43.77％的circRNA长度为200～600 nt.与癌旁组织相比,肾癌组织中发现53个显著异常表达的circRNA,包括21例上调和32例下调的circRNA(倍数≥2.0,P﹤0.05).分别选取表达差异倍数最高的4个上调和下调的circRNA,构建circRNA/微小RNA(miRNA)/mRNA调控网络,有助于预测circRNA在肾癌中的调控通路.结论 本研究阐明了肾癌circRNA的表达模式和差异表达的circRNA,并预测及构建了circRNA/miRNA/mRNA调控网络,用于指导后期关于肾癌circRNA的研究.     

环状RNA在肿瘤中的研究进展

摘 要：环状RNA（circRNA）是一类不同于线性RNAs,可形成共价闭锁环结构,在哺乳动物体内具有巨大基因调控功能的非编码RNAs,其主要来源于外显子或内含子,经索尾插接或套索内含子方式产生,具有数量巨大,进化保守、在细胞质中稳定性高等特点,具有microRNA分子海绵、结合RNA相关蛋白形成RNA-蛋白质复合物和基因转录调控等作用。CircRNA可与肿瘤相关的miRNA形成circRNA-miRNA轴参与肿瘤相关信号通路的调控。全文从circRNA的种类、成环机制、功能及其在肿瘤中的作用及最新进展等方面作一综述。     

环状RNA在头颈部肿瘤侵袭转移中的研究进展

环状RNA（circRNA，circularRNA，环状核糖核酸）是非编码RNA中的一种，以反向剪接方式形成，具有种类多、丰度高、表达稳定、组织特异性强的特点。根据来源不同，环状RNA可分为来自编码基因即外显子序列、定位于细胞质的ecircRNA（exonic circRNA），仅含有内含子序列、主要定位于细胞核的ciRNA（circular intronic RNA）和同时具有外显子和内含子序列、主要定位于细胞核的ElciRNA（exon-intron circRNA）等3种类型。随着高通量测序和生物信息技术的发展，已发现环状RNA具有多种生物学功能，如作为竞争的内源性RNA或miRNA（microRNA，微核糖核酸）海绵、进行蛋白质翻译、与蛋白质结合相互作用、调节母本基因的选择性剪接或转录，从而参与多种疾病的生物过程，特别是肿瘤的发生发展以及肿瘤细胞的增殖、转移、凋亡等过程。作为全球第6大癌症，虽然目前头颈部肿瘤（head and neck cancer，HNC）的治疗方法较多，但其所处部位的特殊性给治疗带来困难，导致患者预后生存质量差。区域和（或）远处转移与HNC的死亡率有密切关系。本文综述了circRNA的生物发生、生物特征、生物功能及其目前在HNC的侵袭转移中的生物分子机制及生物学意义的研究进展，为继续探索HNC的转移致病机理提供参考。      

circRNA与消化道肿瘤：进展和机遇

消化道肿瘤是我国常见的恶性肿瘤,发病率逐年上升,有效筛查和早期诊断是临床上亟需解决的问题。环状RNA（circRNA）是一类新的非编码RNA,可通过多种机制在生物学功能中发挥重要作用,如“miRNA海绵”、转录调节剂以及与RNA结合蛋白的结合。最近也有研究发现部分细胞质circRNA可以翻译成蛋白质。circRNA逐渐成为RNA和消化道肿瘤研究领域的热点之一,但是大多数消化道肿瘤相关circRNA的功能及其作用机制仍未知。本文就消化道肿瘤相关circRNA最新的研究进展及热点进行述评。     

外泌体环状RNA在前列腺癌中的研究现状

环状RNA(circular RNA,circRNA)是一种具有共价闭环结构的非编码RNA,可在肿瘤细胞的增殖、凋亡、侵袭和耐药等多种生物学过程中发挥重要的调控作用。外泌体是一种细胞外囊泡,参与细胞间的物质运输和信息传递,能够携带脂质、蛋白质和核酸等多种生物活性分子。外泌体中circRNA富集且稳定存在,外泌体来源的circRNA在泌尿系统恶性肿瘤的早期诊断、病情进展及预后评估中发挥重要作用。本文就circRNA的生物学特性和功能及外泌体circRNA在前列腺癌中的研究现状进行综述。     

环状RNA在消化系统肿瘤中的研究进展

环状RNA(circular RNA,circRNA)作为非编码RNA(non-coding RNA,ncRNA)家族中的新成员,具有诱捕微小RNA(microRNA,miRNA)、调控相关基因表达、参与转录拼接等重要功能.近年来,随着对circRNA的研究不断深入,其在诸多疾病发生发展过程中所发挥的重要作用不断被揭示.消化系统肿瘤作为发病隐匿且预后相对较差的一大类疾病一直威胁着人类健康.随着对消化系统肿瘤认识的加深,关于其分子水平的诊断和治疗研究逐步成为新热点.本文将就circRNA与消化系统肿瘤的相关性,以及其潜在临床价值做一简要综述.     

环状RNA与肿瘤的研究进展

环状RNA（circRNA）是新近发现的一种共价闭合环状结构的非编码RNA,广泛存在于各种生物细胞中,其是由前体 mRNA 反向剪接产生,具有结构稳定、序列保守和一定的组织特异性等特征。近年研究表明, circRNA可作为微小RNA海绵来抑制微小RNA的活性,并具有调控基因转录、结合RNA结合蛋白等功能。作为一种新型调控分子,circRNA在肿瘤的发生发展过程中发挥重要作用,有望成为新型肿瘤标志物和潜在靶点,为肿瘤的诊断和靶向治疗提供新的方向。本文就 circRNA 的特征、形成机制、功能及其在肿瘤中的作用作一综述。     

环状RNA和癌症

[摘要]环状RNA（circular RNA,circRNA）是一类新近发现的内源性非编码RNA,具有闭合环状结构,由RNA剪切而成。随着高通量测序技术和生物信息学技术的发展,circRNA 不再被认为是RNA剪切过程中的随机产物,其生物学意义和功能受到越来越多的重视。circRNA不具有5’端帽子和3’端poly(A)尾结构,所以其结构较其他非编码RNA稳定。circRNA与多种肿瘤的发生发展密切相关,因此被认为可能是一种新型生物标志物及治疗靶点。本文就circRNA 的特征、形成机制、生物学功能与恶性肿瘤的相关性进行综述,并对具有代表性的肿瘤环状RNA调控机制进行概括总结。     

环状RNA在肿瘤中的研究进展

环状RNA（circular RNA，circRNA）是一种共价闭合环状结构的非编码RNA，广泛存在于生物体中，具有结构稳定、高度保守性及特异性表达的特性。研究表明，circRNA可作为竞争性内源RNA（competing endogenous RNAs，ceRNA），调控基因表达或结合RNA相关蛋白发挥生物学功能。circRNA在肿瘤的发生发展中扮演了重要角色，有望成为肿瘤诊断的生物标志物及治疗靶点。本文结合国内外的最新研究，对circRNA在肿瘤中的研究进展作一综述。     

circRNA的生物学功能及其在卵巢癌中的研究进展

生物信息技术的快速发展正在推动一些隐藏的基因被人们所发现。环状RNA(circRNA)是内源性非编码RNA(ncRNA)家族的新成员,通过单链RNA分子的3’端和5’端连接而成,具有一定的广泛性、保守性、稳定性和组织特异性。近年来,随着高通量测序技术和生物信息学的不断发展,大量内源性circRNA在各种细胞类型中均可被检测到,且circRNA具有发挥微小RNA(miRNA)海绵作用、调控基因表达及翻译等生物学功能,同时在生物发育过程中和疾病诊断中起着至关重要的作用。circRNA具有差异性表达的特点,与多种恶性肿瘤的发生、发展密切相关,在肿瘤中发挥抑癌基因或癌基因的作用,有望成为恶性肿瘤的新型诊断标志物、分子治疗靶点和预后评估指标。目前,仅有少量关于circRNA在卵巢癌中研究进展的报道,本文拟从circRNA的生物学功能及其在卵巢癌中的研究进展进行简要综述。     

Role of circular RNAs in gastric cancer: Recent advances and prospects

Circular RNA (circRNA) is a newly discovered non-coding RNA with special structure, which is widely expressed in eukaryotic organisms and mainly located in the cytoplasm. circRNAs participate in gene regulation by working as miRNA sponges that block the inhibitory effect of miRNA on its target genes. In addition, circRNAs can bind to RNA binding proteins to regulate gene expression. Based on characteristics of stability, expression specificity and participation in gene regulation, circRNAs are expected to be biomarkers for early diagnosis of cancer or potential targets for cancer therapy. With the help of bioinformatics analysis, circRNA microarray analysis and high-throughput sequencing technology, more circRNAs were discovered to participate in the progression of gastric cancer (GC) over the past three years. This article gives an overview of these recent research focusing on the roles of circRNAs in GC and highlights the advances.     

环状RNA在胃癌中的研究进展

环状RNA(circular RNAs，circRNAs)是一种新型的内源性非编码RNA，与其他线性RNA不同，其在真核生物的转录组中占有很大的比例。一般线性RNA具有3＇ 和5＇ 末端，而circRNAs的3' 末端和5' 末端连接在一起，形成环状结构，在真核生物中占很大的比例并显示高组织特异性表达模式。多种circRNAs在转录后水平通过抑制miRNA活性可以调节基因表达，其中一些促进细胞增殖并可望成为胃癌（gastric cancer，GC)的独立生物标志物。胃癌(GC)是世界上大多数地区重要的公共卫生问题，研究表明，circRNA表达谱可能成为胃癌的诊断、进程监测及预后评估的特异标志物，对胃癌患者的诊治及预后具有重要临床意义。笔者结合国内外最新研究报道，对环状RNA在胃癌中的研究进展进行综述，以期为胃癌的诊断、治疗与预后提供新的思路。     

环状RNA在神经胶质瘤中的研究进展

环状RNA（circular RNA，circRNA）是1种特殊的内源性非编码RNA，由前体RNA的3′末端与5′末端首尾相连形成闭合环状结构。主要通过可变剪接、转录调控、编码蛋白、抗病毒免疫反应、微小RNA（microRNA，miRNA）海绵作用等发挥作用。circRNA在神经胶质瘤细胞增殖、凋亡、侵袭等方面发挥关键作用。随着基因芯片的问世，circRNA有望成为1种诊断神经胶质瘤的新型生物学标志物，也可为预防、靶向治疗神经胶质瘤提供新的理论依据。     

Circular RNA LPAR3 sponges microRNA‐198 to facilitate esophageal cancer migration,invasion, and metastasis

In this study, we explored expression and functions of circular RNA LPAR3 (circLPAR3) in esophageal squamous cell carcinoma (ESCC). The differential expression of circular RNAs (circRNAs) in 10 ESCC and corresponding paracarcinoma tissues was analyzed through circRNA microarray, then the candidate circRNAs were detected and verified through quantitative RT‐PCR, and a novel circRNA was screened, which was circLPAR3. Circular RNA LPAR3 showed apparently high expression in ESCC tissues and cells, which was closely correlated with the clinical stage and lymph node metastasis of ESCC patients. Circular RNA LPAR3 was mainly located in the cytoplasm of ESCC cells, which was more stable than the baseline gene. Circular RNA LPAR3 upregulated MET gene expression through sponge adsorption of microRNA (miR)‐198, activated the RAS/MAPK and the PI3K/Akt pathways, and promoted ESCC cell migration, invasion, and metastasis in vivo and in vitro. However, it had no effect on ESCC cell proliferation. Circular RNA LPAR3 can regulate the miR‐198‐MET signal axis to promote the migration, invasion, and metastasis of esophageal cancer cells, which can thereby serve as a potential diagnostic and therapeutic target of esophageal cancer.     

环状RNA在消化道肿瘤中的研究进展

环状RNA(circular RNAs,circRNAs)是一种新型的内源性非编码RNA,与其他线性RNA不同,它形成共价闭合连续的环形结构,在真核生物的转录组中占有很大的比例.这些circRNAs主要来源于内含子或者外显子,通过反向拼接或套索内含子方式产生.近来研究发现,circRNAs在细胞质中富集,具有保守性和相对稳定性,这些特性赋予了circRNAs许多潜在的功能,例如充当微小RNA(miRNA)海绵,结合RNA相关的蛋白质,形成RNA蛋白复合体从而调节基因的转录.有证据表明circRNAs在消化道肿瘤中可能发挥重要的作用并且能够作为某些疾病的诊断性或预测性生物标记物.本文结合国内外的最新研究报道,对circRNAs在消化道肿瘤中的研究进展作一综述,以期为消化系统肿瘤预测、诊断和治疗提供新的思路.     

Circ-E-Cad encodes a protein that promotes the proliferation and migration of gastric cancer via the TGF-β/Smad/C-E-Cad/PI3K/AKT pathway

Accumulating studies indicate that circular RNAs (circRNAs) play critical roles in cancer progression. Most of them have been reported to act as microRNA sponges or interact with RNA-binding proteins; however, their full range of functions remains largely unclear. Recently, an increasing number of circRNAs have been found to encode proteins. C-E-Cad, a protein encoded by circular E-cadherin (circ-E-Cad), has been shown to have a great influence in the progression of glioblastoma, but its specific role in gastric cancer (GC) is unclear. Here, we found that both circ-E-Cad and C-E-Cad were upregulated in GC cell lines and GC tissues compared with a human gastric epithelial cell line (GES-1) and normal tissues. Knockdown of circ-E-Cad suppressed GC cell line proliferation and metastasis in vitro and in vivo, whereas overexpression of C-E-Cad had the opposite effects. Immunoblotting revealed that C-E-Cad exerted tumor-promoting functions by regulating the PI3K/AKT pathway. A rescue experiment showed that C-E-Cad but not circ-E-Cad was the executor of protumor biological functions. In addition, we demonstrated that the C-E-Cad expression level could have been increased by the TGF-β/Smad pathway. In summary, our results indicated that the TGF-β/Smad pathway could increase the expression of C-E-Cad to regulate GC cell proliferation, migration, and epithelial-mesenchymal transition by affecting PI3K/AKT signaling.     

环状RNA在胶质瘤临床诊疗中的研究进展

环状RNA（circular RNAs，circRNAs）是一类共价闭合环状的单链RNA分子，具有高度的稳定性、丰度和保守性，并显示组织/发育阶段特异性表达。与其它非编码RNA类似，circRNAs的功能也具有多样性。近年来，circRNAs作为微小RNA（microRNAs，miRNAs）海绵和蛋白质海绵、翻译、转录和剪接等功能的调控机制逐渐被揭示，circRNAs可为癌症诊疗/预后提供新的生物标志物和靶点。越来越多的研究表明，circRNAs在神经元组织中高丰度存在，其失调与神经系统疾病（包括胶质瘤）的发生密切相关。本文就circRNAs在胶质瘤中诊疗的作用研究进展进行综述。