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基于网络药理学及分子对接探讨交泰丸治疗心律失常的作用机制
引用本文:常燕,林建国,李成,张晓彤,汤文丽,姚魁武.基于网络药理学及分子对接探讨交泰丸治疗心律失常的作用机制[J].世界中医药,2021(13).
作者姓名:常燕  林建国  李成  张晓彤  汤文丽  姚魁武
作者单位:1 北京中医药大学,北京,100029; 2 中国中医科学院广安门医院,北京,100053
基金项目:国家自然科学基金面上项目(81873173);首都卫生发展科研专项项目(2018-2-4153);中医药现代化研究专项(2019YFC1708703)
摘    要:目的:运用网络药理学及分子对接分析交泰丸治疗心律失常的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)与BATMAN数据库检索黄连、肉桂的活性成分和靶基因,利用GeneCards数据库检索得到与心律失常相关的靶基因,采用Cytoscape软件绘制交泰丸的“活性成分-作用靶点”网络图,采用STRING数据库构建交泰丸治疗心律失常的蛋白质-蛋白质相互作用(Protein Protein Interaction,PPI)网络图,将PPI网络图导入Cytoscape,采用DAVID数据库对药物-疾病交集靶点进行基因本体(Gene Ontology,GO)富集分析和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG) 通路富集分析,使用Autodock Vina和Pymol进行分子对接。结果:共收集到交泰丸31个有效成分及其556个成分靶点;心律失常相关靶点2 205个;药物成分和疾病的共有靶点174个;使用Cytoscape拓扑分析得到小檗浸碱、表小檗碱、黄藤素、黄柏酮、小檗碱等20个核心成分,PPI网络得到ALB、AKT1、MAPK3、VEGFA、SRC等15个关键核心靶点。生物信息学富集分析中共获取821个GO条目,109条KEGG通路,主要涉及PI3K-AKT信号通路、Rap1信号通路、cAMP信号通路、甲状腺激素信号通路、HIF-1信号通路等。分子对接结果表明,度值排名前5的主要活性成分与核心靶点(ALB、AKT1、MAPK3、VEGFA、SRC)有较强的亲和力。结论:该研究揭示了交泰丸可能通过调控细胞代谢、降低氧化刺激、改善血管重塑等方面治疗心律失常,为后续研究交泰丸治疗心律失常提供一定的中药药理依据。

关 键 词:交泰丸  心律失常  网络药理学  分子对接  中药药理  作用机制
收稿时间:2021/1/14 0:00:00

Mechanism of Jiaotai Pills in Treatment of Arrhythmia Based on Network Pharmacology and Molecular Docking
CHANG Yan,LIN Jianguo,LI Cheng,ZHANG Xiaotong,TANG Wenli,YAO Kuiwu.Mechanism of Jiaotai Pills in Treatment of Arrhythmia Based on Network Pharmacology and Molecular Docking[J].World Chinese Medicine,2021(13).
Authors:CHANG Yan  LIN Jianguo  LI Cheng  ZHANG Xiaotong  TANG Wenli  YAO Kuiwu
Abstract:
Keywords:Jiaotai Pills  Arrhythmia  Network pharmacology  Molecular docking  Pharmacology of Chinese medicine  Mechanism of action
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