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2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析
引用本文:章惠萍,易文晶,崔大伟.2013~2016年东部沿海地区甲型H1N1流感病毒分子特征分析[J].临床检验杂志,2017(4):306-309.
作者姓名:章惠萍  易文晶  崔大伟
作者单位:杭州市肿瘤医院,杭州市第一人民医院吴山院区检验科,杭州 310002,江苏大学医学院检验医学系,江苏镇江 212013/浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术重点实验室,杭州 310003,浙江大学医学院附属第一医院检验科,浙江省临床体外诊断技术重点实验室,杭州 310003
基金项目:浙江省医药卫生科技项目(2015KYB149);浙江省自然科学基金(LY16H200001);浙江省教育厅项目(Y201534117)。
摘    要:摘要:目的:通过分析东部沿海地区(江苏、浙江和上海)甲型H1N1流感病毒[A(H1N1) pdm09]的分子特征,为防控A(H1N1) pdm09流感提供科学依据。 方法:从GISAID数据库中获得江浙沪地区2013~2016年分离的A(H1N1) pdm09病毒株和WHO推荐疫苗株的血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)基因序列。运用MEGA6.0软件分析HA和NA的分子特征、关键氨基酸位点和耐药位点的变异情况。 结果:进化树分析显示江浙沪地区A(H1N1) pdm09病毒株与WHO参考株的HA、NA基因序列差异较小,与WHO推荐疫苗株A/California/07/2009(H1N1)间的同源性分别为97.0%~99.5%和97.9%~99.6%;与WHO推荐疫苗株A/South_Africa/3626/2013(H1N1)间的同源性分别为98.0%~99.8%和98.6%~99.9%。病毒氨基酸变异分析显示70株A(H1N1)pdm09病毒的HA蛋白均发生83位(P83S)、203位(S203T)和321位(I321V)突变,且2016年分离株出现A195V突变;HA的裂解位点未发生变异,仍为IQSR↓GLF;2013年有2株NA蛋白出现H275Y耐药位点的变异。 结论:2013~2016年东部沿海地区A(H1N1) pdm09流感病毒的HA和NA蛋白与WHO推荐疫苗株具有高度同源性,关键的氨基酸位点发生变异与病毒的毒力及对药物的敏感性相关,因此我们要密切关注A(H1N1) pdm09病毒,防止其再次发生暴发。

关 键 词:甲型H1N1流感病毒  分子特征  进化树  变异
收稿时间:2017/1/4 0:00:00

Molecular characteristics analysis of influenza A(H1N1) pdm09 virus in the eastern foreland during 2013-2016
Abstract:
Keywords:influenza A(H1N1) pdm09 virus  molecular characteristics  phylogenetic tree  variation
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