基于网络药理学探讨人参-钩藤药对治疗原发性高血压的作用机制

目的基于网络药理学探究人参-钩藤药对治疗原发性高血压有效成分的靶基因及作用机制。方法通过中药系统药理学数据库(TCMSP)中药数据库检索人参-钩藤药对的化学成分和靶基因,以生物利用度(OB)>30%和类药性(DL)>0.18为条件筛选药对的潜在有效成分,并通过TCMSP数据库预测药对的潜在靶点。运用Uniprot数据库寻找到潜在靶点相对应的人类基因名称,通过GeneCards数据库检索原发性高血压的疾病靶点,与药对的潜在靶点相映射,绘制韦恩图,将映射找到的有效成分的靶基因导入Cytoscape 3.7.2构建疾病-药对-成分-靶点网络图。利用STRING数据库构建蛋白互作网络图选出核心靶标,最后将人参-钩藤药对治疗原发性高血压的有效靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和基于京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共获得人参-钩藤药对46个有效成分和176个有效靶点。GO分析发现,主要途径有调控核受体活性、转录因子活性、肾上腺素能受体活性、类固醇激素受体活性、G蛋白偶联胺受体活性等。KEGG通路富集分析发现,主要通路为丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、缺氧诱导因子1(HIF-1)信号通路等。结论人参-钩藤药对通过多种靶点、多种途径、多种信号通路协同发挥治疗原发性高血压的作用,为进一步药物作用机制的研究提供理论基础,并为指导临床提供依据。     

基于网络药理学探讨钩藤-桑寄生治疗原发性高血压的作用机制

目的:基于网络药理学探讨钩藤-桑寄生治疗原发性高血压的潜在作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索并筛选出钩藤、桑寄生药对的药物活性成分及作用靶点。利用基因名片数据库(GeneCards)及DisGeNET数据库筛选原发性高血压的疾病靶点。利用韦恩平台(Venny)取活性成分作用靶点和疾病靶点交集,得到共同靶点。通过Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络。通过STRING数据库构建蛋白质相互作用(PPI)网络;利用Cytoscape CentisCape 2.2插件提取核心靶点进行分析,并构建“有效成分-核心靶点”网络图。利用DAVID数据库对核心靶点进行基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,并将富集结果可视化。结果:共筛选出钩藤-桑寄生的活性成分32个,作用于原发性高血压的主要靶点有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶B1(AKT1)、白细胞介素(IL)-6、肿瘤坏死因子(TNF)、血管内皮生长因子A(VEGFA)等;主要集中于晚期糖基化终末产物(AGE)/糖基化终末产物受体(RAGE)信号通路、脂质与动脉粥样...     

基于网络药理学探讨附子理中汤治疗非酒精性脂肪性肝病作用机制

目的:运用网络药理学方法分析附子理中汤(FZLZD)治疗非酒精性脂肪肝性病(NAFLD)的潜在作用机制。方法:检索TCMSP数据库筛选出FZLZD药物活性成分及作用靶点,并借助Uniprot平台进行靶点蛋白规范化处理。检索GeneCards与OMIM数据库得到NAFLD靶点基因,进一步获取药物和疾病共有靶点,即为FZLZD治疗NAFLD的潜在靶点基因。利用Cytoscape 3.7.2绘制药物活性成分-靶点-疾病网络图,利用Cytoscape 3.7.2结合String数据库构建蛋白互作(PPI)网络,利用Metascape数据库对共有靶点进行GO和KEGG富集分析。结果:最终筛选出80种药物活性成分、43个潜在作用靶点;富集分析获取808个生物学过程及25条与NAFLD相关信号通路。结论:FZLZD通过多成分-多靶点-多信号通路协同调控NAFLD。     

基于网络药理学探讨参附养心汤治疗心力衰竭的作用机制

目的探讨参附养心汤治疗心力衰竭的可能作用机制。方法采用网络药理学研究方法,应用中药系统药理数据库和分析平台(TCMSP)数据库和BATMAN-TCM,筛查参附养心汤的有效成分及其作用靶点。通过GeneCards、OMIM、MalaCards、TTD数据库综合筛选心力衰竭的靶标,采用String在线数据库对二者交集的靶点蛋白构建蛋白相互作用网络,并在Cytoscape 3.7.1软件中进行可视化处理,筛选关键基因。使用DAVID工具对查到的基因进行基因本体论(GO)富集分析以及KEGG通路富集分析,探讨潜在靶标可能具有的生物学功能及通路。结果从参附养心汤中筛选出55个化合物,涉及治疗心力衰竭的49个靶点,网络分析结果表明该方可能通过缺氧应答、胰岛素分泌调节、胆固醇代谢过程、衰老、血压调节等生物过程,酶结合、脂肪酰基-辅酶A结合、NADP结合、胆固醇结合、类固醇激素受体活性等分子功能发挥作用;其作用机制与肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、低氧诱导因子-1(HIF-1)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路、心肌细胞的肾上腺素能信号通路、醛固酮调节钠重吸收、环磷酸鸟苷(cGMP)-蛋白激酶(PKG)信号通路、甲状腺激素信号通路、钙信号通路、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、细胞凋亡、磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(Akt)信号通路等有关。结论参附养心汤治疗心力衰竭具有多成分、多靶点、多途径的特点。其主要生物学机制可能与以TNF为中心的信号通路有关。     

基于网络药理学和生物信息学探讨生脉饮(党参方)治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的:运用网络药理学和生物信息学方法,探究生脉饮(党参方)治疗慢性心力衰竭(CHF)的活性成分、作用靶点和分子通路,阐明生脉饮(党参方)治疗CHF的分子机制。方法:借助中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)以及BATMAN-TCM平台获取生脉饮(党参方)有效活性成分及化合物潜在靶点,检索GeneCards、治疗靶点数据库(TTD)、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;将化合物与疾病交集靶点通过STRING数据库构建蛋白相互作用(PPI)网络图,采用Cytoscape软件获得生脉饮(党参方)作用于CHF的关键化合物和核心靶点,使用R语言软件包进行基因本体(GO)生物学过程分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析并可视化,在基因表达综合数据库(GEO)下载CHF基因表达芯片,经过R语言软件包处理后验证核心靶点基因差异表达情况,最后,使用Autodock软件将有效成分和核心靶点进行分子对接再次验证,并将结果可视化展示。结果:共筛选得到35个有效化学成分、120个潜在靶点,获得菠菜甾醇、11-羟基兰金断肠草碱、α菠菜甾醇、邻苯二甲酸二异辛酯、黄豆黄素、...     

基于网络药理学探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制

目的:运用网络药理学方法探讨丹参饮治疗心力衰竭的作用机制。方法:通过TCMSP数据库和UniProt数据库校正筛选出丹参、砂仁和檀香的有效活性成分;运用GeneCards数据库、NCBI基因数据库及OMIM数据库获取心力衰竭的疾病靶点,通过STRING数据库对交集靶点构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图,运用拓扑分析和MCODE聚类分析获得核心作用靶点,并对核心作用靶点进行基因本体(GO)功能富集分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果:从丹参饮3味中药中筛选出78个化合物、264个靶点,心力衰竭靶点2 273个,交集靶点86个,关键靶点36个。GO功能富集分析生物学过程共1 900条,KEGG筛选出通路165条。结论:丹参饮通过多靶点、多途径、多通路干预心力衰竭,可能涉及的靶点包括蛋白激酶B(AKT1)、白细胞介素-6(IL6)、表皮生长因子受体(EGFR)、胱天蛋白酶3(CASP3)、热休克蛋白90α家族A类成员1(HSP90AA1)、低聚果糖(FOS)等,涉及的信号通路包括白细胞介素-17(IL17)、晚期糖基化终末产物-糖基化终产物受体(AGE-RAGE)、松...     

基于网络药理学和实验探讨半夏-陈皮药对治疗卒中后抑郁的作用机制

目的:基于网络药理学和实验的方法探讨疏脑解郁汤中半夏-陈皮药对治疗卒中后抑郁的作用机制。方法:通过中医药系统药理学平台(TCMSP)数据库检索半夏、陈皮的主要化学成分及相关靶点,并结合相关文献对TCMSP所获得的有效成分进行补充。根据药物动力学筛选出中药活性组分;通过UniProt数据库进行靶点信息筛选;运用GeneCards、OMIM、DrugBank数据库获取卒中后抑郁的主要靶点;通过Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点”网络,通过STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络并挖掘网络中潜在的功能。通过Metascape平台进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析,通过实验运用蛋白质印迹法对重要靶点进行验证。结果:共筛选出半夏、陈皮13个有效成分、118个作用靶点;卒中后抑郁相关靶点1 366个。半夏、陈皮作用于卒中后抑郁的GO生物过程主要涉及细胞对有机环状化合物的反应、膜电位的调控、正调控细胞凋亡、离子运输的调节、对缺氧的反应;KEGG通路主要涉及癌症通路、血清素能突触、雌激素信号通路、环磷酸腺苷信号通路、神经活性配体-受体通路、内质...     

半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制的网络药理学分析

目的为了探究半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制,应用网络药理学方法分析半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(HAG)的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对半夏泻心汤药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库和OMIM数据库收集HAG疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape 3.6.1软件以及String数据库分别构建"药物-化合物-潜在靶点"相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果终筛选出槲皮素、山柰酚和汉黄芩素等150种药物活性化合物,涉及SATA3、TP53、MAPK1等109个潜在靶点以及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等96条作用通路。结论半夏泻心汤治疗HAG通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控癌症进展的作用。     

半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制的网络药理学分析北大核心CSCD

目的为了探究半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎作用机制,应用网络药理学方法分析半夏泻心汤治疗幽门螺杆菌相关性胃炎(HAG)的主要活性化合物、潜在靶点和相关通路。方法运用中药系统药理学分析平台(TCMSP)对半夏泻心汤药物活性化合物及药物作用靶点基因进行筛选。通过GeneCards数据库和OMIM数据库收集HAG疾病相关靶点,对药物作用靶点及疾病相关靶点进行韦恩分析,确定药物作用潜在靶点;应用Cytoscape 3.6.1软件以及String数据库分别构建"药物-化合物-潜在靶点"相互作用网络及蛋白相互作用(PPI)网络图。运用DAVID数据库对关键靶点进行基因本体(GO)功能,京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果终筛选出槲皮素、山柰酚和汉黄芩素等150种药物活性化合物,涉及SATA3、TP53、MAPK1等109个潜在靶点以及PI3K-Akt信号通路、TNF信号通路、FoxO信号通路等96条作用通路。结论半夏泻心汤治疗HAG通过多成分、多靶点、多途径发挥其抑菌、抗炎、调控癌症进展的作用。     

基于网络药理学及分子对接探讨三黄泻心汤治疗脓毒症心功能障碍的作用机制研究

目的:运用网络药理学及分子对接探讨三黄泻心汤对脓毒症心功能障碍治疗的作用机制。方法:通过文献检索搜集三黄泻心汤中相关有效成分;通过Swiss Target Prediction、有机小分子生物活性数据库(PubChem)、中药系统药理学数据库(TCMSP)预测三黄泻心汤的潜在作用靶点;运用人类基因数据库(GeneCards)和人类孟德尔遗传数据库(OMIM)检索脓毒症心功能障碍相关的疾病靶点。利用Cytoscape 3.8.2软件构建“药物-成分-靶点”网络,使用蛋白质相互作用分析数据库(STRING)构建交集蛋白间相互作用关系网络;借助注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)在线工具进行基因的基因本体(GO)功能富集和京都基因及基因组百科全书(KEGG)通路分析;利用AutoDockVina、PyMOL软件进行有效成分与关键靶点的分子对接。结果:通过筛选获得三黄泻心汤13种主要有效成分和潜在作用靶点511个,有效成分与疾病相关共同靶点51个,主要涉及细胞凋亡、蛋白磷酸化、炎症反应等生物过程,并可能通过磷酸肌醇-3-激酶/蛋白激酶B(PI3K/Akt)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)...     

基于网络药理学探究络风宁2号方治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的 基于网络药理学筛选出络风宁2号方主要活性化合物,预测络风宁2号方治疗慢性心力衰竭(心衰)的潜在作用靶点及信号通路,探讨其作用机制.方法 利用TCMSP平台和相关文献记载检索络风宁2号方中10味药的化学成分和作用靶点;通过GeneCards数据库获取慢性心衰的相关靶标.采用David数据库对交集靶点进行GO功能富集...     

基于网络药理学的血必清注射液治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用机制研究

目的基于网络药理学探索血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的主要活性成分及作用机制。方法利用TCMSP数据库对血必清注射液的主要活性成分及其靶点筛选,再运用GeneCards数据库和OMIM数据库筛选新型冠状病毒感染合并心肌炎的相关靶点,最后对药物靶点和疾病靶点进行Venn分析,得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的交集靶点。利用STRING数据库对交集靶点进行蛋白互作网络分析并筛选关键靶点。采用Cytoscape 3.6.1软件构建“药物-活性成分-靶点-疾病”网络图,对靶点基因进行基因本体富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析。结果经筛选得到血必清注射液作用于新型冠状病毒感染合并心肌炎的活性成分125个和作用靶点41个,主要涉及71个生物学过程和135条通路。结论本研究初步验证血必清注射液可通过多成分、多靶点和多通路来发挥治疗新型冠状病毒感染合并心肌炎的作用。     

基于网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭的作用机制

目的应用网络药理学及分子对接技术探讨五苓散治疗慢性心力衰竭(CHF)的作用机制。方法在中药系统药理学技术平台(TCMSP)检索五苓散主要成分及对应靶点;检索GeneCards、TTD、DrugBank、DisGeNET数据库,筛选CHF相关靶点;取疾病与药物交集靶点,构建韦恩图;应用Cytoscape 3.8.0软件建立五苓散药物-活性成分-靶点网络及药物成分-交集靶点网络,获得关键化合物;应用STRING平台构建交集靶点蛋白-蛋白相互作用(PPI)的网络图,分析网络图得到关键靶点;应用Metascape数据库对交集基因进行基因本体(GO)及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。比较关键靶点及KEGG通路富集基因,选取主要靶点蛋白及关键化合物,应用CB-Dock平台进行分子对接验证。结果通过口服生物利用度(OB)及生物活性分子类药性(DL)筛选得到五苓散共有46个活性成分,共涉及63个作用靶点,与CHF重合的靶点有36个,得到谷甾醇、3β-乙酰氧基-白术酮、二氢槲皮素等10个关键化合物,NOS3、CASP3、PTGS2等10个关键靶点。GO分析得到与循环系统、细胞膜成分及蛋白质相关的注释条目。KEGG通路富集通路主要包括AGE-RAGE信号通路、细胞凋亡、白细胞介素-17(IL-17)信号通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路等。分子对接结果显示,五苓散关键化合物与新型利尿剂托伐普坦,与治疗靶点均具有良好结合活性。结论五苓散包括多个活性成分,作用于多个靶点,通过抑制细胞凋亡、氧化应激、心肌重构、炎症通路等多种机制作用于CHF,体现了中药治疗疾病多成分、多靶点、多途径的特点。     

苦参汤治疗隐孢子虫病的潜在靶标及协同作用机制研究

目的　采用网络药理学方法和分子对接技术探究苦参汤治疗隐孢子虫病的潜在作用靶标及协同作用机制。方法　检索中药系统药理学数据库与分析平台（Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform, TCMSP）及蛋白质信息数据库（The Universal Protein Resource, UniProt）,获取苦参汤主要活性成分并预测其潜在靶标。检索中国知网、万方数据、中国生物医学文献数据库（CBM）、PubMed和Web of Science数据库,对TCMSP数据库未收录的成分加以补充,利用TargetNet数据库在线预测所补充活性成分的靶标基因。应用Cytoscape软件进行网络构建与分析,在比较毒物遗传学数据库和GeneCards数据库中检索隐孢子虫病相关疾病靶标。基于STRING数据库构建靶标蛋白质⁃蛋白质相互作用网络（PPI）,采用DAVID数据库进行基因本体（GO）功能富集分析及京都基因和基因组百科全书（KEGG）通路注释分析,采用BioGPS数据库定位关键靶标的组织器官分布,应用AutoDockTools软件进行分子对接模拟验证。结果　共筛选出苦参汤活性成分38种,其中核心成分为槲皮素、（+）⁃14α⁃羟基苦参碱、芹菜素等。预测得到831个苦参汤相关靶标及512个隐孢子虫病相关靶标。PPI网络分析发现AKT1、TNF、IL⁃6等69个关键靶标。苦参汤治疗隐孢子虫病可能与303个生物进程、46种分子功能、29种细胞组分相关,Toll样受体（TLR）、核因子kappa B（NF⁃ĸB）、核苷酸结合寡聚化结构域样受体（NLR）信号通路等13条KEGG通路在多靶标协同作用下发挥治疗作用。进一步分析发现,核心靶标主要分布于血液和免疫系统。分子对接显示,活性成分与关键靶标对接的结合能均小于0 kJ/mol,配体与受体结合紧密。结论　苦参汤中槲皮素、（+）⁃14α⁃羟基苦参碱、芹菜素等活性成分可能作用于AKT1、TNF、IL⁃6等靶标,进而调控TLR、NLR、NF⁃κB等信号通路,并主要在血液免疫系统中协同发挥对隐孢子虫病的治疗作用。     

Network pharmacology-based strategy for predicting therapy targets of Tripterygium wilfordii on acute myeloid leukemia

This is a study on the potential therapeutic targets and pharmacological mechanism of Tripterygium wilfordii (TW) in acute myeloid leukemia (AML) based on network pharmacology.Active components of TW were obtained by network pharmacology through oral bioavailability, drug-likeness filtration. Comparative analysis was used to investigate the overlapping genes between active ingredient''s targets and AML treatment-related targets. Using STRING database to analyze interactions among overlapping genes. Both KEGG pathway analysis and Gene Ontology enrichment analysis were conducted in DAVID. These genes were analyzed for survival in OncoLnc database.We screened 53 active ingredients; the results of comparative analysis showed that 8 active ingredients had an effect on AML treatment. On the basis of the active ingredients and overlapping genes, we constructed the Drug-Compounds-Genes-Disease Network. Survival analysis of overlapping genes indicated that some targets possessed a significant influence on patients’ survival and prognosis. The enrichment analysis showed that the main pathways of targets were Toll-like receptor signaling pathway, NF-kappa B signaling pathway, and HIF-1 signaling pathway.This study, using a network pharmacologic approach, provides another strategy that can help us to understand the mechanisms by which TW treats AML comprehensively.     

Network pharmacology-based screening of the active ingredients and mechanisms of Huangqi against aging

Studies have shown that Huangqi (HQ) has anti-aging efficacy. However, its active ingredients and mechanisms for anti-aging are still unclear. In this study, we will systematically screen the active ingredients of HQ and explore the possible mechanism of HQ in prevention from aging through network pharmacology technology.The main active ingredients of HQ were obtained from Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform (TCMSP). The possible targets were predicted by TCMSP. The related targets for aging were obtained from GeneCards (The Human Gene Database) and Online Mendelian Inheritance in Man (OMIM) database. The common targets of HQ and aging were obtained using R 3.6.3 software. The protein–protein interaction (PPI) network and the ingredient-target-disease network were constructed using Cytoscape 3.7.2 software for visualization. In addition, the Gene Ontology (GO) functional enrichment and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes (KEGG) pathway annotation of potential targets were performed using R 3.6.3 software.Based on the screening conditions, 16 active ingredients and 28 drug targets were obtained. The PPI network contained 29 proteins, including PTGS2, AR, NOS2, and so on. GO functional enrichment analysis obtained 40 GO items (P < .05). KEGG pathway enrichment analysis obtained 110 aging related pathways (P < .05), including hypoxia inducible factor 1 signaling pathway, PI3K-Akt signaling pathway, AGE-RAGE signaling pathway in diabetic complication, among others.Sixteen effective ingredients of HQ and 28 targets against aging were identified through network pharmacology. Multiple pathways were involved in the effect of HQ on preventing aging.     

基于网络药理学探讨红花-黄芪治疗原发性胆汁性胆管炎的可能性

目的:利用网络药理学方法探讨红花-黄芪治疗原发性胆汁性胆管炎的可能性。方法:应用中药系统药理学数据库与分析平台搜索“红花”、“黄芪”得到其有效成分及作用靶点,利用GeneCards数据库和OMIM数据库获取原发性胆汁性胆管炎的疾病靶点。将红花、黄芪的作用靶点与原发性胆汁性胆管炎的靶基因取交集得到共同的靶基因,利用Cytoscape3.8.0绘制红花-黄芪与原发性胆汁性胆管炎的成分-靶点网络图;利用String平台构建蛋白质-蛋白质相互作用网络并进行基因本体功能富集分析和京都基因与基因组百科全书通路富集分析。结果:筛选得到红花-黄芪与原发性胆汁性胆管炎的交集靶基因81个,以槲皮素、木犀草素和山萘酚3种有效成分作用靶点较多,主要作用于疾病的前列腺素-环氧合酶1、丝氨酸蛋白酶1和雄激素受体等靶点,蛋白互作网络分析主要核心靶点有白蛋白、白介素6和丝裂原活化蛋白激酶8,主要涉及DNA结合转录激活因子活性/RNA聚合酶Ⅱ特异性的生物过程,主要涉及前列腺癌、乙型肝炎和卡波西肉瘤相关疱疹病毒感染等信号通路。结论:基于网络药理学分析显示红花-黄芪可能通过多成分、多靶点、多途径达到治疗原发性胆汁性胆管炎的作用。     

基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制

目的基于网络药理学探讨侯氏黑散治疗缺血性脑卒中的作用机制。方法采用检索中药系统药理数据库与分析平台(TCMSP)检索侯氏黑散的14味药(牡蛎为动物药,未纳入分析范围)中所有化学成分,筛选活性成分及作用靶点;通过GeneCards检索缺血性脑卒中疾病靶点;利用Venny工具绘制韦恩图,找出交集靶点;应用STRING构建蛋白-蛋白互作(PPI)网络图;通过DAVID数据库对交集靶点进行基因本体(GO)功能富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果共筛选到155个中药活性成分、164个作用靶点,缺血性脑卒中相关靶点3173个,从而得到药物-疾病的共同靶点121个。富集于分子功能、生物过程和细胞组分及47条信号通路,包括NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路、钙信号通路等。预测侯氏黑散居前5位的主要活性成分是前列腺素内过氧化物合酶2、槲皮素、山奈酚、前列腺素内过氧化物合酶1、热休克蛋白90,主要通过调节白细胞介素6(IL-6)、血清对氧磷酶1(PON1)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、白细胞介素2(IL-2)、趋化因子(CCL2)等靶点,调控NOD样受体信号通路、胰岛素信号通路等达到治疗缺血性脑卒中的目的。结论侯氏黑散通过多成分、多靶点、多通路治疗缺血性脑卒中。     

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair's potential mechanism in the treatment of ischemic stroke by network pharmacology and molecular docking technology

To explore the Radix Paeoniae Rubra-Flos Carthami herb pair''s (RPR-FC) potential mechanism in treating ischemic stroke (IS) by network pharmacology and molecular docking technology.The Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database was used to screen the active components of the RPR-FC, and Cytoscape 3.8 software was used to construct a network map of its active components and targets of action. The GeneCards and OMIM databases were used to identify disease targets of IS, and the common targets were chosen as research targets and imported into the STRING database to construct a protein–protein interaction network map of these targets. R language software was used to analyze the enrichment of GO terms and KEGG pathways, and explore the mechanisms of these targets. Molecular docking technology was used to verify that the RPR-FC components had a good bonding activity with their potential targets.A total of 44 active components, which corresponded to 197 targets, were identified in the RPR-FC. There were 139 common targets between the herb pair and IS. GO functional enrichment analysis revealed 2253 biological process entries, 72 cellular components entries, and 183 molecular functions entries. KEGG pathway enrichment analysis was mainly related to the NF-kappa B signaling pathway, the TNF signaling pathway, apoptosis, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, etc. The molecular docking results showed the components that docked well with key targets were quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein.The active components (quercetin, luteolin, kaempferol, and baicalein) of the RPR-FC and their targets act on proteins such as MAPK1, AKT1, VEGFA, and CASP3, which are closely related to IS.¹ These targets are closely related to the NF-kappa B signaling pathway, the MAPK signaling pathway, the PI3K-Akt signaling pathway, the VEGF signaling pathway, and other signaling pathways. These pathways are involved in the recovery of nerve function, angiogenesis, and neuronal apoptosis and the regulation of inflammatory factors, which may have a therapeutic effect on IS.     

基于网络药理学预测川芎嗪、芍药苷干预糖尿病血管并发症的作用机制

目的运用网络药理学方法分析川芎嗪和芍药苷治疗糖尿病血管并发症的潜在作用机制。方法检索SwissTargetPrediction ver 2019、Batman-TCM、PharmMapper ver 2017、ZINC、SEA、GeneCards、DrugBank 5.0、DisGenet、String v11数据库,筛选川芎嗪和芍药苷化学成分作用靶点以及糖尿病血管并发症的相关靶点;应用Cytoscape 3.2.1软件,构建川芎嗪和芍药苷成分靶点-疾病靶点网络;通过GO和KEGG富集分析预测川芎嗪和芍药苷治疗糖尿病血管并发症的潜在作用机制。结果从川芎嗪和芍药苷中分别筛选出成分靶点103个和168个,将这些成分靶点与4662个糖尿病血管并发症靶点取交集得到146个靶点,网络拓扑分析得到TP53、HSP90AA1、STAT3和ANXA14个核心靶点,可能为川芎嗪和芍药苷治疗糖尿病血管并发症的重要靶点;GO和KEGG富集分析显示川芎嗪和芍药苷治疗糖尿病血管并发症的可能通路是Neuroactive ligand-receptor interaction,Calcium signaling pathway,Serotonergic synapse,Inflammatory mediator regulation of TRP channels,cGMP-PKG,Dopaminergic synapse。结论初步揭示了川芎嗪和芍药苷治疗糖尿病血管并发症的作用通路及重要活性靶点,为开发更好地治疗糖尿病血管并发症候选药物的活性成分提供参考依据。