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基于生物信息学结合实验验证的常春藤皂苷元抗肝癌机制研究
引用本文:崔文超,刘明远,关宝生,曾佳,田亚妮,邓仲修,白雪. 基于生物信息学结合实验验证的常春藤皂苷元抗肝癌机制研究[J]. 中草药, 2022, 53(12): 3704-3710
作者姓名:崔文超  刘明远  关宝生  曾佳  田亚妮  邓仲修  白雪
作者单位:佳木斯大学基础医学院, 黑龙江佳木斯 154007;佳木斯大学公共卫生学院, 黑龙江佳木斯 154007
基金项目:黑龙江省自然科学基金资助项目(YQ2020H001);黑龙江省教育科学“十三五”规划课题(GBD1317135)
摘    要:目的 应用生物信息学与实验相结合的方法,分析常春藤皂苷元(hederagenin,HD)抗肝癌的作用机制。方法 通过UCSC Xena数据库获取肝癌RNA-seq数据,应用R软件“Limma”包筛选肝癌差异基因,SwissTargetPrediction数据库预测HD作用靶点,取二者交集基因,String数据库构建交集基因的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,Cytoscape_3.9.0软件筛选PPI网络中核心基因,采用分子对接方法验证HD与核心基因的结合位点。采用MTT法观察HD对人肝癌HepG2细胞增殖的影响;采用Western blotting法检测HD对HepG2细胞和H22荷瘤小鼠模型瘤体内细胞分裂周期因子25A(cell division cycle 25A,CDC25A)、CDC25B、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、雄性激素受体(androgen receptor,AR)、雌激素受体1(estrogen receptor 1,ESR1)和前列腺素内过氧化物酶2(prostaglandin...

关 键 词:常春藤皂苷元  肝癌  生物信息学  白细胞介素-6  细胞分裂周期因子25A  前列腺素内过氧化物酶2  雄性激素受体  细胞分裂周期因子25B  雌激素受体1
收稿时间:2022-02-23

Mechanism of hederagenin on hepatocellular carcinoma based on bioinformatics and experimental validation
CUI Wen-chao,LIU Ming-yuan,GUAN Bao-sheng,ZENG ji,TIAN Ya-ni,DENG Zhong-xiu,BAI Xue. Mechanism of hederagenin on hepatocellular carcinoma based on bioinformatics and experimental validation[J]. Chinese Traditional and Herbal Drugs, 2022, 53(12): 3704-3710
Authors:CUI Wen-chao  LIU Ming-yuan  GUAN Bao-sheng  ZENG ji  TIAN Ya-ni  DENG Zhong-xiu  BAI Xue
Affiliation:School of Basic Medical, Jiamusi University, Jiamusi 154007, China;School of Public Health, Jiamusi University, Jiamusi 154007, China
Abstract:
Keywords:hederagenin  hepatocellular carcinoma  bioinformatics  interleukin-6  cell division cycle 25A  prostaglandin endoperoxide synthase 2  androgen receptor  cell division cycle 25B  estrogen receptor 1
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