全自动半巢式实时荧光定量PCR技术检测 BALF诊断肺结核的价值

目的 探讨全自动半巢式实时荧光定量PCR技术（GeneXpert MTB/RIF）检测肺胞灌洗液（BALF）诊断肺结核的价值。方法 采集2016年6月~2018年6月滨州市结核病防治院已经确诊的住院菌阴肺结核269例设为实验组,另收集其他肺部疾病患者87例设为对照组。利用支气管镜术收集肺胞灌洗液;肺胞灌洗液采用涂片法、培养法和GeneXpert MTB/RIF法3种方法检测结核分枝杆菌,分别对其阳性率及检测菌量进行比较。结果 BALF经涂片、培养和GeneXpert MTB/RIF3种方法检测,敏感度分别为23.05%、33.83%和62.08%,特异度分别为97.70%、97.70%和100.00%。GeneXpert MTB/RIF法分别与涂片法和培养法结果比较,差异均有统计学意义（P＜0.05）;涂片法与培养法结果比较,差异有统计学意义（P＜0.05）;对照组涂片和培养均出现2例阳性者,而GeneXpert MTB/RIF为阴性;涂片和培养相同的2例阳性者,经基因芯片检测确定为NTM。269例菌阴肺结核BALF涂片阴性者207例,207例涂片阴性者经GeneXpert MTB/RIF法检测呈阳性者105例,其中GenXpert MTB/RIF 法“极低”量级50例,占47.62%。269例菌阴肺结核BALF培养阴性者178例,178例涂片阴性者经GeneXpert MTB/RIF法检测呈阳性者76例,其中GenXpert MTB/RIF 法“极低”量级37例,占48.68%。结论 GeneXpert MTB/RIF技术结核分枝杆菌阳性检出率高于涂片和培养法,对早期诊断肺结核具有一定的临床应用价值,且操作简单、快速,值得推广。     

GeneXpert 联合基因芯片在涂阴 MTB 诊断中的价值及患者血清 sTREM-1、 PCT 水平及意义

目的 探讨利福平耐药实时荧光定量核酸扩增技术 ( rifampicin resistant real-time fluorescent quantitative nucleic acid amplification, GeneXpert MTB/ RIF) 联合基因芯片技术在涂阴结核分支杆菌 (Mycobacterium tuberculosis, MTB) 诊断中的价值及血清可溶性髓系细胞触发受体-1 ( serum soluble triggering receptor-1, sTREM-1)、 降钙素原 (procalcitonin, PCT) 水平的意义。 方法 选取 2019 年 1 月至 2021 年 1 月在聊城市 人民医院就诊的疑似涂阴肺结核患者130 例, 采集肺泡灌洗液, 给予 GeneXpert MTB/ RIF、 基因芯片及药敏 试验检查, 同时检查肺结核患者血清 sTREM-1、 PCT 水平。 以肺泡灌洗液结核菌培养及药敏试验为金标准 评价 GeneXpert MTB/ RIF 联合基因芯片检测对涂阴肺结核的诊断价值。 采用 ROC 评价血清 sTREM-1、 PCT 对涂阴肺结核的诊断价值。 结果 以肺泡灌洗液结核菌培养诊断出非涂阴肺结核患者 58 例, 涂阴肺结核患 者 72 例。 GeneXpert MTB/ RIF 联合基因芯片诊断肺结核的灵敏性为 68. 06 % , 高于基因芯片单独诊断 (P< 0. 05), GeneXpert MTB/ RIF 联合基因芯片诊断肺结核的特异性、 准确性、 阳性预测值和阴性预测值分别为 91. 38 % 、 78. 46 % 、 90. 74 % 和 69. 74 % , 与 GeneXpert MTB/ RIF 诊断、 基因芯片单独诊断比较差异无统 计学意义 (P> 0. 05); GeneXpert MTB/ RIF 联合基因芯片诊断 MDR-TB 的灵敏性、 特异性、 准确性、 阳性 预测值和阴性预测值分别为 94. 12 % 、 85. 45 % 、 87. 50 % 、 66. 67 % 和 97. 92 % , 与 GeneXpert MTB/ RIF 诊断基因芯片单独诊断比较差异无统计学意义 (P> 0. 05); 重症肺结核患者血清 sTREM-1、 PCT 分别为 (18. 04 ± 2. 07) ng / ml 和 (2. 09 ± 0. 19) ng / ml, 明显高于轻症肺结核患者 ( P< 0. 05); 血清 sTREM-1、 PCT 预测重症肺结核的 ROC 曲线下面积分别为 0. 811 和 0. 844, 截断值分别为 16. 32 ng / ml 和 2. 00 ng / ml, 灵敏性分别为 89. 30 % 和 82. 00 % , 特异性分别为 61. 40 % 和 79. 60 % 。 结论 GeneXpert 联合基因芯片技 术可提高涂阴 MTB 诊断灵敏性, 且两种手段对 MDR-TB 均有较好的诊断价值。 重症肺结核患者 sTREM-1、 PCT 水平明显高于轻症肺结核, 血清 sTREM-1、 PCT 对重症肺结核诊断灵敏性、 特异性较高, 可作为早期 诊断的手段加以应用。     

应用文献计量学及可视化技术分析富血小板血浆全球研究特征及趋势

文题释义：文献计量学：是指用数学和统计学的方法,定量地分析一切知识载体的交叉科学。它是集数学、统计学、文献学为一体,注重量化的综合性知识体系。其计量对象主要是：文献量(各种出版物,尤以期刊论文和引文居多)、作者数(个人集体或团体)、词汇数(各种文献标识,其中以叙词居多)文献计量学最本质的特征在于其输出务必是“量”。 可视化技术：完整的地理空间信息可视化概念主要包括科学计算可视化、数据可视化和信息可视化。地理空间信息可视化技术的核心是为使用者提供空间信息直观的、可交互的可视化环境。 背景：研究认为,富血小板血浆可以促进组织的修复和再生。 目的：通过文献计量学的方法评价全球富血小板血浆领域的研究现状和热点。 方法：在web of science核心库中,采用普通检索的方式,以“platelet rich plasma”等为关键词进行主题检索,分析从建库至2018-12-25发表的相关研究。通过对已检索的文献按照国家地区、机构、出版年、来源出版物名称等分别进行索引和分析。使用Excel 2007进行描述性统计。使用VOS viewer (Leiden University,荷兰)软件对检索的全部条目进行分析并绘制图形。主要评价指标包括：共现关系、互引关系、共引关系以及合作关系图。 结果与结论：①共检索到8 499篇富血小板血浆方面的研究,研究数量和被引用次数逐年增加;②富血小板血浆研究数量排名前3名的国家是美国、意大利和日本;③富血小板血浆的学科方向和研究领域主要涉及5方面：生长因子功能的基础研究、骨再生领域研究、软骨或骨关节炎相关领域的临床研究、血小板功能研究以及干细胞相关研究领域;④基于大数据的分析结果提示,富血小板血浆的主要研究和应用领域在骨科,尤其是软骨再生和骨关节炎方面,未来富血小板血浆的研究重心和科技投入应该向其倾斜。 ORCID: 0000-0001-6966-3134(邢丹) 中国组织工程研究杂志出版内容重点：人工关节;骨植入物;脊柱;骨折;内固定;数字化骨科;组织工程     

Xpert结核分枝杆菌/利福平试验对结核病及耐多药结核病诊断价值的Meta分析

目的 评估Xpert结核分枝杆菌/利福平（MTB/RIF）试验对结核病的诊断价值.方法 检索PubMed、Medline、中国知网、万方数据库等,收集Xpert MTB/RIF试验对结核病诊断价值的文献,检索起止时间均为建库至2012年6月.2名研究者独立进行资料提取和文献质量评估.采用Meta-Disc 1.4软件进行Meta分析.结果 共纳入26篇文献,其中2篇文献涉及儿童病例,包含了13 270例来自临床患者的检测标本.Meta分析结果显示,Xpert MTB/RIF试验诊断结核病的汇总敏感度为87%（95%CI：86%～88%）、特异度为97%（95%CI：97%～97%）.按照结核病的类型和患者年龄进行亚组分析,Xpert MTB/RIF试验诊断肺结核的敏感度高于肺外结核病,90%（95%CI：89%～91%） vs 76%（95%CI：72%～79%）;诊断涂阴菌阳性和涂阳菌阳性结核病的敏感度分别为74%（95%CI：71%～76%）和99%（95%CI：98%～99%）;对儿童肺结核的诊断敏感度比成人肺结核低,74%（95%CI：65%～83%） vs 90%（95%CI：89%～92%）.Xpert MTB/RIF试验诊断耐多药结核病的敏感度为96%（95%CI：94%～97%）,特异度为98%（95%CI：98%～99%）.结论 Xpert MTB/RIF试验诊断结核病的价值较高,尤其是成人结核病及耐多药结核病.Xpert MTB/RIF试验在儿童结核病中的诊断价值由于纳入文献较少,尚待进一步研究.     

髋关节置换研究：Scopus数据库5年文献检索与分析

背景：人工髋关节置换已经得到肯定并已成为一种可靠的治疗手段,置换的主要目的是缓解关节疼痛、矫正畸形、恢复和改善关节的运动功能。 目的：为人工髋关节置换领域提供有价值的文献计量学分析数据。 设计：来源于Scopus数据库5年髋关节置换相关文献计量学的数据分析。 资料提取：①以hip arthroplasty or hip replacement (髋关节置换);femoral head necrosis (股骨头坏死);femoral neck fracture (股骨颈骨折);rheumatoid arthritis (类风湿性关节炎)为关键词进行数据检索。②分析检索结果。③将分析结果手工导出,生成图片和表格进行描述。 纳入标准：纳入研究原著、综述、会议录,排除信件、社论、校对、随笔、短讯及未发表的文章。 主要数据的判定指标：①检索结果数量。②发表文章年份分布。③国家地区分布。④机构信息。⑤文献类型分析。⑥来源期刊分析。⑦高被引频次文献分析。⑧专利信息。 结果：Scopus数据库收录关于人工髋关节置换应用中最多应用于股骨颈骨折,其次为股骨头坏死和类风湿性关节炎;专利信息最多的为髋关节置换应用与股骨头坏死。文献数量总体稳定并略有上升的趋势,发表此类文献数量最多的国家为美国,3种疾病分别为85篇、142篇和91篇。文献出版物来源最多的为Journal of Arthroplasty《关节成形术杂志》,3种疾病文献数量分别为47篇、58篇和40篇。中国在3种疾病的文献产出中有重要地位,文献产出数量分别为42篇、40篇和10篇。 结论：人工髋关节置换应用于股骨头坏死和股骨颈骨折是近几年的研究热点,中国在该领域的研究趋于成熟,并在国际数据库收录文献数量上占有重要位置。 关键词：髋关节;置换;股骨头坏死;股骨颈骨折;类风湿性关节炎;Scopus;分析 doi:10.3969/j.issn.1673-8225.2012.13.026     

干细胞移植治疗脑卒中的研究与应用

背景：目前脑卒中尚无有效的根治方法。随着人们对神经系统再生与干细胞的认识逐渐加深, 干细胞移植有望成为治疗脑卒中的新手段。  目的：利用Scopus数据库文献检索和深度分析功能,对干细胞移植治疗脑卒中研究的近6年文献资料进行多角度的探讨分析。 设计：文献计量学分析。 资料提取：由第一作者以“neural stem cells (干细胞),stroke (脑卒中),cell transplantation (细胞移植)”为关键词检索Scopus数据库2006-01/2011-12的相关文献,并将分析结果及资料导出,以文字和图表的形式进行统计和计量分析,描述其分布特征。 入选标准：纳入标准：检索干细胞移植治疗脑卒中研究相关的文献。文献类型包括研究原著、综述、会议记录及摘要、快报文章、编辑素材。排除标准：与文章目的无关的文献,大于6年较陈旧的文献,未发表的文章。 主要数据判定指标：发表文献的国家地区分布、作者分布、机构分布、来源期刊、文献被引情况。 结果：Scopus数据库2006/2011收录的文献中共检索到1 045篇干细胞移植治疗脑卒中研究相关的文献,研究原著以517篇位居首位,其中有15篇可以确定为经典文献。在时间分布上,文献数量2006/2011总体呈上升趋势,来源出版物呈分散情况。目前已发表文献中以美国为主,占全球相关领域发稿量的39.8%。中国在过去6年间在数据库中收录文章总量中排在第2名,共发表88篇相关文章,占全球相关文章的8.4%。  结论：通过文献计量学方法对来源于Scopus数据库关于干细胞移植治疗脑卒中的研究文献进行分析,可为了解该领域的概貌、现状和研究者进一步确定该领域研究的热点难点提供有价值的参考。关键词：干细胞;脑卒中;脑梗死;细胞移植;文献计量学 doi:10.3969/j.issn.1673-8225.2012.19.029     

Xpert MTB/RIF系统在盆腔结核诊断中的应用价值分析

目的探讨Xpert MTB/RIF系统检测盆腔积液中结核分枝杆菌对于盆腔结核的诊断价值。方法采集30例临床确诊为盆腔结核患者及30例盆腔恶性肿瘤患者(对照组)的盆腔积液,对积液同时采用离心涂片法、荧光定量PCR法和Xpert MTB/RIF系统进行结核分枝杆菌检测,比较三种方法的敏感性及特异性。结果离心涂片法、荧光定量PCR法和Xpert MTB/RIF系统检测结核分枝杆菌的敏感性分别为6.67%(2/30)、53.33%(16/30)和73.33%(22/30),三种方法间差异均有统计学意义(P均<0.05)。三种方法特异度分别为100.0%,96.7%,100.0%,差异无统计学意义。结论采用Xpert MTB/RIF系统对盆腔积液进行结核分枝杆菌检测敏感性高,特异度好,具有较高的临床应用价值。     

血管内皮生长因子与骨折愈合：SCI数据库10年资料检索分析*☆

背景：血管内皮生长因子在骨折愈合过程中起着重要的作用。 目的：利用SCI数据库文献检索和深度分析功能,对于血管内皮生长因子对骨折愈合的干预作用近10年文献资料趋势进行多角度的探讨分析。 设计：文献计量学分析。 资料提取：由第一作者以vascular endothelial growth factor/VEGF(血管内皮生长因子);fracture(骨折);及healing(愈合)为关键词检索SCI数据库2002-01/2011-12的相关文献,并将分析结果及资料导出,以文字和图表的形式进行统计和计量分析,描述其分布特征。 主要数据的判定指标：①检索结果数量。②发表文章年份分布。③国家地区分布。④机构信息。⑤文献类型分析。⑥来源期刊分析。⑦高被引频次文献分析。 入选标准：纳入标准：检索血管内皮生长因子对骨折愈合的干预作用相关研究的文献。文献类型包括研究原著、综述、会议记录及摘要、快报文章、编辑素材。排除标准：与文章目的无关的文献,大于10年较陈旧的文献,未发表的文章以及需电话追踪和手工检索逐一分析的文献。 主要数据判定指标：以文献的类型、出版时间、发表文献的作者分布、学科类别、机构分布、国家地区分布、来源期刊、文献被引情况进行相关分析。 结果：SCI数据库2002/2011收录的文献中共检索到180篇血管内皮生长因子对骨折愈合的干预作用研究相关的文献,研究原著以158篇位居首位,其中有9篇文献总被引次数超过50次,被确定为经典文献。在时间分布上,文献数量2002/2011总体呈上升趋势,来源出版物呈分散情况,其中Bone《骨》发表文献量21篇,占全部文献的11.67%。其次为Journal of Bone and Mineral Research《骨及矿物质研究》13篇。 结论：血管内皮生长因子对骨折愈合的干预作用是近几年的研究热点,中国在该领域的研究趋于成熟,并在国际数据库收录文献数量上占有重要位置。关键词：血管内皮生长因子;骨折;愈合;干预;文献计量学 doi:10.3969/j.issn.1673-8225.2012.15.039     

干细胞移植治疗脊髓损伤的研究与应用

背景：脊髓损伤是中枢神经系统的严重创伤,一些研究认为,干细胞移植可为脊髓损伤治疗提供新的思路。  目的：利用Scopus数据库文献检索和深度分析功能,对干细胞移植治疗脊髓损伤研究的6年文献资料进行多角度的探讨分析。 设计：文献计量学分析。 资料提取：由第一作者以“neural stem cells (干细胞),spinal cord injury or spinal injury (脊髓损伤),cell transplantation (细胞移植),spinal transection (脊髓横断)”为关键词检索Scopus数据库2006-01/2011-12的相关文献,并将分析结果及资料导出,以文字和图表的形式进行统计和计量分析,描述其分布特征。 入选标准：纳入标准：检索干细胞移植治疗脊髓损伤研究相关的文献。文献类型包括研究原著、综述、会议记录及摘要、快报文章、编辑素材。排除标准：与文章目的无关的文献,大于6年较陈旧的文献,未发表的文章以及需电话追踪和手工检索逐一分析的文献。 主要数据判定指标：以文献的类型、出版时间、发表文献的作者分布、学科类别、机构分布、国家地区分布、来源期刊、及文献被引情况进行相关分析。 结果：Scopus数据库2006/2011收录的文献中共检索到1 080篇干细胞移植治疗脊髓损伤研究相关的文献,研究原著以607篇位居首位,其中有15篇可以确定为经典文献。在时间分布上,文献数量2006/2011总体呈上升趋势,来源出版物呈分散情况。高被引研究原著类文章主要发表在Journal of Neuroscience (《神经科学杂志》)上,目前已发表文献中以美国为主,占全球相关领域发稿量的28.5%。中国在过去6年间在数据库中收录文章总量中排在第2名,共发表212篇相关文章,占全球相关文章的19.6%。 《神经外伤杂志》发表文献量22篇,占全部文献的15.09%。其次为Journal of Neuroscience Research《神经科学研究杂志》21篇。 结论：通过文献计量学方法对来源于Scopus数据库关于干细胞移植治疗脊髓损伤研究的文献进行分析,可为了解该领域的概貌、现状和研究者进一步确定该领域研究的热点难点提供有价值的参考。      

基于文献计量学与可视化分析的骨组织工程支架材料的全球研究现状及发展趋势

目的通过对骨组织工程支架材料的相关文献进行阅读和归纳总结，对相关文献进行文献计量学和相关热点可视化分析，比较不同年份、基金资助机构、机构、作者、来源出版物、国家、文献被引和关键词的相关数据为将来骨组织工程支架材料的研究提供参考。 方法以骨组织工程和支架材料为主题在Web of Science数据库中检索2009年1月1日到2021年12月31日的相关文献，应用文献计量学方法，使用Excel软件对检索到的相关数据进行归纳总结并绘图，利用VOS-viewer软件将文献数据进行可视化分析，并对研究热点进行解读，分析组织工程支架材料的研究现状及发展方向。 结果筛选后共纳入了2 145篇文献，根据文献计量学分析发现骨组织工程支架材料的发文量在逐年上升，其中2020年发文量最高(261篇)，占总发文量12.168%。预测2022年发文量为299篇；从发文量方面看National Natural Science Foundation Of China Nsfc是发文量最多的基金资助机构，有378篇；LEAGUE OF EUROPEAN RESEARCH UNIVERSITIES LERU是发文量最多的机构，共发文80篇；Boccaccini AR是发文量最高的作者，被引总频率1 905；MATERIALS SCIENCE ENGINEERING C MATERIALS FOR BIOLOGICAL APPLICATIONS是发表最多的出版物，共110篇占5.128%；中国是发文量最多的国家，多达608篇占28.345%；被引频率最高的文献是Susmita Bose发表在Trends in Biotechnology的一篇文章。通过文献耦合分析发现关联强度最高的机构和国家分别是中国科学院和美国；并且关键词耦合可视化分析发现骨组织工程支架材料的研究分为"支架材料类型""支架材料需要具备的特征及制备""支架材料的修复过程"三方面，分时段比较分析显示其中"3D打印""力学性能""水凝胶""丝素蛋白"等将成为未来的研究趋势及热点。但是研究最多的是羟基磷灰石、生物材料、体外、力学性能等。 结论近年来关于骨组织工程支架材料的研究日益增多，虽然"3D打印""力学性能""水凝胶""丝素蛋白"逐渐成为研究热点，但是相关研究仍然较少，此外支架材料种类也越来越多。但是仍有许多不足，未来需要各个机构和国家相互交流，以便研究出更适合人体的支架材料。     

Evaluation of the GeneXpert MTB/RIF assay for rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin resistance in pulmonary and extrapulmonary specimens

Mycobacterium tuberculosis remains one of the most significant causes of death from an infectious agent. The rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin (RIF) resistance are essential for early disease management. The GeneXpert MTB/RIF assay is a novel integrated diagnostic device for the diagnosis of tuberculosis and rapid detection of RIF resistance in clinical specimens. We determined the performance of the MTB/RIF assay for rapid diagnosis of tuberculosis and detection of rifampin resistance in smear-positive and smear-negative pulmonary and extrapulmonary specimens obtained from possible tuberculosis patients. Two hundred fifty-three pulmonary and 176 extrapulmonary specimens obtained from 429 patients were included in the study. One hundred ten (89 culture positive and 21 culture negative for M. tuberculosis) of the 429 patients were considered to have tuberculosis. In pulmonary specimens, sensitivities were 100% (27/27) and 68.6% (24/35) for smear-positive and smear-negative specimens, respectively. It had a lower sensitivity with extrapulmonary specimens: 100% for smear-positive specimens (4/4) and 47.7% for smear-negative specimens (21/44). The test accurately detected the absence of tuberculosis in all 319 patients without tuberculosis studied. The MTB/RIF assay also detected 1 RIF-resistant specimen and 88 RIF-susceptible specimens, and the results were confirmed by drug susceptibility testing. We concluded that the MTB/RIF test is a simple method, and routine staff with minimal training can use the system. The test appeared to be as sensitive as culture with smear-positive specimens but less sensitive with smear-negative pulmonary and extrapulmonary specimens that include low numbers of bacilli.     

Tuberculosis diagnosis in resource-limited settings: Clinical use of GeneXpert in the diagnosis of smear-negative PTB: a case report

Background

The Xpert MTB/RIF test (GeneXpert) has recently been endorsed for use in resource-limited settings for the diagnosis of tuberculosis and drug resistant-tuberculosis. In resource-limited settings, GeneXpert has been used predominantly for research and there is little experience with its use in day-to-day management of patients.

Case summary

We describe a case of a 46 year old HIV-infected male with smear-negative pulmonary tuberculosis, who had several visits to various lower level health centres and two admissions in a tertiary care hospital; however, the diagnosis of tuberculosis was only made several months later on GeneXpert testing that was performed under a research project.

Conclusion

GeneXpert facilitated identification of tuberculosis in an HIV positive patient in whom the diagnosis had been delayed when more widely available tests were used. Operational and cost-effectiveness studies are needed to provide evidence to policy makers in order to improve access to GeneXpert.     

动态增强MRI在骨关节中的热点研究

文题释义： 动态增强MRI：是一种MRI功能成像技术,采用快速MRI序列连续采集静脉注射对比剂前、中、后的图像,显示对比剂进入靶器官或组织血管、通过毛细血管床并最终被清除过程中的信息。与常规核磁增强不同的是,动态增强能够提供每一个时间点的强化信息,目前在肿瘤病灶的检出、良恶性病变的鉴别、肿瘤分级、肿瘤放化疗疗效监测、治疗后的预后评价等方面有重要的价值。 偶极-偶极作用：极性分子因电荷分布不均产生偶极矩,当极性分子靠近时,会造成电性的吸引,这种作用力称为偶极-偶极力。分子的偶极矩愈大,分子间的作用力愈大。 背景：动态增强MRI作为一种无创性检测方法,目前在肿瘤领域运用广泛,可进行肿瘤良恶性的鉴别、肿瘤级别的分级以及预后的预测与评估等。近年其在骨关节领域的运用研究逐渐成为热点,可用于骨髓血流灌注的测定、骨组织活性的评估、骨灌注异常的早期发现以及关节炎性病变血运的评估等。 目的：总结动态增强MRI的技术概况及其目前在骨关节方面的应用进展。 方法：英文检索式为“(bone OR joint) AND (dynamic contrast-enhanced MRI) OR dynamic contrast-enhanced magnetic resonance imaging)”,中文检索式为“(骨OR关节)AND动态增强磁共振”“(骨OR关节)AND 动态增强MRI”“(骨OR关节)AND DCE-MRI”,由第一作者检索1984至2019年PubMed、Springerlink以及中国期刊全文数据库(CNKI),查阅近年动态增强MRI在骨关节方面应用的相关文献,最终保留55篇文献进行总结分析。 结果与结论：①目前动态增强MRI成像技术及数据处理尚未标准化,在骨关节主要采用T1WI成像,可行定性、半定量及全定量分析;②定性分析及半定量分析操作简便,量化指标明确,能客观地描述曲线形态,但不能反映组织间、血管内的对比剂浓度,且容易受扫描参数序列的影响,无法检测组织药物代谢动力学信息;而定量分析能获得组织内亚结构间的对比剂浓度变化并生成参数,评估组织的微血管生成及其功能;③动态增强MRI可无创性评估骨关节的微循环灌注,对许多骨关节疾病发病机制的探讨、诊断及鉴别诊断、预后预测、疗效评估以及治疗方式的选择都有一定参考价值。 ORCID: 0000-0002-0093-9910(黄雪洁) 中国组织工程研究杂志出版内容重点：人工关节;骨植入物;脊柱;骨折;内固定;数字化骨科;组织工程     

Evaluation of the Cepheid Xpert MTB/RIF assay for direct detection of Mycobacterium tuberculosis complex in respiratory specimens

A total of 217 specimens submitted for routine smear and culture from three different sites within the western United States were used to evaluate the GeneXpert MTB/RIF assay (for research use only) (Cepheid, Sunnyvale, CA). Overall agreement compared to culture was 89% (98% for smear positives and 72% for smear negatives) for detection of Mycobacterium tuberculosis.     

Cepheid GeneXpert MTB/RIF assay for Mycobacterium tuberculosis detection and rifampin resistance identification in patients with substantial clinical indications of tuberculosis and smear-negative microscopy results

The GeneXpert MTB/RIF assay was evaluated with microscopically negative and positive pulmonary and extrapulmonary specimens from patients with substantial clinical indications for tuberculosis. For the pulmonary samples, the sensitivity, specificity, and positive and negative predictive values were 90.6%, 94.3%, 93.5%, and 91.7%, and for the extrapulmonary samples, they were 100%, 91.6%, 50%, and 100%, respectively. For microscopically negative specimens, the respective values were 86.3%, 93%, 79%, and 95.6%. The assay correctly detected rifampin resistance in all but one specimen, which harbored a mixed population. The GeneXpert assay was highly effective for tuberculosis diagnosis and identification of rifampin-resistant strains in smear-negative samples.     

Rapid detection of Mycobacterium tuberculosis complex and rifampin resistance in smear-negative clinical samples by use of an integrated real-time PCR method

Sixty-four of 85 (75.3%) smear-negative respiratory (n = 78) and nonrespiratory (n = 7) samples with positive cultures of Mycobacterium tuberculosis complex (MTC) were detected by the GeneXpert system using the Xpert MTB/RIF assay (GX). In addition, GX found rpoB mutations in all six of the rifampin-resistant strains detected. The test was negative in 20 culture-negative and 20 nontuberculous culture-positive samples (100% specificity). GX offers high potential for the diagnosis of tuberculosis due to its capacity for direct detection of MTC, its rapidity, and its simplicity.     

Can a Simple Flotation Method Lower the Limit of Detection of Mycobacterium tuberculosis in Extrapulmonary Samples Analyzed by the GeneXpert MTB/RIF Assay?

The rapid and accurate diagnosis of tuberculosis (TB) in children and extrapulmonary TB in adults continues to be a challenge. In this study, we determined the lower limit of detection (LOD) of the GeneXpert MTB/RIF assay with nonrespiratory specimens and investigated the utility of flotation procedures for concentrating the bacilli. Clinical specimens (9 cerebrospinal fluid [CSF], 13 gastric aspirate, 8 tissue, and 17 stool) were spiked with single-celled Mycobacterium tuberculosis, and the LOD of the GeneXpert assay was determined. Flotation studies were conducted with sucrose and NaCl, and the cycle thresholds of the MTB/RIF assay were compared between treated and untreated samples. There was no significant difference between the LODs of the GeneXpert assay with saline solution (median, 33 CFU/ml) and CSF (median, 25 CFU/ml) (P > 0.05) or gastric aspirate samples (median, 58 CFU/ml) (P > 0.05). The LOD with spiked tissue (median, 1,525 CFU/ml) and stool samples (median, 6,800 CFU/ml) was significantly elevated compared to that determined with saline solution (P ≤ 0.05 and ≤ 0.0005, respectively). Flotation studies with sucrose or NaCl did not consistently result in lowered cycle thresholds in stool or gastric aspirates, but a cycle reduction of >10 was achieved in two of the three pooled CSF samples. Unlike the results seen with tissue and stool samples, there was no significant PCR inhibition in the MTB/RIF assay with CSF and gastric aspirates. Although preconcentration of CSF samples with sucrose and NaCl may enhance detection of M. tuberculosis by PCR, further advances are needed to concentrate the bacilli and eliminate PCR inhibitors in paucibacillary nonrespiratory samples.     

Evaluation of GeneXpert MTB/RIF for Diagnosis of Tuberculous Meningitis

Tuberculous meningitis (TBM) is the most severe form of tuberculosis. Microbiological confirmation is rare, and treatment is often delayed, increasing mortality and morbidity. The GeneXpert MTB/RIF test was evaluated in a large cohort of patients with suspected tuberculous meningitis. Three hundred seventy-nine patients presenting with suspected tuberculous meningitis to the Hospital for Tropical Diseases, Ho Chi Minh City, Vietnam, between 17 April 2011 and 31 December 2012 were included in the study. Cerebrospinal fluid samples were tested by Ziehl-Neelsen smear, mycobacterial growth indicator tube (MGIT) culture, and Xpert MTB/RIF. Rifampin (RIF) resistance results by Xpert were confirmed by an MTBDR-Plus line probe assay and all positive cultures were tested by phenotypic MGIT drug susceptibility testing. Overall, 182/379 included patients (48.0%) were diagnosed with tuberculous meningitis. Sensitivities of Xpert, smear, and MGIT culture among patients diagnosed with TBM were 59.3% (108/182 [95% confidence interval {CI}, 51.8 to 66.5%]), 78.6% (143/182 [95% CI, 71.9 to 84.3%]) and 66.5% (121/182 [95% CI, 59.1 to 73.3%]), respectively. There was one false-positive Xpert MTB/RIF test (99.5% specificity). Four cases of RIF resistance (4/109; 3.7%) were identified by Xpert, of which 3 were confirmed to be multidrug-resistant (MDR) TBM and one was culture negative. Xpert MTB/RIF is a rapid and specific test for the diagnosis of tuberculous meningitis. The addition of a vortexing step to sample processing increased sensitivity for confirmed TBM by 20% (P = 0.04). Meticulous examination of a smear from a large volume of cerebrospinal fluid (CSF) remains the most sensitive technique but is not practical in most laboratories. The Xpert MTB/RIF represents a significant advance in the early diagnosis of this devastating condition.