| SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测 |
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| 引用本文： | 吕燕波,万瑛,吴玉章. SARS病毒基因组所编码的E蛋白的二级结构和B细胞表位预测[J]. 免疫学杂志, 2003, 19(6): 407-410 |
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| 作者姓名： | 吕燕波 万瑛 吴玉章 |
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| 作者单位： | 第三军医大学免疫学教研室,全军免疫研究所,重庆,400038 |
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| 摘 要： | 目的：预测SARS病毒E蛋白的B细胞表位和二级结构。方法：以SARS病毒基因组序列为基础，采用Garnier-Robson方法、Chou-Fasman方法和Karplus-Schuhz方法预测E蛋白质的二级结构；用Kyte-Doohttle方案预测蛋白质的亲水性；用Emini方案预测蛋白质的表面可能性；用Jameson-Wolf方案预测氨基酸的抗原性指数。综合评判，预测SAPS病毒E蛋白的B细胞表位。结果：在SARS病毒E蛋白N-端的第1～6、13～19、39～43、47～64区段和第73～76区段有β-折叠中心；第6～12区段和第67～69区段可能形成转角或无规则卷曲，是柔性区域。E蛋白N端第2～13区段和第61～74区段为B细胞优势表位区域。结论：用多参数预测SARS病毒E蛋白的二级结构和B细胞表位，为实验方法探索SARS冠状病毒E蛋白的B细胞表位提供理论依据。
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| 关 键 词： | SARS病毒 基因组编码 E蛋白 二级结构 B细胞表位 预测 严重急性呼吸综合征 |
| 文章编号： | 1000-8861(2003)06-0407-04 |
| 修稿时间： | 2003-05-28 |
Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the E protein of SARS coronavirus |
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| LU Yan-bo,WAN Ying,WU Yu-Zhang. Prediction of the secondary structure and B cell epitope for the E protein of SARS coronavirus[J]. Immunological Journal, 2003, 19(6): 407-410 |
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| Authors: | LU Yan-bo WAN Ying WU Yu-Zhang |
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| Abstract: | |
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| Keywords: | SARS coronavirus E protein B cell epitope Secondary structure Prediction |
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