2型糖尿病遗传易感性与CAPN-10基因多态性的相关性研究

目的探讨2型糖尿病(T2DM)遗传易感性与CAPN-10基因多态性的关系。方法采用限制性片段长度多态性聚合酶链反应(PCR-RFLP)技术对100例T2DM患者(病例组)和100例健康者(对照组)CAPN-10基因SNP19(rs3842570)、SNP43(rs3792267)和SNP63(rs5030952)多态性位点进行基因分型。结果病例组CAPN-10基因43位点的GG基因型频率和G等位基因频率显著高于对照组,差异有统计学意义(P<0.05);19位点和63位点的基因型频率、等位基因频率在病例组与对照组分布差异均无统计学意义(P>0.05)。结论 CAPN-10基因SNP43(rs3842570)位点与T2DM的发生有相关性,而SNP19(rs3842570)和SNP63(rs5030952)位点则与T2DM的发生无相关性。     

β-珠蛋白生成障碍性贫血患者血红蛋白F表达与BCL11A基因rs11886868位点单核苷酸多态性的关系

本研究通过分析β-珠蛋白生成障碍性贫血患者的血红蛋白F(HbF)表达及BCL11A基因rs11886868位点的单核苷酸多态性,探讨二者之间的关系。选取89例已知基因突变类型的轻型β-珠蛋白生成障碍性贫血患者,通过毛细管电泳分析患者的红细胞HbF含量;提取患者基因组DNA,通过聚合酶链反应扩增含rs11886868位点的BCL11A基因片段,用DNA测序法确定rs11886868位点的单核苷酸多态性。结果显示,在89例深圳地区β-珠蛋白生成障碍性贫血患者的BCL11A基因rs11886868位点中发现C和T两种单核苷酸多态性;携带C/C单倍型患者的红细胞HbF含量为(4.47±3.42)%,高于携带C/T单倍型患者的(2.79±2.21)%。结论:β-珠蛋白生成障碍性贫血患者BCL11A基因rs11886868位点存在C和T两种单核苷酸多态性,其中C多态性可能与红细胞内HbF高表达存在相关性。     

IL-17基因多态性位点与新疆地区慢性阻塞性肺病的风险关系

目的探讨IL-17基因核苷酸多态性与新疆地区慢性阻塞性肺病(COPD)的风险关系。方法采用多重单碱基延伸单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)分型技术(SNa Pshot)对149例COPD患者及97例健康人IL-17A基因rs2275913、rs3819024、rs3819025、rs4711998、rs8193036 5个SNP位点及IL-17F基因rs12203582、rs1266828、rs7771466、rs9382084 4个SNP位点进行分型,并比较不同基因型和等位基因与COPD的风险关系。结果健康人与稳定期COPD患者在IL-17A的5个SNP位点及IL-17F的4个SNP位点均未见差异。其位点的变异、突变基因型分布与COPD的易感性亦无明显差异,对IL-17F及IL-17A基因的SNP进行连锁不平衡反应后的分析结果表明,IL-17A基因CAA单体型在COPD与健康人间差异存在统计学意义(OR=0.244,95%CI:0.057~1.043,P0.05)。结论 IL-17F及IL-17A基因多态性与COPD患病无直接风险关系,但在IL-17A基因单体型CAA改变可能与新疆地区COPD易感性有关。     

人内皮脂肪酶基因多态性与肝癌易感性相关性研究

目的 探讨人内皮脂肪酶(EL)基因位点(rs2000812、rs2097055、rs2276269)单核苷酸多态性(SNP)与肝癌易感性的相关性.方法 选取2015—2018年重庆市大足区人民医院收治的经病理诊断为肝癌患者的全血标本120例纳入肝癌组,同期选取无肿瘤疾病、无家族遗传病史的健康体检者血液标本120例纳入健康组,比较两组EL基因位点的SNP分布频率,以及EL基因位点SNP与肝癌易感性的相关性等.结果 两组受试者EL基因位点rs2000812、rs2097055及rs2276269 SNP位点分布频率情况比较,差异均无统计学意义(P>0.05).多因素Logistic回归分析结果显示,EL rs2097055的TT、CT+CC基因型是影响肝癌发病的独立危险因素(P<0.05).EL rs2000812和rs2276269的SNP与肝癌的发生无相关性(P>0.05).丙肝病毒感染是影响EL rs2097055 CT+CC基因型肝癌发生的影响因素.结论 EL基因rs2097055多态性与肝癌的发病具有相关性,且其SNP效果受丙肝病毒感染影响.     

异常血红蛋白合并遗传性持续性胎儿血红蛋白增多症患者一例的基因分析

目的 对1例异常血红蛋白合并遗传性持续性胎儿血红蛋白增多症(HPFH)患者进行基因分析.方法 患者男,26岁,2010年9月到广州金域医学检验中心进行体检,经血液学分析、血红蛋白电泳、红细胞渗透脆性分析后,疑为异常血红蛋白合并HPFH病患者.应用常规血液学检查、碱性琼脂糖凝胶血红蛋白电泳对先证者进行表型分析;通过对HBB基因直接测序检测异常血红蛋白的突变类型;应用多重连接酶依赖探针扩增技术(MLPA)检测整个β-珠蛋白基因簇有无缺失及缺失的大致范围;应用跨越断裂点聚合酶链反应(gap-PCR)进行跨越断裂点PCR扩增,对此扩增产物进行基因测序分析,并将其结果与参考序列NC_000011.9进行比对,判断具体的断裂位点.结果 通过对HBB基因进行直接测序,发现该异常血红蛋白为Ta-Li( HBB:c.250G＞T),通过MLPA结合gap-PCR以及对产物进行基因测序,发现患者存在β-珠蛋白基因的大片段缺失,缺失范围为NC_000011.9:g.5222878_5250288del,即患者的基因型为异常血红蛋白Ta-Li合并东南亚型遗传性持续性胎儿血红蛋白增多症(SEA-HPFH).结论 联合应用MLPA、gap-PCR和基因测序技术可能有助于明确先证者的基因型.     

儿童自闭症与金属硫蛋白Ⅲ基因多态性相关性研究

目的研究金属硫蛋白Ⅲ(MT3)基因内含子区rs45570941多态性与儿童自闭症的关系,同时比较在正常儿童和自闭症患儿中基因型的分布情况和等位基因频率。方法收集71例正常对照儿童和72例诊断为自闭症儿童的外周血标本,提取DNA,运用聚合酶链反应-限制性片段多态性(PCR-RFLP)方法,分别对MT3基因单核苷酸多态性(SNP)进行分析。结果自闭症儿童组与对照组rs45570941多态性位点的等位基因和基因型的频数分布均符合Hardy-Weinberg平衡检验(χ2=2.96,υ=1,P>0.05;χ2=4.14,υ=1,P>0.05);自闭症儿童组与对照组MT3基因rs45570941多态性位点的基因型分布和等位基因频率的总体分布有统计学差异(χ2=13.569,P<0.05;χ2=6.89,P<0.05)。结论在本研究人群中,MT3的多态性位点rs45570941与自闭症的发生有一定的相关性,如果进一步加大样本量和挑选更多的SNP位点进行深入研究,对自闭症的病因将会有更多的发现。     

C13orf31基因单核苷酸多态性与彝族麻风病相关性的研究

目的研究C13orf31基因单核苷酸多态性(SNP)位点与中国彝族人群麻风病的关系。方法采用单碱基延伸法(SNaP shot)检测300例彝族麻风病患者(麻风病组)和300例彝族健康者(对照组)C13orf31基因的2个SNP:rs3764147、rs10507522的基因型。结果 rs3764147和rs10507522这2个位点的基因型分布均符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05),并且其等位基因频率在麻风病组和对照组间的差异具有统计学意义(P<0.05)。结论 C13orf31基因单核苷酸多态性位点rs3764147和rs10507522与中国彝族人群麻风病相关。     

白细胞介素-17基因多态性与山西东南地区汉族人群2型糖尿病的相关性

目的 研究山西省东南地区汉族人群白细胞介素-17(IL-17)基因单核苷酸多态性及其与2型糖尿病（T2DM）的相关性。方法 收集健康对照组和T2DM组受试者基本信息及临床资料,提取全血DNA,采用聚合酶链反应-高温连接酶反应对IL-17基因4个位点（rs2275913、rs3819024、rs4711998和rs8193036）进行多态性检测。结果 两组IL-17基因4个SNP位点基因型和等位基因频率分布差异均无统计学意义（P> 0.05）,在校正年龄、BMI、WC和血脂异常等因素后,两组研究对象在不同遗传模型下的基因型及等位基因频率分布差异亦无统计学意义（P> 0.05）。进一步分析显示,T2DM组rs2275913位点AA基因型FPG和HOMA-IR显著低于AG和GG基因型,三组间差异有统计学意义（P <0.05）;而三组间BMI、FINS、HbA1c水平差异无统计学意义（P> 0.05）。此外,T2DM组rs3819024位点AA基因型WC、HOMA-IR显著高于GG基因型,差异有统计学意义（P <0.05）。结论 IL-17基因rs2275913、...     

包头地区汉族人群PSCA基因rs2294008多态性与非贲门胃癌的关联研究

目的探讨包头地区汉族人群前列腺干细胞抗原(PSCA)基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs2294008CT与非贲门胃癌发病风险的相关性。方法收集288例胃癌患者(胃癌组)和281例健康者(健康对照组)血标本,采用TaqMan进行了基因分型;并用非条件性Logistic回归分析PSCA基因位点rs2294008多态性与非贲门胃癌发病风险的关联性。结果 rs2294008的等位基因和基因型分布频率在胃癌患者和健康对照者中的差异无统计学意义(P0.05)。结论 PSCA基因位点rs2294008多态性可能在包头地区汉族人群非贲门胃癌的发病中不起主要作用。     

剥脱型青光眼LOXL1基因多态性分析

目的探讨类赖氨酸氧化酶1(LOXL1)基因多态性与剥脱型青光眼发病的关系。方法选取2016年1月至2019年2月在我院治疗的剥脱型青光眼患者91例作为观察组,同时选取180例健康志愿者作为对照组,采用聚合酶链反应直接测序LOXL1基因rs2165241、rs1048661和rs3825942位点多态性。结果观察组和对照组LOXL1基因rs2165241位点基因型及等位基因分布比较差异无统计学意义(P0.05);观察组和对照组LOXL1基因rs3825942位点基因型及等位基因分布比较差异无统计学意义(P0.05);观察组LOXL1基因rs1048661位点基因型GG及等位基因G比例分别为62.64%和80.22%,明显高于对照组,比较差异有统计学意义(P0.05)。结论 LOXL1基因rs1048661位点多态性与剥脱型青光眼发病可能有一定关系,值的进一步研究。     

冠心病患者α-内收蛋白基因多态性与表达水平研究

目的 探讨α-内收蛋白基因(ADD1)的单核苷酸多态性(SNP)及表达水平与冠心病(CAD)的相关性。方法 提取2011年1月～2013年10月就诊于火箭军总医院的114例CAD患者和116例健康对照者外周血白细胞DNA和RNA,应用荧光标记单碱基延伸及杂交技术检测ADD1基因的rs3775067和rs1263359多态性,应用荧光标记及毛细管电泳技术检测ADD1的基因表达水平。结果 ADD1基因2个SNP的基因型频率和等位基因频率在两组间差异无统计学意义(χ2=0.018～1.317,P值均>0.05)。CAD组的ADD1基因表达水平为0.226±0.284,明显高于健康对照组(0.153±0.144),差异有统计学意义(P<0.05)。通过对不同基因型间表达水平的比较,结果显示CAD组rs3775067的TC型患者的基因表达水平(0.250±0.319)明显高于健康对照组(0.154±0.156,P<0.05),余各基因型两组间表达水平差异无统计学意义(t=0.557～1.867,P值均>0.05)。结论 ADD1基因表达水平的升高是CAD的危险因素,而rs3775067和rs1263359多态性与CAD的易感性无关。     

HbF水平在β-地中海贫血携带者妊娠期产前筛查中的应用

目的 研究胎儿血红蛋白HbF与妊娠和β-地贫的关系. 方法 采集妊娠与非妊娠期女性外周血,进行HbF血红蛋白电泳分析.同时提取外周血基因组DNA,应用反向斑点杂交技术进行基因分析.分别比较HbF增高在妊娠组与非妊娠组、正常组与β-地贫组、非妊娠组内β-地贫与正常样本、妊娠组内β-地贫与正常样本和β-地贫组内妊娠与非妊娠...     

变异血红蛋白和氨基甲酰血红蛋白对糖化血红蛋白测定干扰的评价

目的评价变异血红蛋白和血红蛋白衍生物氨基甲酰血红蛋白对离子交换-高效液相色谱(HPLC)系统和用酶法检测糖化血红蛋白(HbAlc)的影响。方法分别用2种方法同时检测无尿毒症糖尿病患者血红蛋白结构正常的血液样本和含有不同浓度胎儿血红蛋白(HbF)的血液样本及尿毒症患者HbA1c浓度。结果对于血红蛋白结构正常且无尿毒症的糖尿病患者,2种方法的HbA1c检测结果差异无统计学意义(P>0.05)。当HbF<8.75%时,离子交换-HPLC的HbA1c测定结果与预期值无差异;当样本中HbF浓度为8.8%～23.0%时,其HbA1c测定结果要明显低于理论浓度;当HbF浓度达35.0%～70.0%时,离子交换-HPLC无法检测出结果。因尿毒症患者血液中含氨基甲酰血红蛋白,所以离子交换-HPLC的HbA1c检测结果明显高于酶法;而酶法检测HbA1c不受血液中HbF和氨基甲酰血红蛋白的干扰。结论采用离子交换-HPLC检测含HbF和氨基甲酰血红蛋白的样本中的HbA1c时,结果可能受到干扰;而酶法检测HbA1c时几乎不受样本中HbF和氨基甲酰血红蛋白的干扰。     

毛细管电泳血红蛋白A_2增高对诊断β-珠蛋白生成障碍性贫血符合率分析及应用价值

目的分析毛细管电泳血红蛋白A2增高患者β-珠蛋白生成障碍性贫血(简称地贫)确诊符合率,探讨其在β-地贫中诊断中的应用价值。方法选择该院2014年5月至2015年5月门诊及住院血红蛋白A2增高患者260例进行地贫基因检测。结果 260例血红蛋白A2增高患者中,有257例检测到β-地贫基因突变,符合率达98.85%,另外3例未检测出常见的17种β-地贫基因突变,后续经进一步进行罕见型β-地贫基因检测及β珠蛋白基因测序,发现1例为SEA-HPFHβ缺失型,1例为Taiwaneseβ缺失型,1例为Codon 89-93(-AGT GAG CTG CAC TG)杂合突变,证实3例未检测出17种常见β-地贫基因突变的血红蛋白A2增高标本仍为β链发生突变或大片段缺失引起。同时257例β-地贫基因突变标本中有42例复合α-地贫,占β-地贫的16.34%。结论毛细管电泳血红蛋白A2增高能为β-地贫的诊断提供快速准确的依据,但不能排除复合α-地贫的可能,当患者血红蛋白A2增高时,应同时进行α-地贫和β-地贫基因诊断。     

The Genetic and Clinical Significance of Fetal Hemoglobin Expression in Sickle Cell Disease

Sickle cell disease (SCD) is phenotypically heterogeneous. One major genetic modifying factor is the patient''s fetal hemoglobin (HbF) level. The latter is determined by the patient''s β-globin gene cluster haplotype and cis- and trans-acting single nucleotide polymorphisms (SNPs) at other distant quantitative trait loci (QTL). The Arab/India haplotype is associated with persistently high HbF levels and also a relatively mild phenotype. This haplotype carries the Xmn1 (C/T) SNP, rs7482144, in the HBG2 locus. The major identified trans-acting QTL contain SNPs residing in the BCL11A on chromosome 2 and the HMIP locus on chromosome 6. These collectively account for 15–30% of HbF expression in different world populations and in patients with SCD or β-thalassemia. Patients with SCD in Kuwait and Eastern Saudi Arabia uniformly carry the Arab/India haplotype, but despite this, the HbF and clinical phenotypes show considerable heterogeneity. Pain episodes and avascular necrosis of the femoral head are particularly common, but severe bacterial infections, stroke, priapism, and leg ulcers are uncommon. Moreover, the HbF modifiers appear to be different; the reported BCL11A and HMIP SNPs appear to play insignificant roles. There are probably novel modifiers to be discovered in this population. This review examines the common clinical phenotypes in Kuwaiti patients with elevated HbF and the available information on HbF modifiers. The response of the patients to hydroxyurea is discussed. The presentation of patients with other sickle compound heterozygotes (Sβthal and HbSD), vis-à-vis their HbF levels, is also addressed critically.     

Multiplex-PCR assay for the deletions causing hereditary persistence of fetal hemoglobin.

INTRODUCTION: Hereditary persistence of fetal hemoglobin (HPFH) is a benign condition caused by the failure of normal switching from the fetal to the adult beta-globin gene, resulting in continuous production of fetal hemoglobin beyond the perinatal period. To date, eight deletions of variable size and position have been reported for HPFH. Southern hybridization and PCR are the most common methods used to detect each deletion. AIM: Our aim was to develop a multiplex-PCR assay to detect these deletions in a single tube in order to facilitate rapid and accurate molecular diagnosis. METHODS AND RESULTS: This report is the first application of multiplex-gap-PCR to detect all HPFH deletions simultaneously to expedite diagnosis. The deletion breakpoints were precisely identified for each deletion and primers were designed in the unique regions across the breakpoints of HPFH-1 (Black), HPFH-2 (Ghanaian), HPFH-3 (Asian Indian), HPFH-4 (Italian), HPFH-5 (Italian), HPFH-6 (Vietnamese), HPFH-7 (Kenyan), and SEA-HPFH (Southeast Asian). As many as 16 primers were used in a single amplification reaction by adjusting the relative primer concentrations. The multiplex-PCR approach was standardized on known positive control samples. We identified unique deletion-specific products for each deletion. The results were confirmed by sequence analysis. CONCLUSIONS: We conclude that our multiplex-gap PCR strategy provides the most rapid and accurate diagnosis for the deletions in the beta-globin gene cluster causing HPFH.     

广州市花都区育龄人群Beta-地中海贫血基因型分布

目的探讨广州市花都区育龄人群β-地中海贫血的基因携带率、突变类型及分布情况，并筛查出夫妇双方同时携带β-地中海贫血基因型的高风险家庭。 方法选择2018年1月至12月，在广州市花都区妇幼保健院参加免费优生健康检查的育龄人口共计6 494对(共12 988例)，收集经地中海贫血初筛[平均红细胞体积(MCV)↓和(或)平均红细胞血红蛋白含量(MCH)↓]检查为阳性的乙二胺四乙酸(EDTA)-K2抗凝全血标本2 240对(共4 480例)，采用聚合酶链反应(PCR)＋导流杂交法检测β-地中海贫血基因17个常见位点的突变类型，对于未知突变型基因则采用直接测序法进行β-珠蛋白测序，并对检测结果进行统计分析。如果夫妻双方同时携带β-地中海贫血基因，则归属于高风险人群。 结果6 494对(共12 988例)受检者中，共检测出504例带有β-地中海贫血基因突变，检出率为3.88%。共检出12种常见β-地中海贫血基因型，构成比最高的3种基因型依次是βCD41-42(208/504，41.27%)、βIVS-II-654(143/504，28.37%)、β-28(66/504，13.09%)；检出2种少见缺失型，分别为SEA-HPFH、^Gγ^＋(^Aγδβ)⁰；检出β复合α地中海贫血基因突变者79例，检出率为0.61%(79/12 988)。检测到β-地中海贫血高风险家庭17户。 结论广州市花都区属于β-地中海贫血高发区，且基因型复杂多样，主要以βCD41-42为主，同时应注意罕见型β-地中海贫血基因的检测。     

中国广西人群Nogo—A基因3’-非翻译区遗传多态性的研究

目的研究Nogo—A基因3’-非翻译区单核苷酸多态性（SNP）各等位基因及基因型在中国广西地区人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法采用单碱基延伸的PCR技术和DNA测序法检测199例中国广西人的Nogo—A基因3’-非翻译区rs2588510C／T、rs887G／A多态性,并结合人类基因组计划（Hapmap）公布的四个人群（欧洲人、非洲人、Et本人和中国北京人）的SNP分型数据,比较分析这五个人群的基因型及等位基因的分布频率。结果在中国广西人群中存在Nogo—A基因3’-非翻译区rs2588510C／T、rs887G／A多态性。与欧洲及非洲人群相比,Nogo—A基因多态性的分布频率均存在显著性差异（P〈0．05）;而与日本人及北京人相比,差异无显著性（P〉0．05）。结论在中国广西人群中存在Nogo—A基因多态性,但与其他种族人群比较存在显著性差异,这种差异可能是导致一些疾病在不同种族间的发病率和临床表现存在显著不同的因素之一。