华东地区猪基因4型戊肝病毒的季节变化及与人同源性的分析 |
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作者姓名: | 陆一涵 郑英杰 胡安群 朱建福 王法弟 王学才 姜庆五 |
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作者单位: | 1. 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室,公共卫生安全教育部重点实验室,上海,200032 2. 安徽医科大学附属安庆市立医院检验科 3. 浙江省德清县疾病预防控制中心 |
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摘 要: | 目的 戊型肝炎病毒的人兽共患特征被认可,本研究检测华东地区猪群在不同季节中基因4型戊肝病毒(HEV)的感染情况,了解猪病毒株之间以及与人病毒株的同源性关系.方法2007年9月-2008年6月在华东地区浙江、安徽和江苏的3家屠宰场中共采集猪胆汁标本1200份,应用巢式RT-PCR方法检测HEV RNA,对阳性标本测序并结合同一地区人HEV序列进行同源性分析.结果猪胆汁标本中HEV RNA总检出率为4.5%,各季节猪群的检出率为9-10月平均检出率6%,12-1月4.33%,3-4月4.33%,5-6月3.33%,各地区的平均检出率为江苏6%、安徽5%、浙江2.5%.不同地区猪与猪、猪与人基因4型HEV病毒株的同源性都较高(猪株之间核苷酸序列约为80%~100%,氨基酸序列约为96%~100%;猪与人株之间核苷酸序列约为76%~99%,氨基酸序列约为95%~100%).部分猪HEV与人HEV构成独立的同源性分支,进化起源关系密切.结论 基因4型HEV在华东地区猪群中常年广泛流行,且可能拥有共同的进化与传播起源.猪群携带HEV可能会对人群戊肝的流行趋势产生影响.
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关 键 词: | 病毒,戊型肝炎 基因型 季节 序列同源性,核酸 序列同源性,氨摹酸 猪 人 |
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