基于生物信息学分析关键miRNAs在肺鳞癌发生发展中的功能及意义 |
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引用本文: | 陈利军,张天明,第伍丹琲,刘蓓莉,王虹.基于生物信息学分析关键miRNAs在肺鳞癌发生发展中的功能及意义[J].河北医药,2023(16):2422-2426. |
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作者姓名: | 陈利军 张天明 第伍丹琲 刘蓓莉 王虹 |
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作者单位: | 兰州大学第二医院呼吸科 |
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摘 要: | 目的 应用生物信息学方法探究关键miRNAs在肺鳞癌发生发展中的功能及临床意义。方法 利用GEO2R在线工具分析GSE17681数据集中肺癌样本和对照样本的差异表达miRNA。利用miRTarBase数据库预测排在前3位的上调和下调miRNA的靶基因。利用DAVID数据库对靶基因进行GO和KEGG富集分析。通过STRING数据库构建靶基因间的蛋白互作网络及miRNA-基因互作网络,然后利用Cytoscape软件的cytoHubba插件分析关键miRNA及其调控的Hub靶基因。利用UALCAN数据库分析关键miRNA及其调控的Hub靶基因在肺鳞癌中的表达。最后利用Kaplan-Meier Plotter工具分析关键miRNA对肺鳞癌生存状况的影响。结果 共筛选出116个差异表达的miRNA,包括93个上调miRNA,23个下调miRNA。预测了前3位上调和下调miRNA的1282个靶基因,参与了肺鳞癌的相关通路,如癌症途径、MAPK信号通路等。通过miRNA-基因互作网络筛选到上调和下调的关键miRNA为hsa-miR-19a和hsa-miR-126,其调控的Hub靶基因分别为TNF、P...
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关 键 词: | 生物信息学 miRNA 肺鳞癌 靶基因 |
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