1p13.3 rs599839单核苷酸多态性与早发冠状动脉粥样硬化性心脏病的关联研究

目的 探讨中国汉族人群染色体1p13.3 rs599839基因多态性与早发冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称早发冠心病)的相关性.方法 用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术分析303例经冠状动脉冠脉造影确诊的早发冠心病患者rs599839基因多态性,以同期冠脉造影阴性、排除冠心病诊断的312名受试者为财照组,比较两组间rs599839基因多态性频率分布差异.结果 早发冠心病组与对照组中均检出AA、AG基因型,GG基因型末检出.G等佗基因频率在早发冠心病组和对照组中分别为5.0%、9.1%,差异有统计学意义(P=0.004),使用Logistic回归分析排除吸烟、高血压、糖尿病等因素的影响后,两组G等位基因频率差异仍有统计学意义(P＜0.05).两组中G等位幕因携带者(AG型)低密度脂蛋白胆固醇(low density lipoprotein-cholesterol,LDL-C)水平均低于AA纯合子.结论 中国汉族人群染色体1p13.3 rs599839基因多态性可能与早发冠心病发病相关;rs599839基因多态性可能与血清LDL-C浓度差异相关;rs599839基因多态性与冠脉狭窄程度无关.     

广西壮族及汉族人群CD40配体基因rs3092923G/A和rs3092929A/C遗传多态性的研究

目的探讨CD40配体基因rs3092923G/A和rs3092929A/C多态性位点在广西壮族及汉族人群中的分布,同时比较其基因型及等位基因频率分布在不同种族人群之间以及同一种族不同性别之间存在的差异。方法采用单碱基延伸PCR的检测方法,分析201名广西汉族人和199名广西壮族人的CD40配体基因rs3092923G/A和rs3092929A/C多态性。结果在广西壮族人群中,CD40配体基因rs3092923G/A位点AA、AG与GG基因型频率和rs3092929A/C位点AA、AC与CC基因型频率均为86.4%、7.5%和6.0%,rs3092923G/A位点的A、G等位基因频率和rs3092929A/C位点的A、C等位基因频率均为90.2%、9.8%;在广西汉族人群中,CD40配体基因rs3092923G/A位点AA、AG与GG基因型频率和rs3092929A/C位点AA、AC与CC基因型频率均为93.0%、4.0%、3.0%,rs3092923G/A位点的A、G等位基因频率和rs3092929A/C位点的A、C等位基因频率均为95.0%、5.0%。将这2个多态性位点基因型分布频率在2个民族人群中比较,差异均无显著性(P均>0.05),而等位基因频率却有着显著性差异(P均<0.05)。另外,将这2个位点多态性分布频率在男女性别之间作比较,差异都没有显著性(P均>0.05)。进一步与人类基因组计划公布的4个人群相比,广西汉族人群的rs3092923G/A和rs3092929A/C 2位点基因型和等位基因频率与非洲、日本、欧洲和北京人群比较,差异都具有显著性(P均<0.05)。结论在广西地区壮族及汉族人群中存在着CD40配体基因多态性。广西汉族人群CD40配体基因多态性的分布频率同其他种族人群比较存在着显著性差异,这种差异可能是导致与CD40配体相关的疾病在不同种族人群间的临床表现以及发病率存在明显不同的原因之一。     

染色体12q24.31单核苷酸多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病遗传易感性的关联研究

目的 探讨中国西南地区汉族人群染色体12q24.31 rs2259816基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病(简称冠心病)的相关性.方法 收集592例经冠状动脉造影确诊的冠心病患者及同期冠状动脉造影阴性、排除冠心病诊断的463名正常对照,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-restriction fragment length polymorphism,PCR-RFLP)技术分析染色体12q24.31 rs2259816单核苷酸多态性,比较两组间rs2259816位点等位基因和基因型频率分布差异.结果 冠心病组与对照组中均检出AA、AC、CC基因型.rs2259816等位基因A在冠心病组的频率为49.5%,高于对照组的频率43.8%,两组差异有统计学意义(OR=1.129,95%CI:1.029～1.239,P=0.010).结论 中国西南地区汉族人群染色体12q24.31 rs2259816基因多态性与冠心病发生风险密切相关.     

β2肾上腺素受体基因Arg16Gly位点多态性与华南人群哮喘相关性研究

目的探讨β2肾上腺素受体基因(ADRB2)SNP位点rs1042713即突变位点Arg16Gly的多态性与华南汉族人群支气管哮喘发病的相关性。方法采用病例对照研究,利用基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱技术(MALDI-TOF-MS)对rs1042713进行基因分型,对实验结果运用χ2检验和二分类Logistic回归进行统计学相关性分析。结果 rs1042713多态位点AA、AG、GG 3种基因型在哮喘患者的频率为18.7%、76.0%和5.3%,与对照组(33.8%,44.6%和21.6%)相比具有显著差异(χ2=36.28,P<0.001);对年龄和性别进行校正后,发现相对于AA+GG基因型,携带AG基因型的哮喘发病风险增加(OR=4.37,95%CI:2.64~7.23)。结论华南汉族人群哮喘的发病机制可能与SNP rs1042713位点的单核苷酸多态性有关,杂合子基因型AG为其发病的危险因素。     

2型糖尿病家系与尾加压素2基因多态性

目的探讨我国常州地区汉族家系2型糖尿病与尾加压素2(urotensinⅡ,UT-Ⅱ)基因rs228648多态性位点的关系。方法采用家系内外对照的病例对照研究,并设置无家族史的普通病例组,应用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性技术,对rs228648(G/A)多态性进行基因分型。结果家系中携带AG和AA基因型者患病风险分别为GG型的1.98(95%可信区间=1.19～3.29)和2.46(95%可信区间=1.39～4.34)倍,家系病例组A等位基因频率高于内对照组及普通病例组(P=0.01)。内对照组A等位基因频率高于外对照组(P=0.001)。内对照组携带AG基因型者的胰岛素抵抗指数、胰岛素敏感指数以及胰岛初期分泌功能指数均高于GG基因型者(P<0.05)。结论rs228648多态性位点变异可能是2型糖尿病的危险因素之一,家系人群该基因变异与其胰岛功能间存在关联。     

云南汉族人群CD80基因多态性与宫颈癌发生发展的相关性研究

目的探讨CD80基因多态性与云南汉族人群宫颈癌发生发展的相关性。方法本研究选取云南地区汉族人群癌前病变(CINⅢ期)患者126例,宫颈癌患者450例,健康体检人群500例,采用TaqMan探针基因分型方法对CD80基因中的4个SNP位点rs16829980(AG)、rs16829984(GC)、rs41271391(GT)和rs41271393(CT)进行基因分型,并研究其等位基因、基因型及所构建的单倍型在CINⅢ期患者、宫颈癌患者和健康对照人群中分布频率的差异。结果 rs16829984(GC)等位基因C和G在CINⅢ期组和对照组、癌症组和对照组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.026和0.006)。rs16829980(AG)中等位基因A和G在CINⅢ期组和癌症组中分布频率的差异具有统计学意义(P=0.038)。而rs41271391(GT)和rs41271393(CT)的等位基因和基因型在病例组(CINⅢ期组和癌症组)和对照组中的分布频率的差异无统计学意义(P0.05)。单倍型分析结果显示AGGC单倍型可能是宫颈癌发生的危险因素(OR=1.449;95%CI:1.096-1.915)。结论位于CD80基因启动子区域的SNP位点rs16829984(GC)等位基因C可能是云南汉族人群宫颈癌发生的保护性因素(OR=0.700;95%CI:0.510-0.960),rs16829980(AG)等位基因A可能是云南汉族人群CINⅢ期向宫颈癌发展的保护性因素(OR=0.703;95%CI:0.503-0.982)。     

广西人群IL-22基因多态性分布特征及其与血脂的关系

目的:研究广西正常人群中白细胞介素22(IL-22)基因rs2227485C/T和rs2227491A/G位点的多态性分布特点和在不同人群间的分布差异,探讨不同基因型间常见血脂指标水平的差异。方法:采取多重单碱基延伸法(SNa Pshot)和DNA测序相结合的方法对280例广西人群IL-22基因的rs2227485C/T和rs2227491A/G位点进行基因分型检测,并用统计学方法比较各组间多态性分布的差异及不同基因型间血脂指标水平的差异。结果:rs2227485C/T存在CC、CT和TT 3种基因型,分布频率分别为17.1%、49.3%和33.6%,此位点基因型及等位基因频率在广西人群不同性别间的差异无统计学显著性(P0.05),其基因型及等位基因与国际人类基因组单体型图计划公布的意大利、北京、日本和墨西哥人群相比,差异有统计学意义(P0.05);rs2227491A/G存在AA、AG和GG 3种基因型,分布频率分别为16.1%、52.8%和31.1%,此位点基因型及等位基因频率在广西人群不同性别间的差异无统计学显著性(P0.05),基因型频率与意大利、日本和墨西哥人群之间的差异有统计学意义(P0.05),等位基因分布频率与其他4个人群相比差异均有统计学意义(P0.05)。rs2227491A/G位点3种基因型间的HDL-C和LDL-C差异有统计学意义(P0.05),其中HDL-C在AG/AA与GG组比较差异有统计学意义(P0.05),LDL-C在AG/GG和AA组比较差异有统计学意义(P0.05)。结论:IL-22基因rs2227485C/T和rs2227491A/G位点多态性在不同人群间存在着差异。rs2227491A/G多态性与血脂水平相关。     

LncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T单核苷酸多态性在广西人群中的分布

目的:研究广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T单核苷酸多态性(SNPs)的分布特征,并比较其在不同地区人群中的分布差异。方法 :采用SNPscan技术对289例广西人群rs2235095G/A和rs2067079C/T位点进行基因分型检测,并分析其基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的欧洲(CEU)、日本(JPT)、尼日利亚(YRI)和中国南方汉族人群(CHS)的分布差异。结果 :rs2235095G/A位点存在GG、AG和AA3种基因型,分布频率分别为37.0%、47.4%和15.6%;rs2067079C/T位点存在CC、CT和TT3种基因型,分布频率分别为63.0%、31.5%和5.5%。2个位点的基因型和等位基因频率在广西人群不同性别间比较差异均无统计学意义。rs2235095G/A基因型和等位基因频率与国际千人基因组计划数据库公布的CEU、JPT和YRI人群比较差异均有统计学意义;rs2067079C/T基因型和等位基因频率与YRI人群比较差异均有统计学意义。结论 :广西人群lncRNA-GAS5基因rs2235095G/A和rs2067079C/T位点存在基因多态性,且其在不同人群间存在不同程度的差异。     

CYP2C19、CYP3A5基因多态性与心肌梗死的相关性研究

目的探讨CYP2C19、CYP3A5基因的多态性与心肌梗死发病风险的相关性。方法随机选取心肌梗死患者及健康对照各500例,采用荧光PCR法和Sanger测序分别检测其CYP2C19、CYP3A5基因的多态性,用Logistic回归分析其与心肌梗死的相关性,用Quanto软件评估统计学效能。结果CYP2C19基因rs4986893位点的AG、GG基因型和A等位基因的频率以及CYP3A5基因rs776746位点的AA、AG、GG基因型和G等位基因频率在两组之间的差异具有统计学意义(P<0.05),CYP2C19基因rs4244285、rs12248560位点的基因型和等位基因以及rs4986893位点的AA基因型的频率在两组之间差异无统计学意义(P>0.05)。在校正年龄、性别、体质指数后,Logistic回归分析显示CYP2C19基因rs4986893的AG基因型和A等位基因以及CYP3A5基因rs776746的GG基因型和G等位基因可能是心肌梗死发病的风险因素,而rs4986893的GG基因型以及rs776746的AA、AG基因型可能是心肌梗死的保护因素。依据样本量、样本结构和等位基因频率以及Quanto分析,本研究的结果具有理想的统计学效能(99%)。结论CYP2C19、CYP3A5基因的多态性可能增加心肌梗死的发病风险。     

PI3K-AKT-mTOR信号通路基因多态性与胃癌遗传易感相关性

目的探讨中国福建地区汉族人群PI3K/AKT/mTOR信号通路基因单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)与胃癌遗传易感性的关系。方法选取组织学确诊的胃癌323例及年龄和性别等频数匹配的对照健康体检人493例,采用PCR-连接酶检测反应(ligase detection reaction,PCR-LDR)法进行PI3K rs7651265 AG、mTOR rs7212142 GA及AKT rs1130214 GT多态性检测,应用非条件Logistic回归分析评估不同基因型与胃癌发病风险及病理特征的关系。采用似然比检验分析PI3K和mTOR基因多态性之间的交互作用。结果 PI3K基因rs7651265携带G等位基因(GG+GA)患者发生胃癌的风险是携带AA基因型的4.93倍(P0.05)。而该位点携带AA基因型的患者发生肿瘤浸润的风险是携带GG+AG基因型患者的3.5倍(P0.05)。mTOR rs7212142携带GG基因型的患者发生淋巴结转移的风险是携带AA+AG基因型的1.67倍(P0.05)。采用似然比检验分析表明,PI3K rs7651265 AG和mTOR rs7212142 GA基因多态性间存在明显交互作用。与携带野生型纯合子PI3K AA和mTOR GG基因型的个体相比,位点发生变异的PI3K(AG+GG)~*mTOR(GG)、PI3K(AG+GG)~*mTOR(AG+AA)增加个体患胃癌的风险,OR值分别为5.71(95%CI:3.50~9.34,P0.05)和6.41(95%CI:4.13~9.90,P0.05)。结论 PI3K-AKT-mTOR信号通路基因多态性与胃癌的发生及侵袭转移密切相关,有可能成为胃癌预后的新分子指标。     

Associations between CD36 gene polymorphisms and susceptibility to coronary artery heart disease

Associations between polymorphisms of the CD36 gene and susceptibility to coronary artery heart disease (CHD) are not clear. We assessed allele frequencies and genotype distributions of CD36 gene polymorphisms in 112 CHD patients and 129 control patients using semi-quantitative polymerase chain reaction (PCR) and restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis. Additionally, we detected CD36 mRNA expression by real-time quantitative PCR, and we quantified plasma levels of oxidized low-density lipoprotein (ox-LDL) using an enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA). There were no significant differences between the two groups (P>0.05) in allele frequencies of rs1761667 or in genotype distribution and allele frequencies of rs3173798. The genotype distribution of rs1761667 significantly differed between CHD patients and controls (P=0.034), with a significantly higher frequency of the AG genotype in the CHD group compared to the control group (P=0.011). The plasma levels of ox-LDL in patients with the AG genotype were remarkably higher than those with the GG and AA genotypes (P=0.010). In a randomized sample taken from patients in the two groups, the CD36 mRNA expression of the CHD patients was higher than that of the controls. In CHD patients, the CD36 mRNA expression in AG genotype patients was remarkably higher than in those with an AA genotype (P=0.005). After adjusted logistic regression analysis, the AG genotype of rs1761667 was associated with an increased risk of CHD (OR=2.337, 95% CI=1.336-4.087, P=0.003). In conclusion, the rs1761667 polymorphism may be closely associated with developing CHD in the Chongqing Han population of China, and an AG genotype may be a genetic susceptibility factor for CHD.     

细胞间黏附分子1基因K469E多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病的关联研究

目的研究中国汉族人群中细胞间黏附分子1（intercellular adhesion moleculel，ICAM1）基因K469E多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病（简称冠心病）的关联。方法采用聚合酶链反应．限制性片段长度多态性方法检测了173例冠心病患者和141名对照的ICAM1基因K469E基因型和等位基因的分布。结果基因型频率符合Hardy-Weinberg平衡。冠心病组的KK基因型的频率显著高于对照组（64．2％比48．9％，P〈0．01），同样，冠心病组K等位基因的频率显著高于对照组（79．2％比69．9％，P〈0．01）。经Logistic回归分析排除年龄，性别，和冠心病其它危险因素的影响后，KK纯合子患冠心病的危险性是KE和EE基因型的2．35倍（95％CI：1．03-5．36，P〈0．05）。结论ICAM1基因K469E多态性与中国汉族人冠心病的危险性相关，其中K等位基因可能是冠心病的遗传危险因素。     

二甲基精氨酸二甲基氨基酸水解酶基因多态性与冠心病的相关性研究

目的:研究中国人群二甲基精氨酸二甲基氨基酸水解酶(DDAH)基因单核苷酸多态性(SNP)与冠状动脉性心脏病(coronary heart disease,CHD)的关系。方法:从山西医科大学第二医院选取冠心病患者165例和匹配的对照组192例。并记录所有研究对象的病史、体格检查等临床资料及其它流行病学资料,采取聚合酶链式反应和限制性酶切片段长度多态性分析方法(PCR-RFLP)检测各组DDAH2基因rs805305位点C/G的基因型并统计各组的基因型频率。用连接酶检测反应(LDR)-测序分型方法检测各组基因rs2272592位点G/A的基因型并统计各组的基因型频率。结果:冠心病组rs805305和rs2272592基因型频率与对照组之间相比较均无显著差异(P0.05)。并在校正了年龄、性别、高血压史、糖尿病史、甘油三酯和胆固醇等传统危险因素的影响后,这种相关性依然不存在。结论:DDAH2基因rs805305位点C/G多态性和rs2272592位点G/A多态性可能与中国人群冠心病发病不相关。     

HMG-CoA 还原酶基因多态性与血浆血脂的关系

目的 探讨3—羟—3甲基戊二酰辅酶A(3—hydroxy—3—methylglutaryl coenzyme A，HMG—CoA)还原酶基因多态性在中国汉族人群中的分布及其与冠心病(coronary heart disease,CHD)的关系。方法 用聚合酶链反应—限制性片段长度多态性方法分析HMG—CoA还原酶基因第2内含子区ScrFl酶切多态性。结果 ScrFl多态位点等位基因A、a频率在CHD组和正常对照组分别为0．519、0．481和0．440、0．560。基因频率分布符合Hardy—Weinberg平衡定律。ScrF1酶切多态性基因型频率、等位基因A、a频率在组间比较差异无显著性(P＞0．05)，但是，基因型为AA的冠心病患者，其血浆极低密度脂蛋白、胆固醇水平显著高于其他基因型患者(P＜0．05)。中国人ScrFl多态位点A、a等位基因频率与欧洲白人比较差异有显著性(0．44vs0．55，0．56vs0．45，P＜0．05)，可能由于标本的种族来源不同所致。结论 ScrFl酶切多态性与CHD无相关性(P＞0．05)，但是，患者组AA基因型与血浆极低密度脂蛋白、胆固醇水平密切相关(P＜0．05)。     

APOA5基因单核苷酸多态性与冠心病相关性研究

目的　探讨APOA5基因多态性与冠状动脉粥样硬化性心脏病 (coronaryheartdisease ,CHD)的相关性、与血脂关系及其在中国汉族人群中的分布。方法　用聚合酶链反应 限制性片段长度多态性分析APOA5与APOA4交界区域的T/C单核苷酸多态。结果　T/C单核苷酸多态位点等位基因T、C频率在CHD组和正常对照组分别为 0 .43 5、0 .5 65和 0 .3 74、0 .62 6。等位基因频率和基因型频率分布均符合Hardy Weinberg平衡定律。T/C基因多态性基因型频率 ,等位基因T、C频率在两组间差异有显著性(P <0 .0 5 ) ,且基因型CC的冠心病患者其血浆高密度脂蛋白水平显著高于其他基因型患者 (P <0 .0 1)。中国人T/C单核苷酸多态位点T、C等位基因频率与欧洲白人比较 ,差异存在非常显著性 ( 0 .3 74vs 0 .663、0 62 6vs 0 .3 3 7;P <0 .0 0 1)。结论　T/C单核苷酸多态性与CHD存在相关性 (P <0 .0 5 ) ,患者组CC基因型与血浆高密度脂蛋白水平密切相关 (P <0 .0 1)。     

Meta-Analysis of the Association of the Rs2234693 and Rs9340799 Polymorphisms of Estrogen Receptor Alpha Gene with Coronary Heart Disease Risk in Chinese Han Population

Objective: The association between a common variant of the ESR1 gene rs2234693 and rs9340799 polymorphisms with coronary heart disease (CHD) have been reported, but the available data on this relationship are inconsistent. A meta-analysis was performed to quantitative analysis the association of ESR1 gene polymorphisms and CHD risk using previous case-control studies in Chinese Han population.Methods: Several electronic databases were searched for relevant articles up to August 2012. After data collection, a meta-analysis was performed to assess heterogeneity, combine results and evaluate variations. Different effect models were used according to the difference in heterogeneity. Sensitivity analysis was assessed by omitting one study at a time. Publication bias was examined using Begg''s funnel plot and Egger''s linear regression test.Results: Ten studies covering 3400 subjects on rs2234693 and rs9340799 polymorphisms in the ESR1 gene with CHD risk was included in this meta-analysis. For rs2234693 polymorphism, ten studies were combined to the meta-analysis. A significantly increased CHD risk was found in a dominant model (OR=1.35, 955 CI=1.01-1.81, P=0.05), recessive model (OR=1.40, 95% CI=1.15-1.69, P=0.0007), and additive model (OR=1.67, 95% CI=1.19-2.34, P=0.003). Subgroup for male but not for female showed that the CC genotype could increase the risk of CHD compared with TT and TC genotype in Chinese Han population. Concerning rs9340799 polymorphism, eight studies were combined to the meta-analysis. And no evidence of significant association with CHD risk was found in all genetic models.Conclusion: Our meta-analysis of 10 studies involving Chinese Han population suggests that the CC genotype of the ESR1 rs2234693 polymorphism is significantly associated with an increased risk of CHD in males only. There was no evidence however, of a significant association between the ESR1 rs9340799 polymorphism and CHD risk.     

脂联素基因SNP+45 T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性研究

目的:研究中国华南地区汉族人脂联素基因SNP+45T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性。方法:以153例冠脉造影证实为冠心病的非糖尿病患者为冠心病组,以73例健康者为对照组,采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性(PCR-RFLP)方法分析脂联素基因SNP+45T/G单核苷酸多态性与冠心病的相关性,ELISA法测定血浆脂联素水平。结果:冠心病组T/G+G/G型频率、G等位基因频率均高于对照组(P0.05)。Logistic回归分析发现脂联素基因SNP+45 T/G+G/G型与冠心病正相关(OR:2.132,95.0%C I:1.034-4.397,P0.05),血浆脂联素水平与冠心病的发病呈负相关(OR:0.868,95.0%C I:0.785-0.959,P0.05)。结论:脂联素基因SNP+45 T/G+G/G型可能是华南地区汉族人冠心病的易感基因型。     

肝脂酶基因启动子-250G/A多态性与2型糖尿病合并冠心病易感性的相关研究

目的 探讨汉族人群肝脂酶(hepatic lipase,HL)基因启动子-250G/A多态性与2型糖尿病(type 2 diabetes mellitus,T2DM)合并冠心病(coronary heart disease,CHD)的相关性.方法 采用聚合酶链反应-限制性片段长度多态性方法(polymerase chain reaction-restricted fragment length polymorphism,PCR-RFLP)检测364例T2DM+CHD组、357例T2DM组患者和356名健康对照者HL基因启动子-250G/A多态性,并分析其对脂类的影响.结果 T2DM组与对照组HL基因启动子-250G/A多态性基因型和等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05);T2DM+CHD组GA+AA基因型频率低于对照组(0.431 vs 0.618,P=0.031);等位基因频率差异无统计学意义(P>0.05).调整混杂因素后,Spearman相关及线性回归分析,糖尿病患者(T2DM组和T2DM+CHD组),A等位基因与高密度脂蛋白胆固醇、载脂蛋白A1呈正相关;Logistic回归分析显示,A等位基因是冠心病发生的一个危险因素.结论 HL基因启动子-250G/A多态性与2型糖尿病合并冠心病的发生有关,并影响脂类代谢.