基于焦亡相关基因构建肾细胞癌预后风险模型 |
| |
作者姓名: | 陈驰 何思萍 杨夏威 李海滨 吴基华 陆兵 李明虎 孙煦勇 |
| |
作者单位: | 1. 广西医科大学;2. 广西医科大学第二附属医院 |
| |
基金项目: | 国家自然科学基金面上项目(No.81670596); |
| |
摘 要: | 目的 基于焦亡相关基因构建肾细胞癌(RCC)预后风险模型。方法 从TCGA数据库下载RCC组及正常组mRNA数据及临床数据,筛选焦亡相关差异基因,将单因素Cox回归分析和Lasso回归最终筛选出的焦亡相关基因用于预后风险模型的构建。根据风险评分中位数将患者分为高风险组、低风险组。通过基因本体(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)及单样本基因集富集分析(ssGSEA)进行差异表达基因功能分析与免疫分析。结果 共筛选出了42个焦亡相关差异基因,通过单因素Cox回归分析和Lasso回归最终筛选出5个焦亡相关基因用作预后风险模型的构建。GO与KEGG分析表明,差异表达基因主要与适应性免疫反应、病毒介导的细胞免疫和炎性细胞的趋化等有关;ssGSEA表明,高风险组免疫细胞浸润水平、免疫相关途径活性总体高于低风险组。结论 基于5个焦亡相关基因构建的预后风险模型为RCC的诊断、治疗和靶点预测提供了新的方向。
|
关 键 词: | 肾细胞癌 焦亡相关基因 预后风险模型 |
|