| 胃癌中P53诱导相关微小RNA靶基因预测及生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 曹辉,许钟,白班俊,张玲玲. 胃癌中P53诱导相关微小RNA靶基因预测及生物信息学分析[J]. 重庆医学, 2014, 0(34) |
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| 作者姓名： | 曹辉 许钟 白班俊 张玲玲 |
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| 作者单位： | 1. 贵州省人民医院 肿瘤科,贵阳,550002
2. 贵州省人民医院 消化内科,贵阳,550002 |
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| 基金项目： | 贵州省科学技术基金(黔科合J字[2012]2240号)。 |
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| 摘 要： | 目的：利用生物信息学预测胃癌中 P53诱导相关微小 RNA（miRNA）的靶基因及功能。方法通过胃癌的限定，用在线数据库mir2disease、Gene Expression Atlas缩小目的基因范围。利用在线预测软件miRNA 靶基因数据库 miRGen（v3．0）预测目标miRNA的靶基因。通过在线软件DAVID和Pathway Miner对预测的靶基因数据集进行功能富集和信号转导通路分析。结果胃癌中P53诱导相关miRNA包括miR-21、miR-25、miR-103等，预测miR-21靶基因共1090个，其中在胃癌中下调共115个；Pathway Miner分析显示miR-21的靶基因涉及黏附连接、胰岛素信号转导通路、细胞凋亡、钙信号转导通路、JAK-STAT信号转导途径等。结论 miR-21靶基因涉及多个肿瘤发生、发展相关信号通路。
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| 关 键 词： | 胃肿瘤 基因,P53 微RNAs 计算生物学 |
Bioinformatics analysis of target prediction and function of P5 3 induced miRNAs in human gastric cancer |
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| CaoHui,XuZhong , BaiBanjun,ZhangLingling. Bioinformatics analysis of target prediction and function of P5 3 induced miRNAs in human gastric cancer[J]. Chongqing Medical Journal, 2014, 0(34) |
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| Authors: | CaoHui XuZhong BaiBanjun ZhangLingling |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | stomach neoplasms genes,P5 3 miRNA bioinformatics |
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