甲状腺癌免疫相关lncRNA生物标志物的生物信息学研究 |
| |
作者姓名: | 邓家琦 况容 范宇 李明星 |
| |
作者单位: | 西南医科大学附属医院 超声医学科,泸州 646000;西南医科大学附属医院 肿瘤科,泸州 646000 |
| |
摘 要: | 生物信息学在肿瘤生物标志物分析中发挥重要作用,该研究通过生物信息学方法分析甲状腺癌免疫相关lncRNA用于评估甲状腺癌患者临床预后的价值。从肿瘤基因组图谱(The Cancer Genome Atlas, TCGA)数据库中下载甲状腺癌基因表达数据和临床数据,采用Pearson相关系数计算并构建免疫相关基因与lncRNA共表达体系,共找到1 313条免疫相关lncRNA(P<0.001,r>0.3)。将经单因素Cox回归分析得到的lncRNA纳入多因素Cox回归分析并建立风险评分模型,按照风险评分高低将甲状腺癌患者分为高风险组和低风险组。高风险组患者总生存率比低风险组低(P<0.001)。采用多因素Cox回归分析筛选得CRNDE、AC004918.3、LINC02454、AL162231.2、ZFY-AS1、DOCK9-DT、LINC00900、AC008063.1、TONSL-AS1和AC092279.1可作为甲状腺癌临床预后风险的预测指标(均P<0.05),其中5条lncRNA是预后的不利因素(CRNDE、AC004918.3、LINC02454、AL162...
|
关 键 词: | 甲状腺癌 免疫相关长链非编码核糖核酸 肿瘤基因组图谱 肿瘤免疫 |
本文献已被 万方数据 等数据库收录! |
|