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基于加权基因共表达网络分析研究代谢异常型肥胖儿童的全血转录组特征
作者姓名:王青青  张锐锋  葛星
作者单位:1. 徐州市儿童医院肾内风湿免疫科;2. 徐州医科大学基础医学院
基金项目:江苏省研究生科研与实践创新计划(KYCX20_2445);
摘    要:目的 分析代谢异常型肥胖(metabolically unhealthy obesity,MUO)和代谢正常型肥胖(metabolically healthy obesity,MHO)儿童的全血转录组特征,探讨MUO的生物标志物。方法 采用Gene Expression Omnibus(GEO)数据库的GSE146869数据集,包括27例肥胖儿童的全血转录组测序数据,其中13例MHO儿童,14例MUO儿童。利用R软件的“Limma”包,分析全血细胞中的差异表达基因。使用基因本体论(gene ontology,GO)富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析、蛋白互作(protein-protein interaction,PPI)网络分析等生物信息学方法,探索差异表达基因的生物学功能。使用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA),将差异表达基因聚类为模块,探索MUO的生物标志物或潜在治疗靶点。使用R软件进行生物...

关 键 词:肥胖  代谢异常型肥胖  代谢正常型肥胖  生物信息学分析  加权基因共表达网络分析
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