综合医院非伤寒沙门菌感染腹泻患者病原学分析

目的了解综合医院腹泻患者非伤寒沙门菌感染情况,分析非伤寒沙门菌的血清分型、耐药性和分子特征。方法对2009年9月-2011年6月腹泻病患者送检的767份粪便标本进行非伤寒沙门菌检测,对分离到的菌株进行血清分型、药物敏感性试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果从767份腹泻粪便标本中分离到36株非伤寒沙门菌,阳性检出率为4.56%;以儿童为主,占65.71%;共分为10种血清型,主要以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主,分别占37.14%和28.57%;10个血清型非伤寒沙门菌对头孢类和环丙沙星的敏感率>84.00%,除斯坦利沙门菌和山夫登宝沙门菌外,其他血清型均对多种抗菌药物产生不同程度的耐药或交叉耐药;将13株鼠伤寒沙门菌和10株肠炎沙门菌共分离出19个PFGE分型,其中2株肠炎沙门菌PFGE同型,3株鼠伤寒沙门菌PFGE同型,存在不同耐药谱。结论综合医院引起感染性腹泻的非伤寒沙门菌主要为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,儿童多见;非伤寒沙门菌多药耐药严重,临床在应用氟喹诺酮类治疗非肠外沙门菌属感染时,应根据药敏结果慎重选择。     

2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的分子型别分析

目的研究2011-2012年杭州市肠道沙门菌临床分离株的型别,了解本地菌株分子流行病学特征。方法对66株肠道沙门菌临床分离株进行血清分型和多位点序列分型(MLST)。对其中主要血清型:鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎沙门菌菌株进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型。结果分布于21个血清型的66株沙门菌分成26个ST型别。发现一株纽波特沙门菌为新型ST1690。菌株血清型与MLST型别数据库中所对应的血清型符合率为100.00%。9株甲型副伤寒沙门菌的PFGE带型完全一致(P7型),与先前杭州流行菌株有差异(P1-P6型)。6株肠炎沙门菌分成4个PFGE型,型间最小相似性为92.70%。13株鼠伤寒沙门菌分为11个PFGE型,型间最小相似性为71.70%。7株萨雷甲尼沙门菌分成4个PFGE型别,型间最小相似性为91.00%。结论近年杭州腹泻病人中流行的肠道沙门菌菌株主要血清型为鼠伤寒、甲型副伤寒、萨雷甲尼和肠炎等。甲型副伤寒沙门菌菌株在杭州出现了新PFGE型别。MLST数据可以对沙门菌血清学鉴定提供一定的帮助。     

广西食源性鼠伤寒沙门菌血清型和分子特征研究

目的掌握广西食源性沙门菌优势血清型,建立广西食源性沙门菌优势血清型脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱资料库。方法对2015年收集的菌株进行血清分型,用PFGE方法对优势血清型鼠伤寒沙门菌进行分子分型,结合相关流行病学信息进行分析。结果 2015年从广西共收集到330株沙门菌,80株经血清学鉴定为鼠伤寒沙门菌,其中哨点医院病例中77株,食品中3株。80株鼠伤寒沙门菌经Xba I酶切分为67种型别,其中24株菌11种型别同源性分别达到100%,优势型别为JEX001.CN0056(3株)和JEX001.CN0062(3株)。36株菌26种型别同源性达到96%以上,JEX001.CN0015为食品分离株与腹泻病例株完全匹配型别。结论鼠伤寒沙门菌是2015年广西食源性沙门菌的优势血清型,呈高度散发状态。食品分离株与临床株之间同源性不高,但大部分散发腹泻菌株具有高度同源性。     

2018年陕西省感染性腹泻患者中分离沙门菌的病原学特征分析

目的 了解陕西省腹泻监测病例中沙门菌的血清型别及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子型别特点。方法 对2018年陕西省14家哨点医院的临床腹泻患者中分离到的沙门菌进行血清学分析,并用Xba I 酶切进行PFGE电泳分析其分子型别特征。结果 2294份病例标本中检出沙门菌101株,检出率4.4%。沙门菌腹泻病例的高发时间为8月和9月,感染人群以≤3 岁婴幼儿为主,101株沙门菌有9株血清型未定,其余92株可分为8 种血清型,其中血清型为鼠伤寒沙门氏菌检出最高,其次为肠炎沙门氏菌。101株沙门菌经XbaI 酶切,可分为71种PFGE 带型,每种带型包含1～10 株沙门菌,其中鼠伤寒沙门菌共产生42 种带型,肠炎沙门氏菌共产生6种带型。结论 陕西省临床腹泻患者沙门菌血清型和PFGE带型呈现多样性,鼠伤寒沙门氏菌是陕西地区的优势菌。本研究建立了陕西沙门菌PFGE指纹图谱库,积累了沙门菌分子流行病学基线数据,为沙门菌引发疾病的处置和溯源提供了重要依据。     

脉冲场凝胶电泳技术在鼠伤寒沙门菌分型中的应用

[目的]探讨脉冲场凝胶电泳(PFGE)在鼠伤寒沙门菌分型中的应用。[方法]选择XbaⅠ酶对鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切、脉冲场凝胶电泳。电泳带用Freeview软件进行相似性比较。[结果]13株鼠伤寒沙门菌经PFGE，根据其条带的差异可分为10个PFGE型别。[结论]PFGE法重复实验结果稳定，分型力较强，适合鼠伤寒沙门菌分型应用。     

广州市2012年腹泻病人沙门菌血清学、耐药及PFGE分型分析

目的研究引起患者感染性腹泻的沙门菌的血清学分布、耐药特点及分子流行病学特征。方法对分离自广州市8所哨点医院腹泻病人粪便的沙门菌,用血清凝集实验确定血清型,用K-B纸片法检测对12种抗生素的敏感性,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌进行分子分型。结果从分离的205株沙门菌中,鼠伤寒沙门菌是主要的血清型,占43.4%,其次是肠炎沙门菌,占13.7%。在抗生素敏感性测试中,磺胺复合物耐药率最高,达66.8%;其次是氨苄西林,65.4%;对头孢吡肟和头孢噻肟也出现了耐药,分别为9.8%和9.3%。PFGE分型结果显示71株鼠伤寒沙门菌可分为47个PFGE型,28株肠炎沙门菌可以分为17个PFGE型。结论本研究表明引起腹泻沙门菌血清型以鼠伤寒和肠炎为主。PFGE分型较为分散。值得注意的是,对头孢类抗生素出现较高的耐药率,应当引起重视。     

多位点序列分型和脉冲场凝胶电泳在肠炎沙门菌分子分型的比较

目的 比较多位点序列分型技术和脉冲场凝胶电泳（PFGE）技术在肠炎沙门菌菌株间分型的分辨率。方法 分别建立肠炎沙门菌的6个管家基因thrA、pure、sucA、aroC、hemD、dnaN和一个特异性的DNA标记Sdf Ⅰ的多位点序列分型技术，及以寡切点的XbaⅠ、SpeⅠ作为限制性内切酶的PFGE方法，并应用上述方法对食品中的分离株进行分型，比较两种方法的分辨率。结果 PFGE可以将50株肠炎沙门菌分为11个型。并且通过双酶系统的双重PFGE分型，还可以将PFGE型别再精细划分为亚型；MLST则揭示了在同一血清型内部，各菌株之间的管家基因碱基序列高度保守，而在沙门菌不同血清型的核苷酸序列之间，则分别存在不同数量的碱基差异。即MLST方法只能用于血清型之间，不能在血清型内部进行分型研究。结论 与MLST比较，PFGE方法在肠炎沙门菌的分型方面显示了比较高的分辨率。     

广州市136株沙门菌耐药表型与分子分型研究

目的研究广州市2013年腹泻患者感染的沙门菌的血清型分布、耐药情况以及分子流行特征。方法用传统血清学方法鉴定沙门菌的血清型,并用纸片扩散法进行抗菌药物敏感性试验,用脉冲场凝胶电泳(PFGE)对斯坦利沙门菌、肠炎沙门菌、鼠伤寒沙门菌和Ⅰ4,5,12:i:-沙门菌进行分子分型研究。结果 136株沙门菌被鉴定为29种血清型,数量居前三位的血清型为斯坦利沙门菌(19.9%)、肠炎沙门菌(15.4%)和鼠伤寒沙门菌(15.4%)。所有沙门菌菌株对四环素和萘啶酸耐药率最高,分别达到44.8%和39.7%,对环丙沙星的敏感率仅为19.9%;对头孢他啶、头孢噻肟和头孢曲松的耐药率均为7.4%。对3类及以上抗生素耐药的多重耐药菌有56(41.2%)株。27株斯坦利沙门菌和21株肠炎沙门菌分别可分为25个PFGE型和15个PFGE型。结论在广州市引起腹泻的沙门菌主要以斯坦利沙门菌、肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,分成多种PFGE型,呈高度散发。本地区沙门菌菌株的多重耐药现象严重,对于氟喹诺酮类和头孢类药物的耐药性升高。     

2007年四川省鼠伤寒沙门菌PFGE分型及溯源

目的 用脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型技术.研究四川省2007年鼠伤寒沙门菌分子流行病学,查找沙门菌污染源,为预测疫情和制定防治措施提供依据.方法 选择Xba I酶对12株鼠伤寒沙门菌全基因组DNA进行酶切,用PFGE对菌株进行分子分型,Bionumerisc统计软件聚类分析.结果 12株鼠伤寒沙门菌用XbaI限制性酶切后,分成5个PFGE图谱类型,其中1个PFGE图谱类型有7株菌株,其指纹图谱的相似性达到100%,该型别占分析菌株的58.33%.其余4个PFGE图谱类型分别有2株菌和1株菌.含7株菌的PFGE图谱型中,源于成都市的菌株4株,攀枝花、自贡和内江市的菌株各1株.结论 PFGE分子分型与流行病学资料紧密结合可增强对鼠伤寒沙门菌食源性疾病的溯源和预警.     

福建省50株沙门菌PFGE指纹图谱研究

目的 分析福建省鼠伤寒及肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳(PFGE)指纹图谱,研究其分型特征.方法 收集2009年50株沙门菌临床分离株,其中30株鼠伤寒沙门菌分离自婴幼儿腹泻患者,20株肠炎沙门菌分离自感染性腹泻患者.选择XbaⅠ酶对沙门菌染色体DNA进行酶切,H9812作为脉冲场凝胶分子量标准.采用PFGE技术分析电泳酶切...     

广东省2008－2009 年沙门菌监测

目的 了解广东省腹泻患者中沙门菌的感染及沙门菌暴发的情况以及沙门菌株的血清型别、耐药性和分子特征.方法 对纳入研究的腹泻病患者进行沙门菌的检测,对日常监测中分离到的菌株和暴发监测收集到的菌株进行血清分型、药物敏感试验和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分型.结果 2008年共检测1922份粪便标本,分离到7l株沙门菌,阳性率为3.7%;2009年检测2110份粪便标本,分离到85株沙门菌,阳性检出率为4.0%;156株菌共分37种血清型,鼠伤寒和肠炎沙门菌居多;监测到10起由沙门菌污染引起的食物中毒事件,其中有4起由肠炎沙门菌引起,有3起由鼠伤寒沙门菌引起;发现1起疑似肠炎沙门菌暴发,并开展流行病学调查,结果提示4名病例中有2名病例是感染同一来源的肠炎沙门菌;229株沙门菌对头孢类和喹诺酮类抗菌药物敏感率达80%以上,59.3%是多重耐药沙门菌.结论 在广东省引起感染性腹泻和食物中毒的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌.

Abstract：

Objective To understand the infection of Salmonella (S.) in patients with diarrhea and outbreaks caused by Salmonella to identify the serotypes, resistance to antibiotics and PFGE types of the strains from the surveillance program in Guangdong province. Methods S. strains from patients with diarrhea were detected, and all the positive strains collected in routine and outbreak surveillance programs, were tested by serum agglutination, antibiotic susceptibility and PFGE.Results 71 S. strains were isolated from 1922 stool samples in 2008, with positive rate as 3.7%.85 S. strains were isolated from 2110 stool samples in 2009, with positive rate as 4.0%. All the 156 strains were divided into 37 serotypes, with S. serotype typhimurium and enteritidis as the most common serotypes. 10 incidents of food poisoning were detected, of which 4 were caused by enteritidis and 3 by typhimurium. A suspected outbreak by enteritidis was discovered and under epidemiological investigation. The findings indicated that 2 of the 4 patients from this outbreak were infected with identical enteritidis isolates. 80% of the 229 isolates were found susceptible to cephalosporins and quinoione and 59.3% of them were muitiresistant to the antibiotics. Conclusion S. enteritidis and S. typhimurium were the most common serotypes that caused infectious diarrhoea and food poisoning in Guangdong province.     

广州市566株腹泻病例沙门菌的血清型分布及耐药性分析

目的 了解广州市近两年腹泻病例沙门菌分离株的血清型分布及耐药情况。方法 对广州市8家腹泻病监测医院2012年、2013年间上送的566株沙门菌进行血清分型,同时采用纸片扩散法(K- B法)对12种抗菌药物进行敏感性分析。结果 566株沙门菌分为62个血清型,前三位分别为鼠伤寒沙门菌41.52%（235/566）、肠炎沙门菌15.72%（89/566）和斯坦利沙门菌7.95%（45/566）。药敏分析显示菌株对头孢类抗菌药物敏感率达85%以上,对环丙沙星的敏感性也较高,为75.44%,而对氨苄西林、磺胺复合物、四环素、萘啶酸的耐药率达60%。耐3种及以上抗生素的菌株占71.02%（402/566）,出现ACSSuT+耐药谱（对氨苄西林、氯霉素、链霉素、磺胺复合物、四环素等5种或更多药物多重耐药）的总耐药率为27.39%（155/566）。鼠伤寒沙门菌ACSSuT+耐药率达44.68%（105/235）。结论 本地区沙门菌临床分离株以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌为主,菌株对头孢类抗菌药物的敏感性较高,但某些血清型菌株存在严重的多重耐药现象,其中鼠伤寒沙门菌是耐药最严重的血清型,应引起重视。     

合肥市肉鸡沙门菌携带情况调查

目的了解合肥市养殖屠宰环节中肉鸡沙门菌的带菌率、血清型分布、抗生素耐药谱分布以及脉冲场凝胶电泳（PFGE）分子分型情况,为合肥市食品安全提供科学的基础数据,为进一步加强合肥市公共卫生安全提供科学依据。方法2010年7—9月对合肥市10家肉鸡养殖场和14家屠宰户分别采用肛拭法和胴体漂洗法采集45份肉鸡活体和45份肉鸡胴体标本,根据GB／T4789．4—2010对沙门菌进行分离、鉴定以及血清学分析;并采用PCR方法进行复核鉴定;对最终确定的阳性菌株使用临床实验室标准化协会（CLSI）推荐的纸片法进行药敏试验;同时采用PFGE方法确定其分子分型。结果在45份肉鸡活体样本中未检出沙门菌;45份肉鸡胴体样本中检出12株沙门菌,检出率为26．7％,经PCR复核检测,所分离的12株沙门菌对invA和hilA基因的携带率均为100％;12株沙门菌分为3种血清型,其中9株为印第安纳沙门菌,2株为鼠伤寒沙门菌,1株为肠炎沙门菌;12株沙门菌对实验中所采用的15种抗生素总耐药以及多重耐药菌株数均为10株;12株沙门菌共分出7种PFGE带型,9株印第安纳沙门菌共分离出5种不同的PFGE带型;同一血清型的沙门菌分子分型结果,基本位于同一大簇中;相同PFGE带型的菌株,耐药谱非常接近。结论合肥市肉鸡胴体沙门菌检出率高,沙门菌的血清型、药敏性以及基因型具有多样性特征,耐药现象严重,相同PFGE带型的菌株,耐药谱非常接近。     

成都市未成年人群腹泻沙门氏菌血清型、耐药及分子分型研究

目的 了解成都市未成年腹泻人群中沙门氏菌感染的血清型分布及耐药性。方法 2012—2019年于成都市各区、市的哨点医院采集18岁以下腹泻患者粪便标本,按照GB4789.4进行沙门氏菌的分离鉴定和血清分型,随机选择部分样本进行微量肉汤稀释法药敏试验和脉冲场凝胶电泳（PFGE）分型。结果 共检出611份腹泻粪便来源沙门氏菌,可分为36种血清型,其中鼠伤寒和肠炎沙门氏菌占据主要优势,分别为68.2%和11.0%。耐药方面,沙门氏菌对氨苄西林的耐药率排首位（76.5%）,其次为四环素（70.5%）、甲氧氨苄嘧啶/磺胺甲噁唑（44.5%）、氯霉素（40.0%）和氨苄西林/舒巴坦（38.0%）;对一、二、三代头孢类抗生素的耐药率有较大差异（4.5%~33.0%）,对亚胺培南均敏感。多重耐药现象严重,以氨苄西林-四环素-甲氧氨苄嘧啶/磺胺甲噁唑（AMP-TET-SXT,占39.0%）,氨苄西林-氨苄西林/舒巴坦-四环素（AMP-AMS-TET,占32.0%）等为主。95株鼠伤寒沙门氏菌PFGE聚类相似度为53%,分为87种带型,其中5种带型各含2~3株相同带型。结论 成都市未成年腹泻患者沙门氏菌主要血清型是鼠伤寒沙门氏菌和肠炎沙门氏菌。多重耐药较严重,AMP-TET-SXT耐药率最高,优势沙门氏菌PFGE型别呈现多样性,存在散在沙门氏菌引起食物中毒的可能。     

Laboratory-based surveillance of non-typhoidal Salmonella infections in Guangdong Province, China

Salmonella is one of the most common foodborne pathogens in humans. Laboratory-based surveillance for non-typhoidal Salmonella infection was conducted in Guangdong Province, China to improve understanding about the disease burden and detection of dispersed outbreaks. Salmonella isolated from patients with diarrhea were sent from 16 sentinel hospitals to local public health laboratories for confirmation, serotyping, antimicrobial susceptibility testing, and pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). PFGE patterns were analyzed to identify clusters representing potential outbreaks. Between September 2009 and October 2010, 352 (4%) Salmonella isolates were obtained from 9167 stool specimens. Salmonella enterica serotype Typhimurium (45%) and Salmonella enterica serotype Enteritidis (13%) were the most common serotypes, and multidrug resistance was high, especially in Salmonella Typhimurium isolates. PFGE patterns of obtained Salmonella isolates were found to be diverse, but a unique PFGE pattern comprising 53 Salmonella Typhimurium isolates were found to occur almost exclusively in infants. Epidemiologic studies are ongoing to determine whether a common exposure is the source of the Salmonella Typhimurium strain frequently isolated from infants.     

儿童感染性腹泻中沙门菌血清型及耐药性分析

目的探讨腹泻患儿感染沙门菌的血清型分布及耐药性。方法收集2017年1至12月在郑州大学附属儿童医院消化内科就诊的门诊及住院患儿腹泻粪便标本进行分离培养,对分离的沙门菌进行血清学分型和药物敏感试验。分析患儿腹泻季节性差异及不同血清型对抗菌药物的敏感性差异。结果在检测的2 037例标本中,分离到124株沙门菌,阳性率为6.09%;共检测有12种血清型,其中以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,分别占24.19%(30/124)和20.97%(26/124)。冬季沙门菌分离率最低(2.03%),夏季最高(7.83%),不同季节沙门菌分离率比较差异有统计学意义(χ2=15.902,P <0.05)。沙门菌对三、四代头孢菌素的耐药率较高,其中头孢噻肟的耐药率高达31.45%、头孢他啶和头孢吡肟的耐药率均>20.00%,喹诺酮类抗生素中对左氧氟沙星耐药率为72.58%,环丙沙星耐药率高达93.55%。不同血清型对抗菌药物的耐药率不同,肠炎沙门菌对喹诺酮类抗菌药物耐药率高于其他沙门菌,而氨苄西林、阿莫西林/克拉维酸、氨苄西林/舒巴坦和派拉西林/他唑巴坦的耐药率均低于其他沙门菌。结论沙门菌血清群可被认为是儿童急性腹泻的重要病原体之一,引起感染性腹泻的沙门菌主要为肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌,各血清型沙门菌对抗菌药物的耐药性有所不同,头孢类抗菌药物仍可作为治疗儿童腹泻沙门菌感染的首选。     

食品中沙门氏菌血清及PFGE分型研究

目的了解吉林省食品中分离的沙门氏菌血清型与脉冲场凝胶电泳（PFGE）基因分型,探索沙门氏菌的分子多态性。方法将从市售鸡肉、鸡胴体、中式凉拌菜及婴儿配方奶中分离出的10株沙门氏菌进行血清学分型、PFGE分子分型,BioNumerics version软件分析比较同源性。结果 10株沙门氏菌血清型分别为4株肠炎沙门氏菌,3株里定沙门氏菌,2株阿贡纳沙门氏菌和1株雷摩沙门氏菌。PFGE聚类分型结果主要分为4型：1型4株,相似度超过95%;2型3株,又分2个亚型,亚型间的相似度为78%;3型2株,相似度为100%;4型1株。结论吉林省食品中沙门氏菌具有不同血清学及PFGE型别,相同来源和血清型的菌株PFGE型别显示高度同源性。     

深圳市儿童医院儿童粪便分离的459株沙门菌分布特征及耐药性

目的了解儿童粪便分离沙门菌的分布特征及耐药情况。 方法分析2012年1月—2015年10月某院患儿粪便标本分离的沙门菌检出情况,以及沙门菌血清型和对常用抗菌药物的敏感性。 结果7 047例患儿送检粪便标本,459例患儿检出沙门菌,总检出率为6.51%。沙门菌肠炎患儿男女比为2.4︰1,其中3岁以下儿童352例（占76.69%）;459株沙门菌中5—10月份检出374株（占81.48%）,7、8、9月检出数量最多,分别为72、84、78株。沙门菌血清型主要为B群(69.06%)和D群（19.39%）,分别以鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌血清型为主。未检出耐亚胺培南和厄他培南的菌株,沙门菌属对哌拉西林/他唑巴坦、头孢吡肟、头孢他啶、氨曲南和头孢曲松的敏感率均＞70%,肠炎沙门菌对头孢类抗生素的敏感率低于鼠伤寒沙门菌,但对复方磺胺甲口恶唑的敏感率高于鼠伤寒沙门菌。结论该院儿童粪便检出的沙门菌主要分离自3岁以下婴幼儿,夏秋季节高发,血清型以鼠伤寒和肠炎沙门菌为主,抗菌药物治疗要结合血清型及药敏结果慎重选择。