基于转录组测序探究C-MET表达在非小细胞肺癌中的免疫调控机制 |
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作者姓名: | 徐越 张言斌 苏珊 |
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作者单位: | 1. 清远市人民医院;2. 广州市红十字会医院;3. 广州市胸科医院 |
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基金项目: | 国家自然科学青年基金项目(编号:8200113358);;广东省自然科学基金(编号:2022A1515012400);;广州市科技计划项目(编号:202206010134,202002030152); |
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摘 要: | 目的 通过转录组测序技术分析C-MET表达在非小细胞肺癌中的免疫调控机制。方法使用siRNA分子干扰技术将C-MET高表达肺腺癌细胞株(H1993)、肺鳞癌细胞株(EBC-1)的C-MET表达沉默,利用转录组测序技术检测C-MET沉默前后细胞差异表达的基因(DEGs),通过生物信息学分析挖掘出C-MET可能参与调控的免疫微环境信号通路及相关基因。最后使用人免疫细胞与H1993、EBC-1共培养技术验证C-MET对免疫因子(INF-γ、INF-β、CXCL-10)的影响。结果 通过转录组测序技术共检测到505个DEGs,其中H1993的C-MET调控前后表达差异组的表达差异基因共有38个,上调的差异表达基因有24个,下调的差异表达基因有14个。EBC-1的C-MET调控前后表达差异组的表达差异基因共有467个,上调的差异表达基因有347个,下调的差异表达基因121个。差异基因的KEGG分析表明,C-MET表达可能通过白细胞介素(IL-17)信号通路、白细胞分化、细胞因子受体活性、细胞周期、细胞因子-细胞因子受体相互作用参与免疫细胞调节因子的调控。使用肺癌细胞与人免疫细胞共同培养技术验证C...
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关 键 词: | 非小细胞肺癌 C-MET 免疫微环境 表达谱测序 |
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