使用GeneSifter对小鼠肺钩虫感染基因表达谱的分析 |
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引用本文: | 刘华,马文丽,柯杰兵,丁大鹏,郑文岭.使用GeneSifter对小鼠肺钩虫感染基因表达谱的分析[J].现代预防医学,2008,35(19):3787-3789. |
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作者姓名: | 刘华 马文丽 柯杰兵 丁大鹏 郑文岭 |
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作者单位: | 1. 南方医科大学基因工程研究所,广州,510515 2. 中国人民解放军军事体育进修学院 |
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摘 要: | 目的]从基因水平探索肌萎缩侧索硬化(ALS)其发病机制并发现治疗ALS新靶点. 方法]通过GeneSifter软件对野生型(WT)和重度联合免疫缺陷型(SCID)小鼠肺组织钩虫感染微阵列表达谱进行分析,使用two-way ANOVA统计学方法对数据聚类,并结合 Gene Ontology 和 KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)生物学通路,深入分析具有种系效应517个差异基因(P<0.001). 结果]显示ALS信号转导通路在两组小鼠间差异有统计学意义(Z>2),与Th2反应相关多个基因对ALS代谢异常具有保护作用. 结论]筛选出3个特异基因,可作为治疗肌萎缩侧索硬化新候选基因.
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关 键 词: | GeneSifter软件 基因表达谱 肌萎缩侧索硬化 |
ANALYSIS OF GENE EXPRESSION PATTERN OF LUNG-STAGE HELMINTH INFECTION IN MICE WITH GENESIFTER |
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Abstract: | |
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