维吾尔族苯丙酮尿症R158Q突变基因杂合子报告

目的报道在新疆维吾尔族家系中检出的苯丙酮尿症(PKU)R158Q突变基因杂合子。方法采用PCR结合单链构象多态性(SSCP)分析技术和PCR产物直接测序方法确定PAH基因突变类型。结果分析患者及其父母PAH第7、6、11、3、12、5外显子基因,发现在外显子5中患者的SSCP电泳行为与正常对照不同而与父亲的电泳条带位置一致,测序结果显示,患者和父亲的PAH基因cDNA第473位发生了G→A点突变,为R158Q突变型杂合子。结论国内在维吾尔族中报道PKU R158Q突变基因杂合子尚属首次。     

新疆回族中苯丙酮尿症基因的突变鉴定

目的探讨新疆回族中苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因的突变特点。方法采用PCR产物直接测序的方法,测定7例回族苯丙酮尿症(PKU)患者PAH基因全部外显子及其启动子区域序列。结果在14个回族PAH等位基因中,共检出突变基因10个,包括错义突变5种、无义突变1种、剪切位点突变1种、缺失突变1种,其中的R243Q和R176X为种纯合子突变,这些突变分布于六个外显子,均系在回族中首次发现。检出的突变基因中包含2种新的突变基因类型,即R155H和A300S基因突变,通过查阅国内外文献、查询PAH专业网站及www.pahdb.mcgill.ca国际PAH数据库,证实是国内未见报道的新突变。结论新疆回族PKU患者中PAH基因突变具有明显的异质性特点,我们的研究丰富了PAH基因突变研究的内容,是我国PKU研究中民族资料的重要补充。     

127例PKU患者PAH基因第12外显子点突变及其频率研究

目的　了解中国人苯丙酮尿症 ( phenylketonuria,PKU)患者的苯丙氨酸羟化酶( phenylalanine hydroxylase,PAH)基因第 12外显子点突变种类和频率。方法　应用单链构象多态性( single strand conformation polymorphism,SSCP)、变性梯度凝胶电泳 ( denaturing gradient gelelectrophoresis,DGGE)、DNA测序分析了 12 7例 PKU患者的 PAH基因第 12外显子点突变种类及频率。结果　 DNA测序分析显示 10例患者存在 R4 13P、S4 11X、R4 0 8W、R4 0 8Q 4种杂合突变 ,其突变频率分别为 2 .76 %、0 .39%、0 .39%、0 .39% ,S4 11X突变为中国人中首次报道。 SSCP分析仅发现 2例 R4 13P杂合突变 ,DGGE分析显示 10例出现 3种类型的异常电泳带型。R4 13P突变在南北方人之间、在经典型 PKU和高苯丙氨酸血症之间的分布差异无显著性。结论　 DGGE对 PAH基因第 12外显子点突变检出率明显高于 SSCP。 DGGE结合 DNA测序是明确 PAH基因第 12外显子点突变种类和频率较好的方法。 R4 13P突变在南北方人中分布无明显差异     

西北五省区苯丙酮尿症患者苯丙氨酸羟化酶基因外显子12突变分析

目的研究分析西北五省区苯丙酮尿症患者苯丙氨酸羟化酶(PAH)基因外显子12的突变特征,为该地区苯丙酮尿症(PKU)的产前诊断和遗传咨询提供理论依据。方法应用PCR产物直接测序法对276例PKU患儿及其父母的PAH基因启动子、第1~13外显子及其旁侧内含子区域进行基因突变分析。结果⑴PAH基因外显子12中突变基因检出率为7.4,共检出8种PAH基因突变,其中,错义突变7种、无义突变1种,最常见的突变是R413P(4.0);⑵PAH基因外显子12突变检出率由高到低依次为宁夏(11.3)、陕西(9.7)、甘肃(5.2)、新疆(3.3)和青海(3.1),R413P突变在新疆、宁夏、陕西和甘肃四省区中突变检出率分别为2.5、5.3、5.6和5.2,Y414X(0.7)和L430P(2.7)仅在宁夏检出,R408W(1.0)仅在青海检出;⑶R413P是西北及等国内大多数地区PAH基因外显子12最为常见的突变,R413P突变在西北地区中的检出率低于山西、河南、河北、天津、沈阳、云南等大多数国内省区,日本R413P、中国台湾R408Q突变和挪威、瑞典、北爱尔兰及苏格兰的R408W突变的检出率显著高于西北地区。西北五省区检出的Y414X、Q419R和L430P三种突变在我国其它地区尚未见报道。结论⑴西北地区PAH基因外显子12突变以R413P为主,与韩国、日本相似,但不同于挪威、瑞典等欧洲国家以R408W为主。推测R413P突变基因频率的高处在日本,R408Q和R408W突变基因频率的高处分别在中国台湾、欧洲。⑵西北五省区PAH基因外显子12突变特点有别于中国其他地区和部分欧洲国家,表现出多民族聚居地区基因突变特有的多样性和复杂性。     

高分辨率熔解曲线分析技术检测苯丙酮尿症患者的苯丙氨酸羟化酶基因突变

目的 应用高分辨率熔解曲线（HRM）分析技术检测苯丙酮尿症患者苯丙氨酸羟化酶基因突变.方法 利用PCR扩增13例苯丙酮尿症（PKU）患者的苯丙氨酸羟化酶（PAH）基因第6、7、11及12外显子,然后对PCR产物进行HRM分析,通过DNA测序对HRM结果进行验证.结果 在13例PKU患者的26个PAH等位基因中共检测出5种不同突变基因,总检出率为38.5％.常见的突变类型是R243Q和A434D.检测出两种多态性位点为Q232Q和V245V.HRM分析结果与测序结果完全一致.结论 HRM技术具有简单、快速、易操作、准确等优点,可用于PKU患者PAH基因突变筛查.     

深圳地区苯丙酮尿症患儿苯丙氨酸羟化酶基因突变特征及分布情况研究

目的了解深圳地区苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)患儿苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因突变特征及分布情况,为该地区PKU产前诊断、治疗及干预措施的制定提供科学依据。方法收集2013年2月~2017年9月在深圳市光明新区人民医院产科分娩的新生儿经深圳市新生儿遗传性疾病筛查中心确诊为PKU患儿27例,采用聚合酶链反应(PCR)直接测序法对PKU患者PAH基因突变型进行检测,并对检测结果进行统计分析。结果 27例PKU患儿中检出2个基因突变类型的16例,占59.26%(16/27),其中3例为纯合子突变,明显高于1个基因突变类型的37.04%(10/27)和1例未检出基因突变类型的3.70%(1/27),差异有统计学意义(χ2=3.105~9.683,P0.05);27例PKU患儿54个PAH等位基因中共检出44个基因突变位点,检出率为81.48%(44/54),且此44个突变基因中共检出14种基因突变类型,包括错义突变7个,无义突变3个,剪接突变1个,同义突变1个,缺失突变2个,其中以R243Q,Y356X和R241C突变检出率最高,分别为20.37%,14.81%和12.96%,明显高于其它基因突变类型,差异有统计学意义(χ2=3.921~11.518,P0.05)。结论深圳地区PKU患儿PAH基因突变检出率比较高,且基因突变类型呈现多样化和复杂化,但未检出新的PAH基因突变类型,以R243Q,Y356X和R241C突变类型检出率最高。     

青岛地区29万例新生儿苯丙酮尿症筛查结果及患者PAH基因突变研究分析

目的分析青岛地区苯丙酮尿症的发病情况及遗传病因;并为患儿的诊疗及其父母的再生育提供遗传依据。方法利用茚三酮荧光法对293735新生儿进行血苯丙氨酸浓度检测;利用荧光PCR熔解曲线法,基因捕获配合高通量测序,Sanger测序技术以及多重连接探针扩增技术对40例儿科及成人患者的PAH基因进行检测分析。结果 1. 293 735例新生儿中,共发现并确诊31例患儿,发病率为1/10554;2.在40例PKU患者中,共发现PAH基因突变位点74个,其中包括错义突变,同义突变,无义突变,剪接突变,移码突变。突变主要集中在第1-3、6、7、9-12外显子及第4和12内含子上。常见突变有R243Q(15.0%),R53H(8.7%),Y356X(13.8%),R241C(6.3%),R111X(5.0%),V399V(3.8%),以及1个未曾报道过的突变位点。结论青岛地区苯丙酮尿症的发病情况接近于全国水平,PAH基因突变以错义突变为主,主要集中在7号外显子,R53H和Y356X出现频率高于国内其他地区;此外还发现1例未曾报道过的突变位点c.60+1GA。     

河南地区苯丙酮尿症患者苯丙氨酸羟化酶基因突变研究

目的 了解河南地区苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)患者苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase,PAH)基因突变情况,以便为苯丙酮尿症产前诊断和遗传咨询提供理论依据.方法 应用PCR产物直接测序对47例PKU患者及其父母PAH基因第1～13外显子及其两侧内含子进行序列分析.结果 在94条染色体中共检测到了83个PAH基因突变位点,检出率为88.3%(83/94),共发现了25种突变,其中突变E79fX13、H271R和D415Y国内外未见报道,突变VS10-14C＞G为国内首次报道.河南地区PKU患者的PAH基因突变集中在第6、7和11外显子,常见的7种突变是p.R243Q(20.5%)、EX6-96A＞G(12.0%)、p.Y356X(9.6%)、VS4-1G＞A(9.6%)、p.R111X(8.4%)、p.V399V(8.4%)、p.R413P(7.2%).结论 河南地区PKU患者PAH基因突变与中国其他地区相似,通过PAH基因直接测序可对大部分的PKU家系进行产前诊断.

Abstract：

Objective To study the characteristics of the phenylalanine hydroxylase gene (PAH)mutations in patients with phenylketonuria (PKU) in Henan province, in order to provide basic information for genetic counseling and prenatal diagnosis. Methods Mutations of the PAH gene were detected in exons 1-13 with flanking introns of PAH gene by PCR and DNA sequencing in 47 families with PKU. Results A total of 25 different mutations were detected in 83 out of 94 PAH alleles (88. 3%). Among them,E79fX13, H271R and D415Y have not been reported previously. It was the first time that IVS10-14C＞Gmutation was reported in Chinese PKU population. The mutations p. R243Q, EX6-96A＞G, p. Y356X,IVS4-1G＞A, p. R111X, p. V399V and p. R413P, were the prevalent mutations with relative frequencies of 20. 5 %, 12.0%, 9.6%, 9. 6%, 8. 4%, 8. 4% and 7.2% respectively. Conclusion The mutations of the PAH gene in patients with classical phenylketonuria in Henan province were similar to that in other areas of China. Prenatal gene diagnosis for PKU by PAH gene sequencing is efficient for most PKU families.     

经典型苯丙酮尿症基因全长外显子的突变检测和分析

目的探讨中国PKU患者PAH基因突变特征。方法运用PCR-SSCP及PCR-DNA直接测序检测40例经典型PKU患者和30例正常对照的PAH基因。结果在PAH基因上8个外显子共发现11种突变和3种多态,其中R243Q和Y204C为两个高频突变位点,突变率分别为27.5%和10%,280 insT、M276K、M276R、IVS10nt+32T→A、IVS4nt+46C→T、H290R是首次发现的新突变。结论中国PKU患者基因外显子突变是以两个突变热点和罕见突变并存为特征。     

苯丙氨酸羟化酶突变基因型与生化表型分析

目的 探讨苯丙酮尿症(phenylketonuria,PKU)患者苯丙氨酸羟化酶基因(phenylalanine hydroxylase,PAH)突变基因型与生化代谢表型的相关性.方法 用聚合酶链式反应-单链构象多态性、变性高效液相色谱分析和DNA测序法对102例治疗前血清苯丙氨酸(phenylalanine,Phe)高于120 μmol/L患儿基因组DNA进行PAH基因分析,观察突变基因型与生化代谢表型的相关性.结果 (1)生化代谢表型为经典型PKU(Phe>1200μmol/L)69例,中度PKU(Phe 600-1200 μmol/L)31例,轻度PKU(Phe400~600 μmol/L)2例.(2)共检出基因突变41种,基因型75种.(3)纯合突变基因型共9例(8.8%),含R111X/R111X基因型3例,IVS4-1G>A/IVS4-1G>A基因型1例,R243Q/R243Q基因型3例和V399V/V399V基因型2例.9例纯合突变中除1例RZ43Q/R243Q基因型患者的生化代谢表型属中度PKU外,其余8例生化代谢表型均属经典型苯丙酮尿症.(4)复合突变基因型共91 例(89.2%),生化代谢表型属经典型苯丙酮尿症的61例、中度PKU的29例和轻度PKU的1例.(5)复合突变基因型R111X/R243Q和EX6-96A>G(Y204C)/R243Q均可见于经典型苯丙酮尿症和中度PKU生化代谢表型;均属于无效突变等位基因的R111X/V399V基因型、EX6-96A>G/Y356X和EX6-96A>G/V399V生化代谢表型为中度PKU.含不同无效突变相同错义突变的R111X/A165D和R176X/A165D基因型分别表现为中度PKU和经典型苯丙酮尿症表型.结论 本研究中多数患者的突变基因型属复合突变.因突变等位基因的自由组合,使患者的基因型和生化表型之间关系复杂化.虽然大多数突变基因型与生化表型相关,但仍有个别与规律不一致的现象.因此,在PKU的遗传咨询中,依据患者的突变基因型分析评估预后要慎重.同样的基因型,患者表现出不同的生化代谢表型的现象,提示在苯丙氨酸的代谢过程中可能存在还没有被认识的其它影响因素.     

苯丙氨酸羟化酶基因的六种新型突变

目的　检测中国苯丙酮尿症 ( phenylketonuria ,PKU )患者苯丙氨酸羟化酶 (phenylalaninehy droxylase ,PAH)基因新的突变位点。 方法　应用聚合酶链反应 单链构象多态性及DNA直接测序检测 40例经典型PKU患者和 3 0名正常对照的PAH基因。结果　在PAH基因上共发现 11种突变和 3种多态 ,3 0名正常对照者PAH基因未发现异常。结论　经与国际PAH基因突变数据库比较 ,确认M 2 76K、M 2 76R、2 80insT、IVS10nt 3 2T→A、IVS4nt 4 7C→T是国际上首次发现的突变 ,H 2 90R是中国PKU患者基因上首次发现的新型突变。     

Molecular characterization of phenylketonuria in South Brazil

Phenylketonuria (PKU) is an autosomal recessive disorder due to phenylalanine hydroxylase (PAH) deficiency. The PAH gene, located at 12q22-q24.1, includes about 90kb and contains 13 exons. To date, more than 420 different alterations have been identified in the PAH gene. To determine the nature and frequency of PAH mutations in PKU patients from South Brazil, mutation analysis was performed on genomic DNA from 23 unrelated PKU patients. The 13 exons and flanking regions of the PAH gene were amplified by PCR and the amplicons were analyzed by single strand conformation polymorphism (SSCP). Amplicons that showed abnormal migration patterns were analyzed by restriction endonuclease digestion and/or sequencing. Twenty-two previously reported mutations were identified including R261X, R408W, IVS2nt5g-->c, R261Q, and V388M. Polymorphisms were observed in 48.8% of the PKU patients, the most frequent being IVS2nt19t-->c, V245V, and IVS12nt-35c-->t. In addition, two novel sequence variants were identified: 1378g-->t in the 3(')-untranslated region in exon 13 which may be disease-causing and an intron 12 polymorphism, IVS12nt-15t-->c. The mutation spectrum in the patients from Southern Brazil differed from that observed in patients from other Latin American countries and further defined the molecular heterogeneity of this disease.     

中国北方地区苯丙氨酸羟化酶基因的突变构成

目的了解中国人苯丙氨酸羟化酶（phenylalanine hydroxylase,PAH）基因的突变构成。方法应用PCR单链构象多态结合序列分析检测230例苯丙酮尿症患儿PAH基因全部外显子及其两侧内含子。结果（1）在460个PAH等位基因中检测出75种不同的突变基因,总检测率达94.6%（435/460）,其中3种突变基因（S251-R252〉SfsX89、Y387D和A389G）尚未见到报道。常见的突变基因为：R243Q（21.7%）、EX6-96A〉G（10.2%）、R111X（8.3%）、R413P（6.5%）和Y356X（6.1%）。较常见的突变基因为：V399V（4.1%）、IVS4-1G〉A（3.5%）、IVS7＋2T〉A（2.2%）和R241C（2.2%）。大部分突变集中在第3、5、6、7、11和12外显子及其两侧内含子区域。（2）检测出10种多态性位点,突变率高的4个位点IVS3-22C〉T（56.7%）、IVS10＋97G〉A（75.9%）、Q232Q（89.0%）和V245V（81.9%）,提示PAH基因cDNA序列存在人种差异。结论中国人PAH基因的突变构成与欧洲人群完全不同,与亚洲其它人群有频率的差异。     

Mutation spectrum of phenylketonuria in Iranian population

Identification of molecular basis of phenylketonuria (PKU) in Iran has been accomplished through the analysis of 248 unrelated chromosomes from 124 Iranian classic PKU subjects. Phenylalanine hydroxylase (PAH) gene mutations were analyzed through a combined approach in which p.S67P, p.R252W, p.R261Q, p.R261X, p.L333F, IVS10-11G>A, IVS11+1G>C, p.L364del, p.R408Q and p.R408W mutations were first screened by PCR of PAH gene exons 3, 7, 10, 11 and 12, followed by digestion with the appropriate digestion enzymes. Subsequently SSCP analysis for exons 2, 6, 7 and 11 of the PAH gene and finally, sequencing of 13 PAH gene exons have been used to study uncharacterized PKU chromosomes. 26 different mutations were found. The predominant mutation in this population sample was IVS10-11G>A, with a frequency of 24.6%. Nine mutations (IVS10-11G>A, p.R261Q, p.P281L, IVS11+1G>C, p.K363>NFS, p.R243X, IVS2+5G>C, p.R261X and p.R252W) represent almost 84% of all PKU chromosomes studied. IVS10-11G>A mutation is the major PKU-causing mutation throughout the Mediterranean region. The finding of the high prevalence of this mutation in Iranian population is consistent with the historical and geographical links between Iranian and Mediterranean populations.     

经典型苯丙酮尿症苯丙氨酸羟化酶基因的新突变鉴定

目的研究经典型苯丙酮尿症(phenylketonuria, PKU)基因突变.方法应用聚合酶链反应,单链构象多态分析和DNA直接测序等技术,对内蒙古地区32个PKU家系苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase, PAH)基因第3～12外显子进行了鉴定分析. 结果检出14种PAH基因点突变R243Q (12/64)、Y356X(6/64)、Y204C(5/64)、R261Q(2/64)、Y161S(2/64)、R252Q(1/64)、R111X(2/64)、D282G(1/64)、S303P(1/64)、G239D(1/64)、R413P(1/64)、IVS7nt+2(2/64)、IVS4nt+3(1/64)、IVS9nt+34(2/64),经检索国际PAH基因突变数据统计库(截至到2004年7月),确认IVS4nt+3(G>C)、IVS9nt+34(G>A)为国际首次发现的新突变,S303P(T>C) 、D282G(A>G)为国内首次报道的新突变.结论内蒙古人群苯丙氨酸羟化酶基因存在突变的多样性,R243Q、Y356X、Y204C是PAH基因的突变热点.     

The molecular basis of phenylketonuria in Latvia

Characterization of the molecular basis of phenylketonuria (PKU) in Latvia has been accomplished through the analysis of 96 unrelated chromosomes from 50 Latvian PKU patients. Phenylalanine hydroxylase (PAH) gene mutations have been analyzed through a combined approach in which R158Q, R252W, R261Q, G272X, IVS10-11G>A and R408W mutations were first screened for by PCR or restriction generating PCR amplification of PAH gene exons 5, 7, 11 and 12 followed by digestion with the appropriate diagnostic enzyme. Subsequently 'broad range' denaturing gradient gel electrophoresis analysis of the 13 PAH gene exons has been used to study uncharacterized PKU chromosomes. A mutation detection rate of 98% was achieved. 12 different mutations were found, with the most frequent mutation, R408W, accounting for 76% of Latvian PKU alleles. Six mutations (R408W, E280K, R158Q, A104D, R261Q and P281L) represent 92% of PKU chromosomes. PAH VNTR and STR alleles have been also identified and minihaplotype associations with PKU mutations were also determined.     

天津及周边地区苯丙氨酸羟化酶基因突变谱和新突变分析

目的 分析天津地区人苯丙氨酸羟化酶(phenylalanine hydroxylase gene,PAH)基因突变谱,明确本地区该基因突变类型和特点,为遗传咨询和产前基因诊断提供科学依据.方法 用聚合酶链反应-单链构象多态、变性高效液相色谱法和DNA测序法对天津及河北等地99例已确诊各种类型苯丙酮尿症患儿基因组DNA进行PAH全基因13个外显子分析.结果 全基因共检出41种突变,含错义突变22种、无义突变7种、剪接位点突变9种和缺失突变3种.其中新突变6种(IVS3nt+1g→a、A165D、Q301X、G344D、P362L和R413G).198个PAH等位基因突变总检出率为93.94%.结论 天津及周边地区PAH基因突变谱广、遗传异质性高,一些常见突变的发生频率与以往报道的地域分布略不同.