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肥厚型心肌病关键基因的鉴定及铁死亡机制
引用本文:巴文强,李艳,李梦媛.肥厚型心肌病关键基因的鉴定及铁死亡机制[J].吉林医学,2023(12):3351-3357.
作者姓名:巴文强  李艳  李梦媛
作者单位:1. 吉安市中心人民医院药剂科;2. 吉安市第三人民医院心理科;3. 南京医科大学第二附属医院药学部
摘    要:目的:利用生物信息学方法探究肥厚型心肌病(HCM)的关键基因、铁死亡基因和相关富集通路。方法:从GEO数据库下载GSE36961和GSE32453数据集,筛选共同差异表达基因(DEGs)进行富集分析,构建蛋白质相互作用(PPI)网络并鉴定关键基因,用GSE1145数据集验证关键基因的表达,绘制关键基因的受试者工作特征(ROC)曲线。此外,检索Genecards和FerrDb数据库,获得调控铁死亡基因并进行分析。结果:共筛选出136个共同DEGs,富集分析显示共同DEGs与流体剪切应力和动脉粥样硬化、糖尿病并发症中的晚期糖基化终产物及其受体信号通路等相关。PPI网络鉴定出4个关键基因,其中CCL2、CEBPD和PIM1在HCM中表达下调(均P<0.05),且对HCM有较高的诊断效能。另外,筛选出ATF3、LPCAT3和PIM1等10个调控铁死亡抗HCM的可能作用靶标,介导流体剪切应力和动脉粥样硬化、铁死亡等信号通路调控铁死亡途径。结论:CCL2、CEBPD和PIM1基因在HCM发病中具有重要作用,为HCM的诊断和治疗提供了参考,铁死亡相关基因为HCM发病机制的探索提供了新的方向。

关 键 词:肥厚型心肌病  关键基因  铁死亡  生物信息学
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