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儿童新诊断与慢性免疫性血小板减少症差异基因分析
引用本文:马利敏,杨学文,杨海平,阮林海. 儿童新诊断与慢性免疫性血小板减少症差异基因分析[J]. 中国医药生物技术, 2019, 0(1): 33-38
作者姓名:马利敏  杨学文  杨海平  阮林海
作者单位:河南科技大学第一附属医院血液科
基金项目:洛阳市科技计划项目(1503007A-4)
摘    要:目的筛选儿童新诊断与慢性免疫性血小板减少症(ITP)之间的差异表达基因(DEGs)并进行生物信息学分析。方法从基因表达数据库中下载芯片表达谱GSE46922数据集,利用BRB-ArrayTools软件鉴定DEGs,然后分别对差异基因进行基因本体(GO)功能富集分析、Pathway富集分析和互作网络分析。结果共筛选出1225个DEGs,其中上调基因665个,下调基因560个。GO富集分析发现DEGs主要参与转录调控、小分子代谢、蛋白泛素化、凋亡调控、固有免疫反应、病毒复制等生物学过程。Pathway富集分析发现DEGs显著富集于代谢通路、内质网蛋白加工、破骨细胞分化、MAPK信号通路、病毒感染、凋亡等。网络分析鉴定出的核心基因有CHD4、UQCR10、AP2M1、SIRPγ和GPR180,核心Pathways包括MAPK信号通路、细胞周期和细胞凋亡。结论明确了儿童新诊断与慢性ITP的基因表达谱不同,为进一步阐明儿童ITP发生发展的分子机制和指导早期治疗干预提供了基础。

关 键 词:血小板减少症  基因表达谱  儿童  计算生物学  差异表达基因  免疫应答

Analysis of differential genes between newly diagnosed and chronic pediatric immune thrombocytopenia
MA Li-min,YANG Xue-wen,YANG Hai-ping,RUAN Lin-hai. Analysis of differential genes between newly diagnosed and chronic pediatric immune thrombocytopenia[J]. Chinese Medicinal Biotechnology, 2019, 0(1): 33-38
Authors:MA Li-min  YANG Xue-wen  YANG Hai-ping  RUAN Lin-hai
Affiliation:(Department of Hematology,The First Affiliated Hospital,College of Clinical Medicine of Henan University of Science and Technology,Luoyang 471023,China)
Abstract:MA Li-min;YANG Xue-wen;YANG Hai-ping;RUAN Lin-hai(Department of Hematology,The First Affiliated Hospital,College of Clinical Medicine of Henan University of Science and Technology,Luoyang 471023,China)
Keywords:Thrombocytopenia  Gene expression profiling  Child  Computational biology  Differentially expressed genes  Immune response
本文献已被 CNKI 维普 等数据库收录!
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