噬菌体表面表达人干扰素αlc/86D

目的为今后干扰素αｌｃ／８６Ｄ突变体文库的建立和筛选高活性的新型干扰素分子打下基础。方法利用ｐｈａｇｅｄｉｓｐｌａｙ技术表达人ＩＦＮαｌｃ／８６Ｄ基因。结果酶联免疫吸附试验、点杂交和Ｗｅｓｔｅｒｎｂｌｏｔ均证明重组噬菌体颗粒具有干扰素的免疫反应性，生物学活性测定表明，当重组噬菌体为５×１０１０ＴＵ时，与４ＩＵ的重组ＩＦＮαｌｂ活性相当。结论人ＩＦＮαｌｃ／８６Ｄ在噬菌体表面能正确折叠和功能性表达。     

抗D二聚体的人源性噬菌体抗体库的构建

目的：应用噬菌体展示技术构建人源性抗D二聚体噬菌体抗体抗体组合文库。 方法： 从不同人群外周血淋巴细胞中提取总RNA，经反转录后，以免疫球蛋白信号肽序列引物和家族特异性免疫球蛋白可变区基因引物,进行半套式PCR扩增人全套抗体基因片段，并克隆于pComb3H载体，电转化大肠杆菌XL1-Blu，在辅助噬菌体的超感染下，构建噬菌体抗体组合文库。 结果： 采用不同的引物进行重链、轻链Kappa和Lambda链的半套式PCR扩增，均能获得相应大小的PCR产物，其结果扩增率达到100％。经4次电转化构建了库容为2.8×108的抗体库,轻、重链基因的重组率为46％，经辅助噬菌体的超感染，得到噬菌体滴度为4.1×1017PFU /L的人源性噬菌体抗体库。 结论： 成功构建了含抗D二聚体的人源性噬菌体抗体库，为进一步筛选抗D二聚体的Fab噬菌体抗体奠定了基础。     

人源性抗汉坦病毒抗体VH基因噬菌体表面展示文库的构建与筛选

目的 构建人抗汉坦病毒（HV）抗体重链可变区（VH）基因噬菌体表面展示文库,筛选人源性抗HV单克隆抗体（mAb）。方法 从HV吸附筛选的特异性人外周血B淋巴细胞中,用RT－PCR扩增VH基因,与噬菌粒pHEN1连接,构建VH基因噬菌体表面展示文库。经3轮吸附－洗脱－扩增的亲和筛选后,用ELISA鉴定抗HV噬菌体抗体的活性。结果 HV吸附筛选的特异性人外周血B淋巴细胞中,成功扩增出VH基因,并构建了VH基因噬菌体表面展示文库。经3轮亲和筛选,获得24个具有与HV结合活性的重组噬菌粒克隆。对其中一个克隆的VH基因（VH－D10）的序列分析表明,该基因的全长为363bp,编码121个氨基酸,与EMBL和GenBank中所有已知免疫球蛋白（Ig）基因进行同源性比较,其同源序列均人为IgVH原因。结论 成功地构建了人抗HV抗体VH基因噬菌体表面展示文库,并筛选到有HV结合活性的重组噬菌体克隆,为制备人源性抗HVmAb奠定了基础。     

应用噬菌体随机肽库技术研究干扰素-α2b抗原表位

目的应用噬菌体随机肽库技术，研究干扰素-α2b高抗原性表位。方法利用结合有干扰素-α2b多克隆抗体的免疫磁性微球，对噬菌体随机肽库进行生物淘筛，以ELISA方法鉴定阳性克隆。阳性克隆测序后与干扰素氨基酸序列进行了同源性分析，研究干扰素-α2b分子中高抗原性表位。结果经4轮淘筛后噬菌体克隆的阳性率为57．6％，据随机挑选的12个阳性克隆的同源性分析结果将其分为3组，分别对应干扰素-α2b 3个高抗原性表位与预测的结果吻合，其中第2组与干扰素受体结合区AB环接近。结论利用噬菌体随机肽库技术，成功筛选出3个与抗原性预测相符合的干扰素-α2b抗原表位，为研究干扰素分子的作用机理、制备抗特定表位的单克隆抗体以及设计和开发干扰素的小分子模拟肽奠定了基础。     

天然人源IgG Fab噬菌体抗体库的构建及多样性分析

目的:构建天然人源IgGFab噬菌体抗体库并分析来源于健康人外周血B淋巴细胞的抗体基因可变区的多样性及优势选择。方法:以DNA重组技术从300名健康志愿者的外周血淋巴细胞中扩增出全套人抗体轻链及重链Fd基因,分别插入噬菌体载体pFabICN相应位置,构建天然人源免疫球蛋白G基因文库;进一步从抗体库中随机挑选克隆,获得重轻链基因进行核苷酸序列测定并利用IgBLAST数据库分析抗体基因可变区的同源家族。结果:从4×108库容的天然人源IgGFab噬菌体抗体库中随机挑选克隆,对其中32个轻链及重链Fd基因插入正确的克隆进行核苷酸序列测定和氨基酸序列的推算,获得29条彼此完全不同的Fd重链基因及轻链基因。以IgBLAST数据库比对分析显示29条重链基因的V区分别属于VH3(72.4%),VH1(10.3%),VH4(6.9%),VH5(6.9%)和VH7(3.4%)基因家族。29条轻链基因分别属于Vκ1(44.8%),Vκ2(15.4%),Vκ3(11.5%),Vκ4(23.1%)基因家族和Vλ1(11.5%)基因家族。结论:以300份健康人外周血淋巴细胞的抗体基因构建的天然人源IgGFab噬菌体抗体库基因多样性良好,重链VH3基因家族存在优势表达。     

噬菌体抗体库技术研究进展

噬菌体抗体组合文库技术作为噬菌体展示和抗体组合文库两种技术的集成，自１９９０ 年建立以来，经过不断发展，目前被广泛用于生物医学的许多领域。本文主要就近年来该技术在抗体基因扩增、载体构建、筛选方法和亲和力成熟等方面的进展进行综述。     

构建预设CDR3基因噬菌体抗体库筛选抗人整合素ανβ3 mAb的人源化Fab

目的:构建预设CDR3基因的噬菌体抗体库,通过抗原表位导向选择方法筛选抗人整合素ανβ3单克隆抗体(mAb)人源化Fab。方法:将鼠mAbLCDR3重组到人轻链可变区文库中并与人/鼠嵌合重链Fd基因配对构建杂合噬菌体抗体库,用固相人整合素ανβ3抗原筛选人源化轻链基因。再用所获人轻链基因与移植有鼠mAbHCDR3的人重链Fd基因配对构建人源噬菌体抗体库,筛选人源化Fab。结果:分别构建了库容为2.1×106和2×107的杂合噬菌体抗体库和人源噬菌体抗体库,筛选到3株人源Fab克隆。经间接ELISA及竞争抑制ELISA证实,能特异结合整合素ανβ3抗原,其中人源D5株Fab克隆的基因序列表明,人轻链可变区基因属VKIII亚群,人重链可变区基因属VH1亚群。结论:利用噬菌体抗体库技术,成功地进行了鼠抗人整合素ανβ3mAbE10人源化的改造,为进一步临床应用奠定了基础。     

噬菌体展示抗体微型文库的构建

用噬菌体展示技术构建抗神经钙粘连素（N-cadherin，N-cad）分子胞外结构域、CD34分子胞外结构域及AC133分子的噬菌体展示单链抗体库。将3种分子分别表达于噬菌体表面，再以此噬菌体免疫BALB／c小鼠，提取脾总RNA，RT—PCR扩增抗体重、轻链基因cDNA并插入噬菌体表达载体，构建分别抗N-cad分子胞外结构域、CD34分子胞外结构域及AC133分子的噬菌体表达文库。然后对文库的库容量、多样性、滴度及表达能力进行鉴定。结果显示，用噬菌体展示的3种分子免疫小鼠获得成功，所构建抗体文库的库容量、多样性、滴度及表达能力均能满足进一步筛选目的抗体基因的需要，为制备相应的特异性抗体奠定了基础。     

EBV转化B型健康人B淋巴细胞构建噬菌体抗体库

目的构建人源抗红细胞A抗原单链噬菌体抗体库。方法应用EB病毒转化方法和噬菌体抗体库技术,从EB病毒转化成功的B型个体淋巴细胞中提取总RNA,逆转录合成cDNA第一条链,PCR分别扩增VH和Vκ基因,经重叠延伸拼接法(SOE)组成ScFv基因并将其克隆入pCANTAB5E,转化E.coliTG1,加入辅助噬菌体M13KO7援救,构建人源抗红细胞A抗原单链噬菌体抗体库,并测定文库的库容、滴度及ScFv基因的插入率。使用完整A型红细胞对该库进行4轮“吸附-洗脱-扩增”的筛选,细胞ELISA、红细胞血凝实验对所获抗体进行初步鉴定。结果所构建的噬菌体抗体库,其库容为1.2×106,噬菌体DNA中全长ScFv基因的插入率为0.90,用辅助噬菌体援救后,得到滴度为2.52×1010PFU/mL的初级噬菌体抗体库。以完整A型红细胞进行四轮淘筛,出现特异性富集。经细胞ELISA、红细胞血凝实验鉴定,得到2株与A型红细胞特异结合的ScFv噬菌体抗体。结论EB病毒转化方法联合噬菌体展示技术构建噬菌体抗体库切实可行,可进行亲和筛选以得到人源抗红细胞A抗原的基因工程抗体。     

人源性天然噬菌体展示文库的构建及鉴定

目的:构建人源性天然噬菌体展示文库并对文库进行鉴定。方法:从未经主动免疫健康志愿者的外周血淋巴细胞中提取总RNA,反转录合成cDNA,用直接PCR及半巢式PCR扩增人抗体重链(VH)及轻链(Vκ和Vλ)可变区基因。采用改进的重叠延伸PCR法将VH基因和VL(Vκ和Vλ)基因连接成人单链抗体(scFv)基因,并将scFv文库基因克隆到噬菌体载体pCANTAB-5E中,电转化E.coliTG1,构建单链抗体文库。结果:采用直接PCR和半巢式PCR扩增得到42条VH基因片段,16条Vκ基因片段,18条Vλ基因片段。混合的VH和VL等摩尔比连接后,产生的单链抗体文库基因大小为750bp左右;转化后构建了文库容量为1.35×108的单链抗体文库。BstNⅠ酶切分析文库中的单链抗体基因结果显示,酶切得到的scFv指纹图谱均不相同。结论:构建的抗体文库多样性好,可用于多种人源性单链抗体的筛选。     

人源性噬菌体抗体库的构建及抗amylin抗体的初步筛选

目的:构建人源性噬菌体抗体库,从中筛选胰淀素(amylin)单克隆抗体(mAb),测定其特异性及抗原结合活性。方法:从正常健康人的外周血淋巴细胞中提取总RNA,用RT-PCR方法扩增人免疫球蛋白Fd段和轻链基因,构建噬菌体抗体库。酶切和PCR鉴定后,阳性克隆进行DNA测序分析。用人amylin抗原对抗体库进行筛选富集,将得到的阳性克隆进行Phage-ELISA鉴定,结果进行统计学分析。结果:最终构建的抗体库库容约为0.8×108,酶切鉴定显示有插入片段,抗体库重组率为70%。阳性克隆进行DNA测序证实所获基因为人免疫球蛋白可变区基因。以amylin抗原进行3轮筛选,抗体库得到特异性富集。阳性克隆进行Phage-ELISA检测证实有良好的抗胰淀素抗原的特异性。结论:成功构建了一个人源性噬菌体抗体库,为从中获得人源抗amylin的mAb奠定了实验基础。     

cDNA cloning and assignment to chromosome 21 ofIFI-78K gene,the human equivalent of murineMx gene

Recently we have purified to homogeneity and characterized an interferon-induced human protein (p78 protein) which is the equivalent of the interferon-induced murine Mx protein responsible for a specific antiviral state against influenza virus infection. A cDNA library was constructed using mRNAs from interferon-induced human diploid fibroblasts. cDNA clones coding for the human p78 protein were identified and used to determine the chromosomal location of the corresponding gene (termedIFI-78K gene) by hybridization to DNA from a panel of human x rodent somatic cell hybrids. The newly identified gene is located on chromosome 21. This has been confirmed by the observation of a gene dosage effect using chromosome 21 trisomic cells (fibroblasts derived from Down's syndrome patients). Among all interferon-inducible genes mapped so far, theIFI-78K gene is the only one located on chromosome 21, together with the gene for the receptor of type I interferon. Our results also provide further evidence for homology between human chromosome 21 and mouse chromosome 16, since the gene encoding the mouse Mx protein (the presumed mouse homolog protein of human p78 protein) has been assigned to chromosome 16.     

抗PSMA全人源单链抗体制备、鉴定及初步应用

目的 构建抗PSMA全人源单链抗体库,筛选抗PSMA人源单链抗体(ScFv)并鉴定,应用人源ScFv进行分子显像.方法 从健康人外周血淋巴细胞中提取总RNA,用RT-PCR方法扩增人轻链和重链可变区基因,重叠PCR拼接轻重链可变区基因,构建ScFv的表达载体pDF-ScFv,电转染大肠杆菌XL1 Blue,获得噬菌体单链抗体库,酶切鉴定及测序分析,用PSMA抗原进行富集筛选,阳性克隆用Western-Blot 和DNA指纹图谱鉴定.应用直接标记法将125I标记在ScFv上,通过尾静脉注入前列腺癌动物模型体内,2h后进行小动物SPECT/CT显像,观察人源ScFv对前列腺癌的定位性能.结果 成功构建抗PSMA全人源单链抗体库,库容约2.16×108,插入片段经酶切及DNA测序证实为人抗体轻链和重链可变区基因.筛选出6株ScFv阳性克隆,Western-Blot证实6株ScFv均能与PSMA抗原特异性结合,DNA指纹图谱鉴定6株ScFv可变区基因具有多样性.动物模型的分子显像:人源ScFv能与前列腺癌PSMA抗原特异性结合,并使肿瘤显像.结论 成功构建了一个全人源噬菌体单链抗体库,并筛选出了抗PSMA单链抗体,单链抗体在动物模型体内能靶向结合前列腺癌细胞,从而为前列腺癌的靶向诊断和治疗奠定了基础.     

抗人肺癌单链抗体噬菌体库的构建及特异性单链抗体的鉴定

目的 构建人源噬菌体抗体库,并从中筛选出抗肺癌人源单链抗体。方法 提取肺癌患者癌旁淋巴结组织,通过RT-PCR扩增出重链可变区基因（VH）和轻链可变区基因（VL）,再经剪切-重叠-延伸PCR(SOE-PCR)将VH 和VL连接得到单链抗体（ScFv）。将双酶切后的ScFv基因片段克隆入噬菌体表达载体pCANTAB5E,得到初级噬菌体抗体库。以肺腺癌细胞株A549为抗原对抗体库进行4轮筛选富集,鉴定抗体库性能。将得到的阳性克隆用IPTG诱导表达并进行检测。结果 成功构建噬菌体单链抗体库。经筛选富集,噬菌体收获率得到增加,第4轮是第1轮的115倍。随机选取10个克隆,通过ELISA法检测到其中7个与A549细胞呈阳性反应,阳性率为70%。SDS-PAGE及ELISA检测证实得到人源抗肺癌单链抗体。结论 成功构建人源单链抗体噬菌体库,从中获得具有较高特异性的抗人肺癌单链抗体。     

Construction of a GBS-GAS DNA subtraction library allows discovery of previously unidentified GBS genes and rapid location of unique regions on the GBS chromosome

A subtraction library of group B streptococcus (GBS) strain O9OR with GAS chromosomal DNA (strain SF370) was constructed and more than 100 plasmid clones sequenced. DNA sequences of the plasmid inserts were analyzed using the BLAST gene search. Most inserts had little or no homology to GAS chromosomal DNA and 26 clones from the library had no gene homologues in the gene bank. The majority of genes discovered represented house keeping GBS genes, but several could be considered as possible virulence factors. Inserts from 21 clones were labeled and used as probes for hybridization with GBS DNA fragments separated by pulsed field electrophoresis. A genetic map of GBS strain O9OR was constructed.     

Cloning the ends of size selected Sfi I fragments

As an initial step in the physical mapping of the fragile X region a library of Sfi I ends was constructed from the size class of human Sfi I DNA fragments, which includes the fragment with the locus DXS105. Since Sfi I recognizes the sequence GGCCNNNNNGGCC and leaves a 3 base indeterminate "sticky" end, we used a mixture of 64 synthetic deoxynucleotide oligomers to modify these ends for cloning. The oligomers were of the general form AATTNNN. Ligation of these heptamers to the indeterminate Sfi I ends converted them to the EcoR I sticky end. A suppressor tRNA gene was ligated onto this end as a selectable marker and the DNA was cloned in the lambda phage vector Charon 21A. Analysis showed that clones selected for the presence of the tRNA gene contained Sfi I ends. Because this library was constructed from a specific size class of fragments, it was very reduced in complexity. This will simplify the process of identifying the clone which contains the end of the DXS105 fragment. The use of this strategy for chromosome "jumping" is discussed.     

抗血管性血友病因子A1区单链抗体噬菌体展示文库的构建和筛选

为构建抗人vWF-A1的全套单链抗体噬菌体表面展示文库,从中筛选与vWF-Al高亲合力的单链抗体,为其临床应用奠定基础。从vWF-A1免疫小鼠的脾淋巴细胞中提取总RNA,纯化mRNA并反转录成cDNA后,用抗体可变区混合引物扩增全套轻、重链可变区基因,经重叠延伸反应,在体外装配成单链抗体(scFv),将其克隆至噬菌体载体pHENl中,构建单链抗体噬菌体抗体库。对抗体库进行亲合筛选后,ELISA法鉴定抗vWF-A1单链抗体。结果经过5轮“吸附-洗脱-扩增”的富集过程,phage-ELISA筛选到与vwF-A1有高亲和力的克隆。序列测定符合抗体可变区结构特点。成功构建了全套抗vWF-A1单链抗体噬菌体展示文库,并筛选出具有结合vWF-A1功能的单链抗体。     

抗P选择素免疫小鼠单链抗体噬菌体展示文库的构建和筛选

目的 构建抗P－选择素的全套单链抗体噬菌体表面展示文库，从中筛选与P－选择素高亲合力的单链抗体，为其临床应用奠定基础。方法 从P－选择素免疫的小鼠脾淋巴细胞中提取总RNA，反转录成cDNA后，用抗体可变区混合引物扩增全套轻、重链可变区基因，经重叠延伸反应，装配成单链抗体（ScFv)基因，将其克隆到噬菌体载体pHEN1中，构建单链抗体噬菌体抗体库。对抗体库进行亲合筛选后，ELISA法鉴定抗活化血小板单链抗体。结果 经过5轮“吸附－洗脱－扩增”的富集过程，phage-ELISA得到一个ELISA活性较高的与P－选择素结合的克隆。序列测定符合抗体可变区结构特点。结论 成功构建了全套抗P－选择素单链抗体噬菌体展示文库，并筛选得到具有P－选择素结合能力的单链抗体基因。     

多样性人源天然噬菌体抗体库的构建及初步应用

目的:构建多样性良好的人源天然噬菌体抗体库。方法:从正常人外周血中分离淋巴细胞,以RT-PCR和半巢式PCR扩增重链可变区VH基因和轻链可变区VL基因,以重叠延伸PCR将VH、VL组装成scFv基因,并将其克隆入噬菌粒载体pCANTAB-5E中。以pCANTAB-5E电转化大肠杆菌TG1,构建人源天然噬菌体抗体库,测序分析抗体基因的家族信息和多样性,并用多种抗原对其进行筛选。结果:获得了库容为2×108的人源天然噬菌体抗体库。分别用5种抗原对其进行筛选,均可获得特异性噬菌体抗体的富集。结论:成功地构建了一个多样性良好的人源天然噬菌体抗体库,可用于制备具有应用前景的人源抗体。