基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。     

基于网络药理学和分子对接探讨苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病的作用机制

目的 运用网络药理学及分子对接技术，探究苗药黑骨藤治疗阿尔茨海默病(AD)的活性成分和潜在作用机制。方法 通过文献搜集苗药黑骨藤的化学成分，利用中药系统药理学数据库(TCMSP)和Swiss ADME数据库筛选黑骨藤的主要活性成分，采用Swiss Target Prediction和SEA数据库预测活性成分的作用靶点。通过GeneCards、OMIM数据库检索AD相关靶点，经Venny2.1.0获取成分-疾病交集靶点，结合STRING数据库和Cytoscape3.8.0软件对交集靶点进行蛋白互作(PPI)网络分析。再借助HIPLOT数据库对交集靶点进行基因本体(GO)分析和基因组百科全书(KEGG)信号通路富集分析。最后，利用AutoDock Tools1.5.6软件将潜在成分与核心靶点进行分子对接。结果 苗药黑骨藤的活性成分共24个，对应靶点574个，1 513个AD靶点，交集靶点159个；GO分析得到2 661条生物过程，587条分子功能，311条细胞成分；KEGG分析得到AD主要参与神经退行性疾病-多发性疾病途径、卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染、癌症中的蛋白多糖等相关通路。分子对接结...     

基于网络药理学探讨太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的作用机制

目的应用网络药理学的研究方法挖掘太子参、赤芍治疗糖尿病合并冠心病的物质基础及其作用机制。方法通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)数据库检索太子参、赤芍两味中药的化学活性成分,并进行靶点预测。通过TTD、DisGeNET、OMIM数据库分别检索糖尿病和冠心病的相关疾病靶点,将中药靶点与疾病靶点进行交集,筛选得到共同作用靶点。应用STRING平台构建蛋白-蛋白相互作用(PPI)网络模型。使用Cytoscape软件对该网络进行拓扑学分析得到核心靶点,并对核心靶点进行GO-BP生物功能富集分析,应用DAVID平台对其进行KEGG通路分析。结果经数据库分析共筛选出6个太子参有效活性成分、25个赤芍有效活性成分和451个潜在作用靶点,与糖尿病合并冠心病共同作用靶点173个。通过对共有靶点的拓扑分析,筛选出49个核心靶点。GO-BP生物功能富集分析发现,太子参、赤芍可通过脂多糖的调节、活性氧物质的代谢过程、血液循环的调节、血管收缩的调节等过程,从而共同发挥治疗糖尿病合并冠心病的作用。KEGG通路富集分析发现,其可通过脂肪细胞因子信号通路、ErbB信号通路、间隙连接通路、焦点黏附通路、过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)信号通路、血管内皮生长因子(VEGF)信号通路、促黄体生成素释放激素(GnRH)信号通路等代谢通路起到治疗作用。结论太子参与赤芍可通过多靶点、多通路治疗糖尿病合并冠心病。     

UPLC-Q-TOF-MS技术联合网络药理学探讨补肾活血颗粒治疗帕金森病的质量标志物

目的 探讨补肾活血颗粒治疗帕金森病的作用机制和质量标志物。方法 通过UPLC-Q-TOF-MS技术联合UNIFI数据库分析补肾活血颗粒主要化学成分。通过网络药理学方法挖掘补肾活血颗粒治疗帕金森病的核心靶点和分子通路。将核心靶点与相关成分进行分子对接验证，结合文献将补肾活血颗粒治疗帕金森病的关键成分确定为质量标志物。结果 补肾活血颗粒中共鉴定出37个主要化学成分，预测获得246个靶点。检索GeneCards数据库获得帕金森病靶点。二者取交集获得62个交集基因。基因富集分析结果显示，补肾活血颗粒作用靶点主要涉及调节神经递质水平、多巴胺能突触传递和神经递质受体活性，调控白细胞介素17和细胞凋亡等信号通路发挥帕金森病治疗作用。蛋白-蛋白相互作用网络经筛选得到8个核心基因，分别是淀粉样蛋白βA4、前列腺素G/H合酶2、热休克蛋白90α等。分子对接结果显示，相关成分与核心靶点具有较好的亲和力。结合文献将毛蕊花糖苷、知母皂苷BⅡ、洋川芎内酯Ⅰ、丹酚酸B、黄花远志素A等13个成分作为补肾活血颗粒治疗帕金森病的质量标志物。结论 补肾活血颗粒通过多成分、多靶点、多途径治疗帕金森病，为深入阐明补肾活血颗粒的...     

基于网络药理学探讨红花治疗缺血性脑卒中的机制

目的 基于网络药理学方法探讨红花治疗缺血性脑卒中的作用靶点、相关信号通路和潜在的作用机制。方法 通过中药系统药理学技术平台(TCMSP)、有机小分子生物活性数据(PubChem)筛选红花的主要化学成分及其对应的作用靶点；利用人类基因数据库(GeneCards)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)获取缺血性脑卒中相关靶点基因；将两者取交集得到红花-缺血性脑卒中靶点基因的交集。运用Cytoscape3.7.1软件构建可视化的中药调控网络；借助STRING在线数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络。通过R语言软件对共同靶点进行基因本体(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析，筛选出潜在信号通路并分析其作用机制。结果 通过筛选共获得红花有效成分22个，红花作用于缺血性脑卒的靶点220个，红花-缺血性脑卒中靶点交集的基因100个；构建出的PPI网络中出现频数较高的节点有白蛋白(ALB)、丝氨酸/苏氨酸激酶(AKT)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子(VEGF)A、原癌基因蛋白Fos(FOS)、胱天蛋白酶(CASP)3、表皮细胞生长因子(EG...     

基于网络药理学及分子对接探讨灵芝的免疫调节机制

［摘要］　目的　通过网络药理学及分子对接探讨灵芝调控免疫功能的作用机制。方法　通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)检索和筛选灵芝有效成分,使用Swiss Target Prediction数据库预测其潜在作用靶点。从GeneCards、DrugBank、OMIM、PharmGKB、TDD数据库中获取免疫调控相关靶点,整合药物靶点和疾病靶点,取交集靶点。使用Cytoscape软件构建药物-活性成分-作用靶点-疾病网络图,筛选核心成分。利用String平台构建蛋白互作(PPI)网络,筛选核心蛋白。利用R软件进行GO富集分析和KEGG通路分析。通过分子对接技术进行活性成分和核心靶点的分子对接验证。结果　共获取灵芝活性成分43个,作用靶点499个,免疫相关靶点12 454个,药物与疾病的交集靶点483个。KEGG通路分析显示交集基因主要富集于神经活性配体-受体相互作用、cAMP信号通路、蛋白多糖与癌症等信号通路。GO富集分析显示,交集基因主要参与脂质代谢过程的调节、肽基-丝氨酸磷酸化、肽基-丝氨酸修饰等过程。分子对接结果显示,主要核心成分与核心蛋白有较好的结合活性。结论　研究构建的灵芝“成分-靶点-通路-疾病”网络,一定程度上揭示了灵芝多成分、多靶点的复杂作用机制,为灵芝的临床应用和产品开发提供理论基础。     

基于网络药理学和分子对接探讨养心氏片抗心肌纤维化的作用机制

目的:基于网络药理学与分子对接探讨养心氏片抗心肌纤维化的作用机制。方法:通过中医药系统药理学平台(TCMSP)检索养心氏片中13味中药的活性成分;运用基因名片数据库(GeneCards)、药物遗传学与药物基因组学知识库(PharmGKB)、在线人类孟德尔遗传数据库(OMIM)、DrugBank数据库及治疗靶点数据库(TTD)检索获得心肌纤维化相关靶点;将养心氏片活性成分靶点和疾病靶点取交集,运用Cytoscape 3.8.0软件绘制“药物-活性成分-靶点”网络图;将交集靶点上传至STRING平台进行蛋白相互作用(PPI)网络分析;运用R软件对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析与京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析;运用AutoDock Vina 1.1.2对养心氏片的核心成分与核心靶点进行分子对接验证。结果:养心氏片通过β-谷甾醇、山柰酚、槲皮素等核心成分作用于表皮生长因子受体(EGFR)、雌激素受体(ESR1)、白介素1B(IL1B)等核心靶点,可调节心肌纤维化中晚期糖基化终末产物/晚期糖基化终末产物受体(AGE/RAGE)信号通路、低氧诱导因子(HIF-1)信号通...     

基于网络药理学与分子对接探讨失笑散治疗冠心病的作用机制

目的:基于网络药理学及分子对接技术探讨失笑散治疗冠心病的作用机制。方法:收集TCMSP及BATMAN-TCM、HERB数据库,分别检索蒲黄和五灵脂的化学成分及靶点,运用Cytoscape 3.9.0软件构建药物-活性成分-潜在靶点网络图。通过GeneCards、OMIM、TTD数据库筛选冠心病相关的靶点。利用Venny图获取疾病-药物交集靶点,并将其上传至STRING数据库,进一步通过Cytoscape 3.9.0软件绘制核心蛋白-蛋白互作(PPI)网络图。采用Metascape平台对交集靶点进行基因本体(GO)、京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。利用AutoDockTools-1.5.7软件对核心成分与核心靶点进行分子对接,采用PyMOL软件进行可视化。结果:经筛选后获得失笑散核心成分为槲皮素、山柰酚、异鼠李素等;核心靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、细胞肿瘤抗原p53(p53)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)等。KEGG通路富集的主要通路为环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、核因子-κB(NF-κB)信号通路等。分子对接验证显示：多数核心成分与核心靶点具有...     

基于网络药理学探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制。方法:通过TCMSP数据库和UniProt数据库校正筛选出丹参、砂仁和檀香的有效活性成分;运用GeneCards数据库、NCBI基因数据库及OMIM数据库获取心力衰竭的疾病靶点,通过STRING数据库对交集靶点构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,运用拓扑分析和MCODE聚类分析获得核心作用靶点,并对核心作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从丹参饮3味中药中筛选出78个化合物、264个靶点,心力衰竭靶点2 273个,交集靶点86个,关键靶点36个。GO功能富集分析生物学过程共1 900条,KEGG筛选出通路165条。结论:丹参饮通过多靶点、多途径、多通路干预心力衰竭,可能涉及的靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、低聚果糖(FOS)等,涉及的信号通路包括白细胞介素-17(IL17)、晚期糖基化终末产物-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、松...     

基于网络药理学及分子对接探究大黄-三七-蒲黄治疗脑出血的作用机制

目的:在活血化瘀理论指导下,运用网络药理学及分子对接方法研究大黄-三七-蒲黄治疗ICH的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学分析平台(TCMSP)、UniPort数据库获取大黄-三七-蒲黄活性成分及靶点蛋白,利用GEO数据库获得GSE24265芯片基因表达谱,运用R软件筛选ICH疾病差异基因,并获取药物与ICH交集靶点。运用Cytoscape软件与STRING数据库获得与靶点相关有效成分及蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络。通过R Cluster Profiler对交集基因进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析。使用Cytoscape软件构建“药物有效成分-靶基因-KEGG网络”,获得药物核心成分及作用靶点。运用GSEA进一步富集核心靶点作用途径。运用Autodock软件分子对接以验证核心成分、靶点的结合活性。结果:筛选获得大黄-三七-蒲黄治疗ICH的核心成分为槲皮素、人参皂苷Rh2、芦荟大黄素等;核心靶点为白细胞介素1β(IL-1β)、白细胞介素6(IL-6)、CXC趋化因子配体8(CXCL8)、趋化因子配体2(CCL2)。核心靶点共同富集于NOD样受...     

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair's potential mechanism in the treatment of ischemic stroke by network pharmacology and molecular docking technology

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair''s (RPR-FC) potential mechanism in treating ischemic stroke (IS) by network pharmacology and molecular docking technology.The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database was used to screen the active components of the RPR-FC, and Cytoscape 3.8 software was used to construct a network map of its active components and targets of action. The GeneCards and OMIM databases were used to identify disease targets of IS, and the common targets were chosen as research targets and imported into the STRING database to construct a protein–protein interaction network map of these targets. R language software was used to analyze the enrichment of GO terms and KEGG pathways, and explore the mechanisms of these targets. Molecular docking technology was used to verify that the RPR-FC components had a good bonding activity with their potential targets.A total of 44 active components, which corresponded to 197 targets, were identified in the RPR-FC. There were 139 common targets between the herb pair and IS. GO functional enrichment analysis revealed 2253 biological process entries, 72 cellular components entries, and 183 molecular functions entries. KEGG pathway enrichment analysis was mainly related to the NF-kappa B signaling pathway, the TNF signaling pathway, apoptosis, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, etc. The molecular docking results showed the components that docked well with key targets were quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein.The active components (quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein) of the RPR-FC and their targets act on proteins such as MAPK1, AKT1, VEGFA, and CASP3, which are closely related to IS.¹ These targets are closely related to the NF-kappa B signaling pathway, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, and other signaling pathways. These pathways are involved in the recovery of nerve function, angiogenesis, and neuronal apoptosis and the regulation of inflammatory factors, which may have a therapeutic effect on IS.     

基于网络药理学探究络风宁2号方治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的 基于网络药理学筛选出络风宁2号方主要活性化合物,预测络风宁2号方治疗慢性心力衰竭(心衰)的潜在作用靶点及信号通路,探讨其作用机制.方法 利用TCMSP平台和相关文献记载检索络风宁2号方中10味药的化学成分和作用靶点;通过GeneCards数据库获取慢性心衰的相关靶标.采用David数据库对交集靶点进行GO功能富集...     

基于网络药理学探究灵宝护心丹治疗急性心肌梗死的潜在机制

目的利用网络药理学和分子模拟对接的方法探究灵宝护心丹治疗急性心肌梗死(AMI)的分子机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)、中医综合数据库(TCMID)获得灵宝护心丹所含9味中药相关活性化合物和作用靶点;通过人类基因数据库Gene Cards获得AMI相关基因,利用String 11.0数据库获得目标基因;利用Cytoscape 3.7.2软件构建化合物-靶标网络,根据拓扑学参数筛选灵宝护心丹治疗AMI的核心靶点;利用Cytoscape 3.7.2插件ClueGO+Cluepedia对疾病和药物交集靶点进行基因本体(GO)生物学过程富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路注释分析。结果灵宝护心丹化合物-AMI靶点网络包含57个疾病靶点和104个活性化合物,核心靶点包括叉头转录因子(FoxO1)、沉默信息调节因子1(Sirt1)、CASP3、白介素-6(IL-6)、AKT1、SOD2、Bcl2等。GO功能富集得到73个条目;KEGG富集到111个通路,并且被分类为16个具有统计学意义的亚组,主要涉及FoxO信号通路、HIF-1信号通路、凋亡信号通路、NF-κB信号通路等。使用GeneMANIA数据库构建核心靶标蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络,并对其进行生物学功能分析。利用分子对接模拟软件Autodock Vina 1.1.2,对关键药效分子与核心靶标进行配体-受体对接模拟计算。结论基于网络药理学预测灵宝护心丹治疗AMI的潜在分子机制,为进一步研究其药效和作用机制奠定了基础。     

苦参治疗病毒性心肌炎的网络药理学研究

目的 运用网络药理学方法分析苦参治疗病毒性心肌炎（viral myocarditis,VMC）的潜在作用机制,为中药苦参的深入研究及VMC的药物研发提供参考。方法 通过中药系统药理学TCMSP、TCMIP、BATMANTCM数据库检索苦参发挥药效的主要活性成分及其对应靶点,借助GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB等数据库整理VMC疾病治疗靶标,联合导入Venny2.1.0平台绘制韦恩图并利用Cytoscape构建疾病-成分-靶点网络图与核心基因,最后,基于共有作用靶基因进行GO功能富集和KEGG通路富集分析。结果 共获得苦参主要活性成分11种,对应潜在药物作用靶点662个;与1 161个VMC疾病靶标映射、信息筛选后获得27个药物-疾病关键交互靶点;拓扑分析获得排位前10的核心靶点,包括IL-6、TNF、VEGFA、STAT3、MYC、EGFR、CCND1、CASP3、MMP9、IL-2等。富集分析结果发现苦参发挥VMC治疗作用主要涉及3个生物学过程和151条潜在信号通路。结论 苦参治疗VMC具有多成分、多靶点、多途径的特点,其主要通过调控IL-6、TNF、VEGFA...     

基于网络药理学的血必清注射液治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用机制研究

目的基于网络药理学探索血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的主要活性成分及作用机制。方法利用TCMSP数据库对血必清注射液的主要活性成分及其靶点筛选,再运用GeneCards数据库和OMIM数据库筛选新型冠状病毒感染合并心肌炎的相关靶点,最后对药物靶点和疾病靶点进行Venn分析,得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的交集靶点。利用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析并筛选关键靶点。采用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,对靶点基因进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果经筛选得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的活性成分125个和作用靶点41个,主要涉及71个生物学过程和135条通路。结论本研究初步验证血必清注射液可通过多成分、多靶点和多通路来发挥治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用。     

基于网络药理学探讨红花-黄芪治疗原发性胆汁性胆管炎的可能性

目的:利用网络药理学方法探讨红花-黄芪治疗原发性胆汁性胆管炎的可能性。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台搜索“红花”、“黄芪”得到其有效成分及作用靶点,利用GeneCards数据库和OMIM数据库获取原发性胆汁性胆管炎的疾病靶点。将红花、黄芪的作用靶点与原发性胆汁性胆管炎的靶基因取交集得到共同的靶基因,利用Cytoscape3.8.0绘制红花-黄芪与原发性胆汁性胆管炎的成分-靶点网络图;利用String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:筛选得到红花-黄芪与原发性胆汁性胆管炎的交集靶基因81个,以槲皮素、木犀草素和山萘酚3种有效成分作用靶点较多,主要作用于疾病的前列腺素-环氧合酶1、丝氨酸蛋白酶1和雄激素受体等靶点,蛋白互作网络分析主要核心靶点有白蛋白、白介素6和丝裂原活化蛋白激酶8,主要涉及DNA结合转录激活因子活性/RNA聚合酶Ⅱ特异性的生物过程,主要涉及前列腺癌、乙型肝炎和卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染等信号通路。结论:基于网络药理学分析显示红花-黄芪可能通过多成分、多靶点、多途径达到治疗原发性胆汁性胆管炎的作用。     

基于网络药理学探讨葛花-枳椇子药对治疗酒精性肝病的作用机制

目的:基于网络药理学方法探讨葛花-枳椇子药对治疗酒精性肝病(ALD)的分子生物学作用机制。方法:利用TCMSP在线数据库检索并获取葛花-枳椇子的活性成分及各成分对应的作用靶点,再根据ADME筛选出合适的中药活性组分。通过检索GeneCards、OMIM、TTD、DRUGBANK、DisGeNET、CTD、PharmGkb及DiGSeE数据库,获得ALD相关疾病靶点。将药物与疾病共同靶点提取后利用STRING数据库进行蛋白互作网络分析并构建PPI网络;利用Cytoscape 3.7.1软件对关键靶点进行网络拓扑学分析,获取葛花-枳椇子治疗ALD的核心作用靶点,再利用DAVID在线工具对核心靶点进行GO及KEGG富集分析,最后构建“化学成分-核心靶点-关键通路”的多层次网络关联图。结果:共筛选出葛花-枳椇子药对活性成分23个,潜在靶点222个,ALD的相关潜在靶点1523个,药物-疾病的交集靶基因131个,主要活性成分为槲皮素、山奈酚、β谷甾醇、豆甾醇等,核心靶点有APP、NTRK1、TP53、EGFR、CUL3、XPO1、ESR1、MCM2、UBC、FN1、CDK2、HSP90AA1、COPS5、RNF2、MYC、CUL7、SIRT7、GRB2、CUL1、CAND1等,涉及624个生物学过程、111种分子功能、72个细胞组分、123条信号通路,作用机制可能与癌症通路、乙型肝炎、PI3K-Akt信号通路、肿瘤坏死因子信号通路等有关。结论:揭示了葛花-枳椇子药对治疗ALD的“多靶点-多通路-多作用”作用机制,为进一步验证该作用机制提供了基础,也为临床推广、运用葛花-枳椇子药对治疗ALD提供科学依据。     

基于“胃不和则卧不安”理论探讨贾跃进治疗失眠障碍的用药规律

目的基于中医“胃不和则卧不安”理论与数据挖掘技术探讨贾跃进临床治疗失眠障碍的用药规律。方法通过简述贾跃进对“胃不和则卧不安”的认识,使用古今医案云平台V 2.2.3将门诊近2年中药治疗失眠障碍的处方进行药物频次、属性统计及关联、聚类和复杂网络分析,得到核心组方。再运用TCMSP、GEO等数据库得到核心组方各药物有效成分的靶点与疾病靶点并取交集,利用Cytoscape 3.8.0及其插件构建疾病-药物-成分-靶点、蛋白-蛋白互作网络,并进行基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,选取关键有效成分和关键靶点进行Vina分子对接分析。结果共获得病案228个、方剂228首,涉及中药119味;药性以平、温为多;药味以甘、辛、苦为主;药物主要归脾、肝、胃经;通过药物关联、聚类和复杂网络分析综合得到6味药物的核心组方。共获得核心组方有效成分45种,相关靶点243个,交集基因72个,关键成分包括α-香树素、豆甾醇等;关键靶点有RAC-α丝氨酸/苏氨酸-蛋白激酶(AKT1)、钠依赖性5-羟色胺转运蛋白(SLC6A4)等。GO功能富集分析包括生物调节、信号通路等;KEGG通路富集分析包括神经活性配体-受体相互作用、血清素能突触等。关键成分和关键靶点分子对接显示可稳定结合。结论初步得到贾跃进中药论治失眠障碍的用药规律及相关多成分、多靶点、多通路的作用机制。     

基于网络药理学和分子对接探究余甘子治疗肝细胞癌的分子机制

目的:基于网络药理学及分子对接虚拟预测方法,探究余甘子治疗肝细胞癌的潜在分子机制。方法:通过公共数据库获取余甘子的有效活性成分及作用靶点,并筛选肝细胞癌相关靶点,构建“活性成分-靶点”关系图与PPI网络,进行GO分析和KEGG、Reactome通路富集,采用分子对接评价活性成分与核心靶点的结合活性。结果:共获得19个有效活性成分和12个重要靶点。通过GO分析获得了1794个细胞生物过程,而KEGG和Reactome富集分析分别涉及315和391个相关通路。结论:余甘子的主要有效活性成分为鞣花酸、木犀草素、槲皮素和山奈酚,可能作用于AKT1、MMP9、SRC、ESR1、PPARG和AR等关键靶点,调控内分泌抵抗、癌症中的蛋白多糖、癌症通路、受体酪氨酸激酶信号、白细胞介素信号通路、生长因子受体和第二信使信号转导、PI3K/AKT信号通路等以治疗肝癌。除了直接的肿瘤相关信号通路,间接的炎症、代谢通路在抑制肝癌进展中发挥了重要作用。