| 乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析 |
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| 引用本文： | 刘镭,黄亮,车清海,赵恩宏,黄旭,程露阳,肖丽君. 乳腺癌高表达基因FAM83A的生物信息学分析[J]. 重庆医学, 2013, 42(3): 243-245 |
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| 作者姓名： | 刘镭 黄亮 车清海 赵恩宏 黄旭 程露阳 肖丽君 |
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| 作者单位： | 承德医学院基础医学部免疫教研室;承德医学院附属医院肿瘤诊治中心;吉林市龙潭区妇幼保健院妇产科 |
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| 基金项目： | 河北省人口与计划生育委员会资助项目(2009-B21);河北省卫生厅资助项目(20090579) |
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| 摘 要： | 目的筛选乳腺癌高表达基因,用生物信息学方法预测FAM83A生物学功能。方法使用肿瘤基因组解剖计划数据库的数字基因表达演示工具,在乳腺癌组织和乳腺良性肿瘤组织中筛选差异表达的基因。生物信息学方法预测FAM83A基因及其编码蛋白的序列同源性、理化性质、亚细胞定位、结构和表达谱。RT-PCR方法测定FAM83A在乳腺癌、乳腺纤维瘤和正常乳腺组织中的表达。结果筛选出差异表达基因FAM83A。发现其有3个不同的剪接体,基因进化保守,亚细胞定位于线粒体的可能性大。预测有PK,PKA等磷酸化位点,MAPK作用识别位点,SH2、SH3,RPEL和WH2结合基序。二级结构主要是α螺旋和无规则卷曲。RT-PCR证实FAM83A在乳腺癌组织中高表达,而在乳腺良性肿瘤和正常乳腺组织中均无表达。结论 FAM83A是一个乳腺癌高表达基因,可能作为乳腺癌分子机制研究的靶点。
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| 关 键 词： | 乳腺肿瘤 生物信息学 SAGE库 FAM83A |
Bioinformatics analysis of the highly expressed FAM83A gene in breast cancer |
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| Liu Lei,Huang Liang,Che Qinghai,Zhao Enhong,Huang Xu,Cheng Luyang,Xiao Lijun. Bioinformatics analysis of the highly expressed FAM83A gene in breast cancer[J]. Chongqing Medical Journal, 2013, 42(3): 243-245 |
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| Authors: | Liu Lei Huang Liang Che Qinghai Zhao Enhong Huang Xu Cheng Luyang Xiao Lijun |
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| Affiliation: | 1(1.Department of Immunology,Basic Medical Institute,Chengde Medical College,Chengde,Hebei 067000,China;2.Cancer Diagnosis and Treatment Center,Affiliated Hospital of Chengde Medical College,Chengde,Hebei 067000,China;3.Department of Obstetrics and Gynecology, Maternal and Child Health Hospital of Longtan District,Jilin 132000,China) |
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| Abstract: | |
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