IL-23R基因多态性与吉林人群强直性脊柱炎易感性的关联研究

目的:探讨吉林人群IL-23R基因rs7517847和rs10489629位点的单核苷酸多态性与强直性脊柱炎易感性的关系。方法:采用PCR-RFLP方法对188例强直性脊柱炎患者进行IL-23R基因多态性检测,与100例健康者对照分析。结果:两个SNP位点(rs7517847和rs10489629)各基因型频率和等位基因频率在AS组与对照组之间的分布差异均有统计学意义(P0.05),并在假设遗传方式下,rs7517847位点的纯合突变GG基因型与(TG+TT)基因型比较;rs10489629位点的纯合突变AA基因型与(GA+GG)基因型比较,其频率分布差异在AS组与对照组之间也具有统计学意义(P0.05)。结论:IL-23R基因rs7517847和rs10489629位点的多态性均与吉林人群AS易感性有关;携带G等位基因(或A等位基因)且为GG(或AA)基因型的个体患AS的倾向性增大,可能是患AS的易感因素之一。     

RANTES基因-28C／G单核苷酸多态性与子宫内膜异位症遗传易感性的研究

目的探讨调节正常T细胞表达和分泌活性因子（regulated on activation, normal T cell expressed and secreted,RANTES）基因启动子区-28C／G单核苷酸的多态性与广东籍汉族患者子宫内膜异位症的关系。方法应用聚合酶链反应-限制性酶切片段长度多态性技术（PCR—RFLP）并进行基因测序的方法检测广东籍汉族子宫内膜异位症患者59例（内异症组）,非子宫内膜异位症患者49例（对照组）,比较分析各组间基因型频率和等位基因频率。结果RANTES基因启动子区-28C／C基因型在子宫内膜异症组及对照组分布频率分别为81．36％、81．63％,C／G基因型分布频率分别为18．64％、18．37％;两组间的基因型分布频率比较差异无显著性（P〉0．05）。RANTES基因启动子区-28位点C等位基因型在内异症组及对照组中的分布频率分别为90．68％、90．82％,G等位基因型分布频率分别为9．32％、9．18％,两组间等位基因型频率比较差异无统计学意义（P〉0．05）。结论在广东籍汉族妇女中,RANTES基因启动子区-28C／G单核苷酸多态性与子宫内膜异位症遗传易感性可能无关联。     

强直性脊柱炎与IL-23R基因多态性关联的Meta分析

探讨IL-23R基因多态性与中国人群强直性脊柱炎的相关性。系统检索PubMed、FMJS、CNKI及万方数据库有关IL-23R基因多态性与强直性脊柱炎相关的病例对照研究,应用ReveMan 5.2软件进行Meta分析。本研究共纳入IL-23R基因多态性与强直性脊柱炎相关文献9篇。Meta分析结果显示:IL-23Rrs1004819(OR=1.02,95%CI:0.90~1.14)、rs11209032(OR=0.91,95%CI:0.74~1.11)、rs1343151(OR=0.80,95%CI:0.59~1.08)和rs10889677(OR=0.95,95%CI:0.83~1.09)与强直性脊柱炎无显著关联,rs10489629(OR=0.78,95%CI:0.64~0.95)是强直性脊柱炎的保护性因素。可见部分IL-23R基因多态性与中国人群AS易感性无关联,需要进一步探索与中国人群AS易感性相关的其他基因位点。     

IL-4R、IL-13、ADAM33基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性研究

目的:探讨IL-4受体基因Arg551Gln(rs1801275)、IL-13基因Arg130Gln(rs20541)、ADAM33基因T1(rs2280091)位点基因多态性与中国皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例-对照的方法,用聚合酶链反应及直接基因测序法比较116例支气管哮喘组与70例正常人对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组和对照组IL-4受体基因Arg551Gln位点和IL-13基因Arg130Gln位点的基因型和等位基因型频率的差异有统计学意义,ADAM33基因T1位点基因型哮喘组和对照组差异有统计学意义,等位基因型频率在哮喘组和对照组差异无统计学意义。结论:提示IL-4R Arg551Gln(rs1801275)位和IL-13基因Arg130Gln(rs20541)位的多态性可能与中国皖南地区汉族哮喘有相关性;ADAM33基因(rs2280091)T1位点位的多态性可能与中国皖南地区汉族哮喘无相关性。     

西北地区汉族人群FCAMR基因单核苷酸多态性及单体型分析

为研究西北地区汉族人群IgAIg MFc高亲和力受体(Fc receptor IgAIg Mhigh affinity,FCAMR/Fcα/μR)基因单核苷酸多态性(SNP)及单体型的频率。我们采用聚合酶链反应后直接测序方法,对西北地区79(男45,女34)名没有亲缘关系的汉族健康个体FCAMR基因,T549C(rs1856746),A457G(rs3813952),G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个SNP位点进行基因分型。用SHEsis软件分析FCAMR基因的单体型频率。本研究发现西北地区汉族人群中T549C(rs1856746)位点,等位基因频率C是38.6%,T是61.4%;A457G(rs3813952)位点,等位基因频率G是5.7%,A是94.3%;G421A(rs1340232)位点,等位基因频率A是17.1%,G是82.9%,A298G(rs3813950)位点,等位基因频率G是4.4%,A是95.6%。西北地区汉族人群中FCAMR基因T549C(rs1856746)、A457G(rs3813952)、G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个位点构成的3种主要单体型率(频率>10%)T/A/G/A是60.5%,C/A/A/A是17.1%和C/A/G/A是16.7%。本研究分析了西北地区汉族人群FCAMR基因T549C(rs1856746)、A457G(rs3813952)、G421A(rs1340232)和A298G(rs3813950)4个SNP位点的基因型频率、等位基因频率和单体型频率,为研究该地区FCAMR基因单核苷酸多态性与免疫反应以及相关疾病如IgA肾病易感性之间的相关性提供研究基础。     

PTPN22 G788A和A10281188G与广东地区人群RA易感性的关系研究

目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型22（PTPN22）基因多态性（rs33996649/G788A/R263Q和rs1310182/A10281188G）与广东地区汉族人群类风湿性关节炎（RA）易感性间的关系。方法选取广东地区人群中218例RA患者以及229例健康对照者进行病例对照研究,采用PCR-RFLP技术检测PTPN22G788A和A10281188G两个多态性位点的基因型,计算比较两组基因型和等位基因频率。结果 RA患者和健康对照者PTPN22在788位点均为G等位基因,未检测到A等位基因,没有发现单核苷酸多态性的存在;10281188位点G等位基因在病例组和对照组中的频率分别为12.4%和13.3%（P〉0.05）。结论广东地区人群PTPN22788位点不存在多态性,G788A和A10281188G基因位点与广东汉族人群RA的发病无相关性。     

白介素-23受体基因多态性与乙肝相关肝细胞癌的易感性研究

目的:探讨白介素-23受体(IL-23R)基因多态性与广西壮族人群乙肝相关肝细胞癌(HCC)易感性的关系。方法:采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)对84例乙肝表面抗原(HBSAg)阳性HCC患者(病例组)和94例HbsAg阳性体检者(对照组)IL-23R基因rs10889677、rs1884444、rs114658173个位点的单核苷酸多态性进行检测及其部分标本进行直接测序鉴定。采用SHEsis软件构建IL-23R基因3个位点的单体型。Logistic回归分析IL-23R基因多态性和单体型与HCC遗传易感性的关系。结果:IL-23Rrs10889677、rs11465817位点的AA、AC、CC3种基因型和A、C两种等位基因在HCC组与对照组之间的分布差异无统计学意义(P>0.05)。rs1884444位点的TT、TG、GG三种基因型及T、G两种等位基因在病例组和对照组的频率分布差异均有统计学意义(P均<0.05),Logistic回归分析发现携带TG基因型的个体发生HCC的风险较携带TT基因型的个体增加(校正OR=2.20,95%CI=1.11～4.37)。单体型构建发现CGC、AGC、CTC、ATC、CGA、AGA、CTA、ATA等8种单倍体,病例组和对照组的AGC单倍体分布差异有统计学意义(P<0.05),AGC单倍体携带者发生HCC的风险明显增加(校正OR=2.71,95%CI=1.06～6.93)。结论:IL-23R基因rs1884444位点TG基因型可能是HCC发病的危险因子;乙肝背景下AGC单倍体携带者患HCC的风险增加2.71倍,可能是乙肝相关肝癌发病的危险因素。     

IL-10基因启动子多态性与皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性研究

目的:探讨IL-10基因启动子-1082G/A(rs1800896)、-819C/T(rs1800871)、-592C/A(rs1800872)位点多态性与安徽皖南地区汉族人群支气管哮喘的相关性。方法:采用病例-对照方法,用聚合酶链反应及直接基因测序法比较183例支气管哮喘组与151例正常人对照组之间基因型、等位基因频率的差异。结果:哮喘组IL-10基因启动子-1082G/A、-592C/A位点基因型与对照组相比有差异(P<0.05),其等位基因型频率在哮喘组和对照组间亦有差异(P<0.05)。而-819C/T位点基因型及等位基因型频率在哮喘组和对照组间均无差异(P>0.05)。结论:IL-10基因启动子rs1800896(-1082G/A)位点和rs1800872(-592C/A)位点的多态性可能与安徽皖南地区汉族哮喘相关;而rs1800871(-819C/T)位点的多态性可能与安徽皖南地区汉族哮喘无相关。     

中国大陆汉族人群强直性脊柱炎患者骨保护素基因多态性研究

目的：通过骨保护素（OPG）基因单核苷酸多态性（SNPs）位点的筛查,分析中国大陆汉族人群中OPG基因多态性与强直性脊柱炎（AS）易感性的相关性。方法：采集2008年1月至2012年1月在我院就诊的AS患者195例（AS组）及203例性别、年龄与之匹配的健康体检者（对照组）的外周血样本,并提取基因组DNA。所有样本采用TaqMan探针法对OPG基因SNP rs2073618、rs4355801位点进行基因型鉴定。比较AS组与对照组之间不同等位基因及基因型的分布差异,并分析其与AS易感性的相关性。结果：OPG基因SNP rs2073618、rs4355801位点的等位基因及基因型分布均符合Hardy—Weinberg平衡。AS组与对照组等位基因频率分别如下。rs2073618（G）：71．0％、71．9％,（C）：29．0％、28．1％;rs4355801（G）：27．7％、26．4％,（A）：72．3％、73．6％。两组在基因型频率的分布上显示,m2073618（CC）：9．2％、8．9％,（GC）：39．5％、38．4％,（GG）：51．3％、52．7％;rs4355801（AA）：52．3％、52．7％,（AG）：40．0％、41．9％,（GG）：7．7％、5．4％。以上数据组间比较差异均无统计学意义（P〉0．05）。经关联性分析,未发现AS发病的风险等位基因或基因型。结论：中国大陆汉族人群中OPG基因SNP rs2073618、rs4355801单核苷酸多态性与AS的易感性之间没有相关性。     

Association of interleukin 23 receptor gene with sarcoidosis

Interleukin 23 receptor (IL23R) gene has been reported as a genetic factor strongly associated with inflammatory bowel disease, psoriasis, and ankylosing spondylitis. We investigated the association between IL23R gene single nucleotide polymorphisms (SNPs) and susceptibility to sarcoidosis, including the clinical manifestation of uveitis. Ninety-one sarcoidosis subjects (58 with and 33 without uveitis) and 104 healthy controls were genotyped for eleven IL23R SNPs. DNA was amplified using specific PCR primers and genotyped by denaturing HPLC and/or direct DNA sequencing. Case-control frequency comparisons were analyzed using Chi square test. Three IL23R SNPs, rs7517847 (intron 6), rs11465804 (intron 8), and rs11209026 (exon 9, c.1142G>A, p.Arg381Gln) were associated with sarcoidosis in our population (p<0.05): rs7517847 showed increased frequencies in sarcoidosis compared to controls, but rs11465804 and rs11209026 were decreased. Two of these SNPs were associated with the uveitis subgroup compared to controls: rs11465804 (0.9% vs. 7.2%, OR=0.11, P=0.013) and rs11209026 (1.8% vs. 7.3%, OR=0.23, P=0.038). This finding indicates the association of IL23R polymorphism with sarcoidosis, especially with sarcoid uveitis. IL23R may be a common susceptibility gene shared by several autoimmune disorders including inflammatory bowel disease, psoriasis, and ankylosing spondylitis and sarcoid uveitis.     

白细胞介素-6基因多态性与再生障碍性贫血的相关研究

目的探讨白细胞介素-6（IL-6）基因启动子区域-174G/C基因多态性与中国北方汉族人再生障碍性贫血（AA）的相关性。方法应用顺序特异性引物和聚合酶链反应（PCR-SSP）技术,检测了36例AA患者（再障组）和40例健康献血者（对照组）中IL-6基因位点的多态性变化。结果结果表明IL-6基因-174G/C多态性位点基因型频率和等位基因频率在两组人群中的分布差异有统计学意义（χ2=6.31,P〈0.05）,G等位基因携带者患AA的风险是C等位基因的3.74倍（OR=3.7405）。两组之间比较差异有显著性意义,提示该等位基因频率增高与AA相关。结论IL-6基因-174G/C多态性与AA的发病具有相关性,其中G等位基因可能是我国北方汉族人AA发病的遗传易感基因,携带G等位基因的个体可能通过促进IL-6的高度表达进而增加AA的发病风险。     

PTPN11第3内含子基因多态性及H.pylori感染与广西柳州地区胃癌易感性研究

目的探讨蛋白酪氨酸磷酸酶非受体型11（PTPN11）基因多态性及幽门螺杆菌（H.pylori）感染与广西柳州地区胃癌易感性的相关性。方法通过PCR检测H.pylori的尿素酶B亚单位（UreB）基因和两步法聚合酶链反应（PCR-CTPP）对广西柳州地区238例胃癌患者及112例健康对照者的PTPN11基因第3内含子2460位点进行单链构象多态性分析（SNP）。结果胃癌组和对照组H.pylori（＋）者分别为142例（59.7%）和54例（48.2%）,H.pylori（-）者分别为96例（40.3%）和58例（51.8%）,H.pylori感染率在两组间差异有统计学意义（P〈0.05）。胃癌组和对照组PTPN11基因在该位点的基因型频率分布符合遗传平衡状态且差异无统计学意义（P〉0.05）,但两组间的等位基因分布差异有统计学意义（P〈0.05）。与G/G型相比,G/A型和A/A型不能减低胃癌的发病风险（G/A型：OR=0.642,95%CI：0.397～1.039;A/A型：OR=0.399,95%CI：0.097～1.641）;但将G/A型和A/A型合并后与G/G型相比,带有A基因的个体患胃癌的风险显著降低（OR=0.620,95%CI：0.388～0.992）。根据发病年龄、性别、吸烟史、饮酒史和H.pylori感染对胃癌的易感性进行的分层分析发现,PTPN11基因该位点SNP与胃癌的年龄、性别、吸烟史以及饮酒史无关,H.pylori阳性的A基因携带者相对于G/G型个体患胃癌的风险减少到0.52倍（OR=0.521,95%CI：0.274～0.990）。结论广西柳州地区PTPN11基因第3内含子2460位点A基因携带者能明显降低胃癌的发病风险,H.pylori感染与该位点G/G基因型之间存在交互作用。     

IL23R, NOD2/CARD15, ATG16L1 and PHOX2B polymorphisms in a group of patients with Crohn's disease and correlation with sub-phenotypes

Recent genomic research has identified interleukin-23 receptor (IL23R), nucleotide-binding oligomerization domain containing 2 caspase-activation recruitment domain?15 (NOD2/CARD15), autophagy related 16-like 1 (ATG16L1) and paired-like homeobox 2b (PHOX2B) as susceptibility loci for Crohn's Disease (CD). Our aim was to investigate these gene variants in a group of CD patients and to analyse the correlation to sub-phenotypes such as gender, smoking habits, disease behaviour at diagnosis, severity of disease and extra-intestinal manifestations. Nineteen patients with CD and 20 healthy controls were included in the study. The gene variants IL23R rs7517847 and rs11209026, NOD2/CARD15 rs2066845, PHOX2B rs16853571, ATG16L1 rs2241879 and rs2241880 were genotyped by PCR followed by sequencing. The frequency of the G risk allele of IL23R rs7517847 was found to be increased in patients with CD (42%) compared to that in control subjects (20%) [odds ratio (OR), 2.9; 95% confidence interval [CI], 1.06-7.9; P=0.03]. In addition, the homozygous condition GG was also associated with CD (OR, 8.70; 95% CI, 0.9-81.6; P=0.038). The analysis of correlation of genotype to sub-phenotypes showed an association of ATG16L1 rs2241879 with the lack of extra-intestinal manifestations (OR, 0.03; 95% CI, 0.002-0.45; P=0.006), and the patients defined as non-smokers displayed an increased frequency of the risk allele C (P=0.03). The present study confirms the association of the heterozygous and homozygous IL23R rs7517847 variant with CD and suggests an additive effect of smoking to the ATG16L1 rs2241879 C risk allele SNP, in the context of the multifactorial model established for the development of CD and a protective effect of the same allele against extra-intestinal manifestations.     

白细胞介素-4受体基因多态性与RSV毛细支气管炎相关性的病例对照研究

目的检测白细胞介素-4(IL-4)受体α链(IL-4Rα)I50V和Q576R基因多态性与呼吸道合胞病毒(RSV)毛细支气管炎的相关性。方法采用聚合酶链-限制性片段长度多态法检测130例RSV毛细支气管炎患儿和108例健康儿童IL-4Rα/I50V、Q576R基因多态性,应用化学发光法和酶联免疫吸附法检测血清总IgE和鼻咽分泌物(NPS)IL-4R水平。结果病例组II、IV和VV基因型频率为24.6%、51.5%和23.9%,对照组为27.8%、40.7%和31.5%,差异无统计学意义(χ2=2.960,P0.05);病例组I、V等位基因频率为50.4%、49.6%,对照组为48.1%、51.9%,差异无统计学意义(χ2=0.236,P0.05),II基因型NPS中IL-4R高于IV和VV基因型(Z=2.031,2.034,P0.05)。病例组QQ和QR基因型频率为72.3%、27.7%,对照组为64.8%、35.2%,差异无统计学意义(χ2=0.521,P0.05);病例组Q、R等位基因频率为86.2%、13.8%,对照组为82.4%、17.6%,差异无统计学意义(χ2=1.261,P0.05),R等位基因携带者NPSIL-4R高于Q等位基因携带者(Z=2.205,P0.05)。两个位点基因型间血清总IgE差异无统计学意义(F=1.021,t=0.452,P0.05);基因型频率与病情间亦无关联(χ2=0.322,1.393,P0.05)。结论 IL-4Rα/50II基因型及576R等位基因携带者与RSV毛细支气管炎NPSIL-4R水平增高相关。     

白细胞介素-10基因多态性与卵巢癌的相关性研究

目的探讨白细胞介素-10（IL-10）基因启动子区域-1082、-819和-592位点单核苷酸多态性与卵巢癌的关系。方法用序列特异性引物聚合酶链（PCR-SSP）技术,检测33例卵巢癌患者和90例正常对照组IL-10基因多态性。结果-819位点卵巢癌患者C/T基因型频率显著高于健康对照组（45.5%比21.0%,P〈0.05）,C/C和T/T基因型频率虽然低于对照组（分别为6.1%比20.0%和48.4%比59.0%）,但是差异无统计学意义（P〉0.05）;-592位点卵巢癌患者C/A基因型频率显著高于健康对照组（45.5%比21.0%,P〈0.05）,C/C和A/A基因型频率虽然低于对照组（分别为6.1%比20.0%和48.4%比59.0%）,但是差异无统计学意义（P〉0.05）;-1082位点基因型频率在卵巢癌患者和正常对照组间差异无统计学意义（P〉0.05）。-1082、-819、-592位点等位基因频率在卵巢癌患者和正常对照组间差异均无统计学意义。结论IL-10基因启动子区域-819C/T和-592C/A基因型可能与卵巢癌的发生有关。     

Variants of the IL23R Gene are Associated with Ankylosing Spondylitis but not with Sjögren Syndrome in Hungarian Population Samples

Recently, associations were found between several autoimmune diseases and functional variants of interleukin-23 receptor (IL23R) gene; here, we studied the possible association of nine polymorphisms of IL23R with ankylosing spondylitis (AS) and with Sjögren syndrome (SS). In our study, we genotyped groups of patients with AS ( n  = 206), SS ( n  = 156) and healthy controls ( n  = 235) for rs11805303, rs10889677, rs1004819, rs2201841, rs11209032, rs11209026, rs10489629, rs7517847 and rs7530511 variants using PCR-RFLP methods. We observed significant increase in the carriage of the T allele of rs11805303 and the A allele of rs1004189 in the AS group compared with the controls. For the rs10889677 variant, the prevalence of the AA genotype and for the rs2201841, the CC genotype showed a more than two-fold increase in the AS group compared with the controls. By contrast, the GA heterozygous genotype of rs11209026 variant showed a significant decrease in AS patients compared with controls. Haplotype analysis revealed association of four IL23R haplotypes with AS. There was no difference in the distribution of any of the examined IL23R variants between controls and SS patients. In conclusion, we confirmed the susceptibility or protective associations of IL23R polymorphisms with AS in a Hungarian population and first demonstrated the involvement of the rs11805303 intronic single nucleotide polymorphisms, which was tested so far only for other autoimmune diseases.     

中国桂西地区壮族人群白细胞介素-18基因rs360722G/A多态性研究

目的:了解白细胞介素-18(IL-18)基因单核苷酸多态性(SNP)各等位基因及基因型在中国桂西地区壮族人群中的分布频率,比较其在不同种族间分布的差异。方法:采用单碱基延伸的PCR技术和DNA测序法检测150例桂西地区壮族人群的IL-18基因rs360722G/A多态性,并与人类基因组计划(Hapmap)公布的四组人群(中国北京汉族人、非洲黑人、欧洲白种人和日本东京人)的SNP分型数据中该基因的基因型及等位基因的分布频率进行比较分析。结果:中国桂西地区壮族人群IL-18rs360722基因型GG、GA、AA频率分别为39.3%、48.7%和12.0%;等位基因G、A频率分别为63.7%和36.3%,男女性别间比较差异无统计学意义(P0.05);但与欧洲白种人、非洲黑人和北京汉族人群比较,其基因型和等位基因分布频率的差异均有统计学意义(P0.05)。结论:中国桂西地区壮族人群中存在的IL-18基因多态性差异可能是一些疾病的临床表现与其它地区或种族有所不同的原因之一。     

中山地区人群05L2基因C698T与妊娠期糖尿病相关性研究

目的研究促酰化蛋白（acylation-stimulating protein，ASP）的功能受体C5L2基因的SNP4位点C698T多态性与中山地区人群妊娠期糖尿病（GDM）的相关性。方法本研究采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性（PCR-RFLP）对来自2012年2013年中山博爱医院共285例孕妇检测C5L2基因多态性，评估其与GDM的相关性。其中GDM组I74例，血糖正常103例设为对照组。GDM组和对照组基因型分布运用logistic回归模型分析。GDM组相关表型运用多重回归模型分析。结果C5L2基因C698T杂合子基因型在GDM组和对照组的分布频率分别为0.6％和1.9％，差异不具有统计学意义（校正X2=0.213，P=0.6〉0.05）。基因型TT在GDM组和对照组均未发现。结论在中山地区人群中，C5L2基因C698T基因多态性与GDM的发生可能不具有相关性。