大鼠肝再生中环状RNA的表达变化及其对细胞增殖的调节作用

目的 探讨环状RNA（circRNA）在大鼠肝再生中的表达变化及其对细胞增殖的调节作用。 方法 用生物高通量检测方法分析114只2/3肝切除大鼠诱导的大鼠肝再生中circRNA的表达变化,用miRanda和TargetScan网站分析大鼠肝再生的靶微小RNA（miRNA）及其mRNA,用基因本体论（GO）和IPA软件分析大鼠肝再生涉及的生理活动和信号通路,用Cytoscape v3.0.2软件构建大鼠肝再生的相互作用网络,用表达模式结合靶miRNA数量和功能挑选候选关键circRNA。 结果 在大鼠再生肝材料中检测到20 878个circRNA,其中,560个发生差异表达,它们中的126个能与117个靶miRNA结合,后者调节6510个下游靶mRNA。这些靶mRNA涉及细胞增殖、应激反应、物质代谢等生理活动和转化生长因子β（TGF-β）、蛋白激酶A（PKA）、Wnt/β-连环蛋白（β-catenin）等信号通路。其中,circRNA_03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA可能通过12种miRNA调节15种mRNA进而在大鼠肝再生涉及的细胞增殖中发挥作用,视为大鼠肝再生的候选关键circRNA。 结论 大鼠肝再生中560个circRNA发生差异表达,其中circRNA_03651、circRNA_03653、circRNA_04500、circRNA_05865、circRNA_11274、circRNA_13559等6种circRNA通过12种miRNA和15种mRNA的相互作用网络支配大鼠肝再生涉及的细胞增殖。     

腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导通路的相互作用

背景：腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶的下游靶分子哺乳动物雷帕霉素靶蛋白对细胞生长、分裂和蛋白质合成有重要意义。 目的：综述腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导相互调节的最新研究进展,以期揭示腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶和哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导的交互作用对蛋白质合成的影响。 方法：以“(mammalian target of rapamycin OR mTOR) AND (AMP activated protein kinase OR AMPK) AND signal transduction”为检索式,计算机检索PubMed数据库相关内容的文献,最终纳入30篇可反映腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶与哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导通路相互作用的文献,并进行归纳总结。 结果与结论：腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶活化导致哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导减弱一定程度上抑制蛋白质合成,腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶通过多个位点磷酸化和活化而调节哺乳动物雷帕霉素靶蛋白信号转导。腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶磷酸化马铃薯球蛋白会抑制Akt,ERK1/ERK2和p90rsk等其他蛋白激酶的作用。明确腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶对哺乳动物雷帕霉素靶蛋白的调节过程所起的作用,对揭示腺嘌呤核苷酸活化蛋白激酶-哺乳动物雷帕霉素靶蛋白途径调控能量代谢和蛋白合成方面有重要意义。     

PPAR-γ偶联的信号通路可能参与大鼠肝再生

目的 了解PPAR-γ偶联的信号通路在大鼠肝再生(LR)中作用.方法 用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得上述通路相关基因,用Rat Genome 230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生中表达情况,用真手术与手术对照比较方法确定肝再生相关基因.结果 初步证实上述基因中64个基因与肝再生相关.肝再生启动、Go/G1 过渡、细胞增殖、细胞分化和组织结构功能重建等4个阶段起始表达的基因数为28、4、34和2,基因总表达次数为72、41、247和90,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用.它们共分为11种表达方式,表明肝再生中这些基因表达变化多样和复杂.结论 PPAR-γ偶联的信号通路在肝再生早期、前期和后期促进糖元合成;在整个肝再生中抑制炎症反应,促进细胞增殖和迁移.     

冬虫夏草醇提取物对大鼠缺血再灌注过程心肌保护作用研究

目的和方法：观察冬虫夏草对缺血再灌注过程心肌保护作用。采用Ｌａｎｇｅｎｄｏｒｆ非循环式离体心脏灌流方法，与正常对照组、缺血再灌组、刺五加注射液用药组相对比，研究了冬虫夏草醇提取物对大鼠心肌缺血－再灌注过程脂质过氧化产物（ＭＤＡ）和腺嘌呤核苷酸含量的影响。结果：冬虫夏草醇提取物显著降低了再灌注心肌的ＭＤＡ水平（Ｐ＜０．０１）及显著提高了心肌中腺嘌呤核苷酸含量（Ｐ＜００１）。结论：冬虫夏草可通过改善心肌的能量代谢减少缺血再灌注损伤，对心肌的保护作用明显优于刺五加注射液     

JNK信号通路调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡

目的 从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠再生肝8种细胞中的作用。方法 用密度梯度离心和免疫磁珠等方法分离肝细胞（HC）、胆管上皮细胞（BEC）、卵圆细胞（OC）、肝星形细胞（HSC）、窦内皮细胞（SEC）、库普弗细胞（KC）、陷窝细胞（PC）、树突状细胞（DC）等8种肝脏细胞,用大鼠Genome 230 2.0芯片检测大鼠再生肝8种细胞的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达变化预示的JNK信号通路在调控大鼠再生肝8种细胞增殖、凋亡中的作用。用实时荧光定量PCR方法验证了芯片结果的可靠性。结果 JNK信号通路涉及240个基因和42条途径,其中,225个基因与大鼠肝再生相关。基因协同作用分析显示,在大鼠肝再生启动阶段,JNK信号通路启动HC和KC增殖,促进OC凋亡,启动部分PC和SEC增殖和促进部分PC和SEC凋亡;在进展阶段,JNK信号通路促进HC、BEC、KC和DC增殖,促进部分PC增殖、部分PC凋亡。在终止阶段,JNK信号通路促进HC、OC和PC凋亡,促进部分KC增殖、部分KC凋亡。结论 大鼠肝再生中JNK信号通路的42条途径和225个基因参与调控大鼠再生肝8种细胞的增殖和凋亡。     

Comparative analysis of the role of JNK signaling pathway in cell proliferation and apoptosis of rat liver regeneration and cirrhosis

目的 从基因转录水平了解JNK信号通路在大鼠肝再生(LR)和肝硬化(LC)中的作用异同. 方法 采用2/3部分肝切除手术制备大鼠肝再生模型,以腹腔注射CCl4中性菜籽油溶液法建立大鼠肝硬化模型,采用大鼠Genome 230 2.0芯片检测不同时间点再生肝和肝硬化组织中JNK信号通路的基因表达谱,用生物信息学和系统生物学等方法分析基因表达谱预示的增殖和凋亡活动. 结果 JNK信号通路涉及302个基因和42条途径,大鼠Genome 230 2.0芯片含上述基因中的240个基因,其中,79个基因发生有意义表达变化,涉及LR的52个基因,LC的5个基因,有22个基因与两者相关.在大鼠LR启动阶段,途径1和16促进细胞增殖及途径22 ～ 33促进细胞凋亡作用强于对照;在进展阶段,途径1～17、34和35促进细胞增殖及途径22 ～33促进细胞凋亡作用强于对照,途径37～41抑制细胞凋亡作用弱于对照;在终止阶段,途径37、39、41和42诱导细胞凋亡作用弱于对照,同时,尚未发现途径18 ～ 21和36参与大鼠LR.而在LC发生中,JNK信号通路中的这些途径与对照相比均无显著差异.结论 JNK信号通路的37条途径调控大鼠肝再生的细胞增殖和凋亡,对大鼠肝硬化的调控作用则不显著.     

听源性惊厥易感性大鼠上丘一氧化氮合酶阳性神经成分的分布

用还原性烟酰胺腺嘌呤二核苷酸磷酸黄递酶，简称黄递酶（ＮＡＤＰＨ－ｄ）组织化学的方法，在光镜下对ＮＡＤＰＨ－ｄ反应阳性细胞进行计数和计算机图像分析测定反应产物的光密度（ＯＤ）值，观察一氧化氮合酶（ＮＯＳ）阳性神经元及纤维在惊厥鼠上丘分布的情况。实验动物为听源性惊厥易感性大鼠，简称惊厥鼠（Ｐ７７ＰＭＣ）和正常Ｗｉｓｔａｒ大鼠，简称正常鼠。实验结果如下：（１）在大鼠上丘第Ⅱ层ＮＯＳ阳性神经元呈密集均匀分     

核酸及其衍生物的代谢?加工?运输相关基因在大鼠肝再生中表达模式的分析

目的在基因转录水平了解核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因在大鼠肝再生(LR)中的表达变化。方法用搜索网站资料和查阅相关论文等方法获得核苷酸及其衍生物、DNA及RNA代谢、加工、运输相关基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,用手术组和假手术组比较的方法确定肝再生相关基因。结果初步证实,上述基因中有240个基因与大鼠肝再生相关。肝再生早期[部分肝切除(PH)后0.5~4h]、前期(PH后6~12h)、中期(PH后16~66h)、后期(PH后72~168h)等4个时期起始表达的基因数分别为65、14、150和11,基因的总表达次数为133、87、627和169,它们的表达模式分别为6、5、22和9种,共表达上调768次,下调248次。肝再生前期和中期mRNA降解增强;前期、中期和后期DNA重组、修饰、转录及mRNA加工和运输增强;几乎整个肝再生中核苷酸及其衍生物代谢、DNA复制、包装和分解活动增强。结论肝再生相关基因主要在肝再生早期起始表达,在不同时期发挥作用。     

肝细胞生长和分化相关基因在大鼠肝再生中的表达方式及作用分析

目的在基因转录水平了解肝再生中肝细胞的生长和分化情况。方法用搜集网站资料和查阅相关论文等方法获得参与肝细胞生长和分化基因,用大鼠基因组230 2.0芯片检测它们在大鼠肝再生(LR)中的表达情况,通过比较手术组和假手术组中基因表达差异性以确定上述基因中的肝再生相关基因。结果初步证实上述基因中110个基因与肝再生相关。肝再生启动(PH后0.5~4h)、G0/G1过渡(PH后4~6h)、细胞增殖(PH后6~66h)、细胞分化和组织结构功能重建(PH后72~168h)等4个阶段起始表达的基因数为63、11、43和3,基因总表达的次数为63、43、101和80,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共表达上调488次,下调248次,分为6种表达方式,表明肝再生中细胞生理生化活动的多样性和复杂性。结论肝细胞生长和分化贯穿于整个肝再生中。     

肿瘤坏死因子-α（TNF-α）在肝再生中的作用

肝脏具有强大的再生能力,多种细胞因子和生长因子参与了肝再生过程的调控。其中肿瘤坏死因子-α（TNF-α）在肝细胞再生中都发挥着不可或缺的作用。本文就TNF-α在启动肝再生、促进或抑制肝细胞凋亡调控机制的研究进展作一综述。     

GADD45α对大鼠部分肝切除后肝脏再生的调控作用

目的探讨生长阻滞和DNA损伤诱导基因GADD45α在大鼠部分肝切除(PH)后肝再生中的作用及其调节机制。方法将114只大鼠随机分为19组,2/3肝切除9组,手术对照9组,正常对照1组,制作大鼠部分肝切除模型,然后用大鼠基因组芯片Rat Genome 230 2.0检测部分肝切除后再生肝的基因表达变化,采用实时定量PCR技术验证芯片检测结果。利用谱函数(Ep)分析基因表达变化预示的生理活动改变,进而通过Ingenuity Pathway Analysis(IPA)汇总GADD45α调控肝再生的信号通路并分析其可能的分子机制。结果 GADD45α在PH后2~6h、24h和36~72h均表达上调,GADD45α通过NF-κB、p38PRAK、p53、STAT3-p21、STAT3-Bcl-2、STAT3-c Myc等6条途径参与大鼠部分肝切除后的肝脏再生调控。谱函数分析发现,GADD45α调控的生理活动的变化情况基本与大鼠肝再生进程相符。结论 GADD45α在大鼠肝再生中可能通过上述信号通路调控细胞增殖、细胞周期和细胞存活等生理活动,进而调节肝脏的再生。     

Inhibition of Newcastle disease virus replication by 6-azauridine. II. Combination of 6-azauridine and adenine derivatives.

Twenty-five metabolites (purines, pyrimidines, nucleosides and nucleosides) were tested for their simultaneous action with 6-azauridine (AzUrd) in inhibition of Newcastle disease virus (NDV) replication. With the exception of deoxyadenosine and cyclic AMP all natural adenine derivatives exerted a synergic effect with AzUrd like ATP. Glutamine in combination with AzUrd did not inhibit NDV replication. The inhibitory effect of the combination of AzUrd and adenine derivatives was reversible by guanosine, uridine and cytidine but not by orotic acid or orotidylic acid.     

Red blood cell adenine nucleotides abnormalities in Down syndrome

The red blood cell adenine nucleotides of 20 Down Syndrome patients and 20 healthy controls were determined by a new high-performance liquid chromatography method. All patients showed increased concentrations of adenosine 5'-diphosphate (ADP) and adenosine 5'-monophosphate (AMP), while adenosine 5'-triphosphate (ATP), nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) and nicotinamide adenine dinucleotide phosphate (NADP+) were within normal ranges. This alternation of the energetic charge could be partly responsible for the impairment of glucose metabolism in these patients.     

细胞凋亡相关基因表达谱与大鼠再生肝的细胞凋亡关系

目的在基因转录水平探讨细胞凋亡相关途径对大鼠肝再生的作用。方法采用大鼠2/3部分肝切除(PH)方法,制备再生肝模型,同时设对照手术(假手术)。用查阅网站资料和相关论文等方法获得凋亡相关基因,用大鼠基因230 2.0芯片检测它们在大鼠再生肝中的表达情况,通过比较真、假手术中上述基因的表达差异性确定肝再生相关基因。结果细胞凋亡相关基因中,252个基因与肝再生相关。在肝再生启动(PH后0.5~4h)、G0/G1过渡(PH后4~6h)、细胞增殖(PH后6~66h)、细胞分化和结构功能重建期(PH后72~168h)等4个阶段起始表达的基因数为81、231、55和16,总表达的基因数为161、100、733和192,表明相关基因主要在肝再生启动阶段起始表达,在不同阶段发挥作用。它们共上调795次,下调291次,表明肝再生中大部分基因表达增强。它们的表达模式分为35种,表明肝再生中细胞凋亡相关基因的表达情况多样和复杂。结论15条细胞凋亡途径参与肝再生调控。     

Purine salvage by Tritrichomonas foetus

The anaerobic protozoon Tritrichomonas foetus was found incapable of de novo purine synthesis by its failure to incorporate radiolabeled glycine or formate into the nucleotide pool. It had, on the other hand, high activities in incorporating adenine, hypoxanthine or inosine. Radiolabel pulse-chase experiments indicated that adenine, hypoxanthine and inosine all entered the pool through conversion to IMP. The parasite contained hypoxanthine phosphoribosyl transferase, adenine deaminase and inosine phosphorylase, but no adenine phosphoribosyl transferase, inosine kinase or inosine phosphotransferase activity. Adenine and inosine had to be converted to hypoxanthine before incorporation. Adenosine was also rapidly converted to hypoxanthine in T. foetus cell-free extracts, but the presence of adenosine kinase in the parasite allowed some conversion of adenosine directly to AMP. Guanine and xanthine were directly incorporated into GMP and XMP, probably due to the guanine and xanthine phosphoribosyl transferase. There were also strong enzyme activities which convert guanosine to guanine and guanine to xanthine. A guanosine phosphotransferase was found in the 10(5) X g sedimentable fraction of T. foetus, and was capable of converting some guanosine to GMP. This network of T. foetus purine salvage suggests the importance of hypoxanthine-guanine-xanthine phosphoribosyl transferase activities in the parasite.     

亚低温对SIRS大鼠肝组织能量影响的实验探讨

目的通过测定亚低温情况下全身炎症反应综合征(SIRS)动物模型肝组织腺苷酸含量改变,对亚低温能否减轻SIRS动物模型损伤做初步探讨。方法24只Wistar大鼠均分为正常对照组(NC组,8)、内毒素组(LPS组,8)、亚低温组(MHT组,8),应用高效液相色谱法测定各组肝组织腺嘌呤核苷酸水平。结果内毒素组大鼠肝组织腺苷酸水平(ATP4.093±0.424,ADP1.331±0.136,AMP1.331±0.312μmol/g.wet)和亚低温组大鼠肝组织腺苷酸水平(ATP4.519±0.028,ADP1.483±0.108,AMP1.544±0.301μmol/g.wet)均较正常对照组腺苷酸水平(ATP4.990±0.455,ADP1.632±0.181,AMP1.737±0.407μmol/g.wet)降低,尤以内毒素组明显。亚低温组肝组织腺苷酸水平较内毒素组肝组织腺苷酸水平明显升高。结论亚低温可减缓SIRS大鼠肝组织能量障碍。